Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,972,641 |
G→A |
R145H (CGC→CAC) |
wecD → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,972,641 | 0 | G | A | 99.0%
| 691.8
/ ‑5.8
| 193 | R145H (CGC→CAC) | wecD | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base A (91/100); total (92/101) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
AATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAAAGC > NC_000913/3972553‑3972729
|
aaTGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGt > 2:3773337/1‑93 (MQ=255)
aTGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTa > 2:1888290/1‑93 (MQ=255)
aTGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTa > 2:2106801/1‑93 (MQ=255)
cGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTaaaa < 1:2156525/93‑1 (MQ=255)
cGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTaaaa < 1:4330627/93‑1 (MQ=255)
gACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaac > 1:1633865/1‑93 (MQ=255)
gACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaac < 1:1953004/93‑1 (MQ=255)
aCAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaaca > 1:530417/1‑93 (MQ=255)
cAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaacaa < 1:2012932/93‑1 (MQ=255)
aGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaacaac < 1:3684782/93‑1 (MQ=255)
aGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaacaac > 1:108168/1‑93 (MQ=255)
aGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaacaac < 2:4180959/93‑1 (MQ=255)
gATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACt > 2:2933070/1‑93 (MQ=255)
gATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACt > 1:660642/1‑93 (MQ=255)
gATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACt < 1:3782955/93‑1 (MQ=255)
aTGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACtt < 1:4233160/93‑1 (MQ=255)
tGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACttt < 1:4575094/93‑1 (MQ=255)
tGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACttt < 2:3304928/93‑1 (MQ=255)
gcgcGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTg > 2:3576880/1‑93 (MQ=255)
cgcgAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGc < 2:2917106/93‑1 (MQ=255)
cgAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCgg < 1:2381284/93‑1 (MQ=255)
cgAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCgg < 2:764816/93‑1 (MQ=255)
gAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCggg < 2:495212/93‑1 (MQ=255)
gAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCggg < 1:4052882/93‑1 (MQ=255)
aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGt > 1:176921/1‑93 (MQ=255)
aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGt > 2:578299/1‑93 (MQ=255)
aTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTg > 2:2698401/1‑93 (MQ=255)
aTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTg < 2:3394078/93‑1 (MQ=255)
ttGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTgg > 1:4605844/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTgg > 1:339334/1‑93 (MQ=255)
ggCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCg > 2:3314573/1‑93 (MQ=255)
ggCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCg > 2:1208457/1‑93 (MQ=255)
ccTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGAc > 2:3662273/1‑93 (MQ=255)
ctgctgGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGAcc > 2:4035332/1‑93 (MQ=255)
tgctgGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGAccc < 2:1441026/93‑1 (MQ=255)
tgctgGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGAccc < 1:307825/93‑1 (MQ=255)
gctggctgGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCa > 1:1404989/1‑93 (MQ=255)
tggctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCaaa < 2:3891425/93‑1 (MQ=255)
ggctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAAt > 2:4353213/1‑93 (MQ=255)
gctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATg < 1:4534000/93‑1 (MQ=255)
gctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATg < 2:1768357/93‑1 (MQ=255)
tggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATggg > 1:3577417/1‑93 (MQ=255)
tggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATggg < 2:4291115/93‑1 (MQ=255)
tggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATggg < 2:4376169/93‑1 (MQ=255)
ggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGc > 1:4315706/1‑93 (MQ=255)
aCGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCaa > 2:3000660/1‑93 (MQ=255)
cgcgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAac < 1:514784/93‑1 (MQ=255)
gcgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATTGGCAaca > 2:3229725/1‑93 (MQ=255)
gcgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAaca > 2:4656015/1‑93 (MQ=255)
gcgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAaca > 2:918625/1‑93 (MQ=255)
ggTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAcc > 1:918892/1‑93 (MQ=255)
ggTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAcc > 2:3875925/1‑93 (MQ=255)
gCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgcc < 1:1003068/93‑1 (MQ=255)
gCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgcc < 1:1003067/93‑1 (MQ=255)
cAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgccg > 1:3184210/1‑93 (MQ=255)
aGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACcgccgc < 1:2467005/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGATCTGATGCAAAAGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCcgcg > 2:4580042/1‑93 (MQ=255)
ggTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCcgcg > 1:2563889/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCgcgc < 1:1923081/93‑1 (MQ=255)
ctgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTa < 2:4443347/93‑1 (MQ=255)
gagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTaaa > 1:1700442/1‑93 (MQ=255)
gagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTaaa < 2:2492792/93‑1 (MQ=255)
gagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTaaa > 1:3959442/1‑93 (MQ=255)
agctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAAc < 2:103568/93‑1 (MQ=255)
agctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAAc < 2:1000899/93‑1 (MQ=255)
ctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGa < 1:946057/93‑1 (MQ=255)
tgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGat < 2:1857866/93‑1 (MQ=255)
gaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGata < 2:3501749/93‑1 (MQ=255)
gaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGata < 2:3946725/93‑1 (MQ=255)
gaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGata > 1:622217/1‑93 (MQ=255)
aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac > 1:1356272/1‑93 (MQ=255)
aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac > 2:2791399/1‑93 (MQ=255)
aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac < 1:2770062/93‑1 (MQ=255)
tGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGataca > 1:4457020/1‑93 (MQ=255)
tGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGataca > 1:3349549/1‑93 (MQ=255)
cAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacata < 1:4626230/93‑1 (MQ=255)
aaaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacatac < 2:3014884/93‑1 (MQ=255)
aCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACaa < 1:2668875/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAg < 2:1510020/93‑1 (MQ=255)
cgcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtg < 2:1060035/93‑1 (MQ=255)
gcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtgg < 1:3147513/93‑1 (MQ=255)
gcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtgg < 1:2913669/93‑1 (MQ=255)
gcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtgg > 2:903728/1‑93 (MQ=255)
cTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtggt < 1:280487/93‑1 (MQ=255)
cTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtggt < 2:3181925/93‑1 (MQ=255)
tAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtggtg > 1:3607415/1‑93 (MQ=255)
aaaCTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGc > 1:1023162/1‑93 (MQ=255)
aaaCTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGc > 2:2278314/1‑93 (MQ=255)
aaCTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCg > 2:2390025/1‑93 (MQ=255)
aCTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGa > 1:2954593/1‑93 (MQ=255)
aCTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGa < 2:769104/93‑1 (MQ=255)
cTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACTGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGaa < 1:1263036/93‑1 (MQ=255)
cTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGaa < 2:1346634/93‑1 (MQ=255)
cTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGaa > 1:2288765/1‑93 (MQ=255)
cTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGaa < 2:4022905/93‑1 (MQ=255)
tGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAt > 2:112758/1‑93 (MQ=255)
tGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAt > 2:3158079/1‑93 (MQ=255)
gggCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATg > 1:71146/1‑93 (MQ=255)
gCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTa > 2:4247141/1‑93 (MQ=255)
cgtcaCGGTAAAACAACATTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACAATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAAAGc < 2:810386/93‑1 (MQ=255)
|
AATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAAAGC > NC_000913/3972553‑3972729
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAAAGCACCGC > NC_000913/3972554‑3972734
|
ATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAA > SRR4302535.965250/1‑94 (MQ=60)
CGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAAC < SRR4302535.2172019/94‑1 (MQ=60)
CGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAAC > SRR4302535.1645673/1‑94 (MQ=60)
CGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAAC < SRR4302535.4360243/94‑1 (MQ=60)
GACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACA > SRR4302535.534127/1‑94 (MQ=60)
GACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACA < SRR4302535.1967061/94‑1 (MQ=60)
ACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAA > SRR4302535.1157683/1‑94 (MQ=60)
CAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAAC > SRR4302535.108934/1‑94 (MQ=60)
CAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAAC < SRR4302535.2027432/94‑1 (MQ=60)
AGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACT > SRR4302535.665253/1‑94 (MQ=60)
AGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACT > SRR4302535.2800656/1‑94 (MQ=60)
AGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACT < SRR4302535.3710278/94‑1 (MQ=60)
GATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTT < SRR4302535.3809054/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTT < SRR4302535.4262128/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTT < SRR4302535.1056073/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTG < SRR4302535.4606274/94‑1 (MQ=60)
GCGAAGTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGG < SRR4302535.610267/94‑1 (MQ=60)
CGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGG < SRR4302535.3613613/94‑1 (MQ=60)
CGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGG < SRR4302535.2398384/94‑1 (MQ=60)
CGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGGGCAGGGGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGG > SRR4302535.1093421/1‑94 (MQ=60)
GAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGT > SRR4302535.178150/1‑94 (MQ=60)
GAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGT < SRR4302535.4080632/94‑1 (MQ=60)
GAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGG > SRR4302535.208519/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGG > SRR4302535.4637149/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGG > SRR4302535.341684/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGCGG > SRR4302535.1784488/1‑94 (MQ=60)
TGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCG < SRR4302535.2225338/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCC > SRR4302535.1759923/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCC < SRR4302535.630609/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCA > SRR4302535.1695430/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCA > SRR4302535.1415033/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCA < SRR4302535.309956/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAAT > SRR4302535.4366491/1‑94 (MQ=60)
GGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATG < SRR4302535.3904549/94‑1 (MQ=60)
GCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGG < SRR4302535.4565028/94‑1 (MQ=60)
GCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGG < SRR4302535.3696756/94‑1 (MQ=60)
CTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGG > SRR4302535.3602219/1‑94 (MQ=60)
CTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGG < SRR4302535.144315/94‑1 (MQ=60)
TGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGC < SRR4302535.3005111/94‑1 (MQ=60)
TGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGC > SRR4302535.4345228/1‑94 (MQ=60)
GGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCA < SRR4302535.4497802/94‑1 (MQ=60)
CGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACA < SRR4302535.518384/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGGGGCGACCCAAATGGGCAACAC > SRR4302535.2578095/1‑94 (MQ=60)
CGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACC > SRR4302535.925408/1‑94 (MQ=60)
TGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCC > SRR4302535.2885545/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCG > SRR4302535.3206222/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCG < SRR4302535.1010189/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCG < SRR4302535.1010188/94‑1 (MQ=60)
AGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCG > SRR4302535.2582343/1‑94 (MQ=60)
AGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCG < SRR4302535.495556/94‑1 (MQ=60)
AGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCG < SRR4302535.2484788/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCT < SRR4302535.1936942/94‑1 (MQ=60)
TGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTT > SRR4302535.4084328/1‑94 (MQ=60)
TGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTT < SRR4302535.1949048/94‑1 (MQ=60)
CTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGCCCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAA < SRR4302535.3441407/94‑1 (MQ=60)
TGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAA > SRR4302535.1712728/1‑94 (MQ=60)
TGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAA > SRR4302535.3986482/1‑94 (MQ=60)
AGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACG < SRR4302535.876806/94‑1 (MQ=60)
CTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGAT < SRR4302535.952760/94‑1 (MQ=60)
TGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATA > SRR4302535.626539/1‑94 (MQ=60)
TGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATA < SRR4302535.3270272/94‑1 (MQ=60)
TGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATA < SRR4302535.3406787/94‑1 (MQ=60)
GATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATAC > SRR4302535.1365977/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACA > SRR4302535.4487586/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACA > SRR4302535.527080/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACA < SRR4302535.2789790/94‑1 (MQ=60)
ATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACA > SRR4302535.3372881/1‑94 (MQ=60)
TGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACAT < SRR4302535.4581575/94‑1 (MQ=60)
TGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACAT < SRR4302535.937977/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATA > SRR4302535.2448465/1‑94 (MQ=60)
GCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATA < SRR4302535.3181733/94‑1 (MQ=60)
CAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATAC < SRR4302535.4657638/94‑1 (MQ=60)
AAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACA > SRR4302535.138023/1‑94 (MQ=60)
ACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAA < SRR4302535.2687976/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAG < SRR4302535.2329692/94‑1 (MQ=60)
CGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAGCGATACATACAAAGTGG < SRR4302535.199291/94‑1 (MQ=60)
CGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGG > SRR4302535.3113969/1‑94 (MQ=60)
GCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGT > SRR4302535.3803551/1‑94 (MQ=60)
GCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGT < SRR4302535.2934249/94‑1 (MQ=60)
GCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGT < SRR4302535.4657348/94‑1 (MQ=60)
GCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGT > SRR4302535.4614553/1‑94 (MQ=60)
GCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGT < SRR4302535.3169395/94‑1 (MQ=60)
CTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTG < SRR4302535.282442/94‑1 (MQ=60)
CTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTG > SRR4302535.3632435/1‑94 (MQ=60)
TAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGC > SRR4302535.1030431/1‑94 (MQ=60)
TAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGC < SRR4302535.4046592/94‑1 (MQ=60)
AACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGA > SRR4302535.2975345/1‑94 (MQ=60)
ACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAA > SRR4302535.2305115/1‑94 (MQ=60)
ACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAA < SRR4302535.1284453/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACTGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAT < SRR4302535.1272075/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAT < SRR4302535.4275894/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAT < SRR4302535.688189/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATG > SRR4302535.71668/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATG < SRR4302535.2974603/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATG < SRR4302535.2694804/94‑1 (MQ=60)
GCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAG < SRR4302535.2632244/94‑1 (MQ=60)
TCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAAAGCACC > SRR4302535.1696753/1‑94 (MQ=60)
TCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAAAGCACC > SRR4302535.2508676/1‑94 (MQ=60)
CACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAAAGCACCG > SRR4302535.4223211/1‑94 (MQ=60)
CACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAAAGCACCG > SRR4302535.4439019/1‑94 (MQ=60)
CACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAAAGCACCG > SRR4302535.2194297/1‑94 (MQ=60)
ACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATGCAAAGTGGTGCGAATGTAGAAAGCACCGC < SRR4302535.2381501/94‑1 (MQ=60)
ACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAAAGCACCGC > SRR4302535.4100682/1‑94 (MQ=60)
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ATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAAAGCACCGC > NC_000913/3972554‑3972734
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
