Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F35 I0 R1
|
338 |
60.8 |
3106128 |
78.2% |
2428992 |
142.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
580,115 |
C→T |
100% |
intergenic (+29/+136) |
ybcW → / ← ylcI |
DLP12 prophage; uncharacterized protein/DUF3950 family protein, DLP12 prophage |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 580,115 | 0 | C | T | 99.0%
| 12354.8
/ 23.4
| 4259 | intergenic (+29/+136) | ybcW/ylcI | DLP12 prophage; uncharacterized protein/DUF3950 family protein, DLP12 prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (25/21); new base T (2127/2062); total (2166/2093) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.59e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.32e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 4312 total aligned reads displayed.
GATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGGGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTACTTAACCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTC > NC_000913/579970‑580259
|
aTGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAATCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGTAGCACTATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGTTTGACTGATCACCATAACTTCTAATCATTCAAACTATTTa < 4:108404/148‑1 (MQ=255)
ttgtAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTagtct > 7:16310/1‑145 (MQ=255)
tAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGT < 2:133765‑M1/148‑1 (MQ=255)
aTTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGA < 4:66865‑M1/148‑1 (MQ=255)
gCATGTTTTGAACATAAGGAGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCTATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGTTATTATTATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCTTAACTGCTAATCTTTCAAACTATTTAGTCTGTGACAG < 4:314070‑M1/148‑1 (MQ=255)
cttGTATAGCACATAAGGTGTCTCTGGATGCATTGAGAGGAATTGAGGCAGCGTTGGTGAGGCTCGATAATAATATGAAGGATTAGTGCCTGGTGGTTGACTGATCCCCATAGCTGGTAATCATTCAGCCTATGTAGTCTGTGACagag > 8:262708/3‑149 (MQ=255)
ataGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCaa > 4:158552/1‑148 (MQ=255)
taGAACATAAGTTGTCTCTGGAACCATTAATAGCAATTGAGGCAGCGTTGTTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGTTGGATGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAac < 3:289887/148‑1 (MQ=255)
taGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCCCGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAaca > 2:230933/1‑149 (MQ=255)
taGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCGac < 4:18762/148‑1 (MQ=255)
taGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAaca < 2:259171/149‑1 (MQ=255)
gAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACg > 1:189823/1‑149 (MQ=255)
aaCATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGGAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGCGCCAACACg > 6:173989/1‑148 (MQ=255)
aaCATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGGACGATAATAATATGAATGATTATTACCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACg > 5:306273/1‑148 (MQ=255)
aTAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGt > 5:230531‑M2/1‑148 (MQ=255)
aGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGtct > 5:150414‑M2/1‑145 (MQ=255)
tgtCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGtctgtca > 6:353545‑M2/1‑142 (MQ=255)
tctcTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCTCGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGActgcgtgttggctctgtcaca < 2:103585‑M1/149‑22 (MQ=255)
tctcTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTctgtcact > 5:121056/1‑149 (MQ=255)
tctcTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTctgtcact < 8:169817/149‑1 (MQ=255)
tctGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTctgtcactgt > 8:286238/1‑149 (MQ=255)
tGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGtct < 6:331794‑M2/139‑4 (MQ=255)
gAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGCTCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAg > 4:3453/1‑148 (MQ=255)
gAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATTACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAg > 8:398350/1‑148 (MQ=255)
gAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAg > 3:319543/1‑148 (MQ=255)
gAAGCATTCAGAGCAAATGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTCATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTCGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTctgtcactgtca < 7:185362/147‑1 (MQ=255)
aaGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATATTAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTTGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGa < 8:144930/149‑1 (MQ=255)
aGCATTCAGCGCAATTGAGGCAGCGTTGGGGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGaa < 1:338145/149‑1 (MQ=255)
cAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTgg < 1:74930/148‑1 (MQ=255)
agagCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGt > 2:40903/4‑148 (MQ=255)
agagCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGt > 6:235420/4‑148 (MQ=255)
agagCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGt > 7:346231/4‑148 (MQ=255)
agCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTaa > 7:317216/2‑148 (MQ=255)
cAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAAc > 3:54437/1‑149 (MQ=255)
cAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAAc > 7:295247/1‑149 (MQ=255)
aTTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTg < 3:208211/149‑1 (MQ=255)
aTTGAGGCAGCGTGTGTGAAGCACGATAATAATATGAATGATTATTCCCTGTGGGGTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACAAGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGGGGTAACACTg < 5:258656/149‑1 (MQ=255)
gAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCaa > 7:259002/1‑149 (MQ=255)
aGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGTTAAAACTGCAAc > 7:213315/1‑149 (MQ=255)
gCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAATGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTc < 6:38266/149‑1 (MQ=255)
gCAGCGATGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTTACAGAGCCAAAACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACt > 5:95091/1‑148 (MQ=255)
aGCGTTGGTGAAGCACTATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCaa < 6:269284/149‑1 (MQ=255)
aaGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTTGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCaa < 1:101338/148‑1 (MQ=255)
aCGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGccc < 6:147546/149‑1 (MQ=255)
gATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTc > 6:61744/1‑149 (MQ=255)
gATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTAGACTGATCACCATAACTCCAAATCATTAAAACTATTTAGTCTGTGAAAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTc > 1:165858/1‑149 (MQ=255)
taataataTGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAAGTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCAGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCg > 4:209029/1‑148 (MQ=255)
aataataTGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGt > 8:196835/1‑148 (MQ=255)
ataataTGAAGGATTATTCCCTGGTTGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTaa < 1:41802/149‑1 (MQ=255)
taataTGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGCGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAAt > 5:169689/1‑149 (MQ=255)
taataTGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAAt < 8:69224/149‑1 (MQ=255)
atatGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAAtt > 3:356887/1‑148 (MQ=255)
tatGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTaa < 7:396266/149‑1 (MQ=255)
tGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAg < 2:369936/148‑1 (MQ=255)
tGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGt < 5:205507/149‑1 (MQ=255)
tGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGt < 3:161434/149‑1 (MQ=255)
gAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGc < 6:85623/129‑1 (MQ=255)
aaGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGa < 4:2320/149‑1 (MQ=255)
aGGATTATTCCCTGGTGGTTTACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGaa < 5:283910/149‑1 (MQ=255)
aGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTaa < 3:102803/144‑1 (MQ=255)
aGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGaa > 1:282662/1‑149 (MQ=255)
aGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGaa > 3:128190/1‑149 (MQ=255)
ttattCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTa < 5:355043/149‑1 (MQ=255)
attCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTAc < 7:70974/148‑1 (MQ=255)
attCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTAc < 5:63283/148‑1 (MQ=255)
tCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTAc < 4:42149/146‑1 (MQ=255)
cccTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAAt < 2:72374/132‑1 (MQ=255)
ccTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAatat > 7:118503/1‑149 (MQ=255)
ggtggtTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTg > 2:345000/1‑90 (MQ=255)
gtgggTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTc < 7:371450/149‑1 (MQ=255)
gtTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCt < 1:249883/148‑1 (MQ=255)
gtTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGACACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTg > 4:131402/1‑149 (MQ=255)
ttGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGt > 1:220381/1‑149 (MQ=255)
gACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTa < 8:372110/133‑1 (MQ=255)
aCTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCg > 3:239712/1‑149 (MQ=255)
aCTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCg < 3:77107/149‑1 (MQ=255)
tGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCg > 7:142100/1‑147 (MQ=255)
tGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGa < 2:167235/149‑1 (MQ=255)
tGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTACTTAACCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCg > 6:303149/1‑147 (MQ=255)
tCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAggg < 8:314841/149‑1 (MQ=255)
aCCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCt > 2:289660/1‑137 (MQ=255)
ccATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTc > 4:262000/1‑134 (MQ=255)
cTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAAcgcg < 8:122931/149‑1 (MQ=255)
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AACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTC > NB501016:230:HFVJLAFXY:2:21107:5554:17083/1‑150 (MQ=60)
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ACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGGGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTACTTAACCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCA > NC_000913/579965‑580260
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
