Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I51 R1
|
223 |
69.9 |
1534784 |
95.1% |
1459579 |
214.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
570,560 |
A→C |
intergenic (+132/‑333) |
ybcK → / → ybcL |
DLP12 prophage; putative recombinase/inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; UPF0098 family secreted protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 570,560 | 0 | A | C | 100.0%
| 178.6
/ NA
| 51 | intergenic (+132/‑333) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; UPF0098 family secreted protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (23/28); total (23/28) |
TTTAAACACTATCCTTTAATGAAAGTAATATCCGCCCAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGG > NC_000913/570339‑570789
|
tttAAACACTATCCTTTAATGAAAGTAATATCCGCCCAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCtata < 2:211312/236‑1 (MQ=255)
tttAAACACTATCCTTTAATGAAAGTAATATCCGCCCAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCtata < 1:99537/236‑1 (MQ=255)
cTATCCTTTAATGAAAGTAATATCCGCCCAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCt > 1:677354/1‑234 (MQ=255)
tATCCTTTAATGAAAGTAATATCCGCCCAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTaa > 2:408461/1‑236 (MQ=255)
aTCCTTTAATGAAAGTAATATCCGCCCAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAAt > 2:14049/1‑236 (MQ=255)
ccTTTAATGAAAGTAATATCCGCCCAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCa < 2:344653/236‑1 (MQ=255)
aaGTAATATCCGGCCAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGt < 2:590982/236‑1 (MQ=255)
aaGTAATAGCCGACCAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGt < 2:135474/236‑1 (MQ=255)
aGTAATATCCGCCCAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAAt < 2:521353/223‑1 (MQ=255)
aGTAATATCCGCCCAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAAt > 1:521353/1‑223 (MQ=255)
gtCCGACTAGCAGGCGATAAGTACTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGaa < 2:761352/233‑1 (MQ=255)
gCCCAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCtata > 1:166684/1‑203 (MQ=255)
gCCCAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCtata < 2:166684/203‑1 (MQ=255)
ccAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAATTAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTTTACAATCTTAATCATTTGTTAGTGGGGAACTCTTGGt > 2:699005/1‑236 (MQ=255)
gTGCTCTCTAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATa < 2:8665/236‑1 (MQ=255)
gTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATa < 1:634843/236‑1 (MQ=255)
tatGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTg > 1:613438/1‑236 (MQ=255)
ttGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCtata < 2:232646/169‑1 (MQ=255)
ttGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCtata > 1:232646/1‑169 (MQ=255)
ttGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGt > 2:65930/1‑186 (MQ=255)
ttGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGt < 1:65930/186‑1 (MQ=255)
gaTTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAg > 1:537179/1‑236 (MQ=255)
atttCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCaaa < 1:14049/235‑1 (MQ=255)
aTAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTaa > 1:570618/1‑102 (MQ=255)
aTAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTaa < 2:570618/102‑1 (MQ=255)
aTAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAac > 1:209389/1‑236 (MQ=255)
aGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCg < 2:209389/236‑1 (MQ=255)
cAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCa > 1:502030/1‑116 (MQ=255)
cAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCa < 2:502030/116‑1 (MQ=255)
aGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGAc < 1:699005/232‑1 (MQ=255)
aattaattATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCAc < 2:165169/191‑1 (MQ=255)
aattaattATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCAc > 1:165169/1‑191 (MQ=255)
aattaattATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGgt > 1:630249/1‑236 (MQ=255)
aattaTCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGgtg < 1:408461/233‑1 (MQ=255)
tttGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaataa > 1:139834/1‑236 (MQ=255)
ttGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaataat > 2:287066/1‑236 (MQ=255)
tGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaatatta > 2:293275/1‑236 (MQ=255)
aaCTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCag > 2:494363/1‑236 (MQ=255)
ttACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAg < 2:630249/235‑1 (MQ=255)
tgtttgCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAAt < 2:537179/236‑1 (MQ=255)
ttttGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCag < 2:509027/196‑1 (MQ=255)
ttttGTACGGCTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCag > 1:509027/1‑196 (MQ=255)
cTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGtt > 2:504232/1‑170 (MQ=255)
cTGTATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGtt < 1:504232/170‑1 (MQ=255)
tATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGgt > 2:293467/1‑110 (MQ=255)
tATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGgt < 1:293467/110‑1 (MQ=255)
tATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATgg < 2:11374/132‑1 (MQ=255)
tATTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATgg > 1:11374/1‑132 (MQ=255)
aTTGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAttgggt < 1:293275/235‑1 (MQ=255)
ttGGGGTCGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAttgggtt < 2:613438/235‑1 (MQ=255)
ggggTCGTAAATGAGCTATTCAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAttgggttgg < 2:677354/235‑1 (MQ=255)
|
TTTAAACACTATCCTTTAATGAAAGTAATATCCGCCCAGCAGGCGATAAGTGCTCTCAAATATATGGTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGACGAAACTTAATGGGTAATTACTTTGTTTGCTCCCACAAGCGAGTTTTGTACGGCTGTATTGGGGTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGG > NC_000913/570339‑570789
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
