Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,291,923 |
A→C |
I138L (ATC→CTC) |
nrfE → |
heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,291,923 | 0 | A | C | 99.5%
| 726.0
/ ‑4.2
| 201 | I138L (ATC→CTC) | nrfE | heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base C (92/108); total (92/109) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.12e-01 |
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
CCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGC > NC_000913/4291827‑4292017
|
ccGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCg < 1:4884372/100‑1 (MQ=255)
cGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGa > 1:2905350/1‑100 (MQ=255)
cTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAg > 2:863154/1‑100 (MQ=255)
cTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAg < 2:5314323/100‑1 (MQ=255)
tGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAgg < 1:3405487/100‑1 (MQ=255)
gACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGc < 1:1227576/100‑1 (MQ=255)
gACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGc < 1:1920844/100‑1 (MQ=255)
aGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCTCTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGAt < 1:543907/100‑1 (MQ=255)
aGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGAt < 2:2674183/100‑1 (MQ=255)
gCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGAtc < 1:1314697/100‑1 (MQ=255)
gCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGAtc > 1:606797/1‑100 (MQ=255)
ccGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGAtct > 1:4309510/1‑100 (MQ=255)
gTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCa < 2:2295352/100‑1 (MQ=255)
ttttATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCaa > 1:3474356/1‑100 (MQ=255)
ttATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATc < 2:582581/100‑1 (MQ=255)
ttATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATc < 2:3240014/100‑1 (MQ=255)
tgtctctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCGCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATcc < 2:5472859/98‑1 (MQ=255)
tATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATcc < 1:3757174/100‑1 (MQ=255)
tATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCAACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATcc > 1:5305189/1‑100 (MQ=255)
ctctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGGTCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAt > 2:1181203/1‑100 (MQ=255)
ctctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAt < 2:1494778/100‑1 (MQ=255)
ctctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCCTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAt < 1:1146837/100‑1 (MQ=255)
tctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtg > 2:5263144/1‑100 (MQ=255)
tctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtg < 1:2142103/100‑1 (MQ=255)
ctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtgc < 2:3123377/100‑1 (MQ=255)
ctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtgc > 1:1623099/1‑100 (MQ=255)
tcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtgct > 2:472031/1‑100 (MQ=255)
tcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtgct < 2:2998337/100‑1 (MQ=255)
tcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtgct > 1:1701724/1‑100 (MQ=255)
aTGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtgctgc > 1:3566478/1‑100 (MQ=255)
tGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCa > 1:10932/1‑100 (MQ=255)
gCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCaa > 2:4792986/1‑100 (MQ=255)
gCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCaa > 2:4271933/1‑100 (MQ=255)
cTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCaan < 1:1391879/100‑2 (MQ=255)
cTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAAc > 2:1715230/1‑100 (MQ=255)
cTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAAc > 2:4473795/1‑100 (MQ=255)
gccgcACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATc > 1:2293801/1‑100 (MQ=255)
gccgcACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATc > 1:1688007/1‑100 (MQ=255)
ccgcACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATcc > 2:1710765/1‑100 (MQ=255)
gcACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCg > 1:4087638/1‑100 (MQ=255)
gcctccTACTGTTGGTGGGGCTGGGGTCGGTTCCCTACCTGCGGGTCTTTCCCCCGGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCgg < 2:4962117/95‑1 (MQ=255)
cACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCgg < 1:964586/100‑1 (MQ=255)
cACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCgg < 2:3513511/100‑1 (MQ=255)
gCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCtt > 2:2569373/1‑100 (MQ=255)
cTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTa < 1:1458265/100‑1 (MQ=255)
cTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAGGCCGCAACATCCCGGCCTTa > 2:1924295/1‑100 (MQ=255)
aCTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATc > 2:1785365/1‑100 (MQ=255)
cTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCt > 2:5382/1‑100 (MQ=255)
tGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCtt < 1:1548995/100‑1 (MQ=255)
tGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCtt < 1:3271693/100‑1 (MQ=255)
gTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCttt > 1:1516000/1‑100 (MQ=255)
gTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCttt > 1:4375483/1‑100 (MQ=255)
tttGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTc < 1:564121/100‑1 (MQ=255)
tttGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTc < 2:3533508/100‑1 (MQ=255)
tgtgGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCAt < 2:3998129/100‑1 (MQ=255)
gtggtgCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATc > 2:491829/1‑100 (MQ=255)
tgCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCAcc > 1:4811216/1‑100 (MQ=255)
cTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgc < 1:3314329/100‑1 (MQ=255)
cTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgc < 1:1302891/100‑1 (MQ=255)
cTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgc > 1:843463/1‑100 (MQ=255)
tgtgGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGGACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgct > 2:2037089/1‑100 (MQ=255)
tgtgGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgct > 1:3861070/1‑100 (MQ=255)
tgtgGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgct < 1:1485425/100‑1 (MQ=255)
gtgGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgctg > 2:654799/1‑100 (MQ=255)
ggTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgctgct > 2:3684182/1‑100 (MQ=255)
ggTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgctgct < 1:5527238/100‑1 (MQ=255)
gTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCtt > 1:655589/1‑100 (MQ=255)
gTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAACACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCtt > 1:889961/1‑100 (MQ=255)
tCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCttt > 1:2240586/1‑100 (MQ=255)
ccGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTa < 1:2088119/100‑1 (MQ=255)
ccGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTa < 2:2830898/100‑1 (MQ=255)
ccGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTa < 1:5415544/100‑1 (MQ=255)
gATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTAcc > 1:1861752/1‑100 (MQ=255)
aTCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCt < 1:2637763/100‑1 (MQ=255)
tCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCtt < 2:2781402/100‑1 (MQ=255)
tCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGAGCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCtt > 1:4747753/1‑100 (MQ=255)
ccTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTgg < 1:34420/100‑1 (MQ=255)
ccTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTgg < 1:727964/100‑1 (MQ=255)
ccTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTgg < 2:221831/100‑1 (MQ=255)
cTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGc < 2:1372285/100‑1 (MQ=255)
cTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGc < 2:2243590/100‑1 (MQ=255)
cGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTAt < 1:3053999/100‑1 (MQ=255)
cGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTAt < 1:27006/100‑1 (MQ=255)
ggATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCgg > 2:769084/1‑100 (MQ=255)
ggATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCgg < 2:2542480/100‑1 (MQ=255)
ggATATTACCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATGCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCgg < 2:5115906/100‑1 (MQ=255)
tatTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGttt > 1:3054601/1‑100 (MQ=255)
tttCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGa > 1:5187438/1‑100 (MQ=255)
tttCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGa < 2:3558244/100‑1 (MQ=255)
tttCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTACAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGa > 1:3595148/1‑100 (MQ=255)
ttCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGAt < 2:1603538/100‑1 (MQ=255)
ttCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGAt < 2:3359940/100‑1 (MQ=255)
tCCGCCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATg < 2:1832965/100‑1 (MQ=255)
tCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATg < 1:1355207/100‑1 (MQ=255)
tCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATg < 2:3442088/100‑1 (MQ=255)
tCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATg < 2:107433/100‑1 (MQ=255)
tCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATg < 2:1664544/100‑1 (MQ=255)
tCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATATTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATg < 1:1730805/100‑1 (MQ=255)
tCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATg < 1:399114/100‑1 (MQ=255)
caccaGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGt < 2:2734326/100‑1 (MQ=255)
|
CCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGC > NC_000913/4291827‑4292017
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
