Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F412 I3 R1
|
53 |
201.3 |
10250884 |
92.1% |
9441064 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,624,020 |
G→A |
intergenic (‑170/+85) |
dgcZ ← / ← ydeI |
diguanylate cyclase, zinc‑sensing/hydrogen peroxide resistance OB fold protein; putative periplasmic protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,624,020 | 0 | G | A | 98.8%
| 559.2
/ NA
| 160 | intergenic (‑170/+85) | dgcZ/ydeI | diguanylate cyclase, zinc‑sensing/hydrogen peroxide resistance OB fold protein; putative periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (74/84); minor base C (1/1); total (75/85) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
ATAGAAATCCGAAGTTATGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTGCATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAATTTATTTTTATTTCTGCAA > NC_000913/1623924‑1624116
|
aTAGAAATCCGAAGTTATGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAACAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTCCAt > 2:4707074/1‑100 (MQ=255)
aTAGAAATCCGAAGTTATGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACAt < 1:2518148/100‑1 (MQ=255)
aTAGAAATCCGAAGTTATGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACAt < 2:1514446/100‑1 (MQ=255)
tAGAAATCCGCAGTTATGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAGATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACAtt > 2:4678776/1‑100 (MQ=255)
aaTCCGAAGTTATGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCg < 1:2399391/100‑1 (MQ=255)
aaTCCAAAGTTATGATACATCCCTGAGAGAACATTGTTATTCAACGCAAAATCAGGGGACAAAAAAGTGTTTAATTATCTAAATTACCTCTCCCTTATCg < 2:4838717/100‑1 (MQ=255)
cGAAGTTATGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGtaaa > 2:293035/1‑100 (MQ=255)
gAAGTTATGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGtaaat < 1:2697112/100‑1 (MQ=255)
gAAGTTATGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGtaaat < 1:3461557/100‑1 (MQ=255)
gAAGTTATGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGtaaat < 2:440637/100‑1 (MQ=255)
tATGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAg > 1:1803729/1‑100 (MQ=255)
tATGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAg > 1:2214688/1‑100 (MQ=255)
tATGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAg < 2:4208671/100‑1 (MQ=255)
tATGAGTCATCTCGGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAg < 2:134881/100‑1 (MQ=255)
tGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGa > 2:5026174/1‑100 (MQ=255)
taGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGAt < 1:5066627/99‑1 (MQ=255)
gAGTCATCTATGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGAt < 1:4194353/100‑1 (MQ=255)
aGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGAta > 2:4987866/1‑99 (MQ=255)
aGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATg < 2:1852284/100‑1 (MQ=255)
gTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGa > 2:576976/1‑100 (MQ=255)
gTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGa < 1:1078751/100‑1 (MQ=255)
cATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACa > 1:810027/1‑100 (MQ=255)
cATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACa > 1:1464906/1‑100 (MQ=255)
ctctGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAAt < 1:2634562/100‑1 (MQ=255)
ctctGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAAt > 1:3022810/1‑100 (MQ=255)
ctctGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAAt > 1:4420229/1‑100 (MQ=255)
atctGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAGTAAAAGGATGACAAAt < 2:1381045/99‑1 (MQ=255)
tctGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATa > 2:48013/1‑100 (MQ=255)
tctGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATa > 1:3123252/1‑100 (MQ=255)
tctGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATa > 2:204441/1‑100 (MQ=255)
tctGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATa > 2:2550326/1‑100 (MQ=255)
ctGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAg > 2:1707584/1‑100 (MQ=255)
ctGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAg < 1:4754762/100‑1 (MQ=255)
tGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGc < 2:3390496/100‑1 (MQ=255)
gagaTAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCa < 1:1637895/100‑1 (MQ=255)
gagaTAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATGCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCa < 2:3515609/100‑1 (MQ=255)
tAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAAc > 2:4740322/1‑100 (MQ=255)
aaCATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAAcc < 2:417660/100‑1 (MQ=255)
aCATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAAccc > 2:13829/1‑100 (MQ=255)
aCATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAAccc < 1:1490501/100‑1 (MQ=255)
ttGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAAt < 1:3718318/100‑1 (MQ=255)
tgtgATTTACAACAAAATAAGCGGATAAACAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATa < 1:2826527/100‑1 (MQ=255)
gtgATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATAc < 1:2835887/100‑1 (MQ=255)
aTTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCt > 1:3911115/1‑100 (MQ=255)
aTTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCt > 2:1221680/1‑100 (MQ=255)
tttAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTa > 1:1435209/1‑100 (MQ=255)
ttAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTaa > 1:1898543/1‑100 (MQ=255)
aaaaCAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATg < 2:2184947/100‑1 (MQ=255)
aaaaCAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATg < 1:1372353/100‑1 (MQ=255)
aaaaCAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATg < 2:595674/100‑1 (MQ=255)
aaaCAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATgg < 1:4819929/100‑1 (MQ=255)
aaCAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGc < 2:348656/100‑1 (MQ=255)
aaCAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGc > 1:1981144/1‑100 (MQ=255)
aCAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTAACTCTACATTATCGTAAATAAAATAATAACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGcc > 2:5056331/1‑100 (MQ=255)
cAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGccc > 2:3248188/1‑100 (MQ=255)
cAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGccc > 2:1833914/1‑100 (MQ=255)
cAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGccc < 1:4178187/100‑1 (MQ=255)
aaaaTCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCa < 1:2010849/100‑1 (MQ=255)
aaaTCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCag < 1:5105262/100‑1 (MQ=255)
aaaTCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCag > 1:5058397/1‑100 (MQ=255)
aaaTCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCag < 1:48689/100‑1 (MQ=255)
aaTCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCagt < 1:205089/100‑1 (MQ=255)
aaTCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCagt > 1:3379647/1‑100 (MQ=255)
tCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCagtag < 2:23804/100‑1 (MQ=255)
cGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCa > 1:3281324/1‑100 (MQ=255)
gATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAgg < 2:2974662/100‑1 (MQ=255)
gATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAgg > 1:5132086/1‑100 (MQ=255)
aTAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGc < 1:2617694/100‑1 (MQ=255)
aTAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGc < 2:1780197/100‑1 (MQ=255)
tAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGcc < 1:1234149/100‑1 (MQ=255)
aaaaaGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGTATAACCCAATACCCTAATGGCCCATTAGTTCAGGCCAt > 2:369537/1‑100 (MQ=255)
aaaaGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATc < 1:612319/100‑1 (MQ=255)
aaaGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCa > 2:2763715/1‑100 (MQ=255)
aaGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAg < 2:1321572/100‑1 (MQ=255)
aaGTGCTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAg > 2:313374/1‑100 (MQ=255)
gtgtTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATCGCATACCCCAATACCCTAGTGGCCGAGTAGTTCAGGCCATCAGGc > 1:4826938/1‑100 (MQ=255)
gtgtTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGc < 1:2406194/100‑1 (MQ=255)
gtgtTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGc < 1:679063/100‑1 (MQ=255)
gtTTAATTCTGTAAATTACCTCTACGTTATCGTAAATAAAAGGATGAAAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGACCCAGTAGTTCAGGCCATCATGCTa > 1:4615794/1‑100 (MQ=255)
gtTTAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTa < 1:366337/100‑1 (MQ=255)
tAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAatt > 2:1736772/1‑100 (MQ=255)
tAATTCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAatt > 1:2105300/1‑100 (MQ=255)
tCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAatttatt < 1:676361/100‑1 (MQ=255)
tCTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAatttatt < 1:3870140/100‑1 (MQ=255)
cTGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAatttattt > 2:664048/1‑100 (MQ=255)
tGTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAAtttatttt < 1:1036470/100‑1 (MQ=255)
gTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAACAGGATGTCAAATATCATAACCCAATACCCTCGAGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTATtttattttt < 2:385662/100‑1 (MQ=255)
gTAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAAtttattttt > 2:4770681/1‑100 (MQ=255)
tAAATTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAAtttattttta < 1:3144376/100‑1 (MQ=255)
aaaTTACCTCTACATTACCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCAGAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAAtttatttttat < 2:816691/100‑1 (MQ=255)
aaTTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAAtttatttttatt < 2:2711431/100‑1 (MQ=255)
aaTTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAAtttatttttatt > 1:788275/1‑100 (MQ=255)
aTTACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAATttatttttattt < 2:2064665/100‑1 (MQ=255)
ttACCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAATTTATTTTTATTTc < 2:732075/100‑1 (MQ=255)
aCCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCGTAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAATTTATTTTTATTTCTg < 2:3342277/100‑1 (MQ=255)
aCCTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAATTTATTTTTATTTCTg < 1:2526308/100‑1 (MQ=255)
ccTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAATTTATTTTTATTTCTGc < 1:3284657/100‑1 (MQ=255)
ccTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAATTTATTTTTATTTCTGc < 2:4859998/100‑1 (MQ=255)
ccTCTACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGACCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAATTTATTTTTATTTCTGc > 1:4505990/1‑100 (MQ=255)
tctACATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAATTTATTTTTATTTCTGCaa > 1:3524242/1‑100 (MQ=255)
|
ATAGAAATCCGAAGTTATGAGTCATCTCTGAGATAACATTGTGATTTAAAACAAAATCAGCGGATAAAAAAGTGTTTAATTCTGTAAATTACCTCTGCATTATCGTAAATAAAAGGATGACAAATAGCATAACCCAATACCCTAATGGCCCAGTAGTTCAGGCCATCAGGCTAATTTATTTTTATTTCTGCAA > NC_000913/1623924‑1624116
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
