Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I51 R1
|
223 |
69.9 |
1534784 |
95.1% |
1459579 |
214.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,575,705 |
T→G |
N639H (AAC→CAC) |
yddB ← |
putative TonB‑dependent outer membrane receptor |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,575,705 | 0 | T | G | 100.0%
| 151.8
/ NA
| 45 | N639H (AAC→CAC) | yddB | putative TonB‑dependent outer membrane receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (21/24); total (21/24) |
GCTGATGTATTGCGCATTTGTCTTACCAAGGATAATGCGAGCTTTACGCGCTTCTTGCCAGGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTTTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTCGCGCTGTCGGTACGACTGCTTTTGCTGATTTGATCATGCGCTTCACGGTAAACATAGTTTGCACGCGCAAT > NC_000913/1575475‑1575936
|
gCTGATGTATTGACCATTTATCTTACATAGGATATGGCAAGCTTTACGCGATTCATGCCAGGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACg < 2:47165/236‑1 (MQ=255)
gcgcATTTGTCTTACCAAGGATAATGCGAGCTTTACGCGCTTCTTGCCAGGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGccc < 1:68674/236‑1 (MQ=255)
cgcATTTGTCTTACCAAGGATAATGCGAGCTTTACGCGCTTCTTGCCAGGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGTTTTCCTCATAACCATTGTGTACCGACAAGTTGcc > 2:175627/1‑234 (MQ=255)
cgcATTTGTCTTACCAAGGATAATGCGAGCTTTACGCGCTTCTTGCCAGGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGcc > 1:153656/1‑234 (MQ=255)
cgcATTTGTCTTACCAAGGATAATGCGAGCTTTACGCGCTTCTTGCCAGGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGcc > 1:251987/1‑234 (MQ=255)
cgcATTTGTCTTACCAAGGATAATGCGAGCTTTACGCGCTTCTTGCCAGGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGAATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCt > 1:42179/1‑236 (MQ=255)
cATTTGTCTTACCAAGGATAATGCGAGCTTTACGCGCTTCTTGCCAGGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGt > 2:719690/1‑228 (MQ=255)
aTTTGTCTTACCAAGGATAATGCGAGCTTTACGCGCTTCTTGCCAGGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGc < 2:251987/236‑1 (MQ=255)
aTGCGAGCTTTACGCGCTTCTTGCCAGGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGAc > 1:408785/1‑236 (MQ=255)
tGCGAGCTTTACGCGCTTCTTGCCAGGCCAGCGTATTCGCACACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACa < 1:175627/236‑1 (MQ=255)
cTTTACGCGCTTCTTGCCAGGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTtg < 2:153656/235‑1 (MQ=255)
cTTTACGCGCTTCTTGCCAGGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTtg < 1:478267/235‑1 (MQ=255)
cTTTACGCGCTTCTTGCCAGGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTtg < 1:719690/235‑1 (MQ=255)
cTTGACGCGCTTCTTGCCAGGACAGCGTATTCGCCCACGCTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTtg < 2:668757/235‑1 (MQ=255)
cggcattcttGCCATGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGATCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGt < 2:583812/230‑1 (MQ=255)
cGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACTATAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGatat > 2:454940/1‑236 (MQ=255)
aCCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAACGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGCTCTGCATGGGTTCGGCCAGt > 1:539092/1‑236 (MQ=255)
cTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTc > 2:736319/1‑233 (MQ=255)
tttAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCa > 1:224096/1‑193 (MQ=255)
tttAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCa < 2:224096/193‑1 (MQ=255)
ttagtaAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTtata < 2:178919/236‑1 (MQ=255)
aTCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAGTTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTaa > 1:24203/1‑236 (MQ=255)
cTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAGTTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAAtg < 2:24203/236‑1 (MQ=255)
ccACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAAtggtg > 1:236508/1‑236 (MQ=255)
ccACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGCAAtggtg > 1:527628/1‑236 (MQ=255)
cTATCGTAAGAGCCCAGATTACCGTTATAACCCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTcg < 2:42179/235‑1 (MQ=255)
tATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTcgcg < 1:736319/236‑1 (MQ=255)
ccAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTtgt > 2:702625/1‑107 (MQ=255)
ccAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTtgt < 1:702625/107‑1 (MQ=255)
aTTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTtata > 1:424865/1‑195 (MQ=255)
aTTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTtata < 2:424865/195‑1 (MQ=255)
ttATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTtata < 2:469584/188‑1 (MQ=255)
ttATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTtata > 1:469584/1‑188 (MQ=255)
ccaccTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTCGCGCTGTCGGTACGACTGCTTTTGCTGATTTGa > 1:407643/1‑236 (MQ=255)
tATCAACGGTATGGCTCACAGAATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTGGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGGGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTCGCGCTGTCGGTACGACTGCTTTTGCTGATTTGATCATGCGCt < 2:408785/236‑1 (MQ=255)
aCCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTCGCGCTGTCGGTACGACTGCTTTTGCTGATTTGATCATGCGCTTCAc < 1:454940/236‑1 (MQ=255)
aCCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTGGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTCGCGCTGTCGGTACGACTGCTTTTGCTGATTTGATCATGCGCTTCAc < 1:636768/236‑1 (MQ=255)
ctcctcATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTCGCGCTGTCGGTACGACTGCTTTTGCTGATTTGATCATGCGCTTCACGGTAAACATAg > 1:79797/1‑235 (MQ=255)
ctcATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTCGCGCTGTCGGTACGACTGCTTTTg < 1:269638/199‑1 (MQ=255)
ctcATAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTCGCGCTGTCGGTACGACTGCTTTTg > 2:269638/1‑199 (MQ=255)
tAACCATTTGGTAACGAAAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTCGCGCTGTCGGTACGACTGCTTTTGCTGATTTGATCATGCGCTTCACGGTAAACATAGTTTGCAcg < 2:527628/236‑1 (MQ=255)
tAACCATTGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTCGCGCTGTCGGTACGACTGCTTTTGCTGATTTGATCATGCGCTTCACGGTAAACATAGTTTGCAcg < 2:236508/236‑1 (MQ=255)
ttGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTCGCGCt < 2:310877/170‑1 (MQ=255)
ttGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTCGCGCt > 1:310877/1‑170 (MQ=255)
ttGTGTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTCGCGCTGTCGGTACGACTGCTTTTGCTGATTTGATCATGCGCTTCACGGTAAACATAGTTTGCACTCGCAAt > 1:669524/1‑236 (MQ=255)
|
GCTGATGTATTGCGCATTTGTCTTACCAAGGATAATGCGAGCTTTACGCGCTTCTTGCCAGGCCAGCGTATTCGCCCACACTAACCCGCTCGGTTGATGCGTGAAATCCATGTTTAAGGAGATCTTTAATGGGTTATTAAAATCTGCCACTGGAACGCTATCGTAAGAGACCAGATTACCGTTATAAACCACCTGGTTATCACCGGTATTGCTCTCCTCATAACCATTGTTTAACGACAAGTTGCCCTTGCTCTTGATATAGCTAAAGACAATTTGTGGGTTAATATCTACCTGGCGGATATGCAGGGGTTCGGCCAGTTCAAAACTGAGGCTGAACGAATGCGTTTTGGTTTTGCCATCGTTGTTATATTCAGTAATGGTGGTTTTAGTCGCGCTGTCGGTACGACTGCTTTTGCTGATTTGATCATGCGCTTCACGGTAAACATAGTTTGCACGCGCAAT > NC_000913/1575475‑1575936
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
