Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,393,051 |
T→G |
intergenic (‑10/+154) |
nuoM ← / ← nuoL |
NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit M/NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit L |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,393,051 | 0 | T | G | 97.6%
| 731.4
/ 2.6
| 210 | intergenic (‑10/+154) | nuoM/nuoL | NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit M/NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit L |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/3); new base G (98/107); total (100/110) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
CCAGCGTGGCACCTTGACGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTTATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCGGATGCACCGCG > NC_000913/2392952‑2393145
|
aGCGTGGCACCTTGACGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGAt < 1:92428/100‑1 (MQ=255)
gCGTGGCACCTTGACGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGAtt < 1:5399466/100‑1 (MQ=255)
gCGTGGCACCTTGACGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGAtt < 1:476191/100‑1 (MQ=255)
cGTGGCACCTTGACGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTc < 2:2044614/100‑1 (MQ=255)
tGGCACCTTGACGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCt < 1:3547585/100‑1 (MQ=255)
ggCACCTTGACGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCtt < 1:3255421/100‑1 (MQ=255)
gCACCTTGACGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCttn < 1:4451101/100‑2 (MQ=255)
gCACCTTGACGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTg < 1:736236/100‑1 (MQ=255)
cACCTTGACGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGt > 1:5306787/1‑100 (MQ=255)
cACCTTGACGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGt < 1:3114854/100‑1 (MQ=255)
cACCTTGACGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGt > 1:1359575/1‑100 (MQ=255)
cTTGACGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTaaa < 2:1532239/100‑1 (MQ=255)
aCGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTTATTCCTTGTAAAAGTc > 1:2615152/1‑100 (MQ=255)
aCGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTc < 2:674254/100‑1 (MQ=255)
cGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTcc > 2:5098756/1‑100 (MQ=255)
cGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTcc > 1:3037701/1‑100 (MQ=255)
cGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGCGAATTGATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTCGATTGCTGGTAAAAGTcg > 2:5124528/1‑99 (MQ=255)
gCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTccc < 2:1404464/100‑1 (MQ=255)
gCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTccc > 1:5047885/1‑100 (MQ=255)
ccAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCg > 1:2099828/1‑100 (MQ=255)
aaGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCa < 2:4216472/100‑1 (MQ=255)
gCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAgg < 2:130101/100‑1 (MQ=255)
gCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAgg > 2:2590368/1‑100 (MQ=255)
gTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGAc < 1:113333/100‑1 (MQ=255)
gTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGAc > 2:1229526/1‑100 (MQ=255)
gTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGAc > 2:4360714/1‑100 (MQ=255)
gTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATCCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGAc > 2:4480420/1‑100 (MQ=255)
tCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCg < 1:5081032/100‑1 (MQ=255)
tCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCg < 2:3663226/100‑1 (MQ=255)
gTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGAt < 1:2175403/100‑1 (MQ=255)
gTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAAAATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGAt < 2:579076/100‑1 (MQ=255)
tGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGAtttt < 1:4804907/100‑1 (MQ=255)
tGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGAtttt > 2:3318109/1‑100 (MQ=255)
tGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGGAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGAtttt > 2:2285307/1‑100 (MQ=255)
gCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTc > 2:3969655/1‑100 (MQ=255)
gCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTc > 1:4492001/1‑100 (MQ=255)
gCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTc < 1:1886969/100‑1 (MQ=255)
ccAGCACAGGAAGCCGCCAATAAATGGAATTAATATTAGCCAGGGTTGTAATATGGCGATCTTTATTTTTTTTATAAGTCCCTTCAGGATCGGATTTTCa < 2:2439530/100‑1 (MQ=255)
aGCACAGGAGGCGGCGAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAAc < 2:4145538/100‑1 (MQ=255)
aGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAAc > 1:3755612/1‑100 (MQ=255)
aGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAAc > 1:1795808/1‑100 (MQ=255)
gCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACg > 2:3724134/1‑100 (MQ=255)
caGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAAt < 1:2958731/100‑1 (MQ=255)
ggAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATtc > 1:617232/1‑100 (MQ=255)
ggAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATtc > 1:2435736/1‑100 (MQ=255)
aGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCa < 2:3487768/100‑1 (MQ=255)
gccgccAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCAc < 2:1170566/100‑1 (MQ=255)
gccgccAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCAc < 2:1803695/100‑1 (MQ=255)
ccgccAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACg > 2:1030569/1‑100 (MQ=255)
ccgccAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACg < 1:4928870/100‑1 (MQ=255)
ccgccAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACg < 2:4674681/100‑1 (MQ=255)
ccgccAATAAAGAGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCAcn < 2:4806192/100‑2 (MQ=255)
cgccCATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGACCCGTCAGCGACGGATTTTCAACGAATTCACACgc > 2:4643341/1‑99 (MQ=255)
gccAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGAc < 2:1557967/100‑1 (MQ=255)
ccAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACa < 2:2204673/100‑1 (MQ=255)
aaTAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGa > 1:3384361/1‑100 (MQ=255)
aaTAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGa > 2:2137593/1‑100 (MQ=255)
aTAAAGGGAATTAATATTAGTCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCATTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGACTTTTCAACGAATTCGCACGACAGaa > 2:324854/1‑100 (MQ=255)
aTAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGaa < 2:2488295/100‑1 (MQ=255)
aaGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAAt > 2:3567996/1‑100 (MQ=255)
gggAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATAGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAAtac > 2:4528263/1‑98 (MQ=255)
ggAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAATAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATtct < 1:5288136/100‑1 (MQ=255)
gAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATtctc < 1:3873237/100‑1 (MQ=255)
aTTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCtt > 1:4058637/1‑100 (MQ=255)
ttAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCATGACAGAAAATTCTCTTc < 1:2828530/100‑1 (MQ=255)
tAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCg < 1:1523271/100‑1 (MQ=255)
tAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGAGCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCg < 1:860078/100‑1 (MQ=255)
aaTATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCgg < 2:1341658/100‑1 (MQ=255)
aaTATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCgg < 2:2786116/100‑1 (MQ=255)
atatTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAACTTCTCTTCGGa > 2:4394741/1‑100 (MQ=255)
atatTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGa > 2:2675537/1‑100 (MQ=255)
atatTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGa > 1:673473/1‑100 (MQ=255)
tatTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGAc > 1:1159633/1‑100 (MQ=255)
tatTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGAc > 1:3931475/1‑100 (MQ=255)
tatTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTCTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAGTTCTCTTCGGAc < 2:5295640/100‑1 (MQ=255)
atTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACt > 2:3885536/1‑100 (MQ=255)
aGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTggg < 2:2022663/100‑1 (MQ=255)
aGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTggg < 2:2863647/100‑1 (MQ=255)
cAGGGTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAGAATTCTCTTCGGACTGGGGGt < 1:2565877/100‑1 (MQ=255)
gggTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAg < 2:1161349/100‑1 (MQ=255)
gggTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAg < 2:1797095/100‑1 (MQ=255)
gggTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAg > 1:1941656/1‑100 (MQ=255)
ggTAGTAACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAgt < 1:5189636/100‑1 (MQ=255)
gtagtaACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAgtg > 2:1727788/1‑100 (MQ=255)
gtagtaACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAgtg > 1:4194683/1‑100 (MQ=255)
gtaACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCg < 2:769922/100‑1 (MQ=255)
gtaACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCg < 1:1630896/100‑1 (MQ=255)
gtaACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCg > 1:553732/1‑100 (MQ=255)
gtaACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCg > 2:5381823/1‑100 (MQ=255)
gtaACATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCg > 1:4953077/1‑100 (MQ=255)
aCATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCGGAt < 2:853410/100‑1 (MQ=255)
aCATGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCGGAt > 1:3571664/1‑100 (MQ=255)
aTGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCGGATGc < 2:2089338/100‑1 (MQ=255)
tGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCGGATGCa > 1:5130717/1‑100 (MQ=255)
tGGCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCGGATGCa > 1:1308129/1‑100 (MQ=255)
ggCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACTAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCGGATGCAc < 2:4977882/100‑1 (MQ=255)
ggCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCGGATGCAc > 1:2469833/1‑100 (MQ=255)
gCGATCTTTATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCGGATGCAcc > 2:3381563/1‑100 (MQ=255)
gCGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCGGATGCAcc < 1:1019408/100‑1 (MQ=255)
cGATCTTGATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCGGATGCACcg > 1:4666903/1‑100 (MQ=255)
|
CCAGCGTGGCACCTTGACGCCAAAGCGTTCGGTCTGCCAGCACAGGAAGCCGCCAATAAAGGGAATTAATATTAGCCAGGGTAGTAACATGGCGATCTTTATTCCTTGTAAAAGTCCCGTCAGGACCGGATTTTCAACGAATTCTCACGACAGAAAATTCTCTTCGGACTGGGGGTAGTGTCGGATGCACCGCG > NC_000913/2392952‑2393145
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
