Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,483,809 |
T→G |
L19V (TTA→GTA) |
evgA → |
response regulator in two‑component regulatory system with EvgS |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,483,809 | 0 | T | G | 90.7%
| 439.2
/ 21.0
| 152 | L19V (TTA→GTA) | evgA | response regulator in two‑component regulatory system with EvgS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (6/8); new base G (55/82); total (61/91) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CTACAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATTTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGCCTGATATCGTCAT > NC_000913/2483712‑2483903
|
acAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTAtt > 2:1365568/1‑100 (MQ=255)
cAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTg < 1:1408753/100‑1 (MQ=255)
agggagaagggagaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGa < 1:3965312/100‑1 (MQ=255)
gggagaagggagaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGTAGCAATTCGTAATGTATTGAt < 1:1928062/100‑1 (MQ=255)
gggagaagggagaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGAt > 2:38294/1‑100 (MQ=255)
gggagaagggagaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGAt > 2:1535271/1‑100 (MQ=255)
gggagaagggagaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGAt > 1:3557582/1‑100 (MQ=255)
ggagaagggagaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATc > 1:3535758/1‑100 (MQ=255)
ggagaagggagaTGCTTCATTGCAAAGGCAATAATCTATGAACGCAATAATGATGGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATc < 2:140111/100‑1 (MQ=255)
gagaagggagaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGATCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTAttattca < 2:3382390/100‑6 (MQ=255)
agaagggagaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCaa < 1:1874254/100‑1 (MQ=255)
gaagggagaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCaaa > 1:3703451/1‑100 (MQ=255)
aagggagaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCaaaa > 1:917943/1‑100 (MQ=255)
gggagaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAAc > 2:3038932/1‑100 (MQ=255)
gggagaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAAc < 2:148338/100‑1 (MQ=255)
gggagaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCCATGAACGCAATAATGATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATTACAAAc < 2:3766118/100‑1 (MQ=255)
ggagaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACg < 2:5745/100‑1 (MQ=255)
agaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATTTATTGATCAAAAACGat < 1:3846029/100‑1 (MQ=255)
gaTGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGata < 1:631260/100‑1 (MQ=255)
tGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATAtt < 1:2895775/100‑1 (MQ=255)
tGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAACTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATAtt > 2:3576721/1‑100 (MQ=255)
cTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGa > 1:3836300/1‑100 (MQ=255)
cTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGa < 1:292600/100‑1 (MQ=255)
ttCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGaa < 1:796161/100‑1 (MQ=255)
tCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGaaa < 2:637298/100‑1 (MQ=255)
tCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGaaa > 1:2767066/1‑100 (MQ=255)
cATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAAt > 1:2817952/1‑100 (MQ=255)
ttGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCt < 1:3015789/100‑1 (MQ=255)
ttGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCt < 1:3015720/100‑1 (MQ=255)
gCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATTTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTa > 2:3068353/1‑100 (MQ=255)
gCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTa > 2:1274296/1‑100 (MQ=255)
gCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTa < 2:2223869/100‑1 (MQ=255)
gCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAAAAATTATTGATGACCATCATATTGCTATAGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGAAATTGAAATCTTa > 2:2619280/1‑100 (MQ=255)
cAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATTTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAg < 1:1018027/100‑1 (MQ=255)
cAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAg < 1:1771113/100‑1 (MQ=255)
aaaGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGc > 2:3666417/1‑100 (MQ=255)
aaGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATTTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCa < 1:3106414/100‑1 (MQ=255)
aaGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCa < 1:1910362/100‑1 (MQ=255)
aaGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCa > 1:2349142/1‑100 (MQ=255)
aGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTTTTTTTTTTTTGTTTTAAAACGATATTGGTATCTTAGCag > 2:375526/1‑100 (MQ=255)
aGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATAGCAGCAATTCGTAGTGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCag > 2:3946316/1‑100 (MQ=255)
aGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCAGCCTCTTGCCATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCag < 2:1600880/100‑1 (MQ=255)
gggAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCaga > 2:12270/1‑100 (MQ=255)
gggAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCaga > 1:460862/1‑100 (MQ=255)
ggAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCagag < 2:411365/100‑1 (MQ=255)
gAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGCGt < 1:2246432/100‑1 (MQ=255)
ataatGTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCTCATCAATTCGTAATGTATTGATACAAAACGATATTGAAATCTTATCcgagctt > 2:3515116/1‑97 (MQ=255)
aatCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGAc < 1:1344601/100‑1 (MQ=255)
atCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACt < 2:2127712/100‑1 (MQ=255)
atCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACt < 1:38960/100‑1 (MQ=255)
atCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACt < 1:2912117/100‑1 (MQ=255)
tCTATGAACGCAATAATTATTGATGGCCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTg < 2:2094974/100‑1 (MQ=255)
tCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTg < 1:752137/100‑1 (MQ=255)
cTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAAAAAAAAAAAAAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGa < 2:2851273/100‑1 (MQ=255)
gAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGc > 2:2502798/1‑100 (MQ=255)
aaCGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCg > 1:1613917/1‑100 (MQ=255)
aCGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCgg > 2:1221113/1‑100 (MQ=255)
aCGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCgg < 1:3161130/100‑1 (MQ=255)
gCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGaa > 2:1453382/1‑100 (MQ=255)
gCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGaa < 1:153791/100‑1 (MQ=255)
cAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATTTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAg > 2:3282735/1‑100 (MQ=255)
cAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAg > 1:1295839/1‑100 (MQ=255)
cAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAg < 2:3506254/100‑1 (MQ=255)
aataatTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGt > 1:235304/1‑100 (MQ=255)
taatTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATTTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGc > 1:3766032/1‑100 (MQ=255)
taatTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGCGGTGACTGAAGGCGGAAGTGc < 1:3483855/100‑1 (MQ=255)
taatTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGc < 2:2533704/100‑1 (MQ=255)
aatTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATTTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGcc < 1:2891828/100‑1 (MQ=255)
aatTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGcc < 1:2540802/100‑1 (MQ=255)
aatTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGcc < 1:1624850/100‑1 (MQ=255)
aatTATTGATGACCATCCTCTGGCTATCGTAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGcc < 2:2979090/100‑1 (MQ=255)
attattGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCg < 2:3597731/100‑1 (MQ=255)
tattGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGtt < 2:836095/100‑1 (MQ=255)
tattGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGtt > 1:2223755/1‑100 (MQ=255)
attGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTc > 1:1428726/1‑100 (MQ=255)
attGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTc < 1:3493068/100‑1 (MQ=255)
tgatgaCCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAg > 1:85105/1‑100 (MQ=255)
aCCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTAGTGATCAAAAACGATGTTGAAAGGTTAGCAGAGTTAACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCTGCGGGt < 2:3065835/100‑1 (MQ=255)
ccATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATTTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTg < 2:2968855/100‑1 (MQ=255)
aTCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGa < 2:3698192/100‑1 (MQ=255)
ctctTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAac > 1:1143602/1‑100 (MQ=255)
tctTGCTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAaca > 2:2779744/1‑100 (MQ=255)
cTATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTaa > 2:1870886/1‑100 (MQ=255)
tATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAg < 2:1909291/100‑1 (MQ=255)
tATCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAg > 2:3980924/1‑100 (MQ=255)
tCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGcc < 1:1644128/100‑1 (MQ=255)
tCGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGcc > 1:2164952/1‑100 (MQ=255)
cGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGCCt > 1:1685034/1‑100 (MQ=255)
cGCAGCAATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGCCt > 1:3683110/1‑100 (MQ=255)
gcagcaATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGCCTg > 1:145254/1‑100 (MQ=255)
gcaATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGCCTGata > 1:606301/1‑100 (MQ=255)
gcaATTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGCCTGata > 1:2424215/1‑100 (MQ=255)
aTTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGCCTGATATCg < 1:2588930/100‑1 (MQ=255)
aTTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGCCTGATATCg < 1:1949251/100‑1 (MQ=255)
aTTCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGCCTGATATCg < 2:2206072/100‑1 (MQ=255)
aTTCGTAATGTATTGAGCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGGGGAAACACTTAAGCCTGATATCg > 1:1792569/1‑100 (MQ=255)
tCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGCCTGATATCGtc < 1:2282298/100‑1 (MQ=255)
tCGTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGCCTGATATCGtc < 2:126264/100‑1 (MQ=255)
cGTAATGTATTGATCAAAAACGATAGTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGCCTGATATCGtca < 2:3372540/100‑1 (MQ=255)
gTAATGTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGCCTGATATCGtcat < 1:3765268/100‑1 (MQ=255)
|
CTACAGGGAGAAGGGAGATGCTTCATTGCAAAGGGAATAATCTATGAACGCAATAATTATTGATGACCATCCTCTTGCTATCGCAGCAATTCGTAATTTATTGATCAAAAACGATATTGAAATCTTAGCAGAGTTGACTGAAGGCGGAAGTGCCGTTCAGCGGGTGGAAACACTTAAGCCTGATATCGTCAT > NC_000913/2483712‑2483903
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
