Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F13 I1 R1
|
15 |
2083.3 |
68373553 |
99.6% |
68100058 |
141.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,297,592 |
A→G |
L177P (CTG→CCG) |
adhE ← |
aldehyde‑alcohol dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,297,592 | 0 | A | G | 99.3%
| 7878.6
/ 19.2
| 1890 | L177P (CTG→CCG) | adhE | aldehyde‑alcohol dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (5/9); new base G (951/921); total (956/934) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.94e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 1890 total aligned reads displayed.
TCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGTTACGGGTCTTC > NC_000913/1297445‑1297738
|
tCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATCGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGCGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGt > 1:9507972/1‑150 (MQ=255)
tCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGt < 1:9506380/150‑1 (MQ=255)
agcagTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGtt < 1:9506191/149‑1 (MQ=255)
cagTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCaa < 1:9507163/150‑1 (MQ=255)
cagTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCa > 2:9508012/1‑149 (MQ=255)
agTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCaa > 1:9508024/1‑149 (MQ=255)
ttCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCCTCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAg > 2:9508051/1‑149 (MQ=255)
cATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAg > 1:9508078/1‑150 (MQ=255)
aTCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAg > 2:9508093/1‑149 (MQ=255)
gATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGtt > 1:9508121/1‑149 (MQ=255)
aacaacTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGtt > 2:9508146/1‑134 (MQ=255)
acaacTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTgatc < 1:9505633/149‑1 (MQ=255)
acaacTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTgatc < 1:9507024/149‑1 (MQ=255)
caacTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTgatcga > 1:9508155/1‑150 (MQ=255)
cTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCCACAGAAGGtt > 2:9508190/1‑141 (MQ=255)
cTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTgatcgatc < 1:9506586/149‑1 (MQ=255)
cTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTgatcgatc > 1:9508187/1‑149 (MQ=255)
gAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGGGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCa < 2:9506637/148‑1 (MQ=255)
gAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAg < 2:9506822/149‑1 (MQ=255)
gtgtTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCg < 1:9506868/150‑1 (MQ=255)
gtTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGAt > 2:9508222/1‑150 (MQ=255)
tGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGAt > 1:9508235/1‑148 (MQ=255)
cccGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAg < 1:9505795/149‑1 (MQ=255)
ccGCCCCTACGCCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCGTGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTg < 2:9505842/130‑1 (MQ=255)
cgcgCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATc > 1:9508261/1‑150 (MQ=255)
cgcCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCtt > 2:9508275/1‑150 (MQ=255)
gcCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCttt > 1:9508293/1‑150 (MQ=255)
ccTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCCCCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCaa < 2:9506073/115‑1 (MQ=255)
cacCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGa > 1:9508328/1‑149 (MQ=255)
cacCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAg > 2:9508321/1‑150 (MQ=255)
acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGc < 2:9506157/150‑1 (MQ=255)
aTAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGc < 2:9506694/146‑1 (MQ=255)
tAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCgg > 1:9508367/1‑150 (MQ=255)
tAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCgg > 2:9508364/1‑150 (MQ=255)
tGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAg > 2:9508397/1‑149 (MQ=255)
ttACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGa > 1:9508417/1‑148 (MQ=255)
aCCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGa < 2:9506478/133‑1 (MQ=255)
cGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATagcag < 1:9506969/150‑1 (MQ=255)
cGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATagcag > 1:9508451/1‑150 (MQ=255)
aGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCCGCCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCg < 2:9506236/113‑1 (MQ=255)
aGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCt > 2:9508473/1‑150 (MQ=255)
tGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGa < 2:9506926/111‑1 (MQ=255)
tGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTg > 1:9508493/1‑148 (MQ=255)
tGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAAc < 1:9505276/150‑1 (MQ=255)
gCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAAc > 1:9508521/1‑149 (MQ=255)
gCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAAc > 2:9508521/1‑149 (MQ=255)
gCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGata < 1:9506308/150‑1 (MQ=255)
tttAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGTTCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCAcc > 2:9508555/1‑120 (MQ=255)
tAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCg < 1:9506702/119‑1 (MQ=255)
tAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATc < 2:9507365/148‑1 (MQ=255)
aaCCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGc > 1:9508569/1‑150 (MQ=255)
aTGCGCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACCGTTCAACAGAAGGt < 2:9505696/78‑1 (MQ=255)
aTGCCCGGGCCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGGTgat < 2:9506352/82‑1 (MQ=255)
aTGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCt > 2:9508590/1‑150 (MQ=255)
tGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCtt < 1:9506753/150‑1 (MQ=255)
gCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCttt > 1:9508607/1‑150 (MQ=255)
cGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTttgtt < 1:9507659/150‑1 (MQ=255)
cGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGATGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTgatcgat > 2:9508631/1‑81 (MQ=255)
cGGACCACCAGCCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAAc < 2:9507010/132‑1 (MQ=255)
gACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTtgg < 1:9506801/150‑1 (MQ=255)
gACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTtgg < 1:9506923/150‑1 (MQ=255)
accaccAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCa < 2:9507180/103‑1 (MQ=255)
accaccAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTtggt > 1:9508644/1‑150 (MQ=255)
caGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACCGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCCGCGATAGCAGCCTGCAGAACGa > 2:9508673/1‑126 (MQ=255)
caGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAAc < 2:9506303/124‑1 (MQ=255)
caGTCGCGAGGAGCAGGTTGATGTCTGTGGGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGc < 1:9506116/148‑1 (MQ=255)
cgTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGcc < 2:9505430/77‑1 (MQ=255)
aGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGGGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGatat < 1:9505900/128‑1 (MQ=255)
gccgcgAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTGAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATc < 2:9506409/79‑1 (MQ=255)
gTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCt < 1:9506512/150‑1 (MQ=255)
gTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCt > 1:9508680/1‑150 (MQ=255)
gTCGCGAGGATCAGGTTGAGGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGc < 2:9505987/95‑1 (MQ=255)
tCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCtt < 1:9506031/150‑1 (MQ=255)
cgAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGGTGGTGGCATCtttt > 2:9508710/1‑149 (MQ=255)
gAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCa < 2:9507090/142‑1 (MQ=255)
gAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTg > 1:9508716/1‑149 (MQ=255)
aTCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCCGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCttt > 2:9508750/1‑143 (MQ=255)
tCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCAcgcg > 1:9508755/1‑150 (MQ=255)
cAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCAcgcg < 2:9507847/149‑1 (MQ=255)
aGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCggg < 1:9503757/150‑1 (MQ=255)
ttGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGc > 2:9508779/1‑150 (MQ=255)
aTGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCggg < 1:9506637/150‑1 (MQ=255)
tGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCggg > 1:9508802/1‑149 (MQ=255)
cTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATATTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCACCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGgag > 2:9508816/1‑149 (MQ=255)
gggTGGTGCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGgag > 1:9508834/1‑147 (MQ=255)
gtggtgCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCAt > 2:9508849/1‑122 (MQ=255)
gtggtgCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGAt < 1:9507109/150‑1 (MQ=255)
gtgCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATaa < 1:9507482/149‑1 (MQ=255)
tgCATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATc < 2:9506570/98‑1 (MQ=255)
cATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATgg < 1:9507242/149‑1 (MQ=255)
cATCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGc > 2:9508874/1‑150 (MQ=255)
aTCAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCg > 1:9508887/1‑150 (MQ=255)
cAGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTtggt > 2:9508912/1‑108 (MQ=255)
aGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGtt < 1:9507326/149‑1 (MQ=255)
aGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGTTa > 1:9508921/1‑150 (MQ=255)
aGTGCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGTTa < 1:9506452/150‑1 (MQ=255)
ggCGTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGAGCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTg < 2:9507507/115‑1 (MQ=255)
gTTAGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGTTACggg > 2:9508949/1‑149 (MQ=255)
aGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGTTACGGGTCtt > 1:9508970/1‑150 (MQ=255)
aGACGGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGTTACGGGTCt < 2:9508434/149‑1 (MQ=255)
|
TCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGTTACGGGTCTTC > NC_000913/1297445‑1297738
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
