Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
89,815 |
C→T |
S61L (TCG→TTG) |
yabB → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 89,815 | 0 | C | T | 99.5%
| 719.1
/ ‑5.5
| 198 | S61L (TCG→TTG) | yabB | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (122/75); total (123/75) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.83e-01 |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
CCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCGAGCAAAAATTATCGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGTC > NC_000913/89725‑89904
|
ccGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATtgc < 2:3932653/93‑1 (MQ=255)
ccGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATtgc < 2:262901/93‑1 (MQ=255)
cGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGTATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATtgcg > 2:347018/1‑93 (MQ=255)
ggTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCATGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGt > 2:4562975/1‑93 (MQ=255)
tCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCt > 1:1095125/1‑93 (MQ=255)
aaaTGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGt > 1:4495059/1‑93 (MQ=255)
aaaTGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGt > 1:3095604/1‑93 (MQ=255)
aaaTGATTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGt > 2:3054703/1‑93 (MQ=255)
aaTGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTc < 1:229672/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCg > 1:3048825/1‑93 (MQ=255)
tttGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCa > 2:121706/1‑93 (MQ=255)
tttGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCa < 1:875095/93‑1 (MQ=255)
tttGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCa < 1:806071/93‑1 (MQ=255)
gCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGa < 2:3602440/93‑1 (MQ=255)
cACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGaa < 2:1071466/93‑1 (MQ=255)
ccATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCCAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCCTGAAcc > 2:821991/1‑93 (MQ=255)
ccATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAAcc > 1:4673109/1‑93 (MQ=255)
ccATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAAcc < 2:2328163/93‑1 (MQ=255)
ccATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAAcc > 1:2872911/1‑93 (MQ=255)
ccATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTAAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAAcc > 1:1682662/1‑93 (MQ=255)
cATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAAccc < 2:3215261/93‑1 (MQ=255)
aTTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCg < 2:277922/93‑1 (MQ=255)
tGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGt > 1:1746861/1‑93 (MQ=255)
tGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGt > 2:2020333/1‑93 (MQ=255)
gACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGtt < 2:2514273/93‑1 (MQ=255)
cATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGa > 2:1992151/1‑93 (MQ=255)
aTTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGGATGAACCCGGTTGAg > 2:1619571/1‑93 (MQ=255)
ttATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAgcg > 1:2528198/1‑93 (MQ=255)
tCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCg > 1:3478495/1‑93 (MQ=255)
cccGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCgtgt > 2:3384339/1‑93 (MQ=255)
cccGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCgtgt > 1:2072735/1‑93 (MQ=255)
cccGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGCAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTCGAGCGCCgtgt > 2:225630/1‑93 (MQ=255)
ccGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGtgtg > 1:1808252/1‑93 (MQ=255)
ccGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGtgtg > 1:4004307/1‑93 (MQ=255)
gTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCa > 1:702330/1‑93 (MQ=255)
ccTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAgcg > 2:368191/1‑93 (MQ=255)
tgctgcTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGcc > 2:4086343/1‑93 (MQ=255)
tgctgcTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGcc > 1:4401035/1‑93 (MQ=255)
tgctTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTAc < 2:1873057/93‑1 (MQ=255)
tgctTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTAc > 2:1741132/1‑93 (MQ=255)
gctTTACCGCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAATTTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACt < 2:3856809/93‑1 (MQ=255)
gctTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACt < 1:1980881/93‑1 (MQ=255)
tttACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGt < 2:61514/93‑1 (MQ=255)
ttACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGtt > 1:2918759/1‑93 (MQ=255)
tACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTa < 1:1561672/93‑1 (MQ=255)
tACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTa < 2:2862790/93‑1 (MQ=255)
ccccTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGt < 2:3168222/93‑1 (MQ=255)
cccTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTc > 1:2712952/1‑93 (MQ=255)
cctgcctgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCa < 1:2926888/93‑1 (MQ=255)
ctgcctgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCAt > 2:1419746/1‑93 (MQ=255)
tgcctgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATg > 2:1867303/1‑93 (MQ=255)
tgcctgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATg < 1:3560806/93‑1 (MQ=255)
gcctgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGc > 1:304055/1‑93 (MQ=255)
gcctgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGc > 1:4092248/1‑93 (MQ=255)
cctgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGcc > 1:322258/1‑93 (MQ=255)
tgAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAg > 2:421696/1‑93 (MQ=255)
gAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGc < 2:4023171/93‑1 (MQ=255)
gAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGc < 1:1250511/93‑1 (MQ=255)
gAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGc > 1:2783987/1‑93 (MQ=255)
gAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGc > 2:2171391/1‑93 (MQ=255)
aTGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGa > 2:4656026/1‑93 (MQ=255)
aTGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGa > 2:3781235/1‑93 (MQ=255)
tGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGaa < 2:1297680/93‑1 (MQ=255)
tGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGaa > 2:803801/1‑93 (MQ=255)
ggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATg < 2:4335051/93‑1 (MQ=255)
ggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATg > 2:694409/1‑93 (MQ=255)
ggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATg < 2:318653/93‑1 (MQ=255)
ggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATg > 2:2667891/1‑93 (MQ=255)
ggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATg > 2:1493444/1‑93 (MQ=255)
ggAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATg < 2:2037424/93‑1 (MQ=255)
gAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGt > 2:3119755/1‑93 (MQ=255)
aaTTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGCGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCa > 1:3977191/1‑93 (MQ=255)
aaTTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCa > 1:3481814/1‑93 (MQ=255)
aaTTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCa > 2:2375082/1‑93 (MQ=255)
aaTTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCa > 1:4590969/1‑93 (MQ=255)
aaTTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGAGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGGCATGCCAGCGAATGTCa > 1:2137452/1‑93 (MQ=255)
aTTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAg > 2:4493236/1‑93 (MQ=255)
ttATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAga < 1:4550811/93‑1 (MQ=255)
ttATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAga > 2:3559826/1‑93 (MQ=255)
tATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAgat < 2:4249960/93‑1 (MQ=255)
tATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAgat > 2:3419309/1‑93 (MQ=255)
aTCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAgatg > 1:2376831/1‑93 (MQ=255)
aTCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAgatg > 1:3769205/1‑93 (MQ=255)
caaGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAgatgga > 1:4467126/3‑93 (MQ=255)
aaGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGGGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAgatggat < 1:2346171/92‑1 (MQ=255)
aaGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAgatggat < 1:611009/92‑1 (MQ=255)
gCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGatggatgg < 1:1160606/93‑1 (MQ=255)
gCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGatggatgg < 1:4308031/93‑1 (MQ=255)
cAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGgc < 1:3855340/93‑1 (MQ=255)
aaaaaTTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGgcg > 1:3055391/1‑93 (MQ=255)
aaaaaTTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGgcg > 1:1486722/1‑93 (MQ=255)
aaaTTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCa > 1:2449949/1‑93 (MQ=255)
aaTTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAg > 1:1914995/1‑93 (MQ=255)
aaTTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAg > 2:368460/1‑93 (MQ=255)
attattGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAgg > 1:2227089/1‑93 (MQ=255)
attattGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAgg > 1:1469752/1‑93 (MQ=255)
ttATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGt > 1:1409962/1‑93 (MQ=255)
ttATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGt < 1:1072102/93‑1 (MQ=255)
tATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGTc < 2:3304101/93‑1 (MQ=255)
tATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGTc > 2:2396329/1‑93 (MQ=255)
|
CCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCGAGCAAAAATTATCGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGTC > NC_000913/89725‑89904
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCGAGCAAAAATTATCGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGTCGATT > NC_000913/89722‑89908
|
CTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATT > SRR4302535.3028623/1‑94 (MQ=60)
TGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTG < SRR4302535.3302478/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGC < SRR4302535.168331/94‑1 (MQ=60)
CGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGT > SRR4302535.3775827/1‑94 (MQ=60)
GTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCT > SRR4302535.1102918/1‑94 (MQ=60)
CAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGT > SRR4302535.4525912/1‑94 (MQ=60)
CAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGT > SRR4302535.3117162/1‑94 (MQ=60)
AATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCG < SRR4302535.231255/94‑1 (MQ=60)
AATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCG > SRR4302535.3070183/1‑94 (MQ=60)
TTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCAT < SRR4302535.811725/94‑1 (MQ=60)
TTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCAT < SRR4302535.881296/94‑1 (MQ=60)
TGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGA < SRR4302535.4531033/94‑1 (MQ=60)
TGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGA > SRR4302535.4195091/1‑94 (MQ=60)
TGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGA < SRR4302535.1089572/94‑1 (MQ=60)
GCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAA < SRR4302535.1183444/94‑1 (MQ=60)
CACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAAC < SRR4302535.4643913/94‑1 (MQ=60)
ACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACC > SRR4302535.4084150/1‑94 (MQ=60)
ACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACC > SRR4302535.2893268/1‑94 (MQ=60)
ACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACC > SRR4302535.4704665/1‑94 (MQ=60)
ACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTAAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACC > SRR4302535.1694849/1‑94 (MQ=60)
CCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCC > SRR4302535.2964528/1‑94 (MQ=60)
CCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCC < SRR4302535.1935789/94‑1 (MQ=60)
ATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGG > SRR4302535.3850783/1‑94 (MQ=60)
ATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGG > SRR4302535.2126878/1‑94 (MQ=60)
TTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGT < SRR4302535.3505797/94‑1 (MQ=60)
TTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGT > SRR4302535.1759496/1‑94 (MQ=60)
GACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTG < SRR4302535.2883257/94‑1 (MQ=60)
CATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAG > SRR4302535.2903164/1‑94 (MQ=60)
ATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGC > SRR4302535.930573/1‑94 (MQ=60)
TTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCG > SRR4302535.2546411/1‑94 (MQ=60)
TTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGC < SRR4302535.180100/94‑1 (MQ=60)
ATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCG > SRR4302535.3502665/1‑94 (MQ=60)
CACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCTGTG > SRR4302535.2761241/1‑94 (MQ=60)
ACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGT > SRR4302535.2087668/1‑94 (MQ=60)
CCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTG > SRR4302535.1821340/1‑94 (MQ=60)
CCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTG > SRR4302535.4031701/1‑94 (MQ=60)
CGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCA > SRR4302535.707254/1‑94 (MQ=60)
GCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCG < SRR4302535.3097944/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCG > SRR4302535.341714/1‑94 (MQ=60)
CCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGC > SRR4302535.2407555/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCC > SRR4302535.4431152/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCT > SRR4302535.1270295/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTAC > SRR4302535.864738/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTAC > SRR4302535.1932319/1‑94 (MQ=60)
TGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACT < SRR4302535.3906315/94‑1 (MQ=60)
GCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTG < SRR4302535.1995143/94‑1 (MQ=60)
TTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTT > SRR4302535.2939356/1‑94 (MQ=60)
TACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAG < SRR4302535.1572926/94‑1 (MQ=60)
TACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAG < SRR4302535.1434909/94‑1 (MQ=60)
ACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGG < SRR4302535.2372472/94‑1 (MQ=60)
CCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGT < SRR4302535.2706392/94‑1 (MQ=60)
CCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGT > SRR4302535.2806898/1‑94 (MQ=60)
CCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTC > SRR4302535.2732337/1‑94 (MQ=60)
CCTGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCAT < SRR4302535.2947518/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGC < SRR4302535.3585496/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGC > SRR4302535.4120252/1‑94 (MQ=60)
TGCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGC > SRR4302535.306167/1‑94 (MQ=60)
GCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCC > SRR4302535.4397043/1‑94 (MQ=60)
GCCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCC > SRR4302535.324489/1‑94 (MQ=60)
CCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCA > SRR4302535.368175/1‑94 (MQ=60)
CCTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCA > SRR4302535.1147322/1‑94 (MQ=60)
CTGAATGGGAAATTATCGAGCAAAAATTATCGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAG > SRR4302535.2946690/1‑94 (MQ=60)
CTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAG < SRR4302535.531531/94‑1 (MQ=60)
CTGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAG > SRR4302535.4647289/1‑94 (MQ=60)
TGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGC > SRR4302535.2328619/1‑94 (MQ=60)
TGAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGC > SRR4302535.2803797/1‑94 (MQ=60)
GAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCG > SRR4302535.2085282/1‑94 (MQ=60)
GAATGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCG < SRR4302535.1259440/94‑1 (MQ=60)
TGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAAT < SRR4302535.4523812/94‑1 (MQ=60)
TGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAAT > SRR4302535.3074921/1‑94 (MQ=60)
TGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAAT > SRR4302535.2310488/1‑94 (MQ=60)
TGGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAAT < SRR4302535.651941/94‑1 (MQ=60)
GGGAATTTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATG > SRR4302535.4009171/1‑94 (MQ=60)
GGGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATG < SRR4302535.2190394/94‑1 (MQ=60)
GGAAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGT > SRR4302535.4454907/1‑94 (MQ=60)
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AAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCA > SRR4302535.3505996/1‑94 (MQ=60)
AAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCA > SRR4302535.4622218/1‑94 (MQ=60)
AAATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGAGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGGCATGCCAGCGAATGTCA > SRR4302535.2152846/1‑94 (MQ=60)
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ATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGA > SRR4302535.3185909/1‑94 (MQ=60)
ATTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGA < SRR4302535.1716773/94‑1 (MQ=60)
TTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGAT > SRR4302535.708321/1‑94 (MQ=60)
TTATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGAT < SRR4302535.4581916/94‑1 (MQ=60)
TATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATG > SRR4302535.2393903/1‑94 (MQ=60)
TATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATG > SRR4302535.3795221/1‑94 (MQ=60)
TATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATG > SRR4302535.4599776/1‑94 (MQ=60)
ATCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGG < SRR4302535.1493107/94‑1 (MQ=60)
TCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGA > SRR4302535.4497774/1‑94 (MQ=60)
TCAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGA > SRR4302535.1593254/1‑94 (MQ=60)
CAAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGAT < SRR4302535.306354/94‑1 (MQ=60)
AAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGGGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATG < SRR4302535.2362986/94‑1 (MQ=60)
AAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATG < SRR4302535.3583503/94‑1 (MQ=60)
AAGCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATG < SRR4302535.615263/94‑1 (MQ=60)
GCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGC < SRR4302535.1168905/94‑1 (MQ=60)
GCAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGC < SRR4302535.4337504/94‑1 (MQ=60)
CAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCG > SRR4302535.1541682/1‑94 (MQ=60)
CAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCG < SRR4302535.3881888/94‑1 (MQ=60)
CAAAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCG > SRR4302535.3076775/1‑94 (MQ=60)
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AAAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCA > SRR4302535.2467604/1‑94 (MQ=60)
AAATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAG > SRR4302535.1928794/1‑94 (MQ=60)
AATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGG > SRR4302535.1480280/1‑94 (MQ=60)
AATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGG > SRR4302535.2242934/1‑94 (MQ=60)
ATTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGT > SRR4302535.1420028/1‑94 (MQ=60)
TTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGTC < SRR4302535.247927/94‑1 (MQ=60)
TTATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGTC < SRR4302535.1079717/94‑1 (MQ=60)
TATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGTCG > SRR4302535.2715706/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGTCGA > SRR4302535.1534832/1‑94 (MQ=60)
TTGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGTCGAT < SRR4302535.3671261/94‑1 (MQ=60)
TGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGTCGATT > SRR4302535.3689157/1‑94 (MQ=60)
TGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGTCGATT > SRR4302535.3861267/1‑94 (MQ=60)
|
CTGCCGGTCAAATGGTTTGCACCATTGACATTTATCACCCGTGCCTGCTGCTTTACCCCCTGCCTGAATGGGAAATTATCGAGCAAAAATTATCGCGTCTGTCGAGCATGAACCCGGTTGAGCGCCGTGTGCAGCGCCTACTGTTAGGTCATGCCAGCGAATGTCAGATGGATGGCGCAGGTCGATT > NC_000913/89722‑89908
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
