Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,245,692 |
A→C |
F243C (TTT→TGT) |
malE ← |
maltose transporter subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,245,692 | 0 | A | C | 98.0%
| 508.7
/ 0.8
| 147 | F243C (TTT→TGT) | malE | maltose transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base C (75/69); total (77/70) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.78e-01 |
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
GGTCGGCAGTACCGTTACACCATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTAAAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTCGCGCCAGCGT > NC_000913/4245595‑4245788
|
ggTCGGCAGTACCGTTACACCATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAg < 1:1973127/100‑1 (MQ=255)
tCGGCAGTACCGTTACACCATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGc > 2:1252848/1‑100 (MQ=255)
gCAGTACCGTTACACCATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGc > 2:3284384/1‑100 (MQ=255)
cAGTACCGTTACACCATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCt < 1:3007217/100‑1 (MQ=255)
cAGTACCGTTACACCATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCt < 1:3979057/100‑1 (MQ=255)
tACCGTTACACCATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCCCGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCt > 1:3708912/1‑100 (MQ=255)
ccGTTACACCATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGc < 1:2987184/100‑1 (MQ=255)
ccGTTACACCATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGc < 1:1645402/100‑1 (MQ=255)
cGTTACACCATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCg > 1:3784168/1‑100 (MQ=255)
gTTACACCATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGa > 2:1015238/1‑100 (MQ=255)
ttACACCATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGAt > 1:2124129/1‑100 (MQ=255)
tACACCATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATg < 1:2322026/100‑1 (MQ=255)
acCATAATTCCCTTTGCTGGTGTCGATGTTTGATCATGCCCACGGGCCGTTGAGGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAg < 2:1843021/100‑1 (MQ=255)
ccATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTTATGGTCATCGCTGTTTCGCACTTATTACACGCCGCTTCTGCGATTGAGt > 2:2232955/1‑100 (MQ=255)
ccATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGt > 1:1020781/1‑100 (MQ=255)
aaTTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATc > 1:3644487/1‑100 (MQ=255)
aaTTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATc > 2:2411542/1‑100 (MQ=255)
aTTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCg > 2:2370550/1‑100 (MQ=255)
aTTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCg > 2:3184170/1‑100 (MQ=255)
ttCACTTTGCTGGTGTCGATGGTGGACGATGGCCACGGGCCGTGGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATggg < 2:485094/100‑1 (MQ=255)
tCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGgt > 1:369306/1‑100 (MQ=255)
cACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGgtg > 1:3924653/1‑100 (MQ=255)
aCTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGgtgt > 1:1857182/1‑100 (MQ=255)
aCTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGgtgt < 2:897870/100‑1 (MQ=255)
ttGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTg < 1:2523520/100‑1 (MQ=255)
tGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCAtt < 1:360305/100‑1 (MQ=255)
ggTGTGGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTc > 2:3516222/1‑100 (MQ=255)
ggTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTc > 1:1802050/1‑100 (MQ=255)
ggTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTc > 2:926779/1‑100 (MQ=255)
gtCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCAtg > 1:4024971/1‑100 (MQ=255)
gtCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCAtg < 1:273430/100‑1 (MQ=255)
cGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCAtgtg > 2:845194/1‑100 (MQ=255)
cGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCAtgtg > 1:1568134/1‑100 (MQ=255)
aTGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGtgtt < 1:3641734/100‑1 (MQ=255)
aTGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGGCTGCATTCATGtgtt > 2:2046176/1‑100 (MQ=255)
tGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGtgttt < 2:575276/100‑1 (MQ=255)
tGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGtgttt > 1:673141/1‑100 (MQ=255)
gTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGtgtttg < 1:699027/100‑1 (MQ=255)
gTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGtgtttg < 1:1563699/100‑1 (MQ=255)
gACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGtttt < 1:2133900/100‑1 (MQ=255)
gACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTGTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGtttt < 2:2595160/100‑1 (MQ=255)
aCCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGttttt > 2:458764/1‑100 (MQ=255)
ccATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTa < 1:1253610/100‑1 (MQ=255)
ccATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTa > 1:524188/1‑100 (MQ=255)
cATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTaa < 1:2465636/100‑1 (MQ=255)
cATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTaa > 2:2252187/1‑100 (MQ=255)
tGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATc < 1:306901/100‑1 (MQ=255)
tGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATc > 2:3592574/1‑100 (MQ=255)
gCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCa < 2:362663/100‑1 (MQ=255)
cccACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAg > 2:170477/1‑100 (MQ=255)
cccACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAg > 2:1093961/1‑100 (MQ=255)
cccACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGACTAATCGGCGTCTGCCTTCATGTGTTTGTTTTTAATCAg > 1:2139723/1‑100 (MQ=255)
ccACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAgg < 1:488426/100‑1 (MQ=255)
ccACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAgg < 1:361189/100‑1 (MQ=255)
cACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGt < 1:946593/100‑1 (MQ=255)
cACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGt < 1:2968424/100‑1 (MQ=255)
aCGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTc < 1:2223291/100‑1 (MQ=255)
cGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCa < 2:3163746/100‑1 (MQ=255)
ggCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAAc > 2:852647/1‑100 (MQ=255)
gCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAAcc > 2:2133569/1‑100 (MQ=255)
gCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAAcc > 2:2622474/1‑100 (MQ=255)
gCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAAcc > 2:2824032/1‑100 (MQ=255)
gCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAAcc > 1:2763742/1‑100 (MQ=255)
gCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAAcc < 1:1987995/100‑1 (MQ=255)
ncGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCa > 1:3230779/2‑100 (MQ=255)
ccGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCa > 1:1072770/1‑100 (MQ=255)
ccGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCa < 1:2105854/100‑1 (MQ=255)
cGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAg > 1:1119784/1‑100 (MQ=255)
ttGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGa < 1:3371067/100‑1 (MQ=255)
ttGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGa < 2:2257605/100‑1 (MQ=255)
tGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGaa < 2:2739669/100‑1 (MQ=255)
tGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTAAAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATGGATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAATCAGGaattc > 1:1620081/1‑97 (MQ=255)
ggTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCCGGAAGGTc < 2:3829706/100‑1 (MQ=255)
ggTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGtn < 2:1721883/100‑2 (MQ=255)
ggTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTc < 1:1176483/100‑1 (MQ=255)
ggTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTc > 2:116019/1‑100 (MQ=255)
ggTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTAAAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTc < 1:958625/100‑1 (MQ=255)
tCATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAg < 1:1036834/100‑1 (MQ=255)
cATCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTAGTTTTTAATCAGGTCAAGCAGGACGGTCAGa > 2:3139251/1‑100 (MQ=255)
aTCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGAc > 1:450552/1‑100 (MQ=255)
tCGCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGAcc > 2:3087094/1‑100 (MQ=255)
gCTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCg < 1:2286678/100‑1 (MQ=255)
cTGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGc > 2:574335/1‑100 (MQ=255)
tGTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCt < 1:3320542/100‑1 (MQ=255)
gTTTCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGcct > 2:157432/1‑98 (MQ=255)
tttCGCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCttt < 1:911298/100‑1 (MQ=255)
gCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTcgcg < 1:1394494/100‑1 (MQ=255)
gCCTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTcgcg < 1:3217550/100‑1 (MQ=255)
ccTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTCgcgc < 1:2336796/100‑1 (MQ=255)
cTTTATTACAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTCGCGcc < 2:441999/100‑1 (MQ=255)
ttattaCAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTCGCGCCAg > 1:2807371/1‑100 (MQ=255)
ttattaCAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTCGCGCCAg < 1:2266274/100‑1 (MQ=255)
tattaCAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTGATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTCGCGCCAGc < 1:1319872/100‑1 (MQ=255)
tattaCAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTCGCGCCAGc > 1:1902142/1‑100 (MQ=255)
tattaCAGGCAGCTTCTGCGACGGAGTAATCGGGGTCTGGATTCATGTGTTAGTTTTTAATCAGTTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTCGCGCCAGc > 2:1286946/1‑100 (MQ=255)
attaCAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTCGCGCCAGCg < 2:3506263/100‑1 (MQ=255)
attaCAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTCGCGCCAGCg < 2:1688129/100‑1 (MQ=255)
attaCAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTCGCGCCAGCg < 2:1592587/100‑1 (MQ=255)
attaCAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTCGCGCCAGCg > 1:3150385/1‑100 (MQ=255)
ttaCAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTCGCGCCAGCGt < 1:1467575/100‑1 (MQ=255)
|
GGTCGGCAGTACCGTTACACCATAATTCACTTTGCTGGTGTCGATGTTGGACCATGCCCACGGGCCGTTGATGGTCATCGCTGTTTCGCCTTTATTAAAGGCAGCTTCTGCGATGGAGTAATCGGTGTCTGCATTCATGTGTTTGTTTTTAATCAGGTCAACCAGGAAGGTCAGACCCGCTTTCGCGCCAGCGT > NC_000913/4245595‑4245788
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
