Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,785,382 |
G→A |
T306T (ACG→ACA) |
b3613 → |
putative membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,785,382 | 0 | G | A | 99.6%
| 971.5
/ ‑5.7
| 270 | T306T (ACG→ACA) | b3613 | putative membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (104/165); total (105/165) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.89e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.42e-01 |
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
ACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAT > NC_000913/3785292‑3785471
|
accgaccgAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACt > 2:4321063/1‑93 (MQ=255)
accgaccgAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACt > 2:2823785/1‑93 (MQ=255)
ccgaccgaAAGCGAAAAACCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTg < 2:108610/93‑1 (MQ=255)
gaccgaAAGCGAAAAATCGCCGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCa > 2:3188079/1‑93 (MQ=255)
ccgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATc > 2:824771/1‑93 (MQ=255)
ccgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATc < 1:2062445/93‑1 (MQ=255)
ccgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGGGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGAGAGTGCATc > 2:3565711/1‑93 (MQ=255)
cgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCg > 1:1533836/1‑93 (MQ=255)
cgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCg > 2:2259/1‑93 (MQ=255)
cgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCg > 2:3492934/1‑93 (MQ=255)
gaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGc < 1:2138115/93‑1 (MQ=255)
aaaGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCt < 1:3495699/93‑1 (MQ=255)
aaaGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGGGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGGTCGCGGGCCGACACTGCATCGCt > 2:3269492/1‑93 (MQ=255)
aaGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTa < 1:3370282/93‑1 (MQ=255)
aGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTAt > 2:2993132/1‑93 (MQ=255)
aGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTAt > 1:188251/1‑93 (MQ=255)
aGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTAt < 1:570861/93‑1 (MQ=255)
gCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATg > 1:4235325/1‑93 (MQ=255)
gAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGc < 1:1784200/93‑1 (MQ=255)
aaaaaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCg > 1:2357361/1‑93 (MQ=255)
aaaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGaa > 1:4557996/1‑93 (MQ=255)
aaaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGaa < 1:4460864/93‑1 (MQ=255)
aaaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGaa < 1:1018831/93‑1 (MQ=255)
aaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCGGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAAc < 1:4115129/93‑1 (MQ=255)
aaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAAc > 1:3395297/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACa < 2:2675113/93‑1 (MQ=255)
aTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACa > 2:1446490/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACa < 2:775912/93‑1 (MQ=255)
aTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACa < 1:1171683/93‑1 (MQ=255)
tCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAg > 2:890598/1‑93 (MQ=255)
tCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAg > 2:1612959/1‑93 (MQ=255)
cGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGc < 2:2456591/93‑1 (MQ=255)
cGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGc < 2:3860858/93‑1 (MQ=255)
tGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTAc < 2:1697037/93‑1 (MQ=255)
tGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTAc < 2:3196457/93‑1 (MQ=255)
tGATGCCCCGTACCGGTGGTCGGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTAc < 2:321011/93‑1 (MQ=255)
gATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCGGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACa < 1:901349/93‑1 (MQ=255)
gATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACa > 2:1590368/1‑93 (MQ=255)
aTGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAg > 1:171519/1‑93 (MQ=255)
aTGGCCCGTACCGGTGGTCGGGGCGCCCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAg < 1:2025996/93‑1 (MQ=255)
gTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAggg > 2:1990439/1‑93 (MQ=255)
gTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAggg > 1:1810070/1‑93 (MQ=255)
gTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGCCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAggg < 2:559420/93‑1 (MQ=255)
tCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGt < 1:766906/93‑1 (MQ=255)
tCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGt < 2:2896441/93‑1 (MQ=255)
ccGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGa > 2:1354991/1‑93 (MQ=255)
cGTACGGGTGGCCGGGGCGCCCGGCGTGGCAAGGCATTCTGGCCGCTCCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGaa < 1:2820063/93‑1 (MQ=255)
tACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAAtt < 1:4376591/93‑1 (MQ=255)
tACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAAtt < 2:1310200/93‑1 (MQ=255)
tACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAAtt < 1:961595/93‑1 (MQ=255)
gccGGTGGTGTGGGCGCGCTGCTTGGTCAGGCATTCGGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTa < 2:4174895/92‑1 (MQ=255)
ccGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTAc < 2:2749486/93‑1 (MQ=255)
ccGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTAc < 1:752140/93‑1 (MQ=255)
ccGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTAc < 1:2883574/93‑1 (MQ=255)
ggtggtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGc < 1:625866/93‑1 (MQ=255)
gggtCGGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTg < 1:3167389/92‑1 (MQ=255)
ggtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGGCGACACTGTATAGCTATGGCGAACAGCTGCAGGGTGAATTACGCTgg > 2:4663018/1‑93 (MQ=255)
tCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGaa > 1:2382457/1‑93 (MQ=255)
cTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGaaa < 1:2626751/93‑1 (MQ=255)
gggCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAgg < 2:1504447/93‑1 (MQ=255)
ggCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGt < 2:1007317/93‑1 (MQ=255)
cgctcCGCGTGTGAAGACCTTCTGGCCGCTTAGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTAt < 2:1143357/93‑1 (MQ=255)
gggccgcGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATg < 1:3988276/91‑1 (MQ=255)
gcgcCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGCATTACGCTGGAAAGGTATg < 2:4524121/93‑1 (MQ=255)
gcgcCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATg < 1:1764151/93‑1 (MQ=255)
gcgcCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATg > 1:1861824/1‑93 (MQ=255)
ccgcGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGtt > 1:3884535/1‑93 (MQ=255)
gcgTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTAt < 2:2626516/93‑1 (MQ=255)
gTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCg < 1:1686835/93‑1 (MQ=255)
tGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCgg < 2:643495/93‑1 (MQ=255)
tGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCgg < 2:502469/93‑1 (MQ=255)
gttCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGt < 2:3354709/91‑1 (MQ=255)
ggTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGACAGGTATGGTTATCgct > 2:232430/1‑91 (MQ=255)
gTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTg > 1:2965286/1‑93 (MQ=255)
tCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGc > 2:3705850/1‑93 (MQ=255)
tCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGc > 1:270583/1‑93 (MQ=255)
cAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCt > 2:3671911/1‑93 (MQ=255)
cAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCt < 1:663381/93‑1 (MQ=255)
aGGCATTCGGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCtt < 1:1282107/93‑1 (MQ=255)
aTTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGa > 2:4005976/1‑93 (MQ=255)
ttCTGGCCGGTTGCCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAATGTATGGTTATCGGTGCTTCTGaa < 2:579487/93‑1 (MQ=255)
ttCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGGGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATAGGTGCTTCTGaa > 2:1625951/1‑93 (MQ=255)
tCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAg < 1:3819143/93‑1 (MQ=255)
tCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAg > 1:3295889/1‑93 (MQ=255)
tCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAg < 2:1881981/93‑1 (MQ=255)
cTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAgg < 1:323919/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTCCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTAc < 2:3801502/93‑1 (MQ=255)
ccGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACt < 1:2648593/93‑1 (MQ=255)
gTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGaa > 2:3414542/1‑93 (MQ=255)
ttCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAg < 1:3064554/93‑1 (MQ=255)
ttCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAg < 2:4184744/93‑1 (MQ=255)
ttCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAg < 1:424088/93‑1 (MQ=255)
ttCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAg < 2:2160644/93‑1 (MQ=255)
tCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGt < 1:228356/93‑1 (MQ=255)
gcgGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTa > 1:1819305/1‑93 (MQ=255)
gggCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTaaa < 1:3640959/93‑1 (MQ=255)
ggCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAg < 2:2139159/93‑1 (MQ=255)
gCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGc < 2:3105340/93‑1 (MQ=255)
gCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGc < 2:732/93‑1 (MQ=255)
cGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGa < 1:3584563/93‑1 (MQ=255)
|
ACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAT > NC_000913/3785292‑3785471
