Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,432,258 |
T→C |
G136G (GGT→GGC) |
fmt → |
10‑formyltetrahydrofolate:L‑methionyl‑tRNA(fMet) N‑formyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,432,258 | 0 | T | C | 99.5%
| 631.6
/ ‑6.3
| 203 | G136G (GGT→GGC) | fmt | 10‑formyltetrahydrofolate:L‑methionyl‑tRNA(fMet) N‑formyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (90/112); total (90/113) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
CTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGG > NC_000913/3432168‑3432347
|
cTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGgcgt > 1:488604/1‑93 (MQ=255)
gTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGa > 2:1967387/1‑93 (MQ=255)
gTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGa > 1:1850473/1‑93 (MQ=255)
aTCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGAcc > 1:109281/1‑93 (MQ=255)
aTCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGAcc < 2:2401043/93‑1 (MQ=255)
tCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCGAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTTACCa > 2:464097/1‑93 (MQ=255)
tCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCa > 2:1693940/1‑93 (MQ=255)
cAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCAt < 1:3254857/93‑1 (MQ=255)
aaCGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCAtt > 1:3942319/1‑93 (MQ=255)
aaCGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCAtt > 1:249061/1‑93 (MQ=255)
aaCGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGAGATGCAGAAACTGGCGTGCCCCtt > 1:3195221/1‑93 (MQ=255)
acattCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTa < 1:2420745/90‑1 (MQ=255)
aCGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTa < 1:1561878/93‑1 (MQ=255)
aCGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTa > 2:3375264/1‑93 (MQ=255)
cGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTAt > 2:154735/1‑93 (MQ=255)
cGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTAt < 1:572998/93‑1 (MQ=255)
cGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTAt < 2:2750226/93‑1 (MQ=255)
gTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATg > 2:2164486/1‑93 (MQ=255)
gTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATg > 2:612615/1‑93 (MQ=255)
gTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATg > 2:1216572/1‑93 (MQ=255)
tCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCa > 1:4148072/1‑93 (MQ=255)
tCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCa > 2:3842296/1‑93 (MQ=255)
cATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCaa > 1:1318205/1‑93 (MQ=255)
tGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGTAACTGGCGTGAGCATTATGCAAAt > 1:835812/1‑93 (MQ=255)
tGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAAt < 1:1651248/93‑1 (MQ=255)
ggTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATg < 2:2156519/93‑1 (MQ=255)
ggTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATg > 1:2567622/1‑93 (MQ=255)
ggTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATg < 2:3306274/93‑1 (MQ=255)
ggTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATg < 2:4664813/93‑1 (MQ=255)
gTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATgg > 2:4291579/1‑93 (MQ=255)
gTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATga > 2:3719720/1‑92 (MQ=255)
gTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTCCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATgg < 2:1565924/93‑1 (MQ=255)
ttCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGa < 1:1580189/93‑1 (MQ=255)
tCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGAt > 1:346029/1‑93 (MQ=255)
tCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGAt < 2:3856026/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGt < 2:2042275/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGt < 2:3092499/93‑1 (MQ=255)
aCTGCCGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGt < 1:2804079/93‑1 (MQ=255)
ctgctgCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTc > 2:1903389/1‑93 (MQ=255)
ctgctgCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTc < 2:2897571/93‑1 (MQ=255)
ctgctgCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTc < 1:3631531/93‑1 (MQ=255)
tgcCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGtt > 2:1489183/1‑93 (MQ=255)
ccACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTa < 2:3162043/93‑1 (MQ=255)
cACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAg > 2:3922545/1‑93 (MQ=255)
aCGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGa < 1:4188792/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGac > 1:304493/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGaca > 2:2970583/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGacac > 1:2829937/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGacac < 1:4277360/93‑1 (MQ=255)
cgcgGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGt > 1:4380329/1‑93 (MQ=255)
gcgGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTg > 1:2976175/1‑93 (MQ=255)
ggTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGat > 2:2631704/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGata > 1:905487/1‑93 (MQ=255)
tgctgcACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGatat < 2:1001883/93‑1 (MQ=255)
ctgcACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGc < 1:4111755/93‑1 (MQ=255)
ctgcACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGc > 1:436781/1‑93 (MQ=255)
tgcACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGct > 2:447248/1‑93 (MQ=255)
tgcACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGct > 1:1953239/1‑93 (MQ=255)
cACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGctct < 1:356581/93‑1 (MQ=255)
aCCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCta > 2:525013/1‑93 (MQ=255)
aCCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCta > 1:610192/1‑93 (MQ=255)
ccAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCtat > 2:3669583/1‑93 (MQ=255)
ccAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCtat < 2:485438/93‑1 (MQ=255)
ccAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCtat > 1:3147916/1‑93 (MQ=255)
aaTCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATaa < 2:428483/93‑1 (MQ=255)
aaTCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATaa < 2:1774598/93‑1 (MQ=255)
aaTCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATaa < 1:2731638/93‑1 (MQ=255)
aaTCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATaa < 1:3921964/93‑1 (MQ=255)
aaTCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATaa < 1:2850479/93‑1 (MQ=255)
aTCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAg > 1:349668/1‑93 (MQ=255)
tCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGc < 1:3978508/93‑1 (MQ=255)
cAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGctc < 2:2509962/93‑1 (MQ=255)
aaCGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGctct > 1:242525/1‑93 (MQ=255)
aaCGCTCACTATGGGCGGGCGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGctct > 2:836988/1‑93 (MQ=255)
cGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTcc < 2:2261695/93‑1 (MQ=255)
tCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGc > 1:203255/1‑93 (MQ=255)
tCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGc > 1:646943/1‑93 (MQ=255)
cACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGcc < 2:2094611/93‑1 (MQ=255)
aCTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGccc < 1:100475/93‑1 (MQ=255)
aCTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGccc < 1:4345679/93‑1 (MQ=255)
cTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCg > 2:4530382/1‑93 (MQ=255)
cTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCg > 1:323309/1‑93 (MQ=255)
cTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTCATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCg > 2:2577513/1‑93 (MQ=255)
tATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGa < 2:4235445/93‑1 (MQ=255)
aTGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGAt < 1:1604337/93‑1 (MQ=255)
aTGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGAt < 1:2136002/93‑1 (MQ=255)
tGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGAtt < 1:1789735/93‑1 (MQ=255)
tGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGAtt < 2:892399/93‑1 (MQ=255)
gggCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTa < 1:4011614/93‑1 (MQ=255)
gggCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTa < 1:3660889/93‑1 (MQ=255)
gCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACt < 2:2447280/93‑1 (MQ=255)
ggTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCa > 1:217822/1‑93 (MQ=255)
aTGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCagaag > 2:1612227/1‑93 (MQ=255)
tGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCagaaga < 1:920688/93‑1 (MQ=255)
gAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATAcc < 1:4484290/93‑1 (MQ=255)
gAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATAcc > 2:1353603/1‑93 (MQ=255)
gAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATAcc > 2:638893/1‑93 (MQ=255)
aaCTGGCGTGACCATTATGAAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAg < 1:4551698/93‑1 (MQ=255)
aCTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGt < 1:1705251/93‑1 (MQ=255)
tGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTgg < 2:1024461/93‑1 (MQ=255)
|
CTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGG > NC_000913/3432168‑3432347
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACG > NC_000913/3432165‑3432351
|
TGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGC < SRR4302535.2835970/94‑1 (MQ=60)
GGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCG < SRR4302535.2435749/94‑1 (MQ=60)
GGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCG > SRR4302535.1720687/1‑94 (MQ=60)
GCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGT > SRR4302535.492029/1‑94 (MQ=60)
TGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGA > SRR4302535.1863809/1‑94 (MQ=60)
TATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACC > SRR4302535.110054/1‑94 (MQ=60)
TCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCAT < SRR4302535.531842/94‑1 (MQ=60)
CAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATT > SRR4302535.250776/1‑94 (MQ=60)
CAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATT > SRR4302535.3969229/1‑94 (MQ=60)
CAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATT < SRR4302535.3277471/94‑1 (MQ=60)
AACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTA > SRR4302535.829631/1‑94 (MQ=60)
ACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTAT > SRR4302535.286145/1‑94 (MQ=60)
ACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTAT > SRR4302535.3818338/1‑94 (MQ=60)
ACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTAT < SRR4302535.440317/94‑1 (MQ=60)
ACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTAT < SRR4302535.1573132/94‑1 (MQ=60)
ACATTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTAT < SRR4302535.2438176/94‑1 (MQ=60)
CGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATG < SRR4302535.577020/94‑1 (MQ=60)
TTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCA < SRR4302535.3362010/94‑1 (MQ=60)
TTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCA > SRR4302535.4176473/1‑94 (MQ=60)
TCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAA > SRR4302535.4627765/1‑94 (MQ=60)
TCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAA > SRR4302535.1327622/1‑94 (MQ=60)
CATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAA > SRR4302535.3418365/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGTAACTGGCGTGAGCATTATGCAAAT > SRR4302535.841674/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAAT < SRR4302535.4651079/94‑1 (MQ=60)
ATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAAT < SRR4302535.4029332/94‑1 (MQ=60)
TGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATG < SRR4302535.1964964/94‑1 (MQ=60)
TGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATG > SRR4302535.2586093/1‑94 (MQ=60)
TGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATG < SRR4302535.1663187/94‑1 (MQ=60)
TTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGAT > SRR4302535.348411/1‑94 (MQ=60)
TTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGAT < SRR4302535.1591596/94‑1 (MQ=60)
CACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGT < SRR4302535.3272604/94‑1 (MQ=60)
ACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTC > SRR4302535.3253068/1‑94 (MQ=60)
ACTGCCGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTC < SRR4302535.2824018/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCG < SRR4302535.4195756/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCG < SRR4302535.3656705/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGG < SRR4302535.982560/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGG > SRR4302535.3661877/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGT < SRR4302535.2177595/94‑1 (MQ=60)
TGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGCTGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTT > SRR4302535.1573630/1‑94 (MQ=60)
GCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTA < SRR4302535.2830541/94‑1 (MQ=60)
CCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAG < SRR4302535.203816/94‑1 (MQ=60)
CCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAG < SRR4302535.867479/94‑1 (MQ=60)
CACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGA > SRR4302535.2071557/1‑94 (MQ=60)
CACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGA > SRR4302535.1619067/1‑94 (MQ=60)
ACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGAC < SRR4302535.4217463/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGAC > SRR4302535.917506/1‑94 (MQ=60)
ACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGAC > SRR4302535.306606/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACAC > SRR4302535.2269579/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACAC > SRR4302535.2850023/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACC < SRR4302535.4306634/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACC > SRR4302535.1860424/1‑94 (MQ=60)
TGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCG < SRR4302535.4117719/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCG > SRR4302535.1029245/1‑94 (MQ=60)
TGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCG < SRR4302535.2925411/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGT > SRR4302535.4410298/1‑94 (MQ=60)
CGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGaccacgcagatcgg < SRR4302535.1967640/94‑15 (MQ=60)
CGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTG > SRR4302535.2997058/1‑94 (MQ=60)
CGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTG < SRR4302535.3539978/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGA > SRR4302535.1230164/1‑94 (MQ=60)
CGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGAT > SRR4302535.3169473/1‑94 (MQ=60)
CGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGAT < SRR4302535.640493/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATA > SRR4302535.911913/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGAGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATA < SRR4302535.4558821/94‑1 (MQ=60)
GCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGC > SRR4302535.439831/1‑94 (MQ=60)
CTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCT < SRR4302535.4139898/94‑1 (MQ=60)
CTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCT < SRR4302535.1938911/94‑1 (MQ=60)
CTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCT > SRR4302535.1967297/1‑94 (MQ=60)
CACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTA > SRR4302535.3215950/1‑94 (MQ=60)
CACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTA < SRR4302535.359045/94‑1 (MQ=60)
CACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTA > SRR4302535.614443/1‑94 (MQ=60)
ACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTAT > SRR4302535.3169800/1‑94 (MQ=60)
CAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAA > SRR4302535.3506763/1‑94 (MQ=60)
AATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAG < SRR4302535.2751138/94‑1 (MQ=60)
AATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAG < SRR4302535.592594/94‑1 (MQ=60)
AATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAG < SRR4302535.3948775/94‑1 (MQ=60)
AATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAG < SRR4302535.2870676/94‑1 (MQ=60)
AATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAG > SRR4302535.352076/1‑94 (MQ=60)
TCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCT < SRR4302535.3020396/94‑1 (MQ=60)
TCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCT < SRR4302535.4005695/94‑1 (MQ=60)
TCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCT > SRR4302535.4438803/1‑94 (MQ=60)
CAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCT > SRR4302535.244187/1‑94 (MQ=60)
CAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCT < SRR4302535.3648094/94‑1 (MQ=60)
CGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCT < SRR4302535.1593002/94‑1 (MQ=60)
CGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCT < SRR4302535.1682013/94‑1 (MQ=60)
GCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTG < SRR4302535.2438702/94‑1 (MQ=60)
CTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGC > SRR4302535.651454/1‑94 (MQ=60)
CTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGC > SRR4302535.204641/1‑94 (MQ=60)
CTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGC > SRR4302535.2804046/1‑94 (MQ=60)
TCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCC < SRR4302535.4056196/94‑1 (MQ=60)
ACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCG > SRR4302535.325543/1‑94 (MQ=60)
ACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCG < SRR4302535.4375414/94‑1 (MQ=60)
ACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCG < SRR4302535.101182/94‑1 (MQ=60)
CTATGGGCGGGGGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGA > SRR4302535.3968084/1‑94 (MQ=60)
ATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATT < SRR4302535.2467823/94‑1 (MQ=60)
ATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATT < SRR4302535.1615909/94‑1 (MQ=60)
ATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATT < SRR4302535.2151390/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTA < SRR4302535.1802681/94‑1 (MQ=60)
GGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTAC < SRR4302535.3686229/94‑1 (MQ=60)
GGGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTAC < SRR4302535.4039058/94‑1 (MQ=60)
GGCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACT < SRR4302535.4349542/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCAGTAGGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTG < SRR4302535.4005042/94‑1 (MQ=60)
GGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCA > SRR4302535.2745119/1‑94 (MQ=60)
GGGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCA > SRR4302535.219322/1‑94 (MQ=60)
GGTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAG < SRR4302535.2803699/94‑1 (MQ=60)
GTGATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGA > SRR4302535.4265389/1‑94 (MQ=60)
ATGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGA > SRR4302535.4379674/1‑94 (MQ=60)
TGCAGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGAT < SRR4302535.927219/94‑1 (MQ=60)
AGAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACC < SRR4302535.1729780/94‑1 (MQ=60)
GAAACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCA < SRR4302535.4515075/94‑1 (MQ=60)
AACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGT < SRR4302535.4160980/94‑1 (MQ=60)
AACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGT < SRR4302535.1347234/94‑1 (MQ=60)
AACTGGCGTGACCATTATGAAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGT < SRR4302535.4582805/94‑1 (MQ=60)
ACTGGCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTG < SRR4302535.1717577/94‑1 (MQ=60)
TGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGTAGATACCAGTGGT < SRR4302535.2552116/94‑1 (MQ=60)
GCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTAC < SRR4302535.2240716/94‑1 (MQ=60)
GCGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTAC < SRR4302535.2274436/94‑1 (MQ=60)
CGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACG > SRR4302535.1800946/1‑94 (MQ=60)
CGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACG < SRR4302535.2022909/94‑1 (MQ=60)
|
TGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACG > NC_000913/3432165‑3432351
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
