Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F13 I1 R1
|
28 |
562.2 |
19051950 |
96.7% |
18423235 |
140.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,279,072 |
A→G |
V53V (GTA→GTG) |
kbaZ → |
tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 1 subunit KbaZ |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,279,072 | 0 | A | G | 99.1%
| 2225.1
/ 4.3
| 535 | V53V (GTA→GTG) | kbaZ | tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 1 subunit KbaZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/2); new base G (272/257); total (275/260) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 535 total aligned reads displayed.
ACAGAAATGGTGAGACAGCACAAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGG > NC_000913/3278926‑3279217
|
aGAAATGGTGAGACAGCACAAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGAc > 2:6389637/1‑148 (MQ=255)
aGAAATGGTGAGACAGCACAAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCa < 1:6389113/150‑1 (MQ=255)
gAAATGGTGAGACAGCACCAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAAGCAGGTGGACCAg < 2:6388698/150‑1 (MQ=255)
aaaTGGTGAGACAGCACAAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGt > 1:6389645/1‑150 (MQ=255)
aaTGGTGAGACAGCACAAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGtt < 1:6388923/150‑1 (MQ=255)
aaTGGTGAGACAGCACAAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGtt > 1:6389652/1‑150 (MQ=255)
aTGGTGAGACAGCACAAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTc < 1:6389623/150‑1 (MQ=255)
aTGGTGAGACAGCACAAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTc < 2:6388918/150‑1 (MQ=255)
aTGGTGAGACAGCACAAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTc > 2:6389651/1‑150 (MQ=255)
gTGAGACAGCACAAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTcggc < 1:6389249/150‑1 (MQ=255)
agaCAGCACAAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGt < 2:6389044/150‑1 (MQ=255)
agaCAGCACAAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGt > 1:6389664/1‑150 (MQ=255)
cAGCACAAAGCGGGCAGAACAAATGGCATTTATGCCGTTTGTTCGGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCGGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAAGCAGGTGGa > 2:6389667/1‑134 (MQ=255)
cAGCACAAAGCGGGCAAAACAANTGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTtat < 2:6389196/150‑1 (MQ=255)
cacaAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATAcc < 1:6388664/150‑1 (MQ=255)
acaAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCg < 2:6389293/150‑1 (MQ=255)
aaaGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCNACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCgg > 2:6389679/1‑149 (MQ=255)
aaaGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCgg > 1:6389680/1‑149 (MQ=255)
aaaGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGa < 2:6389327/150‑1 (MQ=255)
ggCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGAcg < 1:6389094/150‑1 (MQ=255)
ggCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGAcg > 1:6389690/1‑150 (MQ=255)
cAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGAcgcc > 1:6389696/1‑150 (MQ=255)
aaaCAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGAcgcccg > 2:6389697/1‑150 (MQ=255)
aCAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGAcgcccgcc < 1:6389256/150‑1 (MQ=255)
aCAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGAcgcccgc > 1:6389707/1‑149 (MQ=255)
aaTGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGAt > 1:6389715/1‑150 (MQ=255)
aTGGAATTTATGCCGTGTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGAtt < 2:6389272/150‑1 (MQ=255)
tGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGAttt > 2:6389719/1‑150 (MQ=255)
tGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGAttt < 1:6389177/150‑1 (MQ=255)
gAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTc < 2:6389066/150‑1 (MQ=255)
aTTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTcgc < 1:6389375/150‑1 (MQ=255)
ttATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCgg > 2:6389727/1‑150 (MQ=255)
tATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGAcgcccgcc > 2:6389736/1‑138 (MQ=255)
tATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGc > 1:6389734/1‑150 (MQ=255)
tGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCtt > 1:6389746/1‑150 (MQ=255)
ccGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCtttg < 1:6389029/150‑1 (MQ=255)
ccGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCtttg < 1:6389453/150‑1 (MQ=255)
gTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGtt > 2:6389753/1‑112 (MQ=255)
gTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCtttgtt > 1:6389752/1‑150 (MQ=255)
gTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTttgtttgt < 1:6389339/149‑1 (MQ=255)
ttCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTttgtttgt > 2:6389762/1‑148 (MQ=255)
ttCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTttgtttgt > 1:6389765/1‑148 (MQ=255)
ttCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCa < 1:6388892/150‑1 (MQ=255)
ttCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCa < 1:6389407/150‑1 (MQ=255)
ttCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCa < 1:6389207/150‑1 (MQ=255)
ccGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCgg > 2:6389770/1‑112 (MQ=255)
cGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGc < 1:6389308/149‑1 (MQ=255)
gCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTc > 1:6389777/1‑150 (MQ=255)
cacaTCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACTAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGa > 2:6389779/1‑124 (MQ=255)
acaTCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGc < 2:6389129/150‑1 (MQ=255)
aTCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGcc < 2:6388977/149‑1 (MQ=255)
tCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGa > 1:6389790/1‑150 (MQ=255)
ccGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACGAAACGACGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGAcgccc > 2:6389791/1‑114 (MQ=255)
cGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGa < 2:6389166/108‑1 (MQ=255)
cGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACt < 2:6389248/150‑1 (MQ=255)
gCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTc < 1:6389264/150‑1 (MQ=255)
gCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTc < 1:6389155/150‑1 (MQ=255)
cTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCg > 1:6389798/1‑150 (MQ=255)
tGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCg < 1:6389041/149‑1 (MQ=255)
ggTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGtt > 2:6389799/1‑150 (MQ=255)
ttGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGCGCAAACCAAACGCCGTTANTGATTTAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTc < 2:6389471/145‑1 (MQ=255)
gTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGtt < 2:6389709/149‑1 (MQ=255)
tGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAAtt > 1:6389808/1‑150 (MQ=255)
gAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGAAATGANGCCCGCCGATTTTCGCGGCtt > 2:6389808/1‑119 (MQ=255)
aGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTccc < 1:6389071/150‑1 (MQ=255)
cAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATNAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTCTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAg > 1:6389819/1‑149 (MQ=255)
cAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCa < 2:6389413/148‑1 (MQ=255)
cAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATGTc > 2:6389818/1‑143 (MQ=255)
tCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCCACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGAt < 1:6389431/149‑1 (MQ=255)
tCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATg > 1:6389827/1‑150 (MQ=255)
cGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGc > 2:6389829/1‑149 (MQ=255)
cGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGc < 1:6389494/149‑1 (MQ=255)
cGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGc < 2:6389148/149‑1 (MQ=255)
cGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTg < 2:6389084/148‑1 (MQ=255)
cGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGAt > 1:6389839/1‑150 (MQ=255)
cGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGAt < 1:6389134/150‑1 (MQ=255)
gCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCATTGAATTTCCCGCAGGAt > 2:6389841/1‑141 (MQ=255)
gTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTgg < 1:6389672/150‑1 (MQ=255)
gTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTgg < 1:6389273/150‑1 (MQ=255)
tGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTggg < 1:6389301/150‑1 (MQ=255)
gCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTTTACCGGCATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTggg < 2:6389103/149‑1 (MQ=255)
caaaccaaacGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGggtg > 1:6389849/1‑150 (MQ=255)
aaaccaaacGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGc > 2:6389853/1‑135 (MQ=255)
aaccaaacGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGggtggt < 1:6389195/150‑1 (MQ=255)
accaaacGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGggtggt > 1:6389858/1‑149 (MQ=255)
accaaacGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGgtggtg < 1:6388991/150‑1 (MQ=255)
cGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATc > 1:6389866/1‑150 (MQ=255)
gCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGCCTCGTTGATTTcccc > 2:6389866/1‑117 (MQ=38)
ttACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTgggg < 1:6389235/150‑1 (MQ=255)
cTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGcc > 1:6389877/1‑149 (MQ=255)
tGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGggt > 2:6389878/1‑131 (MQ=255)
atggaagaaACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTAAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATg < 2:6389353/112‑1 (MQ=255)
aGCAACCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTg > 1:6389887/1‑150 (MQ=255)
aaCCTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTgg > 2:6389890/1‑148 (MQ=255)
ccTCCAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCaa > 1:6389896/1‑149 (MQ=255)
cAATCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAAc < 1:6389536/148‑1 (MQ=255)
aaTCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCGAAACCTg > 2:6389906/1‑150 (MQ=255)
aaTCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAAc < 1:6389282/147‑1 (MQ=255)
aaTCAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTg > 1:6389906/1‑150 (MQ=255)
cAGGTGGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTgccg > 1:6389916/1‑150 (MQ=255)
|
ACAGAAATGGTGAGACAGCACAAAGCGGGCAAAACAAATGGAATTTATGCCGTTTGTTCCGCACATCCGCTGGTGCTGGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGG > NC_000913/3278926‑3279217
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
