Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,424,497 |
T→G |
K5Q (AAA→CAA) |
hisP ← |
histidine ABC transporter ATPase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,424,497 | 0 | T | G | 99.1%
| 381.4
/ ‑5.4
| 109 | K5Q (AAA→CAA) | hisP | histidine ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base G (53/54); total (54/55) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GATGATGCTTATTACATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTTATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCAGGACATAA > NC_000913/2424399‑2424592
|
gatgatGCTTATTACATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTTa < 2:3673519/100‑1 (MQ=255)
atgatgCTTATTACATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGAt < 2:1152607/100‑1 (MQ=255)
gatgCTTATTACATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATtc < 1:2716844/100‑1 (MQ=255)
tgCTTATTACATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATtctc < 1:1747009/100‑1 (MQ=255)
tgCTTATTACATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATtctc < 1:179966/100‑1 (MQ=255)
tgCTTATTACATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATtctc < 1:1941219/100‑1 (MQ=255)
cTTATTACATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCgg < 1:3395361/100‑1 (MQ=255)
cTTATTACATCTCCGGCACTAGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCgg < 1:3827033/100‑1 (MQ=255)
tattaCATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGAc > 1:2855588/1‑100 (MQ=255)
tattaCATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGAc > 1:489318/1‑100 (MQ=255)
tattaCATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGAc < 1:567082/100‑1 (MQ=255)
attaCATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACa < 1:3154293/100‑1 (MQ=255)
attaCATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGGTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGAGAACGTTTAATTGGTTCTCGGACa > 2:296672/1‑100 (MQ=255)
attaCATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCATTTCAGCACTTCATGTTCACCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACa > 2:3691939/1‑100 (MQ=255)
ttaCATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACAt > 1:969963/1‑100 (MQ=255)
aCATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCCCGGACATCg < 1:3983832/100‑1 (MQ=255)
aCATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCCCGGACATCg > 2:1882986/1‑100 (MQ=255)
caccGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTAAGCCCGTCATGTTATCCGTAGCGTTTGTACAAATCGATAACGTTCCTTTCATTATCGGACTTCGTAtt > 2:1791152/3‑100 (MQ=255)
tcCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTCCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATtc > 2:2917096/1‑100 (MQ=255)
cGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATtctc < 2:1251567/100‑1 (MQ=255)
ggCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCa < 1:527503/100‑1 (MQ=255)
gCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAg > 2:1222155/1‑100 (MQ=255)
gCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAg < 1:381830/100‑1 (MQ=255)
gCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAg < 1:1065821/100‑1 (MQ=255)
ccctCGCCTGCCGTCATACGCCTTTCCGCACGTCGTTTTCGCCCTAGCGCTTGGGCAAATCGACTACGATTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGt > 2:2235255/4‑100 (MQ=255)
aTTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAGATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTg > 1:1544124/1‑100 (MQ=255)
aTTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTg < 2:3616421/100‑1 (MQ=255)
ttCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGTACATCGTAGTCTCAGTGc > 2:2606061/1‑100 (MQ=255)
gCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAGTCGATAACGTTTAATTGATTCGCGGACATCGTATGCTCAGTGCGtt > 1:2456453/1‑100 (MQ=255)
gCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGtt < 2:2005480/100‑1 (MQ=255)
gCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGtt < 2:3080334/100‑1 (MQ=255)
gCAGTGATACCCCTTTCAACACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTgaag > 2:714628/1‑100 (MQ=255)
cAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTgaaga < 1:2003608/100‑1 (MQ=255)
cAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTgaaga > 1:2045189/1‑100 (MQ=255)
cAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTgaaga < 1:3535368/100‑1 (MQ=255)
ccccTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTca > 2:322430/1‑100 (MQ=255)
cccTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTcac < 1:89599/100‑1 (MQ=255)
cccTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTcac < 1:2913811/100‑1 (MQ=255)
cccTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTcac < 2:1548911/100‑1 (MQ=255)
cccTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCCCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTcac < 1:1913490/100‑1 (MQ=255)
cccTTTCAACACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTcac < 1:729941/100‑1 (MQ=255)
ccTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTcaca > 2:142458/1‑100 (MQ=255)
ccTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTcaca > 2:3858458/1‑100 (MQ=255)
cTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACAt > 2:713566/1‑100 (MQ=255)
cTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACAt > 2:1105722/1‑100 (MQ=255)
cTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACAt > 2:3916867/1‑100 (MQ=255)
ttCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACAtgc > 2:115742/1‑100 (MQ=255)
tCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACAtgct < 1:2996936/100‑1 (MQ=255)
cAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACAtgctg > 1:2351740/1‑100 (MQ=255)
aGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAAGTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACAtgctgc < 2:1536603/100‑1 (MQ=255)
cTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAAcc < 2:3883841/100‑1 (MQ=255)
cTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAAcc < 2:1575228/100‑1 (MQ=255)
cTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAAcc > 1:1812754/1‑100 (MQ=255)
cTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAAcc < 2:1426570/100‑1 (MQ=255)
cTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAAcc > 1:992634/1‑100 (MQ=255)
cTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAAcc > 1:2833052/1‑100 (MQ=255)
gaTGTTGGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGATATCGTATTCTCATTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGc > 2:1594260/2‑100 (MQ=255)
cATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGc < 2:1924415/100‑1 (MQ=255)
cATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGc > 2:1488346/1‑100 (MQ=255)
aTGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCg > 2:2201857/1‑100 (MQ=255)
tGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATCCTGCAACCAGCgc > 2:1371000/1‑99 (MQ=255)
ttCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGttt > 2:2817952/1‑100 (MQ=255)
gCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGtttttn < 1:3076978/100‑2 (MQ=255)
gCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTc < 2:2560805/100‑1 (MQ=255)
ccGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTcc < 1:807854/100‑1 (MQ=255)
ccGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTcc < 1:2433984/100‑1 (MQ=255)
gTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGc > 1:43875/1‑100 (MQ=255)
tAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGct < 1:2275820/100‑1 (MQ=255)
aGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGctc < 1:517446/100‑1 (MQ=255)
gCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGctct < 1:3027968/100‑1 (MQ=255)
cGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTg > 1:2963895/1‑100 (MQ=255)
tttGTGCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCg < 1:2625029/100‑1 (MQ=255)
tgtgCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGaa < 1:1410859/100‑1 (MQ=255)
tgtgCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGaa > 1:1251145/1‑100 (MQ=255)
tgCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAag > 2:2508078/1‑100 (MQ=255)
gCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAaga > 1:2765442/1‑100 (MQ=255)
gCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAaga > 1:3310919/1‑100 (MQ=255)
gCAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAaga > 1:3112980/1‑100 (MQ=255)
cAAATCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAagag < 1:3491117/100‑1 (MQ=255)
aaaTCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAgg > 2:2653470/1‑100 (MQ=255)
aaTCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGc < 1:1051824/100‑1 (MQ=255)
tCGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTg < 1:1441478/100‑1 (MQ=255)
cGATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGa < 1:1802727/100‑1 (MQ=255)
gATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGATTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGAt > 1:1859023/1‑100 (MQ=255)
gATAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCGCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGAt > 1:2054278/1‑100 (MQ=255)
aTAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATc < 2:2960493/100‑1 (MQ=255)
tAACGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCACAGTGCGTCGAAGAAGGGTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCa > 2:690206/1‑100 (MQ=255)
aaCGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCAg < 1:3459021/100‑1 (MQ=255)
aCGTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCAgg > 1:1642427/1‑100 (MQ=255)
tattAAGTGATTCGCGGACAGCGTGGTCTCAGTTGGTTTAAGATGTTTTCACAGGCTTCAACGAGCGATTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCAGGAc < 2:164535/98‑1 (MQ=255)
gTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCAGGAc > 2:77969/1‑100 (MQ=255)
gTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCAGGAc > 2:1743994/1‑100 (MQ=255)
gTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCAGGAc < 1:3771796/100‑1 (MQ=255)
gTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCAGGAc > 1:2874001/1‑100 (MQ=255)
gTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCAGGAc < 1:2778638/100‑1 (MQ=255)
gTTTAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGAAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGTGAAAGAGGCGGATAAGGAc > 2:1710273/1‑100 (MQ=255)
ttAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCAGGACAt > 1:2311185/1‑100 (MQ=255)
ttAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGCTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCAGGACAt > 2:3688699/1‑100 (MQ=255)
tAATTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCAGGACATa < 1:2767420/100‑1 (MQ=255)
aaTTGATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCAGGACATaa > 2:2380713/1‑100 (MQ=255)
|
GATGATGCTTATTACATCTCCGGCATTCGCTTGCAGTGATACCCCTTTCAGCACTTCATGTTCGCCGTAGCGTTTGTGCAAATCGATAACGTTTAATTTATTCTCGGACATCGTATTCTCAGTGCGTTGAAGAAGGTTTCACATGCTGCAACCAGCGTTTTTCCGCTCTGCGAAAGAGGCTGATCAGGACATAA > NC_000913/2424399‑2424592
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
