Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I51 R1
|
223 |
69.9 |
1534784 |
95.1% |
1459579 |
214.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,546,032 |
A→C |
intergenic (‑4/+256) |
yddL ← / ← yddG |
putative lipoprotein;putative membrane; Not classified; putative outer membrane porin protein/aromatic amino acid exporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,546,032 | 0 | A | C | 100.0%
| 196.5
/ NA
| 54 | intergenic (‑4/+256) | yddL/yddG | putative lipoprotein;putative membrane; Not classified; putative outer membrane porin protein/aromatic amino acid exporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (25/29); total (25/29) |
AGTGACCAAAACCAATCATTTGATCATTGATTTGCGTTTCTCCTTTAAAGCCGAGACGGGCATAAGTTTTATCACCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATT > NC_000913/1545800‑1546257
|
aGTGACCAAAACCAATCATTTGATCATTGATTTGCGTTTCTCCTTTAAAGCCGAGACGGGCATAAGTTTTATCACCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCa > 1:363689/1‑235 (MQ=255)
aGTGACCAAAACCAATCATTTGATCATTGATTTGCGTTTCTCCTTTAAAGCCGAGACGGGCATAAGTTTTATCACCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCa > 2:176210/1‑235 (MQ=255)
gTGACCAAAACCAATCATTTGATCATTGATTTGCGTTTCTCCTTTAAAGCCGAGACGGGCATAAGTTTTATCACCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGa < 2:46813/236‑1 (MQ=255)
tGACCAAAACCAATCATTTGATCATTGATTTGCGTTTCTCCTTTAAAGCCGAGACGGGCATAAGTTTTATCACCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAg > 1:324461/1‑234 (MQ=255)
cAATCATTTGATCATTGATTTGCGTTTCTCCTTTAAAGCCGAGACGGGCATAAGTTTTATCACCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTaa > 2:151675/1‑235 (MQ=255)
aaTCATTTGATCATTGATTTGCGTTTCTCCTTTAAAGCCGAGACGGGCATAAGTTTTATCACCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAAtt < 1:176210/236‑1 (MQ=255)
aTCATTTGATCATTGATTTGCGTTTCTCCTTTAAAGCCGAGACGGGCATAAGTTTTATCACCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTa > 1:748685/1‑236 (MQ=255)
ttGATCATTGATTTGCGTTTCTCCTTTAAAGCCGAGACGGGCATAAGTTTTATCACCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGt > 1:609230/1‑235 (MQ=255)
tGATCATTGATTTGCGTTTCTCCTTTAAAGCCGAGACGGGCATAAGTTTTATCCCCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTa < 2:727270/236‑1 (MQ=255)
tGATCATTGATTTGCGTTTCTCCTTTAAAGCCGAGACGGGCATAAGTTTTATCACCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTa < 1:191876/236‑1 (MQ=255)
ttGATTTCAGTTTCTCCTTGAAAGCCGAGACGGGCATAAGTTTTATCCCCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTa < 2:540359/236‑1 (MQ=255)
tttCTGCTTGAAAGCCGAAACGGGTATAAGTTTTATCACCATCGTCGAGGTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGTTAACCGTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCGGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAAc < 2:65042/236‑1 (MQ=255)
aTAAGTTTTATCACCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATaa < 2:748685/236‑1 (MQ=255)
aaGTTTTATCACCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTtat < 1:403193/232‑1 (MQ=255)
aTCACCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATa < 2:609230/235‑1 (MQ=255)
aTCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGtttt > 1:555842/1‑236 (MQ=255)
gCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAg > 2:91990/1‑236 (MQ=255)
cTTAACATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGa < 2:669464/236‑1 (MQ=255)
atcatcAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGc < 1:22460/198‑1 (MQ=255)
atcatcAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGc > 2:22460/1‑198 (MQ=255)
atcatcAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTACAATAGAATg > 1:657312/1‑236 (MQ=255)
atcatcAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAg > 2:362561/1‑232 (MQ=255)
tcatcaGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATgg < 1:151675/236‑1 (MQ=255)
tcatcaGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATgg < 2:363689/236‑1 (MQ=255)
tcatcaGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATgg < 1:91990/236‑1 (MQ=255)
cGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATaa > 2:571577/1‑193 (MQ=255)
cGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATaa < 1:571577/193‑1 (MQ=255)
tAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATgag > 2:217696/1‑236 (MQ=255)
tAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATgg < 1:330769/211‑1 (MQ=255)
tAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATgg > 2:330769/1‑211 (MQ=255)
gCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAaat > 2:186045/1‑236 (MQ=255)
aTAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGaaa < 1:362561/232‑1 (MQ=255)
cGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATAttattta > 1:766989/1‑236 (MQ=255)
aGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATAttatttat < 2:555842/235‑1 (MQ=255)
aTCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATc > 1:334312/1‑236 (MQ=255)
aGACTTCGGCAGCTTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAAt < 2:324461/236‑1 (MQ=255)
aGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAAt < 1:203360/236‑1 (MQ=255)
ttCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATgaga > 1:157613/1‑236 (MQ=255)
cGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGaaa > 2:452436/1‑194 (MQ=255)
cGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGaaa < 1:452436/194‑1 (MQ=255)
cGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGata > 1:390920/1‑236 (MQ=255)
cGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGata > 1:707088/1‑236 (MQ=255)
gcagctgttgCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGAtata < 2:636253/228‑1 (MQ=255)
gCAGCTTGGGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTAAAACCAACGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGAtata < 2:390920/236‑1 (MQ=255)
cGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATgag < 2:353962/174‑1 (MQ=255)
cGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATgag > 1:353962/1‑174 (MQ=255)
gCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGAAtt > 2:324108/1‑236 (MQ=255)
aaaCCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAattta < 1:217696/236‑1 (MQ=255)
ttACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTAttttttt > 1:482591/1‑236 (MQ=255)
aaCCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAata < 2:766989/236‑1 (MQ=255)
tacGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGt < 2:429523/234‑1 (MQ=255)
cGCAACTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCg > 1:329053/1‑236 (MQ=255)
aaCTATTTTTAATTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGaa < 1:283016/236‑1 (MQ=255)
aTTTCATTTACCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGATGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGAtt < 2:707088/236‑1 (MQ=255)
|
AGTGACCAAAACCAATCATTTGATCATTGATTTGCGTTTCTCCTTTAAAGCCGAGACGGGCATAAGTTTTATCACCATCGTCACGCTTATCATCAGTAAAATAACGTAGAGCGGTAACCTTGCCATAAAGGTCGAGTTTATTACCATCCTTGTTATAGACTTCGGCAGCGTGTGCTACGTTCGCAGCTAACAAACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATT > NC_000913/1545800‑1546257
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
