Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
89,802 |
G→A |
E57K (GAG→AAG) |
yabB → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 89,802 | 0 | G | A | 99.5%
| 728.3
/ ‑5.5
| 202 | E57K (GAG→AAG) | yabB | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (120/80); total (122/80) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.17e-01 |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
CTTGAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCGAGCAAAAATTATCGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATG > NC_000913/89712‑89891
|
ctTGAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAg > 2:2944714/1‑93 (MQ=255)
ttGAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAga > 2:4390951/1‑92 (MQ=255)
tGAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCa < 1:1295247/93‑1 (MQ=255)
agaACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCaaa > 1:3963033/1‑93 (MQ=255)
gaACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCaaaa > 1:3449410/1‑93 (MQ=255)
aaCGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCaaaaa < 2:120956/93‑1 (MQ=255)
cGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCTCCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAAtt < 2:2144048/93‑1 (MQ=255)
gCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTa < 1:164014/93‑1 (MQ=255)
gCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTa > 2:3220259/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTAtt < 1:3279699/93‑2 (MQ=255)
tGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTAtt > 1:3007556/1‑92 (MQ=255)
tGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTAtt > 2:2484016/1‑92 (MQ=255)
tGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTAtt < 2:780384/93‑2 (MQ=255)
gCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTAttg < 2:4504213/93‑3 (MQ=255)
gCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTAttg < 1:167170/93‑3 (MQ=255)
ccGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATtgc < 2:1998715/93‑1 (MQ=255)
ccGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATtgc < 2:3932653/93‑1 (MQ=255)
ccGGTCAAATGGATTGCCCCATTGACATTTATCCCCCGTGCCTGCTGCTTTATCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATtgc < 2:809664/93‑1 (MQ=255)
cGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGTATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATtgcg > 2:347018/1‑93 (MQ=255)
ggTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGt > 2:2534583/1‑93 (MQ=255)
ggTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGt > 1:3749882/1‑93 (MQ=255)
ggTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCATGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGt > 2:4562975/1‑93 (MQ=255)
gTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTc > 2:1869095/1‑93 (MQ=255)
aaaTGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGt > 1:3095604/1‑93 (MQ=255)
aaaTGATTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGt > 2:3054703/1‑93 (MQ=255)
aaTGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTc < 1:229672/93‑1 (MQ=255)
tGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATg < 1:1081880/93‑1 (MQ=255)
tGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATg < 1:4500127/93‑1 (MQ=255)
gCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGa < 2:3602440/93‑1 (MQ=255)
gCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGa > 1:4166563/1‑93 (MQ=255)
cACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGaa < 2:1071466/93‑1 (MQ=255)
cACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGaa < 1:4612575/93‑1 (MQ=255)
ccATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAAcc < 1:1921935/93‑1 (MQ=255)
ccATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAAcc < 2:2328163/93‑1 (MQ=255)
ccATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAAcc > 1:4673109/1‑93 (MQ=255)
ccATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAAcc > 1:2872911/1‑93 (MQ=255)
ccATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAAcc > 1:4056380/1‑93 (MQ=255)
aTTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCg < 2:277922/93‑1 (MQ=255)
ttGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCgg > 1:2111635/1‑93 (MQ=255)
ttGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCgg < 1:3481615/93‑1 (MQ=255)
ttGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCgg > 1:3824404/1‑93 (MQ=255)
aTTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGGATGAACCCGGTTGAg > 2:1619571/1‑93 (MQ=255)
tttATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAgc > 1:924028/1‑93 (MQ=255)
ttATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAgcg < 1:178857/93‑1 (MQ=255)
aCCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCtgtg > 1:2741700/1‑93 (MQ=255)
cccGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCgtgt > 2:3384339/1‑93 (MQ=255)
cccGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCgtgt > 2:1935466/1‑93 (MQ=255)
cccGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGCAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTCGAGCGCCgtgt > 2:225630/1‑93 (MQ=255)
cGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGc > 2:497908/1‑93 (MQ=255)
ccTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAgcg > 2:368191/1‑93 (MQ=255)
ctgctgCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAgcgc > 1:2390368/1‑93 (MQ=255)
tgctgcTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGcc > 2:664964/1‑93 (MQ=255)
tgctgcTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGcc > 1:4401035/1‑93 (MQ=255)
gctgctTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCt < 2:2025871/93‑1 (MQ=255)
tgctTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTAc < 2:3534982/93‑1 (MQ=255)
tgctTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTAc > 1:858680/1‑93 (MQ=255)
tgctTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTAc > 2:1741132/1‑93 (MQ=255)
gctTTACCGCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAATTTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACt < 2:3856809/93‑1 (MQ=255)
ttACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGtt > 1:2918759/1‑93 (MQ=255)
tACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTa < 2:2862790/93‑1 (MQ=255)
aCCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAg < 1:2355581/93‑1 (MQ=255)
cccccTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAgg < 1:2687182/93‑1 (MQ=255)
ccccTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGt < 2:3168222/93‑1 (MQ=255)
ccccTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGt > 1:2787067/1‑93 (MQ=255)
cctgcctgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCa < 1:2926888/93‑1 (MQ=255)
ctgcctgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCAt > 2:1419746/1‑93 (MQ=255)
ctgcctgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCAt < 2:4134410/93‑1 (MQ=255)
tgcctgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATg < 1:3560806/93‑1 (MQ=255)
gcctgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGc > 1:304055/1‑93 (MQ=255)
ctgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCa > 1:1139202/1‑93 (MQ=255)
tgcaTGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCAAGAACCCGGATGAACGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAg > 2:4068955/4‑93 (MQ=255)
tgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAg > 2:421696/1‑93 (MQ=255)
gAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGc < 2:4023171/93‑1 (MQ=255)
gAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGc < 1:1250511/93‑1 (MQ=255)
aaTGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCg > 1:2070359/1‑93 (MQ=255)
aTGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGa > 2:3781235/1‑93 (MQ=255)
aTGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGa > 2:4656026/1‑93 (MQ=255)
tGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGaa < 1:4492972/93‑1 (MQ=255)
tGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGaa < 2:1297680/93‑1 (MQ=255)
tGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGaa < 1:647428/93‑1 (MQ=255)
gggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAAt > 1:3053541/1‑93 (MQ=255)
gggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAAt < 1:2174842/93‑1 (MQ=255)
ggAATTTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATg > 1:3981966/1‑93 (MQ=255)
ggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATg > 2:694409/1‑93 (MQ=255)
ggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATg < 2:318653/93‑1 (MQ=255)
ggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATg > 2:2667891/1‑93 (MQ=255)
ggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATg < 2:21767/93‑1 (MQ=255)
ggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATg > 2:1493444/1‑93 (MQ=255)
ggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATg < 2:2037424/93‑1 (MQ=255)
ggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATg < 2:4335051/93‑1 (MQ=255)
gAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGt > 2:3119755/1‑93 (MQ=255)
aaTTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCa > 2:2375082/1‑93 (MQ=255)
aTTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAg < 1:1704450/93‑1 (MQ=255)
ttATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAga > 1:3163970/1‑93 (MQ=255)
ttATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAga > 1:1825861/1‑93 (MQ=255)
tATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAgat < 2:4249960/93‑1 (MQ=255)
tATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAgat > 1:703387/1‑93 (MQ=255)
tATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAgat > 2:3419309/1‑93 (MQ=255)
aTCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAgatg > 1:4568617/1‑93 (MQ=255)
aTCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAgatg < 1:1482506/93‑1 (MQ=255)
|
CTTGAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCGAGCAAAAATTATCGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATG > NC_000913/89712‑89891
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGCTTGAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCGAGCAAAAATTATCGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATG > NC_000913/89709‑89895
|
CTGCTTGAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCA > SRR4302535.896659/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTGAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCA > SRR4302535.2490563/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTGAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCA < SRR4302535.2758666/94‑1 (MQ=60)
TGCTTGAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAA > SRR4302535.4199600/1‑94 (MQ=60)
GCTTGAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAG < SRR4302535.4556488/94‑1 (MQ=60)
TGAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAA < SRR4302535.1304486/94‑1 (MQ=60)
GAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAA > SRR4302535.3990102/1‑94 (MQ=60)
GAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAA < SRR4302535.3913943/94‑1 (MQ=60)
AGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAA > SRR4302535.3473391/1‑94 (MQ=60)
AGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAA > SRR4302535.3055918/1‑94 (MQ=60)
ACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACTCGTGCCTGCTGCTTTACACCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATT > SRR4302535.2483247/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTAT > SRR4302535.941026/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTAT > SRR4302535.314745/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTAT < SRR4302535.1672900/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTAT < SRR4302535.165159/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATT > SRR4302535.3028623/1‑94 (MQ=60)
TGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTG < SRR4302535.3302478/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGC < SRR4302535.168331/94‑1 (MQ=60)
CGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGT > SRR4302535.3775827/1‑94 (MQ=60)
GTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCT > SRR4302535.1102918/1‑94 (MQ=60)
CAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGT > SRR4302535.3117162/1‑94 (MQ=60)
CAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGT > SRR4302535.4525912/1‑94 (MQ=60)
AATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCG > SRR4302535.3070183/1‑94 (MQ=60)
AATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCG < SRR4302535.231255/94‑1 (MQ=60)
TTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCAT < SRR4302535.881296/94‑1 (MQ=60)
TTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCAT < SRR4302535.811725/94‑1 (MQ=60)
TGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGA < SRR4302535.1089572/94‑1 (MQ=60)
TGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGA > SRR4302535.4195091/1‑94 (MQ=60)
TGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGA < SRR4302535.4531033/94‑1 (MQ=60)
GCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAA < SRR4302535.1183444/94‑1 (MQ=60)
CACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAAC < SRR4302535.4643913/94‑1 (MQ=60)
ACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACC > SRR4302535.4084150/1‑94 (MQ=60)
ACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACC > SRR4302535.4704665/1‑94 (MQ=60)
ACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACC > SRR4302535.2893268/1‑94 (MQ=60)
ACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTAAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACC > SRR4302535.1694849/1‑94 (MQ=60)
CCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCC < SRR4302535.1935789/94‑1 (MQ=60)
CCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCC > SRR4302535.2964528/1‑94 (MQ=60)
ATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGG > SRR4302535.3850783/1‑94 (MQ=60)
ATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGG > SRR4302535.2126878/1‑94 (MQ=60)
TTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGT < SRR4302535.3505797/94‑1 (MQ=60)
TTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGT > SRR4302535.1759496/1‑94 (MQ=60)
GACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTG < SRR4302535.2883257/94‑1 (MQ=60)
CATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAG > SRR4302535.2903164/1‑94 (MQ=60)
ATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGC > SRR4302535.930573/1‑94 (MQ=60)
TTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCG > SRR4302535.2546411/1‑94 (MQ=60)
TTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGC < SRR4302535.180100/94‑1 (MQ=60)
ATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCG > SRR4302535.3502665/1‑94 (MQ=60)
CACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCTGTG > SRR4302535.2761241/1‑94 (MQ=60)
ACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGT > SRR4302535.2087668/1‑94 (MQ=60)
CCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTG > SRR4302535.1821340/1‑94 (MQ=60)
CCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTG > SRR4302535.4031701/1‑94 (MQ=60)
CGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCA > SRR4302535.707254/1‑94 (MQ=60)
GCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCG < SRR4302535.3097944/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCG > SRR4302535.341714/1‑94 (MQ=60)
CCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGC > SRR4302535.2407555/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCC > SRR4302535.4431152/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCT > SRR4302535.1270295/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTAC > SRR4302535.864738/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTAC > SRR4302535.1932319/1‑94 (MQ=60)
TGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACT < SRR4302535.3906315/94‑1 (MQ=60)
GCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTG < SRR4302535.1995143/94‑1 (MQ=60)
TTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTT > SRR4302535.2939356/1‑94 (MQ=60)
TACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAG < SRR4302535.1572926/94‑1 (MQ=60)
TACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAG < SRR4302535.1434909/94‑1 (MQ=60)
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CCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGT < SRR4302535.2706392/94‑1 (MQ=60)
CCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGT > SRR4302535.2806898/1‑94 (MQ=60)
CCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTC > SRR4302535.2732337/1‑94 (MQ=60)
CCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCAT < SRR4302535.2947518/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGC > SRR4302535.4120252/1‑94 (MQ=60)
TGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGC < SRR4302535.3585496/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGC > SRR4302535.306167/1‑94 (MQ=60)
GCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCC > SRR4302535.4397043/1‑94 (MQ=60)
GCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCC > SRR4302535.324489/1‑94 (MQ=60)
CCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCA > SRR4302535.368175/1‑94 (MQ=60)
CCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCA > SRR4302535.1147322/1‑94 (MQ=60)
CTGAATGGGAAATTATCGAGCAAAAATTATCGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAG > SRR4302535.2946690/1‑94 (MQ=60)
CTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAG > SRR4302535.4647289/1‑94 (MQ=60)
CTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAG < SRR4302535.531531/94‑1 (MQ=60)
TGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGC > SRR4302535.2803797/1‑94 (MQ=60)
TGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGC > SRR4302535.2328619/1‑94 (MQ=60)
GAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCG > SRR4302535.2085282/1‑94 (MQ=60)
GAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCG < SRR4302535.1259440/94‑1 (MQ=60)
TGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAAT < SRR4302535.651941/94‑1 (MQ=60)
TGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAAT > SRR4302535.3074921/1‑94 (MQ=60)
TGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAAT < SRR4302535.4523812/94‑1 (MQ=60)
TGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAAT > SRR4302535.2310488/1‑94 (MQ=60)
GGGAATTTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATG > SRR4302535.4009171/1‑94 (MQ=60)
GGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATG < SRR4302535.2190394/94‑1 (MQ=60)
GGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGT > SRR4302535.4454907/1‑94 (MQ=60)
AAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGCGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCA > SRR4302535.4004362/1‑94 (MQ=60)
AAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCA > SRR4302535.4622218/1‑94 (MQ=60)
AAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCA > SRR4302535.3505996/1‑94 (MQ=60)
AAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGAGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGGCATGCCAGCGAATGTCA > SRR4302535.2152846/1‑94 (MQ=60)
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TATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATG > SRR4302535.3795221/1‑94 (MQ=60)
ATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGG < SRR4302535.1493107/94‑1 (MQ=60)
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TCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGA > SRR4302535.1593254/1‑94 (MQ=60)
CAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGAT < SRR4302535.306354/94‑1 (MQ=60)
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AAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATG < SRR4302535.615263/94‑1 (MQ=60)
AAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATG < SRR4302535.3583503/94‑1 (MQ=60)
|
CTGCTTGAGAACGCTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCGAGCAAAAATTATCGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATG > NC_000913/89709‑89895
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
