Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F13 I1 R1
|
28 |
562.2 |
19051950 |
96.7% |
18423235 |
140.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,617,887 |
G→A |
C287Y (TGC→TAC) |
ydeA → |
L‑arabinose exporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,617,887 | 0 | G | A | 99.1%
| 1826.0
/ 0.2
| 427 | C287Y (TGC→TAC) | ydeA | L‑arabinose exporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/2); new base A (208/214); total (211/216) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 |
Only 100 of 429 total aligned reads displayed.
CATTGCGGGATTCAGCGCCAACTTTGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTGCCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTGCTGGCGCTGGCACCAGATGCTACCGACGTCGCGATGGC > NC_000913/1617741‑1618034
|
aTTGCGGGATTCAGCGCCAACTTTGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTg > 1:3143338/1‑150 (MQ=255)
cGGGATTCAGTGCCAACTTTGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCa < 1:3142855/149‑1 (MQ=255)
cGGGATTCAGCGCCAACTTTGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCa > 2:3143347/1‑149 (MQ=255)
cGGGATTCAGCGCCAACTTTGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCAt > 1:3143345/1‑150 (MQ=255)
gggATTCAGCGCCAACTTTGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCAtt > 1:3143351/1‑150 (MQ=255)
gggATTCAGCGCCAACTTTGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCAtt < 1:3142809/150‑1 (MQ=255)
ggATTCAGCGCCAACTTTGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTg > 1:3143359/1‑150 (MQ=255)
aGCGCCAACTTTGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGtt < 1:3142691/149‑1 (MQ=255)
aGCGCCAACTTTGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTa > 2:3143362/1‑150 (MQ=255)
gcCAACGTTGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCt < 2:3142998/134‑1 (MQ=255)
cAACTTTGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTGCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTgc < 1:3142277/150‑1 (MQ=255)
aaCTTTGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTgcg > 1:3143370/1‑150 (MQ=255)
tGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTgcgg > 2:3143377/1‑146 (MQ=255)
ccACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAAc < 1:3142990/149‑1 (MQ=255)
cACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCt < 1:3142912/139‑1 (MQ=255)
aCGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGt > 1:3143382/1‑150 (MQ=255)
cGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTgcg < 2:3142962/140‑1 (MQ=255)
gCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCt < 2:3143067/119‑1 (MQ=255)
gCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTACGGCGAACAGTGa > 1:3143386/1‑149 (MQ=255)
ttACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATa < 1:3142950/150‑1 (MQ=255)
aCTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATaca > 2:3143389/1‑150 (MQ=255)
tGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTg < 2:3143048/122‑1 (MQ=255)
tGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACAcc > 1:3143393/1‑150 (MQ=255)
gTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTg < 2:3142740/112‑1 (MQ=255)
ttattaCTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCt < 1:3142580/149‑1 (MQ=255)
tattaCTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGAGTGATTTTCGGTAAACCGGTTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTAGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCg > 2:3143395/1‑150 (MQ=255)
ttaCTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCgg < 1:3142880/149‑1 (MQ=255)
aCTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGt > 1:3143404/1‑150 (MQ=255)
cTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGt < 2:3143055/149‑1 (MQ=255)
ttggtggtGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGaa < 2:3143014/132‑1 (MQ=255)
cGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCt > 1:3143408/1‑150 (MQ=255)
gtggtgCGGGCATTATTGGCAGCGTGATATTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGAGAATACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTANCTGGCATTGCTGTTACCTACGGCGAACAGTGAAATACACCTCggg > 2:3143410/1‑143 (MQ=255)
gtgCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTCCCTGGCATTGCTGTTACCTTCGGCGAACAGTGAAATACACCTAGGGGt > 2:3143416/1‑142 (MQ=255)
gtgCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGt < 2:3142905/149‑1 (MQ=255)
gtgCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTa > 1:3143417/1‑150 (MQ=255)
ggCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTAGCTGGCATTGCTGCTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACAGCTCGGGGTGCTGAGTAtc > 2:3143423/1‑146 (MQ=255)
ggCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTc < 2:3143325/150‑1 (MQ=255)
ggCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTc < 1:3143125/150‑1 (MQ=255)
gCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCCCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCt < 1:3143061/150‑1 (MQ=255)
cATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGNGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCTAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTg > 1:3143430/1‑150 (MQ=255)
attattGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTgg > 2:3143431/1‑150 (MQ=255)
attGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTgggg > 1:3143438/1‑149 (MQ=255)
attGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTgggg < 1:3142730/149‑1 (MQ=255)
attGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTgggg < 2:3143138/149‑1 (MQ=255)
ttGGCAGCGAGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTgggg < 1:3143174/148‑1 (MQ=255)
gTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCgg > 2:3143444/1‑119 (MQ=255)
gTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCgat > 1:3143444/1‑149 (MQ=255)
ttttCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCgatgatga > 2:3143450/1‑150 (MQ=255)
ttttCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGAGCGCgatgat > 1:3143454/1‑148 (MQ=255)
tacGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCgatg < 2:3143110/142‑1 (MQ=255)
cGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCAGTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGGGCTGAGTATTTTCTgggg > 2:3143458/1‑132 (MQ=255)
ggTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGatcat < 1:3143092/149‑1 (MQ=255)
gTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCg < 1:3142775/150‑1 (MQ=255)
aaaCTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCggg > 1:3143466/1‑150 (MQ=255)
aaCTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATc < 1:3143021/131‑1 (MQ=255)
aaCTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACAGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACGTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCggg < 1:3142963/149‑1 (MQ=255)
aCTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTGCCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATcgc < 1:3143107/132‑1 (MQ=255)
cTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCtt > 1:3143472/1‑150 (MQ=255)
cTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCtt > 2:3143468/1‑150 (MQ=255)
tGGGTAATGAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTAAGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATGTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCg < 2:3142976/144‑1 (MQ=255)
tGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATcg < 2:3143116/129‑1 (MQ=255)
ggTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTgg < 1:3143363/149‑1 (MQ=255)
ggTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGt < 2:3142856/150‑1 (MQ=255)
gTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTa < 2:3143162/150‑1 (MQ=255)
aaTCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTGCCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTAt > 2:3143475/1‑149 (MQ=255)
cAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAg > 2:3143481/1‑150 (MQ=255)
aGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAgg > 1:3143486/1‑150 (MQ=255)
gTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGt > 1:3143490/1‑150 (MQ=255)
tATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGtt < 1:3143072/150‑1 (MQ=255)
gCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAATGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGGTGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTa > 2:3143495/1‑148 (MQ=255)
cGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAg > 1:3143499/1‑150 (MQ=255)
tCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGt > 2:3143504/1‑149 (MQ=255)
cTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTgc > 1:3143507/1‑150 (MQ=255)
tGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCg < 2:3142947/125‑1 (MQ=255)
gCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTgctg > 1:3143513/1‑150 (MQ=255)
cGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTgctg < 1:3143083/149‑1 (MQ=255)
cGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTgctg < 1:3143041/149‑1 (MQ=255)
cGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTgctg < 1:3143203/149‑1 (MQ=255)
cGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTgctg < 1:3142838/149‑1 (MQ=255)
cGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTgct < 1:3143137/148‑1 (MQ=255)
cGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGCTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGAGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCACGATGATGATCATCGGGATTGGTATGCAGGTTAAAGTgctg > 2:3143514/1‑149 (MQ=255)
cGTTGGGGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTAtttt < 2:3142570/97‑1 (MQ=255)
ggTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTgctggcgct > 1:3143523/1‑150 (MQ=255)
tGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTgctggcgctg > 2:3143522/1‑149 (MQ=255)
gAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAg < 2:3143211/137‑1 (MQ=255)
tACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTGCTGGCGCTGGCAc < 1:3143257/149‑1 (MQ=255)
cGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCt < 2:3143272/115‑1 (MQ=255)
cGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTGCTGGCGCTGGCAc > 2:3143528/1‑147 (MQ=255)
cGATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGGTAAAGTGCTGGCGCTGGCACCAGATg > 2:3143533/1‑150 (MQ=255)
gATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGCGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGt > 2:3143540/1‑123 (MQ=255)
gATTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTGCTGGCGCTGGCACCAGATGc > 1:3143538/1‑150 (MQ=255)
aTTGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTgctggcgctgg < 2:3142876/139‑1 (MQ=255)
tGCGCTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTggg < 2:3143100/83‑1 (MQ=255)
gcgcTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTGCTGGCGCTGGCACCAGATGCTAcc > 1:3143545/1‑150 (MQ=255)
gcgcTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTGCTGGCGCTGGCACCAGATGCTAc < 1:3142980/149‑1 (MQ=255)
gcTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATCGACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGCGATCGCGATGATGATCATCGCGCGTGGCATGCAGGTTAAAGTgctg < 2:3143082/127‑1 (MQ=255)
cTGTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTGCTGGCGCTGGCACCAGATGCTACCGAc < 1:3143002/150‑1 (MQ=255)
gTTGCTGGTGTACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTGCTGGCGCTGGCACCAGATGCTACCGACGt > 1:3143550/1‑150 (MQ=255)
gtgtACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTGCTGGCGCTGGCACCAGATGCTACCGACGTCGCGAt < 1:3142934/149‑1 (MQ=255)
gtgtACCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTGCTGGCGCTGGCACCAGATGCTACCGACGTCGCGATg < 1:3143190/150‑1 (MQ=255)
|
CATTGCGGGATTCAGCGCCAACTTTGCCACGGCATTACTGTTATTACTCGGTGGTGCGGGCATTATTGGCAGCGTGATTTTCGGTAAACTGGGTAATCAGTATGCGTCTGCGTTGGTGAGTACGGCGATTGCGCTGTTGCTGGTGTGCCTGGCATTGCTGTTACCTGCGGCGAACAGTGAAATACACCTCGGGGTGCTGAGTATTTTCTGGGGGATCGCGATGATGATCATCGGGCTTGGTATGCAGGTTAAAGTGCTGGCGCTGGCACCAGATGCTACCGACGTCGCGATGGC > NC_000913/1617741‑1618034
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