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCC > NC_000913/3785289‑3785475
|
CAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACA < SRR4302535.4573878/94‑1 (MQ=60)
CAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACA > SRR4302535.4602457/1‑94 (MQ=60)
CAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGCGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACA > SRR4302535.3612299/1‑94 (MQ=60)
AAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACAC > SRR4302535.1038353/1‑94 (MQ=60)
AAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACAC < SRR4302535.2358276/94‑1 (MQ=60)
AAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACAC > SRR4302535.228479/1‑94 (MQ=60)
AACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACT < SRR4302535.2968239/94‑1 (MQ=60)
CCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGC < SRR4302535.1876953/94‑1 (MQ=60)
CGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCA > SRR4302535.1163126/1‑94 (MQ=60)
GACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCAT < SRR4302535.3652180/94‑1 (MQ=60)
GACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCAT < SRR4302535.1731331/94‑1 (MQ=60)
GACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGCCCCGTCCCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGCCAGGCATTCTGGCAGGTTCGCGGGCCGACACTGCAT < SRR4302535.4167811/94‑1 (MQ=60)
ACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCCTC > SRR4302535.1749742/1‑94 (MQ=60)
ACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATC < SRR4302535.2370028/94‑1 (MQ=60)
ACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATC > SRR4302535.3354644/1‑94 (MQ=60)
CCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCG > SRR4302535.2896225/1‑94 (MQ=60)
CCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCG < SRR4302535.2077314/94‑1 (MQ=60)
CCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCG > SRR4302535.1544886/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGC > SRR4302535.1704582/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGC > SRR4302535.4514100/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCT < SRR4302535.2153512/94‑1 (MQ=60)
AAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTA < SRR4302535.3168922/94‑1 (MQ=60)
AAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTA < SRR4302535.3519988/94‑1 (MQ=60)
AAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGCGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCCTTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTA > SRR4302535.4594791/1‑94 (MQ=60)
AAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTAT > SRR4302535.189554/1‑94 (MQ=60)
AAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTAT > SRR4302535.2394427/1‑94 (MQ=60)
AAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTAT < SRR4302535.3393730/94‑1 (MQ=60)
AAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTAT > SRR4302535.1562979/1‑94 (MQ=60)
AGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATG < SRR4302535.3854396/94‑1 (MQ=60)
AGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATG < SRR4302535.3454864/94‑1 (MQ=60)
AGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATG < SRR4302535.574869/94‑1 (MQ=60)
AGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATG > SRR4302535.4264313/1‑94 (MQ=60)
taaacgTCGCTGATGTCCCGAAACGGTGGTCTGGGCGCTCCGAGTGGTCCGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCG < SRR4302535.152412/88‑1 (MQ=60)
GAAAACTCGCTGAGGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATTGCG < SRR4302535.2675641/94‑1 (MQ=60)
GAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCG > SRR4302535.263198/1‑94 (MQ=60)
GAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCG < SRR4302535.3395369/94‑1 (MQ=60)
GAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCG < SRR4302535.1797112/94‑1 (MQ=60)
GAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCG > SRR4302535.2374269/1‑94 (MQ=60)
GAAAAAGCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCG < SRR4302535.2059023/94‑1 (MQ=60)
AAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGA > SRR4302535.2394676/1‑94 (MQ=60)
AAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAA > SRR4302535.835681/1‑94 (MQ=60)
AAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAA > SRR4302535.617033/1‑94 (MQ=60)
AAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAA > SRR4302535.4589117/1‑94 (MQ=60)
AAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAAC < SRR4302535.4491459/94‑1 (MQ=60)
AAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAAC > SRR4302535.3418919/1‑94 (MQ=60)
AAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAAC < SRR4302535.1026068/94‑1 (MQ=60)
AAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAAC > SRR4302535.3555369/1‑94 (MQ=60)
AATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCGGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACA < SRR4302535.4143298/94‑1 (MQ=60)
ATCGCTGATGTCCCGTCCCGGTGGTCTGGGCGCGCAGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAG < SRR4302535.166710/94‑1 (MQ=60)
ATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAG > SRR4302535.1798046/1‑94 (MQ=60)
ATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAG < SRR4302535.1180050/94‑1 (MQ=60)
ATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAG < SRR4302535.932740/94‑1 (MQ=60)
ATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAG > SRR4302535.4563457/1‑94 (MQ=60)
ATCGCTGATGCCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAG < SRR4302535.3264132/94‑1 (MQ=60)
CGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCT > SRR4302535.3528390/1‑94 (MQ=60)
GCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTC > SRR4302535.647675/1‑94 (MQ=60)
CTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTAC > SRR4302535.74118/1‑94 (MQ=60)
CTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTAC > SRR4302535.4345800/1‑94 (MQ=60)
TGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACA > SRR4302535.1795319/1‑94 (MQ=60)
TGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACA < SRR4302535.1840858/94‑1 (MQ=60)
GATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCGGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAG < SRR4302535.907732/94‑1 (MQ=60)
GATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAG < SRR4302535.4037262/94‑1 (MQ=60)
GATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAG > SRR4302535.172707/1‑94 (MQ=60)
ATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGG < SRR4302535.4416635/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCCGTACCGGTGGTCGGGGCGCCCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGG < SRR4302535.2040594/94‑1 (MQ=60)
TGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCTCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGG < SRR4302535.98997/94‑1 (MQ=60)
TGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGG > SRR4302535.1823163/1‑94 (MQ=60)
TGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGG < SRR4302535.1813624/94‑1 (MQ=60)
TCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTG < SRR4302535.772307/94‑1 (MQ=60)
CCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGA < SRR4302535.2770768/94‑1 (MQ=60)
CCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAA > SRR4302535.3389675/1‑94 (MQ=60)
CGTACGGGTGGCCGGGGCGCCCGGCGTGGCAAGGCATTCTGGCCGCTCCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAAT < SRR4302535.2840092/94‑1 (MQ=50)
CGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAAT > SRR4302535.615054/1‑94 (MQ=60)
GTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTTGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATT > SRR4302535.3412609/1‑94 (MQ=60)
GTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATT < SRR4302535.2205861/94‑1 (MQ=60)
GTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATT > SRR4302535.961687/1‑94 (MQ=60)
TGCCGGTGGCCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTA < SRR4302535.750113/94‑1 (MQ=60)
TACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTA < SRR4302535.968428/94‑1 (MQ=60)
TACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTA < SRR4302535.4406537/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTAC > SRR4302535.3820283/1‑94 (MQ=60)
CCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACG < SRR4302535.2903980/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACG < SRR4302535.757435/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCT < SRR4302535.630218/94‑1 (MQ=60)
GTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTG > SRR4302535.4268772/1‑94 (MQ=60)
GGGTCGGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGG < SRR4302535.3189334/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAA > SRR4302535.2399565/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCGCGCGGCGTGTACAGGCATTCTGGCCGGTGCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAG < SRR4302535.1713916/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAG < SRR4302535.985297/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAG < SRR4302535.2117335/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAG < SRR4302535.2645574/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGG < SRR4302535.3726559/94‑1 (MQ=60)
GGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGT < SRR4302535.201673/94‑1 (MQ=60)
GGCGCGCGGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTA < SRR4302535.764456/94‑1 (MQ=60)
GCGCGCCGCTGGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTAT < SRR4302535.3142264/94‑1 (MQ=60)
GCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTAT < SRR4302535.2998777/94‑1 (MQ=60)
CGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATG > SRR4302535.1875250/1‑94 (MQ=60)
CGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATG > SRR4302535.1875251/1‑94 (MQ=60)
CGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATG < SRR4302535.4713302/94‑1 (MQ=60)
CGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATG < SRR4302535.4031637/94‑1 (MQ=60)
GGGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGG < SRR4302535.4015549/94‑1 (MQ=60)
GCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGG > SRR4302535.4417128/1‑94 (MQ=60)
GCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGG > SRR4302535.3044533/1‑94 (MQ=60)
GCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGG < SRR4302535.1776936/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGT > SRR4302535.2820656/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGT > SRR4302535.1266769/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGT > SRR4302535.3985345/1‑94 (MQ=60)
GCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTT > SRR4302535.3911183/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGCTCAGGCATTCTGGCTGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTAT < SRR4302535.4228088/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTAT < SRR4302535.758911/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTAT > SRR4302535.4370818/1‑94 (MQ=60)
GCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGGTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATC > SRR4302535.2878104/1‑94 (MQ=60)
GTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGG < SRR4302535.1699047/94‑1 (MQ=60)
TGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGT > SRR4302535.2929231/1‑94 (MQ=60)
GGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTG > SRR4302535.2986093/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGC > SRR4302535.272464/1‑94 (MQ=60)
TCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCT < SRR4302535.3863599/94‑1 (MQ=60)
CAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTT < SRR4302535.668016/94‑1 (MQ=60)
AGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTC > SRR4302535.2248876/1‑94 (MQ=60)
AGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTC > SRR4302535.3432401/1‑94 (MQ=60)
AGGCATTCGGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTC < SRR4302535.1291254/94‑1 (MQ=60)
GGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCT < SRR4302535.3944163/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAA > SRR4302535.1935847/1‑94 (MQ=60)
TTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAG < SRR4302535.2136746/94‑1 (MQ=60)
TTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAG > SRR4302535.3318804/1‑94 (MQ=60)
TCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGG < SRR4302535.3845497/94‑1 (MQ=60)
TCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGG < SRR4302535.2510564/94‑1 (MQ=60)
TCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGG < SRR4302535.1291596/94‑1 (MQ=60)
CTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGT < SRR4302535.326155/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTA < SRR4302535.1824049/94‑1 (MQ=60)
TGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTA > SRR4302535.880057/1‑94 (MQ=60)
GGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTAC < SRR4302535.1300042/94‑1 (MQ=60)
CCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTG < SRR4302535.2667565/94‑1 (MQ=60)
CGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGA < SRR4302535.3291341/94‑1 (MQ=60)
GTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAG < SRR4302535.1864843/94‑1 (MQ=60)
TTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGT < SRR4302535.3085974/94‑1 (MQ=60)
TTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGT < SRR4302535.427047/94‑1 (MQ=60)
TCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTT < SRR4302535.229929/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTA > SRR4302535.1832450/1‑94 (MQ=60)
GCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAA < SRR4302535.2333971/94‑1 (MQ=60)
CGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTAAGCTGGAAAGGTATGGGTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAA > SRR4302535.2649137/1‑94 (MQ=60)
GGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAG < SRR4302535.3666180/94‑1 (MQ=60)
GGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAG < SRR4302535.1830067/94‑1 (MQ=60)
GGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGC < SRR4302535.2696196/94‑1 (MQ=60)
GGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGC > SRR4302535.3204330/1‑94 (MQ=60)
GGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGC > SRR4302535.120061/1‑94 (MQ=60)
GCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCG < SRR4302535.292515/94‑1 (MQ=60)
CGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAT < SRR4302535.3609422/94‑1 (MQ=60)
ACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTG < SRR4302535.3582647/94‑1 (MQ=60)
ACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTG < SRR4302535.2928919/94‑1 (MQ=60)
CACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGGGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGC > SRR4302535.1756567/1‑94 (MQ=60)
ACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCC > SRR4302535.3801897/1‑94 (MQ=60)
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CAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCC > NC_000913/3785289‑3785475
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
