Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,934,461 |
A→G |
P186P (CCA→CCG) |
rbsB → |
D‑ribose periplasmic binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,934,461 | 0 | A | G | 100.0%
| 822.7
/ NA
| 259 | P186P (CCA→CCG) | rbsB | D‑ribose periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (133/126); total (133/126) |
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
CATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCAGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGTTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGA > NC_000913/3934371‑3934550
|
cATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCcagccagccggc > 2:4186949/1‑93 (MQ=255)
aTTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCcggca < 2:4624561/93‑1 (MQ=255)
aTTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCcggca > 1:4384597/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCcggcag > 1:1081133/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCcggcag > 2:453273/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCcggcag > 1:3000102/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCcggcag > 1:521095/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGTACAGCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGa < 1:118252/93‑1 (MQ=255)
cTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGAtt < 1:1766781/93‑1 (MQ=255)
tGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGAttt > 1:3432366/1‑93 (MQ=255)
ggTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGAtttt < 2:1437887/93‑1 (MQ=255)
ggTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGAtttt > 2:1323151/1‑93 (MQ=255)
aCATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGAt > 1:653662/1‑93 (MQ=255)
aCATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGAt < 1:264203/93‑1 (MQ=255)
aCATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGAt < 2:2547691/93‑1 (MQ=255)
cATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATc < 2:2517986/93‑1 (MQ=255)
cATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATc < 2:1071583/93‑1 (MQ=255)
cATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATc < 1:2438909/93‑1 (MQ=255)
cATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATc < 1:4346216/93‑1 (MQ=255)
ccGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCa > 1:588427/1‑93 (MQ=255)
gCAGCCGGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCAtt < 1:1805529/93‑1 (MQ=255)
gCAGCCCGTGAGCGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCAtt < 2:2912138/93‑1 (MQ=255)
gCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCAtt < 2:2814041/93‑1 (MQ=255)
gCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCAtt < 1:4039096/93‑1 (MQ=255)
gCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCAtt > 2:973938/1‑93 (MQ=255)
aGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTaa < 1:1373415/93‑1 (MQ=255)
gCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTaaa > 1:3531282/1‑93 (MQ=255)
ccGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCGCAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAgg > 2:4301656/1‑93 (MQ=255)
ccGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAgg > 1:3810801/1‑93 (MQ=255)
ccGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAgg < 1:1964344/93‑1 (MQ=255)
ccGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAgg > 1:4197040/1‑93 (MQ=255)
cGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGt > 1:4616664/1‑93 (MQ=255)
aaCGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGa < 2:1144791/93‑1 (MQ=255)
aCGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGaa > 1:1943430/1‑93 (MQ=255)
aCGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGaa < 1:4587385/93‑1 (MQ=255)
cGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAAc < 1:1244058/93‑1 (MQ=255)
cGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAAc < 1:873674/93‑1 (MQ=255)
cGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAAt < 2:4059762/93‑1 (MQ=255)
gAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATg < 2:1919138/93‑1 (MQ=255)
gAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATg < 2:3944284/93‑1 (MQ=255)
aaGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGc > 1:451308/1‑93 (MQ=255)
aGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCa > 1:1747/1‑93 (MQ=255)
ggCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAg > 2:3094662/1‑93 (MQ=255)
gCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGa < 2:3360529/93‑1 (MQ=255)
ttCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAAc > 2:2337881/1‑93 (MQ=255)
tCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCGCAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAAcc > 1:4069499/1‑93 (MQ=255)
tCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAAcc < 2:481409/93‑1 (MQ=255)
ccAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCTCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCt < 1:2948923/93‑1 (MQ=255)
ccAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCt > 2:2872208/1‑93 (MQ=255)
cagcagGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTg > 2:3577662/1‑93 (MQ=255)
agcagGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGt > 2:1221418/1‑93 (MQ=255)
agcagGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGt < 2:4160649/93‑1 (MQ=255)
agcagGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGt > 2:3219491/1‑93 (MQ=255)
gcagGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGtt > 2:24275/1‑93 (MQ=255)
gcagGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGtt < 2:2145987/93‑1 (MQ=255)
gcagGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGtt > 2:3282764/1‑93 (MQ=255)
gcagGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGtt < 2:3038852/93‑1 (MQ=255)
cagGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTg < 2:2113889/93‑1 (MQ=255)
cagGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTg < 1:3326027/93‑1 (MQ=255)
ggCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGAc < 1:2148260/93‑1 (MQ=255)
ggCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGAc > 1:3958364/1‑93 (MQ=255)
ggCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGAc > 2:4018576/1‑93 (MQ=255)
cGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGc > 1:3263614/1‑93 (MQ=255)
cGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGc < 2:4313087/93‑1 (MQ=255)
gTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCt > 2:170146/1‑93 (MQ=255)
gTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCt > 1:373558/1‑93 (MQ=255)
tgctgcTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCa < 2:1831939/93‑1 (MQ=255)
gctgctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCAt > 2:1116814/1‑93 (MQ=255)
ctgctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATc < 2:1588540/93‑1 (MQ=255)
ctgctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATc < 1:711818/93‑1 (MQ=255)
tgctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATcc < 1:2906555/93‑1 (MQ=255)
ctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCgg > 2:3674725/1‑93 (MQ=255)
ctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCgg > 2:589043/1‑93 (MQ=255)
tCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGa > 2:2655451/1‑93 (MQ=255)
cacaAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGAt > 2:9140/1‑93 (MQ=255)
acaAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTATTGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATg > 1:3609622/1‑93 (MQ=255)
acaAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATg < 2:3903328/93‑1 (MQ=255)
caAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATgc > 2:495991/1‑92 (MQ=255)
aGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTc > 2:4475005/1‑93 (MQ=255)
gTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCa < 1:1272833/93‑1 (MQ=255)
ttAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAgg > 2:380487/1‑93 (MQ=255)
tAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGc > 2:4433727/1‑93 (MQ=255)
tAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGc < 2:128107/93‑1 (MQ=255)
aaTGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCt > 1:1007310/1‑93 (MQ=255)
aaTGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGACTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCt > 2:1732284/1‑93 (MQ=255)
aTGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTg > 2:4106218/1‑93 (MQ=255)
aTGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTg > 2:3447758/1‑93 (MQ=255)
tGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGt > 1:2293040/1‑93 (MQ=255)
gTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTa < 2:2378630/93‑1 (MQ=255)
gTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTa > 1:3204447/1‑93 (MQ=255)
ttCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTAt > 1:1556035/1‑93 (MQ=255)
tCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTAtt > 1:7551/1‑93 (MQ=255)
ttGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTcg > 1:1694510/1‑93 (MQ=255)
tGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTcgc < 2:424462/93‑1 (MQ=255)
gccagccagccgGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTcgcg > 2:2023076/1‑93 (MQ=255)
gccagccagccgGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTcgcg > 2:1200200/1‑93 (MQ=255)
gccagccagccgGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTcgcg > 1:2535399/1‑93 (MQ=255)
ccagccagccggCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCgcgc > 2:3304209/1‑93 (MQ=255)
agccagccggcAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAg > 2:669049/1‑93 (MQ=255)
gccggcAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAatga < 1:271258/93‑1 (MQ=255)
|
CATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCAGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGTTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGA > NC_000913/3934371‑3934550
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGGCATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCAGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGTTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGAA > NC_000913/3934368‑3934554
|
gggtgtgggtggtgcagCCGCAGCTCGTGAACGAGGCGAAGGCGTCCAGCAGGCGGTTGCGGCTCACGAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCG < SRR4302535.2337957/77‑1 (MQ=55)
AGGCATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCG > SRR4302535.2309703/1‑94 (MQ=60)
AGGCATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCG > SRR4302535.4652367/1‑94 (MQ=60)
CATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCA > SRR4302535.4414596/1‑94 (MQ=60)
CATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCA < SRR4302535.685260/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGGTCCATCCGCAGCCCGTGAACGGGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAG < SRR4302535.3271183/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAG > SRR4302535.3021134/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAG < SRR4302535.1813911/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAG > SRR4302535.490405/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAG > SRR4302535.524740/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAG > SRR4302535.1088823/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGAT < SRR4302535.2150368/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGTACAGCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGAT < SRR4302535.119082/94‑1 (MQ=60)
ctggtacattctcttCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAATTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTT < SRR4302535.3306152/79‑1 (MQ=60)
CTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTT > SRR4302535.1356888/1‑94 (MQ=60)
CTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTT > SRR4302535.3456219/1‑94 (MQ=60)
CTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTT > SRR4302535.370026/1‑94 (MQ=60)
CTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTT < SRR4302535.1779592/94‑1 (MQ=60)
TGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGTCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTT > SRR4302535.2525199/1‑94 (MQ=60)
GGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTG > SRR4302535.3262746/1‑94 (MQ=60)
TACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGAT > SRR4302535.658226/1‑94 (MQ=60)
TACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGAT < SRR4302535.4626889/94‑1 (MQ=60)
ACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATC < SRR4302535.266036/94‑1 (MQ=60)
ACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATC > SRR4302535.2791368/1‑94 (MQ=60)
CATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCG < SRR4302535.4375952/94‑1 (MQ=60)
CATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCG > SRR4302535.1577121/1‑94 (MQ=60)
CATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCG < SRR4302535.2456479/94‑1 (MQ=60)
CATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTACCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCG < SRR4302535.1156155/94‑1 (MQ=60)
ATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGC > SRR4302535.2616383/1‑94 (MQ=60)
ATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGC < SRR4302535.3807397/94‑1 (MQ=60)
ATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGATTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGC > SRR4302535.745032/1‑94 (MQ=60)
TCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCA > SRR4302535.592553/1‑94 (MQ=60)
CCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCAT < SRR4302535.3778456/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATT > SRR4302535.3552128/1‑94 (MQ=60)
CGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATT > SRR4302535.3364979/1‑94 (MQ=60)
GCAGCCGGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTA < SRR4302535.1818575/94‑1 (MQ=60)
GCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTA < SRR4302535.4066744/94‑1 (MQ=60)
CAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAA > SRR4302535.43753/1‑94 (MQ=60)
CAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAA > SRR4302535.3023511/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAA > SRR4302535.1803026/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAA < SRR4302535.1383230/94‑1 (MQ=60)
AGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAA > SRR4302535.3555797/1‑94 (MQ=60)
GCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAG < SRR4302535.1213209/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTGCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAG < SRR4302535.2172604/94‑1 (MQ=60)
CCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGG > SRR4302535.4225759/1‑94 (MQ=60)
CCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGG > SRR4302535.3837096/1‑94 (MQ=60)
CCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGT > SRR4302535.4648039/1‑94 (MQ=60)
CCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGT > SRR4302535.4615280/1‑94 (MQ=60)
CCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGT < SRR4302535.1978506/94‑1 (MQ=60)
CCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGT > SRR4302535.3938424/1‑94 (MQ=60)
CCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGT > SRR4302535.3970464/1‑94 (MQ=60)
CGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTT < SRR4302535.2309104/94‑1 (MQ=60)
CGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTT > SRR4302535.3439539/1‑94 (MQ=60)
GTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTT < SRR4302535.2877477/94‑1 (MQ=60)
GTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTT > SRR4302535.405103/1‑94 (MQ=60)
TGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTG < SRR4302535.2716954/94‑1 (MQ=60)
AACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAA < SRR4302535.3012344/94‑1 (MQ=60)
AACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAA > SRR4302535.2678323/1‑94 (MQ=60)
AACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAA > SRR4302535.1957427/1‑94 (MQ=60)
ACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAAC < SRR4302535.4618622/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACG < SRR4302535.4095764/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACG < SRR4302535.4542313/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACG > SRR4302535.83079/1‑94 (MQ=60)
CGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACG < SRR4302535.879865/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACG < SRR4302535.1252938/94‑1 (MQ=60)
GTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGT < SRR4302535.3290736/94‑1 (MQ=60)
GTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGT > SRR4302535.1885629/1‑94 (MQ=60)
TGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTA > SRR4302535.613476/1‑94 (MQ=60)
GAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGC < SRR4302535.748915/94‑1 (MQ=60)
GAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGC > SRR4302535.663660/1‑94 (MQ=60)
GAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGC > SRR4302535.454467/1‑94 (MQ=60)
AAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCA > SRR4302535.1766/1‑94 (MQ=60)
AGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAG > SRR4302535.1389818/1‑94 (MQ=60)
AGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAG > SRR4302535.2574295/1‑94 (MQ=60)
CTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAAC > SRR4302535.2961323/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCGCAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACC > SRR4302535.4097349/1‑94 (MQ=60)
CCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCTCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTG < SRR4302535.2969641/94‑1 (MQ=60)
CAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGT > SRR4302535.1116538/1‑94 (MQ=60)
CAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGT > SRR4302535.3634589/1‑94 (MQ=60)
AGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTT < SRR4302535.1880106/94‑1 (MQ=60)
AGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTT > SRR4302535.2494354/1‑94 (MQ=60)
CAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGA < SRR4302535.3349172/94‑1 (MQ=60)
AGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCTGGCAGATTTTGATCGCACTTAAGGTTTCGACGTTATGCATAATCTGTTGAC > SRR4302535.1971963/1‑94 (MQ=55)
AGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGAC > SRR4302535.3985395/1‑94 (MQ=60)
GGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACC > SRR4302535.2974072/1‑94 (MQ=60)
GGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACC < SRR4302535.2163709/94‑1 (MQ=60)
GCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCG < SRR4302535.177719/94‑1 (MQ=60)
CCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGC > SRR4302535.3286280/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCT > SRR4302535.376144/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTGCTCACAATTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTC < SRR4302535.2446156/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCA < SRR4302535.1720596/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCA > SRR4302535.4223511/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCAT < SRR4302535.3993761/94‑1 (MQ=60)
TCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATC < SRR4302535.563206/94‑1 (MQ=60)
CTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCC < SRR4302535.716814/94‑1 (MQ=60)
TGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCG < SRR4302535.2927099/94‑1 (MQ=60)
CTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGA > SRR4302535.2384511/1‑94 (MQ=60)
TCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGAT > SRR4302535.1335888/1‑94 (MQ=60)
TCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGAT < SRR4302535.4328502/94‑1 (MQ=60)
TCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGAT < SRR4302535.3547636/94‑1 (MQ=60)
CACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTATTGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATG > SRR4302535.3634658/1‑94 (MQ=60)
ACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGC > SRR4302535.1709792/1‑94 (MQ=60)
CAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCT > SRR4302535.865116/1‑94 (MQ=60)
AAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTC < SRR4302535.1478263/94‑1 (MQ=60)
AGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCA > SRR4302535.439378/1‑94 (MQ=60)
GTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAG < SRR4302535.1281927/94‑1 (MQ=60)
GTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAG > SRR4302535.4499477/1‑94 (MQ=60)
TTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGG < SRR4302535.3571246/94‑1 (MQ=60)
TTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGG < SRR4302535.1226057/94‑1 (MQ=60)
TTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGC > SRR4302535.1253818/1‑94 (MQ=60)
TAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCT > SRR4302535.1768009/1‑94 (MQ=60)
TAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCT > SRR4302535.4647319/1‑94 (MQ=60)
TAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCT > SRR4302535.1014468/1‑94 (MQ=60)
AATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTG < SRR4302535.439583/94‑1 (MQ=60)
AATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTG > SRR4302535.1978339/1‑94 (MQ=60)
ATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGT > SRR4302535.2309443/1‑94 (MQ=60)
ATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGT < SRR4302535.2058677/94‑1 (MQ=60)
ATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGT > SRR4302535.4154218/1‑94 (MQ=60)
ATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGT > SRR4302535.4648554/1‑94 (MQ=60)
TGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTA < SRR4302535.1062488/94‑1 (MQ=60)
TGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTA > SRR4302535.3226638/1‑94 (MQ=60)
GTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTAT > SRR4302535.4095846/1‑94 (MQ=60)
GTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTAT > SRR4302535.1567253/1‑94 (MQ=60)
TTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATT > SRR4302535.7610/1‑94 (MQ=60)
TCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTC < SRR4302535.590969/94‑1 (MQ=60)
CTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCG > SRR4302535.1706763/1‑94 (MQ=60)
TTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGC < SRR4302535.3084991/94‑1 (MQ=60)
TGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCG > SRR4302535.2553662/1‑94 (MQ=60)
TGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCG > SRR4302535.657286/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGC > SRR4302535.4558924/1‑94 (MQ=60)
CCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCA > SRR4302535.2957704/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGA > SRR4302535.1266573/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGGTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGA > SRR4302535.3702875/1‑94 (MQ=60)
GCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGAT < SRR4302535.1673037/94‑1 (MQ=60)
GCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGAT < SRR4302535.273146/94‑1 (MQ=60)
CCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCANGCTGTATTCGCGCAGNATGNTG > SRR4302535.3912794/1‑94 (MQ=60)
CCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATG < SRR4302535.2399755/94‑1 (MQ=60)
CCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATG > SRR4302535.829263/1‑94 (MQ=60)
CGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGA > SRR4302535.3488519/1‑94 (MQ=60)
CGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGA > SRR4302535.440369/1‑94 (MQ=60)
CGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGA > SRR4302535.3756010/1‑94 (MQ=60)
CGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGA > SRR4302535.2268717/1‑94 (MQ=60)
GGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGAA < SRR4302535.241186/94‑1 (MQ=60)
GGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGAA > SRR4302535.1527942/1‑94 (MQ=60)
|
AGGCATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCAGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGTTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGAA > NC_000913/3934368‑3934554
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
