Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
385,074 |
T→G |
intergenic (‑458/‑158) |
yaiS ← / → tauA |
putative PIG‑L family deacetylase/taurine ABC transporter periplasmic binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 385,074 | 0 | T | G | 96.2%
| 811.7
/ 9.0
| 236 | intergenic (‑458/‑158) | yaiS/tauA | putative PIG‑L family deacetylase/taurine ABC transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/6); new base G (120/107); total (123/113) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.17e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
ATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTC > NC_000913/384978‑385169
|
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ataGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTc > 1:3320128/1‑100 (MQ=255)
aGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTccc < 2:1132308/100‑1 (MQ=255)
gTTTTATTATCTGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTATTGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCa > 2:5064522/1‑100 (MQ=255)
gTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCa > 1:566153/1‑100 (MQ=255)
gTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCa > 1:3724913/1‑100 (MQ=255)
gTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCa > 2:396122/1‑100 (MQ=255)
ttttATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCaa > 2:2869829/1‑100 (MQ=255)
tattatATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTg > 2:3688424/1‑100 (MQ=255)
ttatATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGtt < 2:247712/100‑1 (MQ=255)
ttatATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGATCCCAATTgat < 2:5097423/100‑3 (MQ=255)
atatGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAg < 1:2711932/100‑1 (MQ=255)
atatGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAg > 1:3589855/1‑100 (MQ=255)
tatGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGa > 1:1770938/1‑100 (MQ=255)
atGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGaa > 2:2316502/1‑100 (MQ=255)
tGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAAc > 1:2227828/1‑100 (MQ=255)
gTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACg > 2:1814374/1‑100 (MQ=255)
tattgatattgaTAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACgg > 2:4986576/1‑100 (MQ=255)
gtatgatattgataGAAATTATGAAGTAATAATTCTCTTGATGTGGTTGTTTAGGCAGCAATAAAGTGAAGTGTAGTAATGTTCCCGCTTGTTCGATCgg < 2:3231228/97‑1 (MQ=255)
attgatattgatAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGa > 1:2994854/1‑100 (MQ=255)
tgatattgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGt < 1:187557/100‑1 (MQ=255)
tgatattgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGt < 2:4591250/100‑1 (MQ=255)
gatattgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTa > 1:275315/1‑100 (MQ=255)
atattgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTaa > 2:3063105/1‑100 (MQ=255)
attgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAAtt < 1:2654045/100‑1 (MQ=255)
ttgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTg < 1:3208346/100‑1 (MQ=255)
ttgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTg > 2:1613484/1‑100 (MQ=255)
tgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGc < 2:2928157/100‑1 (MQ=255)
tgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGc < 2:3461037/100‑1 (MQ=255)
gataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCa < 2:3584943/100‑1 (MQ=255)
gataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCa > 2:784862/1‑100 (MQ=255)
gataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCa < 1:5394828/100‑1 (MQ=255)
taGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCata > 1:988229/1‑100 (MQ=255)
gAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATAtt > 2:4031368/1‑100 (MQ=255)
gAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATAtt > 2:1919639/1‑100 (MQ=255)
gAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATAtt < 1:2898860/100‑1 (MQ=255)
gAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATAtt > 1:5503523/1‑100 (MQ=255)
gAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATAtt > 2:4443808/1‑100 (MQ=255)
gAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATAtt > 1:1411898/1‑100 (MQ=255)
gAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATAtt < 1:4513175/100‑1 (MQ=255)
aaaTAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATAttt < 1:5107568/100‑1 (MQ=255)
aaaTAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATAttt < 2:2054954/100‑1 (MQ=255)
aaaTAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATAttt < 2:1045491/100‑1 (MQ=255)
taatGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTaan < 1:502058/100‑2 (MQ=255)
taatGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAAt < 1:3445315/100‑1 (MQ=255)
aatGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATc > 1:3249526/1‑100 (MQ=255)
atGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTACCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCt < 2:4823257/100‑1 (MQ=255)
tGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCtt > 1:1668671/1‑100 (MQ=255)
tGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCtt > 2:4370728/1‑100 (MQ=255)
gAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCttt < 1:1353480/100‑1 (MQ=255)
gAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCttt > 1:739040/1‑100 (MQ=255)
gTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCt < 1:235594/100‑1 (MQ=255)
gTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCt < 2:5334098/100‑1 (MQ=255)
taataaATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCtt < 2:2687298/100‑1 (MQ=255)
taataaATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCtt > 1:4406854/1‑100 (MQ=255)
aataaATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTa < 1:400002/100‑1 (MQ=255)
ataaATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAg < 2:3163460/100‑1 (MQ=255)
taaATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGc > 2:5442347/1‑100 (MQ=255)
taaATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGc < 1:3802596/100‑1 (MQ=255)
taaATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGc > 1:4969577/1‑100 (MQ=255)
ntcGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGttt > 2:1373387/2‑100 (MQ=255)
ngTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGttttt > 1:4419984/2‑100 (MQ=255)
gTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGtttttt > 2:893800/1‑100 (MQ=255)
aaTGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTg < 2:718/100‑1 (MQ=255)
aaTGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTg < 1:4115610/100‑1 (MQ=255)
aTGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGc < 2:629649/100‑1 (MQ=255)
ggTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAg < 2:1404901/100‑1 (MQ=255)
ggTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAg < 1:692848/100‑1 (MQ=255)
ggTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAg < 2:1346819/100‑1 (MQ=255)
gttTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATa > 1:209983/1‑100 (MQ=255)
tttATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATaa > 1:3918095/1‑100 (MQ=255)
ttATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATaaa < 2:2797977/100‑1 (MQ=255)
tGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAatc > 2:1968303/1‑100 (MQ=255)
gCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAatca > 2:3311914/1‑100 (MQ=255)
gCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAatca > 1:2161234/1‑100 (MQ=255)
cATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAatcat > 2:4872915/1‑100 (MQ=255)
cATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAatcat > 2:2156338/1‑100 (MQ=255)
aTCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAatcatc > 2:1754272/1‑100 (MQ=255)
aTCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAatcatc > 1:1176278/1‑100 (MQ=255)
cACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTTCTTTTATTAAAATCATCtg > 2:68665/1‑100 (MQ=255)
cACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCtg < 1:5285694/100‑1 (MQ=255)
aCTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCtgt < 1:1305465/100‑1 (MQ=255)
aCTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCtgt > 1:3699155/1‑100 (MQ=255)
aCTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCtgt < 1:4606679/100‑1 (MQ=255)
cTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCtgtg > 1:2508999/1‑100 (MQ=255)
cTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCtgtg > 1:4834998/1‑100 (MQ=255)
tAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGc < 2:1318683/100‑1 (MQ=255)
aaaaTGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCg > 1:3785905/1‑100 (MQ=255)
aaaTGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGa < 2:2377826/100‑1 (MQ=255)
aaTGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGAt > 2:4084650/1‑100 (MQ=255)
aTGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATa < 1:1740138/100‑1 (MQ=255)
aTGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATa < 1:4791814/100‑1 (MQ=255)
aTGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATa < 1:1787751/100‑1 (MQ=255)
aTGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGAGATa > 2:4252074/1‑100 (MQ=255)
aaGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTTTTTAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACg > 2:2570280/1‑100 (MQ=255)
aaGTGTAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACg > 1:41995/1‑100 (MQ=255)
gtgtAGTAATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGAc < 1:1032207/100‑1 (MQ=255)
gtagtaATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTa > 1:522993/1‑100 (MQ=255)
tagtaATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGTTAATATTAAAATCATCTGTGCGATAACGACTaa > 2:3665174/1‑100 (MQ=255)
taATGTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTc < 2:5310499/100‑1 (MQ=255)
|
ATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTC > NC_000913/384978‑385169
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
