Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,056,373 |
A→G |
K129K (AAA→AAG) |
yihK → |
putative GTP‑binding factor |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,056,373 | 0 | A | G | 100.0%
| 915.1
/ NA
| 289 | K129K (AAA→AAG) | yihK | putative GTP‑binding factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (145/144); total (145/144) |
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
TGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGA > NC_000913/4056283‑4056462
|
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tGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGt < 1:3841663/93‑1 (MQ=255)
tGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGt < 2:3475374/93‑1 (MQ=255)
gACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGtt < 2:4377820/93‑1 (MQ=255)
aCGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTg > 2:2957134/1‑93 (MQ=255)
gCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGGTGAc > 1:1644679/1‑93 (MQ=255)
gCATTTGACCGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGAc > 1:80993/1‑93 (MQ=255)
cATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGAcc > 1:1202798/1‑93 (MQ=255)
tttGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGc > 1:1341544/1‑93 (MQ=255)
tttGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGc > 1:2627222/1‑93 (MQ=255)
tttGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGc > 1:4390793/1‑93 (MQ=255)
ttGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGcc < 2:3667130/93‑1 (MQ=255)
ttGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGcc < 2:2536221/93‑1 (MQ=255)
tGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGccc < 1:1532569/93‑1 (MQ=255)
tGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGccc < 1:1408804/93‑1 (MQ=255)
aCGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTg > 1:3251770/1‑93 (MQ=255)
cGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTgg < 1:4202768/93‑1 (MQ=255)
ggCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGgc < 1:2480177/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGt > 1:2792428/1‑93 (MQ=255)
gCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTcc > 2:3229319/1‑93 (MQ=255)
gCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGa < 2:3380125/93‑1 (MQ=255)
cAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTgtt < 2:2446988/93‑3 (MQ=255)
aaaCGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGAtt > 1:4510943/1‑93 (MQ=255)
aaaCGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGAtt < 1:4312540/93‑1 (MQ=255)
aaaCGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGAtt > 1:2098470/1‑93 (MQ=255)
aaCGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTg < 1:890727/93‑1 (MQ=255)
aCGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTgg > 1:2622918/1‑93 (MQ=255)
aCGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTgg < 1:686819/93‑1 (MQ=255)
gcggTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGt < 1:19473/93‑1 (MQ=255)
gcgcTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGt < 2:3042825/93‑1 (MQ=255)
gcgcTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGt < 2:3011609/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGt > 1:1065026/1‑93 (MQ=255)
cTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtgt > 1:466667/1‑93 (MQ=255)
ttCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtgtg < 1:525213/93‑1 (MQ=255)
ttCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtgtg < 2:4482704/93‑1 (MQ=255)
gTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGAt > 1:3742457/1‑93 (MQ=255)
gTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGAt > 2:1865165/1‑93 (MQ=255)
gTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCCGATTGGGTTGTGGAt > 2:2244255/1‑93 (MQ=255)
aaCCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCa > 1:2461482/1‑93 (MQ=255)
aCCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAg < 2:4279015/93‑1 (MQ=255)
aCCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAg < 2:1797626/93‑1 (MQ=255)
cAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGt < 2:524923/93‑1 (MQ=255)
aaaaaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTAt > 1:1670911/1‑93 (MQ=255)
aaaaaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTAt > 2:1058295/1‑93 (MQ=255)
aaaaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTAtt < 2:4130649/93‑1 (MQ=255)
aaaaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTAtt > 2:828768/1‑93 (MQ=255)
aaaaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTCGCGCGCGTCCTGCTTGGGTTGTGGATCATGTAtt > 1:1710010/1‑93 (MQ=255)
aaaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTc > 1:1151377/1‑93 (MQ=255)
aaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCg < 1:3289452/93‑1 (MQ=255)
aaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCg > 2:3840760/1‑93 (MQ=255)
aaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCg > 2:1151571/1‑93 (MQ=255)
aGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGa > 2:1626360/1‑93 (MQ=255)
aGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGa < 1:69948/93‑1 (MQ=255)
gCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGAt < 1:4590841/93‑1 (MQ=255)
gCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGAt < 2:4624811/93‑1 (MQ=255)
cGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATc > 1:61375/1‑93 (MQ=255)
cGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATc < 2:1587483/93‑1 (MQ=255)
gTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCt < 1:3596615/93‑1 (MQ=255)
gTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCt > 1:2925910/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCt > 2:456980/1‑93 (MQ=255)
tttGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTg > 2:4536538/1‑93 (MQ=255)
tttGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTg > 2:91317/1‑93 (MQ=255)
tttGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGGTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTg > 2:2599855/1‑93 (MQ=255)
ttGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGt < 1:2157060/93‑1 (MQ=255)
tGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGtt < 1:4144636/93‑1 (MQ=255)
ttACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGt > 2:1872286/1‑93 (MQ=255)
ttACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGt < 2:195435/93‑1 (MQ=255)
ttACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGt < 1:267489/93‑1 (MQ=255)
tACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGtt > 1:394601/1‑93 (MQ=255)
cGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTaa < 1:2396731/93‑1 (MQ=255)
cGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTaa < 2:3909941/93‑1 (MQ=255)
cGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTaa > 1:3355931/1‑93 (MQ=255)
ggCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAAc < 1:2603844/93‑1 (MQ=255)
gCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAAcc > 2:1490026/1‑93 (MQ=255)
gCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAAcc > 2:208979/1‑93 (MQ=255)
gCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAAcc > 2:3272328/1‑93 (MQ=255)
gCCTGAAGCCGATTGTTGCTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAAcc < 1:1504130/93‑1 (MQ=255)
cggAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTc < 1:1024639/91‑1 (MQ=255)
cTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTc > 2:3524156/1‑93 (MQ=255)
cTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTc < 2:316101/93‑1 (MQ=255)
gAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGa < 1:4018161/93‑1 (MQ=255)
gAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGa < 2:3628978/93‑1 (MQ=255)
gAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGa < 2:2162786/93‑1 (MQ=255)
aGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAcg > 2:1471110/1‑93 (MQ=255)
aGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAcg > 1:2205911/1‑93 (MQ=255)
gCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAcgc < 2:1256424/93‑1 (MQ=255)
gATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTAGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgac > 1:2264498/1‑93 (MQ=255)
aTTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgacc > 1:4061067/1‑93 (MQ=255)
aTTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgacc > 2:405469/1‑93 (MQ=255)
ttgttgTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgaccg > 2:667199/1‑93 (MQ=255)
tgttATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACcgacga < 1:2723063/93‑1 (MQ=255)
ttATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGagc > 2:2838717/1‑93 (MQ=255)
tATCACCAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAATCTCGACGCGAGCGACGagca > 2:3697792/1‑93 (MQ=255)
tATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGcgca > 2:131093/1‑93 (MQ=255)
tATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGagca < 1:4283147/93‑1 (MQ=255)
aTCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGagcag < 2:1544536/93‑1 (MQ=255)
tCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGagcagc > 1:38802/1‑93 (MQ=255)
tCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGagcagc < 1:1042693/93‑1 (MQ=255)
caacaaGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCt > 1:364746/1‑93 (MQ=255)
aacaaGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTg > 1:3038668/1‑93 (MQ=255)
|
TGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGA > NC_000913/4056283‑4056462
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTC > NC_000913/4056280‑4056466
|
GGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAG > SRR4302535.1255138/1‑94 (MQ=60)
GGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAG < SRR4302535.4225181/94‑1 (MQ=60)
GGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAG < SRR4302535.1966650/94‑1 (MQ=60)
GGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAG < SRR4302535.584870/94‑1 (MQ=60)
GTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGG < SRR4302535.2496951/94‑1 (MQ=60)
GTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGG < SRR4302535.2030033/94‑1 (MQ=60)
GTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGG > SRR4302535.4207590/1‑94 (MQ=60)
TTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAGCGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTAAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGT < SRR4302535.4041101/94‑1 (MQ=60)
TTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGT < SRR4302535.1887283/94‑1 (MQ=60)
TTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGT < SRR4302535.103016/94‑1 (MQ=60)
TGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTT < SRR4302535.4178210/94‑1 (MQ=60)
TGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTT < SRR4302535.3868131/94‑1 (MQ=60)
TGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTT < SRR4302535.3898505/94‑1 (MQ=60)
TGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTT < SRR4302535.2881316/94‑1 (MQ=60)
CGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGAC > SRR4302535.3006933/1‑94 (MQ=60)
CGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGGTGAC > SRR4302535.1656566/1‑94 (MQ=60)
CGCATTTGACCGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGAC > SRR4302535.81570/1‑94 (MQ=60)
GCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACC > SRR4302535.1211432/1‑94 (MQ=60)
CATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCG < SRR4302535.1712262/94‑1 (MQ=60)
CATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCG > SRR4302535.2330039/1‑94 (MQ=60)
ATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGC > SRR4302535.1351113/1‑94 (MQ=60)
ATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGC > SRR4302535.3361299/1‑94 (MQ=60)
ATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGC > SRR4302535.4009110/1‑94 (MQ=60)
ATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGC > SRR4302535.2646050/1‑94 (MQ=60)
ATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGC > SRR4302535.4420837/1‑94 (MQ=60)
TGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCT < SRR4302535.1418866/94‑1 (MQ=60)
TGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCT < SRR4302535.1543611/94‑1 (MQ=60)
GACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAATGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTG < SRR4302535.3628707/94‑1 (MQ=60)
GACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTG > SRR4302535.3274362/1‑94 (MQ=60)
CGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGC < SRR4302535.4231525/94‑1 (MQ=60)
CGCCCCGATGCCGCAACCGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTGGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTCTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGC < SRR4302535.1633160/94‑1 (MQ=60)
GGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCG < SRR4302535.2498061/94‑1 (MQ=60)
GGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCG > SRR4302535.1674077/1‑94 (MQ=60)
CCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCG < SRR4302535.2420119/94‑1 (MQ=60)
CCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCG < SRR4302535.4650669/94‑1 (MQ=60)
CCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGC > SRR4302535.1969100/1‑94 (MQ=60)
CCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGCTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGC > SRR4302535.1521801/1‑94 (MQ=60)
CGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCG > SRR4302535.506631/1‑94 (MQ=60)
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GATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGT > SRR4302535.1137483/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCC < SRR4302535.1170190/94‑1 (MQ=60)
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CGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGA > SRR4302535.4066729/1‑94 (MQ=60)
CAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATT > SRR4302535.2113605/1‑94 (MQ=60)
CAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATT > SRR4302535.1443465/1‑94 (MQ=60)
CAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATT > SRR4302535.4541887/1‑94 (MQ=60)
CAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTGACGGCCTGAAGCCGATGGGTGTTAGCAACAAGGTGGACCGCCCTGGCGCGCGTCCggaat > SRR4302535.4715423/1‑89 (MQ=60)
AAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTG > SRR4302535.2214101/1‑94 (MQ=60)
AAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTG > SRR4302535.2678264/1‑94 (MQ=60)
AAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTG < SRR4302535.1680651/94‑1 (MQ=60)
AAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTG < SRR4302535.4342040/94‑1 (MQ=60)
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AACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGG > SRR4302535.1389321/1‑94 (MQ=60)
AACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGG > SRR4302535.2641715/1‑94 (MQ=60)
ACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGG < SRR4302535.691632/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGT > SRR4302535.3788834/1‑94 (MQ=60)
CGCGCCTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGT > SRR4302535.1072603/1‑94 (MQ=60)
GCTCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTT < SRR4302535.2732311/94‑1 (MQ=60)
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GCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTT > SRR4302535.1811475/1‑94 (MQ=60)
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GCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGT > SRR4302535.469933/1‑94 (MQ=60)
GCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGG > SRR4302535.1060659/1‑94 (MQ=60)
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CTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGCTTGCTGTTATCAACAAGGCTGACCGCCCCGGCGCGCGTCCTGATTGGGGTGTG > SRR4302535.3738985/1‑94 (MQ=60)
CTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTG < SRR4302535.700582/94‑1 (MQ=60)
CTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTG < SRR4302535.2255257/94‑1 (MQ=60)
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TCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGA < SRR4302535.3297351/94‑1 (MQ=60)
CGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGAT > SRR4302535.647532/1‑94 (MQ=60)
CGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGAT < SRR4302535.1185261/94‑1 (MQ=60)
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CGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGAT < SRR4302535.170827/94‑1 (MQ=60)
GTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATC > SRR4302535.2414645/1‑94 (MQ=60)
GTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATC > SRR4302535.1818075/1‑94 (MQ=60)
TAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCA > SRR4302535.2479227/1‑94 (MQ=60)
TAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTGATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCA > SRR4302535.3324572/1‑94 (MQ=60)
AACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTCGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAG > SRR4302535.2700404/1‑94 (MQ=60)
ACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAGGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGG > SRR4302535.3303886/1‑94 (MQ=60)
ACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGG < SRR4302535.1052356/94‑1 (MQ=60)
ACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGG < SRR4302535.4523281/94‑1 (MQ=60)
CAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTA < SRR4302535.4207799/94‑1 (MQ=60)
CAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTA < SRR4302535.1964736/94‑1 (MQ=60)
AAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTAT > SRR4302535.1683008/1‑94 (MQ=60)
AAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTAT < SRR4302535.2647240/94‑1 (MQ=60)
AAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTAT > SRR4302535.2987057/1‑94 (MQ=60)
AAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTAT > SRR4302535.3830660/1‑94 (MQ=60)
AAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTAT < SRR4302535.1569085/94‑1 (MQ=60)
AAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTAT > SRR4302535.4040168/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATT > SRR4302535.2604317/1‑94 (MQ=60)
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AAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTCGCGCGCGTCCTGCTTGGGTTGTGGATCATGTATT > SRR4302535.1722372/1‑94 (MQ=60)
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AAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTA > SRR4302535.2255977/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCG > SRR4302535.4052321/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCG < SRR4302535.451067/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGA > SRR4302535.1451930/1‑94 (MQ=60)
AAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGA < SRR4302535.3312324/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGAT < SRR4302535.70460/94‑1 (MQ=60)
GCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATC > SRR4302535.61834/1‑94 (MQ=60)
GCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATC < SRR4302535.4622089/94‑1 (MQ=60)
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GTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTG < SRR4302535.3621574/94‑1 (MQ=60)
TTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTT < SRR4302535.2172557/94‑1 (MQ=60)
TTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTT < SRR4302535.658210/94‑1 (MQ=60)
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CTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGT > SRR4302535.1048535/1‑94 (MQ=60)
TTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTT > SRR4302535.2220886/1‑94 (MQ=60)
TTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTT < SRR4302535.269344/94‑1 (MQ=60)
TTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTT > SRR4302535.397355/1‑94 (MQ=60)
ACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAA < SRR4302535.4582665/94‑1 (MQ=60)
ACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAA > SRR4302535.3379298/1‑94 (MQ=60)
CGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAAC < SRR4302535.3703318/94‑1 (MQ=60)
CGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAAC < SRR4302535.2413956/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACC < SRR4302535.2622537/94‑1 (MQ=60)
GCCTGAAGCCGATTGTTGCTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCT < SRR4302535.1514949/94‑1 (MQ=60)
CCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCCGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTC > SRR4302535.3110941/1‑94 (MQ=60)
CCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTC < SRR4302535.1417057/94‑1 (MQ=60)
CTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACGTCG > SRR4302535.413368/1‑94 (MQ=60)
CTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCG > SRR4302535.2130046/1‑94 (MQ=60)
CGGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCG < SRR4302535.1031918/94‑1 (MQ=60)
TGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGA < SRR4302535.4357597/94‑1 (MQ=60)
GAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAC < SRR4302535.2636891/94‑1 (MQ=60)
GAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAC < SRR4302535.4045652/94‑1 (MQ=60)
AAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACG < SRR4302535.863041/94‑1 (MQ=60)
AAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACG < SRR4302535.4675752/94‑1 (MQ=60)
AAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACG > SRR4302535.2221621/1‑94 (MQ=60)
AGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGC < SRR4302535.3599215/94‑1 (MQ=60)
GCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCG < SRR4302535.4089228/94‑1 (MQ=60)
CCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTGGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGA > SRR4302535.79731/1‑94 (MQ=60)
CCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGC > SRR4302535.3392088/1‑94 (MQ=60)
CGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGAC > SRR4302535.849469/1‑94 (MQ=60)
CGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGAC > SRR4302535.366239/1‑94 (MQ=60)
CGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTAGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGAC > SRR4302535.2280633/1‑94 (MQ=60)
CGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCACGTATTCGATCTGTTAGTTAACCTCGACGCGAC > SRR4302535.1257784/1‑94 (MQ=60)
GATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGTCCTGGCGCGCTTCCTGCTTGGGGTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAAGCTCGACGCGACC > SRR4302535.2618093/1‑94 (MQ=60)
GATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACC < SRR4302535.3868869/94‑1 (MQ=60)
GATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACC > SRR4302535.4088865/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCG > SRR4302535.571249/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCG > SRR4302535.2489978/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCG > SRR4302535.2121804/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCG > SRR4302535.3962684/1‑94 (MQ=60)
TTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGA > SRR4302535.1606880/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTAGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACG > SRR4302535.2532338/1‑94 (MQ=60)
TTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGA > SRR4302535.1535824/1‑94 (MQ=60)
TGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAG < SRR4302535.912540/94‑1 (MQ=60)
TGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAG < SRR4302535.3078784/94‑1 (MQ=60)
TGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAG < SRR4302535.2742515/94‑1 (MQ=60)
TGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAG < SRR4302535.2645906/94‑1 (MQ=60)
TGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAG > SRR4302535.2635838/1‑94 (MQ=60)
TGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAG < SRR4302535.23154/94‑1 (MQ=60)
TTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCA < SRR4302535.4414217/94‑1 (MQ=60)
TATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAG < SRR4302535.4312450/94‑1 (MQ=60)
ATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGC < SRR4302535.4601701/94‑1 (MQ=60)
ATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGC > SRR4302535.39101/1‑94 (MQ=60)
TCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCT > SRR4302535.367256/1‑94 (MQ=60)
TCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCT < SRR4302535.1050085/94‑1 (MQ=60)
CAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTG < SRR4302535.3965150/94‑1 (MQ=60)
CAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTG > SRR4302535.3059951/1‑94 (MQ=60)
AACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGG > SRR4302535.4312890/1‑94 (MQ=60)
ACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGTAGCTGGA > SRR4302535.69354/1‑94 (MQ=60)
AAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACT > SRR4302535.2322760/1‑94 (MQ=60)
AAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACT < SRR4302535.2280564/94‑1 (MQ=60)
AAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACT > SRR4302535.118112/1‑94 (MQ=60)
AAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACT < SRR4302535.1131138/94‑1 (MQ=60)
AAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACT < SRR4302535.1114320/94‑1 (MQ=60)
AGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTT > SRR4302535.1221927/1‑94 (MQ=60)
GGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTTGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTC < SRR4302535.1266470/94‑1 (MQ=60)
GGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGATCGACGAGCAGCTGGACTTC > SRR4302535.2507762/1‑94 (MQ=60)
GGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTC > SRR4302535.675153/1‑94 (MQ=60)
GGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTC > SRR4302535.2004796/1‑94 (MQ=60)
GGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTC > SRR4302535.1665939/1‑94 (MQ=60)
GGTTGACAGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTC > SRR4302535.2410054/1‑94 (MQ=60)
|
GGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTC > NC_000913/4056280‑4056466
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
