Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,411,354 |
A→C |
intergenic (‑2/+85) |
yfbS ← / ← yfbT |
putative transporter/sugar phosphatas |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,411,354 | 0 | A | C | 98.7%
| 799.5
/ ‑2.2
| 228 | intergenic (‑2/+85) | yfbS/yfbT | putative transporter/sugar phosphatas |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base C (102/122); total (104/124) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.94e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
AAACAAAGCGACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAA > NC_000913/2411257‑2411449
|
aacaaaGCGACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCtt > 2:207852/1‑100 (MQ=255)
aacaaaGCGACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCtt > 1:2972921/1‑100 (MQ=255)
aaaGCGACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATc < 1:4817301/100‑1 (MQ=255)
aGCGACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCt < 1:2625752/100‑1 (MQ=255)
gACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGt < 2:3769424/100‑1 (MQ=255)
aCCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGtt > 2:3862138/1‑100 (MQ=255)
ccGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTa < 2:5069779/100‑1 (MQ=255)
gcatgcatACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAAt > 2:4682568/1‑100 (MQ=255)
gCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAAt > 1:5417912/1‑100 (MQ=255)
gCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAAt < 1:2772864/100‑1 (MQ=255)
gCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAAt < 2:1413201/100‑1 (MQ=255)
tCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGa > 2:447463/1‑100 (MQ=255)
ccATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAg < 1:3488041/100‑1 (MQ=255)
cATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAgg < 1:3864937/100‑1 (MQ=255)
aTACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAggg < 2:2886291/100‑1 (MQ=255)
aTACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAggg < 1:2655092/100‑1 (MQ=255)
aTACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACAATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAggg < 2:3606518/100‑1 (MQ=255)
tACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAgggg < 2:3532830/100‑1 (MQ=255)
gCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGAt > 1:5379219/1‑100 (MQ=255)
gCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGAt < 1:2120334/100‑1 (MQ=255)
cACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATg < 2:5113730/100‑1 (MQ=255)
aCTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGa > 2:3906576/1‑100 (MQ=255)
aCTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGa < 1:1960512/100‑1 (MQ=255)
ctctGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGAc < 2:4177843/100‑1 (MQ=255)
ctctGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGAc > 2:1501242/1‑100 (MQ=255)
tctGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACt < 2:5332146/100‑1 (MQ=255)
ctGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACtt > 2:853443/1‑100 (MQ=255)
tGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTg > 1:3682/1‑100 (MQ=255)
cccGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGAt < 1:5026004/100‑1 (MQ=255)
cccGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGAt > 1:1344660/1‑100 (MQ=255)
cccGTCGCAAACAAGACGAGGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGAt < 1:2194116/100‑1 (MQ=255)
ccGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGAtt > 1:2861260/1‑100 (MQ=255)
cGCAAACAAGACGATGGCGACGGCGAGTAATGAAAGAACCGAAATCAGTTGTGCGTGCACATCTTAGCCTTGTTAATTGCGGGGGATGACTTGATTCTGc < 2:1031629/100‑1 (MQ=255)
cGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGc < 2:65794/100‑1 (MQ=255)
cGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGc < 1:2540078/100‑1 (MQ=255)
gCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGcc > 1:1967412/1‑100 (MQ=255)
gCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGcc > 1:3706215/1‑100 (MQ=255)
gCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGcc > 1:1210347/1‑100 (MQ=255)
gCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGcc < 2:4305866/100‑1 (MQ=255)
cAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCa > 2:3075670/1‑100 (MQ=255)
cAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCa < 2:257124/100‑1 (MQ=255)
cAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCa > 1:2726094/1‑100 (MQ=255)
aaaCAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCGATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCAt < 2:4977463/100‑1 (MQ=255)
aCAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATaa > 1:4929335/1‑100 (MQ=255)
cAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATaaa < 2:2918391/100‑1 (MQ=255)
aCGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAg < 1:4746479/100‑1 (MQ=255)
tGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGcccc < 1:1842561/100‑1 (MQ=255)
tGGCAAAGGTAAGTCATGCAAGAAACGAACTAAATTAACCGTTCACACTTTATAATTGTTAATTGTGGGGGATGATTTGATTTTGCCATAAAAAAGcccc > 2:1104214/1‑100 (MQ=255)
gCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTTAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCcga > 2:2284505/1‑100 (MQ=255)
gCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCcga > 2:2348560/1‑100 (MQ=255)
cAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCcgac > 1:1763484/1‑100 (MQ=255)
aaCGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCcgacg < 2:1836020/100‑1 (MQ=255)
cGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACgag > 2:5089633/1‑100 (MQ=255)
ccAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACg > 1:757599/1‑100 (MQ=255)
aGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTGATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACggg < 1:3840039/100‑1 (MQ=255)
gTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACgggg > 1:2221138/1‑100 (MQ=255)
tAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGc < 2:1743494/100‑1 (MQ=255)
aaTGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCATGTTCATTGAGGGGGATGACCTGATTCTGCCCTAAAAACGCCCCGACGAGACGGGGCt > 2:5228933/1‑100 (MQ=255)
aTGAAAGAACCCAAAGCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTa < 2:1991527/100‑1 (MQ=255)
tGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTaa > 1:3575914/1‑100 (MQ=255)
tGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTaa > 2:5482367/1‑100 (MQ=255)
gAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTaaa > 2:2176543/1‑100 (MQ=255)
aaaGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAAt > 1:1422094/1‑100 (MQ=255)
gAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCAt < 2:1592657/100‑1 (MQ=255)
gAACCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCAt < 1:1051016/100‑1 (MQ=255)
aaCCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATg < 1:1788090/100‑1 (MQ=255)
aCCCAAATCAATTCACCGTTCACACCTCATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGCGACGGGGCTAAATCATGa > 2:5463868/1‑100 (MQ=255)
cccAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGAt > 2:586493/1‑100 (MQ=255)
cccAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGAt > 1:2096388/1‑100 (MQ=255)
cccAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGAt < 2:711854/100‑1 (MQ=255)
cccAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGAt > 2:3279055/1‑100 (MQ=255)
accAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCGTGGTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGAt < 2:1268582/99‑1 (MQ=255)
ccAAATCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATc > 2:2977936/1‑100 (MQ=255)
aaaTCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAg > 1:925596/1‑100 (MQ=255)
aaTCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAGAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAgg > 2:5413336/1‑100 (MQ=255)
aaTCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAgg < 2:1928049/100‑1 (MQ=255)
aTCAATTCACCGTTCACACCTTCTCCTTGATAATTGAGGGGGATGACATGCTTCTGCCATAAAAAAGACCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGTTTAGgt > 2:5381770/1‑100 (MQ=255)
aTCAATTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGgt < 1:3304826/100‑1 (MQ=255)
aaTTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGtt > 1:303077/1‑100 (MQ=255)
aaTTCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGtt < 2:1194220/100‑1 (MQ=255)
ttCACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTc < 1:1520427/100‑1 (MQ=255)
tCACCGTTCACACCTTATCCATGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTCAATCATGATCAGGTGTTTCa > 1:4345867/1‑100 (MQ=255)
cACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCAc < 1:1116541/100‑1 (MQ=255)
cACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCAc < 1:3193655/100‑1 (MQ=255)
cACCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCAc > 2:434028/1‑100 (MQ=255)
cACCCTTCAAACCATAGCCTCGGTAATTGAGGGGGATGACTTGATCCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCAc < 2:3663467/100‑1 (MQ=255)
aCCGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACt > 1:4710088/1‑100 (MQ=255)
ccGTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTg < 1:5486681/100‑1 (MQ=255)
cGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGa > 1:449615/1‑100 (MQ=255)
gTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGaa < 2:5172356/100‑1 (MQ=255)
gTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGaa > 2:3921416/1‑100 (MQ=255)
gTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGaa > 1:1180428/1‑100 (MQ=255)
gTTCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGGTTCACTGaa > 2:3455430/1‑100 (MQ=255)
ttCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGaat < 1:419546/100‑1 (MQ=255)
ttCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGaat < 2:4850882/100‑1 (MQ=255)
ttCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGaat < 1:863098/100‑1 (MQ=255)
ttCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGaat < 2:402451/100‑1 (MQ=255)
ttCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGaat < 2:2699915/100‑1 (MQ=255)
tCACACCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGaata < 1:1493785/100‑1 (MQ=255)
cacaCCTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGaataa > 2:2450560/1‑100 (MQ=255)
|
AAACAAAGCGACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAA > NC_000913/2411257‑2411449
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
