Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F35 I0 R1
|
338 |
60.8 |
3106128 |
78.2% |
2428992 |
142.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
578,809 |
T→C |
100% |
T29A (ACA→GCA) |
borD ← |
DLP12 prophage; putative lipoprotein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 578,809 | 0 | T | C | 98.6%
| 10691.6
/ 37.8
| 3778 | T29A (ACA→GCA) | borD | DLP12 prophage; putative lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/27); new base C (1676/2012); total (1728/2050) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.48e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.53e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 3814 total aligned reads displayed.
ATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGTCTGTTTGTTTTGAACAGTAAATGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAAC > NC_000913/578665‑578954
|
cATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGATGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCggtttg > 1:36413/1‑149 (MQ=255)
aTTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCggtttgt > 6:302981/1‑149 (MQ=255)
aTTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCAAGAAACGAATAAATGATGGTTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTTCCggtttgt > 4:251029/1‑149 (MQ=255)
tttACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCTCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCggtttgtt < 3:308337/149‑1 (MQ=255)
tttACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCggtttgtt > 7:114855/1‑149 (MQ=255)
tttACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCggtttgtt < 1:312354/149‑1 (MQ=255)
aCGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGtttt < 7:334649/148‑1 (MQ=255)
cGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGa < 4:52960/149‑1 (MQ=255)
aTGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACa < 2:67073/149‑1 (MQ=255)
tGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTCCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAg < 1:250013/149‑1 (MQ=255)
tttGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGt > 5:281986/1‑148 (MQ=255)
cTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTaaac < 7:82199/148‑2 (MQ=255)
cTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTGTTGAACAGTacacg > 2:309056/1‑145 (MQ=255)
tGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTaa < 6:161295/145‑1 (MQ=255)
tGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGt > 7:284476/1‑149 (MQ=255)
tGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGACCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGATGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGt > 7:2195/1‑149 (MQ=255)
ttttCTGGTTTATCAACATTTTCTGCGCATACACAAATTTTAGCTGCTTCGACAGTTTTCTTGTGCCCATTTCCATATACGTAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACa < 5:341867/137‑1 (MQ=255)
gTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTg < 7:141562/149‑1 (MQ=255)
tCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGtt < 5:307134/148‑1 (MQ=255)
ttttAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGAGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGACGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGca > 1:170362/1‑149 (MQ=255)
ttAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGcac < 3:15284/148‑1 (MQ=255)
ttAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCATCTGCCCAATTCCAGAAAAGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGcaca > 1:144259/1‑149 (MQ=255)
aacaacATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCggttt > 6:130047/1‑117 (MQ=255)
aacaacATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATc > 2:22960/1‑149 (MQ=255)
aacaacATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAAGGCTGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTAGTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCCCATc > 8:103635/1‑149 (MQ=255)
acaacaTTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCggtttgtt > 8:136880/1‑119 (MQ=255)
caacaTTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCt < 4:142498/149‑1 (MQ=255)
caacaTTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCt > 2:97602/1‑149 (MQ=255)
aacaTTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGgtttgttt > 5:254973/1‑118 (MQ=255)
aacaTTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTg > 7:248016/1‑149 (MQ=255)
aacaTTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTg > 7:47020/1‑149 (MQ=255)
aacaTTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGAAAGTAATCTACTGCCCAAATCCAGAAACGAAGAAAAGATGGTTGAAGGTGACCTTAGGGGCTACTTCTGCCCGATTGTTTAGAACAGTAAACGTCTGTTGAGcacagatcc > 5:226996/1‑144 (MQ=255)
acaTTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAATCGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTATACGTCTGTTGAGCACATCCCGt < 1:28035/149‑1 (MQ=255)
acaTTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGt < 3:126361/149‑1 (MQ=255)
acaTTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGt < 1:188580/149‑1 (MQ=255)
ttttCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGCCAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGGTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCGCATCCTGtaat < 2:365206/149‑1 (MQ=255)
tCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCACAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGGTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGtaataa < 8:166745/148‑1 (MQ=255)
cTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAg < 4:112861/148‑1 (MQ=255)
gcgcCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAg > 7:162634/1‑149 (MQ=255)
cgccgcCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAg < 7:311620/148‑1 (MQ=255)
cgccgcCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAg < 5:202209/148‑1 (MQ=255)
ccgccACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGc < 2:337885/149‑1 (MQ=255)
gccACAAATTTTAGTTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGTGCCa > 6:103593/1‑149 (MQ=255)
acaAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAgcg > 4:168973/1‑149 (MQ=255)
aaaTTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCTATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAgag > 2:25522/1‑145 (MQ=255)
aaTTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAg < 1:223847/149‑1 (MQ=255)
ttttAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTa < 3:85524/149‑1 (MQ=255)
tAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGc < 4:19893/148‑1 (MQ=255)
tAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGc < 6:249471/148‑1 (MQ=255)
gCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGa < 2:14826/148‑1 (MQ=255)
tGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCa > 3:54578/1‑128 (MQ=255)
gCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTg > 7:190357/1‑89 (MQ=255)
cATCGACATTTTTATTCTGCCAAATTCCAGAAACGAAGAAATGATTGGTGATTGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTa < 4:361833/147‑1 (MQ=255)
cATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGa > 4:89310/1‑107 (MQ=255)
gACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAg > 1:339450/1‑134 (MQ=255)
aCAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTTTTTTGAACAGTAAACGTCTTTTGAGAACATCCTGTAATAAGAAGGGACAGCGCAGTAGCGAGTAGCAtttt > 5:5325/1‑149 (MQ=255)
aCAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCAtttt > 8:7535/1‑149 (MQ=255)
aCAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCAtttt > 4:278073/1‑149 (MQ=255)
cAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCa > 1:74576/1‑144 (MQ=255)
aGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGtttt > 1:100248/1‑80 (MQ=255)
aGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGc > 8:1938/1‑135 (MQ=255)
aGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCAtttttt < 8:34884/149‑1 (MQ=255)
ttttCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTc < 3:182663/149‑1 (MQ=255)
tctgctGCCCAATTCCAGAACCGAAGAAATGATGTGTGAGGGTTTCGTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCTCATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCAt < 3:203382/148‑1 (MQ=255)
cttctGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATg < 8:25312/148‑1 (MQ=255)
cttctGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATg < 5:175487/148‑1 (MQ=255)
ttctGCCCATTTGCAGATACGAAGATATGATGGGTTATGGTTTCCTTTGGTTCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTATAGGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCATTGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGgt < 1:121107/149‑1 (MQ=255)
tctGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGgtg > 2:397594/1‑149 (MQ=255)
ctGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGgt < 2:104605/147‑1 (MQ=255)
tGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGgtgt > 6:217854/1‑148 (MQ=255)
aaatCCAGAACCGAAGAAATGAGGGGTGATGGGTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGGTGGTTTTGAACAGTAAACGGCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGAAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTcc < 2:173045/146‑1 (MQ=255)
aaTTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTcc > 2:199328/1‑149 (MQ=255)
aaTTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTcc > 5:142503/1‑149 (MQ=255)
ccAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGa < 8:377204/148‑1 (MQ=255)
aGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGc > 7:382791/1‑149 (MQ=255)
cGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCttttt < 3:252227/149‑1 (MQ=255)
gaagaaATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTGGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCttttt > 4:305486/1‑148 (MQ=255)
aagaaATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGa < 8:44700/149‑1 (MQ=255)
agaaATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGaa < 6:188801/149‑1 (MQ=255)
gaaATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTAATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAg > 1:40969/1‑149 (MQ=255)
aaaTGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGt < 8:315194/149‑1 (MQ=255)
atgatgGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTc < 6:367748/149‑1 (MQ=255)
atgGGTCATGGGTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTATGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCTCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGc < 2:123301/148‑1 (MQ=255)
agTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCAtttttt < 7:355802/109‑1 (MQ=255)
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TACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAAC > NB501016:230:HFVJLAFXY:2:11109:16903:9300/1‑150 (MQ=60)
ACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACA < NB501016:230:HFVJLAFXY:4:21504:7073:2692/150‑1 (MQ=60)
CTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAA > NB501016:230:HFVJLAFXY:4:21602:12030:16571/1‑150 (MQ=60)
CTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAA > NB501016:230:HFVJLAFXY:4:21509:10639:17986/1‑150 (MQ=60)
GCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAAC < NB501016:230:HFVJLAFXY:1:21209:21017:10829/150‑1 (MQ=60)
CTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCC > NB501016:230:HFVJLAFXY:1:21309:17595:4012/1‑151 (MQ=60)
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CGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTAGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGTCTGTTTGTTTTGAACAGTAAATGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCT > NC_000913/578659‑578957
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
