Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I51 R1
|
223 |
69.9 |
1534784 |
95.1% |
1459579 |
214.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,273,796 |
A→C |
D478A (GAC→GCC) |
yejA → |
microcin C ABC transporter periplasmic binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,273,796 | 0 | A | C | 98.3%
| 191.0
/ ‑3.5
| 59 | D478A (GAC→GCC) | yejA | microcin C ABC transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base C (29/29); total (29/30) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.91e-01 |
TGACAACCTGTTAAAAGCCGACAAACTTCTCAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGACTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGATCGCGTATTAACGTGGAATTATTACATGCTGCCA > NC_000913/2273563‑2274028
|
tGACAACCTGTTAAAAGCCGACAAACTTCTCAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCt > 1:353160/1‑236 (MQ=255)
tGACAACCTGTTAAAAGCCGACAAACTTCTCAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGCGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAGCATGGCCATTCGCAAGGTGGATCACTCGGAAATCACTCACCGCATACGCACACGCGCCt > 2:486524/1‑236 (MQ=255)
aCAACCTGTTAAAAGCCGACAAACTTCTCAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGCTAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTAt > 1:234258/1‑236 (MQ=255)
aaaaGCCGACACACTTCGCAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGc < 1:736115/236‑1 (MQ=255)
ttCTCAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATg < 1:504758/213‑1 (MQ=255)
ctcAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATggcg > 1:758373/1‑233 (MQ=255)
aaCGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATCACTCGCAAATCACTAACCGCATTCGCAGTCGCGCCTATGACATGATTACGCGCGGATTGCGGTCGAt > 2:39321/1‑236 (MQ=255)
cGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTa < 2:756830/204‑1 (MQ=255)
cGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTa > 1:756830/1‑204 (MQ=255)
aaGCGGGCTGGGTGCTTAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCg < 1:521874/236‑1 (MQ=255)
aaGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCg < 2:331384/236‑1 (MQ=255)
cGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCg < 2:353160/233‑1 (MQ=255)
gAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGAtt < 1:429285/236‑1 (MQ=255)
tCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTa > 1:448868/1‑180 (MQ=255)
tCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTa < 2:448868/180‑1 (MQ=255)
tCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGGCATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGCttttaac > 1:4004/1‑231 (MQ=255)
aGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGCTGCCGGGGCCCAGTTCCCACTTTCAgc > 2:654449/1‑233 (MQ=255)
cgcgTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTg < 2:625726/236‑1 (MQ=255)
gcgTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGGGATGGCGTGGTCCAGGTTCGCATTACAGATATcacgg > 2:232462/1‑232 (MQ=255)
gcgTTAATGCCACAACGGGTAAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTg < 1:323479/235‑1 (MQ=255)
tCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAAtt < 1:654449/236‑1 (MQ=255)
tCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAAtt > 1:480113/1‑228 (MQ=255)
tCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTtat < 2:758373/236‑1 (MQ=255)
tCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCAGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAAtt < 2:480113/228‑1 (MQ=255)
caaTTAGTGCTTCCCTCAAGCAGCAAGAGTCAGTGGGTACTCCCGTTCAAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACAGTATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATaa < 2:203505/229‑1 (MQ=255)
ttGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGCTTTTCACATTTCCTGTTG‑ATCGGCATATATCAATTCCCCTTATAATTCACCCGGCgg > 2:627893/1‑235 (MQ=255)
ttGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGaa < 2:575026/204‑1 (MQ=255)
ttGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGGTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGaa > 1:575026/1‑204 (MQ=255)
tCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGGGGGCCAGGTCCGGTTTTCAGAGTTCCTTGTCAATCGGAATATATCAATTACCCTACAAATGCCCCCGGGT‑TGCa > 2:675387/1‑235 (MQ=255)
cGCAAGCAGCAATAGGCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGcc < 1:627893/236‑1 (MQ=255)
aTAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCCGTTCCGACTTACAGATTTTCTGGTC‑ATCGGAGAATATCAATTCCACTTATCATGCCCCCAGCGCTGCAAAACCCgtctatgg > 2:499755/1‑228 (MQ=255)
tCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCC‑CGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTTCGATTTACa > 2:379354/1‑161 (MQ=255)
tCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCC‑CGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACa < 1:379354/161‑1 (MQ=255)
tATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGACTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTg < 1:67900/230‑1 (MQ=255)
aTTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGGC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCCGCG‑TGCAAAGCCCGGCTATCGACTCGCTGATCAccc > 1:454789/1‑236 (MQ=255)
ttGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCa > 1:336794/1‑236 (MQ=255)
ttGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGGGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGAATCGCTGATCAACCa > 1:422824/1‑236 (MQ=255)
ccTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACANNATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAACATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑gg > 1:58765/1‑236 (MQ=255)
aaCATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGGATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGGTTTCGACTCGCTGATTCACCTAATTCTTTCCGCGCAGGGGAATTCAAGAAAATTTat > 2:745882/1‑235 (MQ=255)
aCATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑GGCAAAGCCCGGTTTTCGACTCGCTGCTCAACCAAATTATTGCCGCGCC‑GGGAAATAAAGAAAAATTACtt > 2:220670/1‑235 (MQ=255)
cGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACt < 2:685711/175‑1 (MQ=255)
cGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACt > 1:685711/1‑175 (MQ=255)
cGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGc < 1:675387/235‑1 (MQ=255)
aaGGTAGATAGCGCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCTTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGc < 2:287399/232‑1 (MQ=255)
gATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCCGGTCCGATTTAAAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAAAAAATAAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGTAAAGGCCGGGTTTACAACCGCTGGTCAACCCAATTATGTCACCGCC‑GGGGATAAAAGAAACATTACGTACGTTgggggtgagcccgga > 2:61046/1‑225 (MQ=255)
caaCTCGCAACTCACTAACCTGATGCCAAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTNNNNNGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGa < 2:58765/233‑1 (MQ=255)
gCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑At > 1:434747/1‑101 (MQ=255)
gCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑At < 2:434747/101‑1 (MQ=255)
tCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGTCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGATCGCGTATTAACg < 1:61046/236‑1 (MQ=255)
tCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGATCGCGTATTAACg < 1:499755/236‑1 (MQ=255)
tCACTAACCGAATGAGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGATCGCGTATTAACg < 1:745882/236‑1 (MQ=255)
cACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGATCGCGTATTAACGt < 1:133455/236‑1 (MQ=255)
cTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGc > 2:614080/1‑128 (MQ=255)
cTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGc < 1:614080/128‑1 (MQ=255)
ccGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTc > 2:152186/1‑105 (MQ=255)
ccGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTc < 1:152186/105‑1 (MQ=255)
tGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCCGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGGC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCCCTGATCAACCAAATTATTGCCGCCGC‑GGGACATAAAGAAAAATAAATGCCGTTAGGGCGCGCACTGGAACGCGGATTAACCCGGAAttatta > 2:259968/1‑235 (MQ=255)
tGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATGTATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGATCGCGTATTAACGTGGAAttatta > 2:626465/1‑235 (MQ=255)
gcgcAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGATCGCGTATTAACGTGGAATTATTACa < 1:232462/236‑1 (MQ=255)
gcgcCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGATCGCGTATTAACGTGGAATTATTACATGCTGCCa < 1:220670/236‑1 (MQ=255)
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TGACAACCTGTTAAAAGCCGACAAACTTCTCAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGACTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGATCGCGTATTAACGTGGAATTATTACATGCTGCCA > NC_000913/2273563‑2274028
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
