Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,173,456 |
A→G |
intergenic (+48/‑67) |
thrT → / → tufB |
tRNA‑Thr/protein chain elongation factor EF‑Tu |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,173,456 | 0 | A | G | 100.0%
| 668.4
/ NA
| 211 | intergenic (+48/‑67) | thrT/tufB | tRNA‑Thr/protein chain elongation factor EF‑Tu |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (89/122); total (89/122) |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
GGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACG > NC_000913/4173366‑4173545
|
ggTAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGt < 2:627814/93‑1 (MQ=255)
gTAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTc < 1:2779551/93‑1 (MQ=255)
tAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCg > 2:3164477/1‑93 (MQ=255)
aaGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCgg < 2:3726943/93‑1 (MQ=255)
aGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCggg > 2:3007025/1‑93 (MQ=255)
tggggTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATg > 2:1580553/4‑93 (MQ=255)
ggggTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGt < 1:4499859/91‑1 (MQ=255)
ggTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTg > 1:896365/1‑93 (MQ=255)
gTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGc < 1:1784373/93‑1 (MQ=255)
tCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGcc < 2:408130/93‑1 (MQ=255)
tCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGcc < 2:4010295/93‑1 (MQ=255)
cGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCt < 2:1965216/93‑1 (MQ=255)
ggCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTg < 1:3656627/93‑1 (MQ=255)
gCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTgg < 2:3950260/93‑1 (MQ=255)
gTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTTCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTg > 1:1521365/1‑93 (MQ=255)
gTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTg > 1:3108809/1‑93 (MQ=255)
ttCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGa < 1:2314339/93‑1 (MQ=255)
cGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGAtg < 1:438594/93‑1 (MQ=255)
gAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGAtgt < 2:1648104/93‑1 (MQ=255)
gAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGAtgt < 1:1832563/93‑1 (MQ=255)
aaTCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGAtgtg > 2:1272629/1‑93 (MQ=255)
aTCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATgtgg > 2:4410712/1‑93 (MQ=255)
tCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATgtggt < 1:3573429/93‑1 (MQ=255)
tGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGa < 1:2140331/93‑1 (MQ=255)
tGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGa > 1:527263/1‑93 (MQ=255)
gCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGat < 2:1053246/93‑1 (MQ=255)
cTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGatat < 2:3197367/93‑1 (MQ=255)
cTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGatat < 2:1680043/93‑1 (MQ=255)
cTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGatat > 1:327582/1‑93 (MQ=255)
tATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATc > 2:2125238/1‑93 (MQ=255)
tATCAGCACCACTTCTTGTCACCTCCCTGTTTTTTCGTTCTGTTTATTGCATTCAGCAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATc < 2:2392433/93‑1 (MQ=255)
tCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCAc > 2:1620659/1‑93 (MQ=255)
cAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATaccacc < 1:1734664/93‑1 (MQ=255)
gCACTACTTCTTTTCTCCTGACTGTATTGCCCTTCTGATTGCTACCTTCAACAGGTCGGGCATGTGGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGa < 2:729701/93‑1 (MQ=255)
gCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGa < 1:610543/93‑1 (MQ=255)
gCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGa < 1:289535/93‑1 (MQ=255)
gCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGa > 1:3219475/1‑93 (MQ=255)
gCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGa > 2:3813798/1‑93 (MQ=255)
gCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGa > 1:1968306/1‑93 (MQ=255)
gCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGa > 1:1442940/1‑93 (MQ=255)
accacTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGAtt > 1:1597301/1‑93 (MQ=255)
cacTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTa < 1:105115/93‑1 (MQ=255)
acTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTAt > 1:4368979/1‑93 (MQ=255)
acTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTAt < 1:2497298/93‑1 (MQ=255)
cttcttTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATc < 2:222042/93‑1 (MQ=255)
cttcttTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATc < 2:855077/93‑1 (MQ=255)
cttcttTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATc < 1:487626/93‑1 (MQ=255)
cttTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCgt > 1:4552407/1‑93 (MQ=255)
ttCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTc < 1:2256176/93‑1 (MQ=255)
ctcctcCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCtt < 1:162736/93‑1 (MQ=255)
ctcctcCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCtt < 1:284617/93‑1 (MQ=255)
tcctccCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTa < 2:255467/93‑1 (MQ=255)
tcctccCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTa < 1:3951267/93‑1 (MQ=255)
ctccCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTaga > 2:2253997/1‑93 (MQ=255)
tccCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTagag < 1:1312699/93‑1 (MQ=255)
cccTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAgg < 1:1962912/93‑1 (MQ=255)
ccTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAggg > 1:4052176/1‑93 (MQ=255)
cTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGa > 2:4532192/1‑93 (MQ=255)
tGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGAc > 2:2587041/1‑93 (MQ=255)
ttttttCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACaa > 1:2938218/1‑93 (MQ=255)
ttttttCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACaa > 1:1222173/1‑93 (MQ=255)
ttttttCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACaa < 2:3607901/93‑1 (MQ=255)
ttttttCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACaa < 2:3376109/93‑1 (MQ=255)
tttttCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAAt < 2:3873035/93‑1 (MQ=255)
ttttCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATc < 2:2091415/93‑1 (MQ=255)
ttttCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATc < 1:4443915/93‑1 (MQ=255)
ttttCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATc < 2:1349601/93‑1 (MQ=255)
ttttCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATc > 2:1229493/1‑93 (MQ=255)
tCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGAt < 2:2238257/93‑1 (MQ=255)
tCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGAt < 2:3379464/93‑1 (MQ=255)
tCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGAt > 2:1753789/1‑93 (MQ=255)
tCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGAt < 2:1305539/93‑1 (MQ=255)
ccTTCTGTTTATTGCTTTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATg < 2:2501244/93‑1 (MQ=255)
ccTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATg < 1:345723/93‑1 (MQ=255)
cTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGt < 2:4109575/93‑1 (MQ=255)
cTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGt > 2:4318190/1‑93 (MQ=255)
cTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGt > 1:17075/1‑93 (MQ=255)
cTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGt > 1:4169309/1‑93 (MQ=255)
cTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGt > 2:325979/1‑93 (MQ=255)
ttCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTc < 2:2958093/93‑1 (MQ=255)
ttCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTc > 1:3205059/1‑93 (MQ=255)
ttCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTc < 1:2224909/93‑1 (MQ=255)
cTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTa < 1:717235/93‑1 (MQ=255)
tGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTaa > 2:1945100/1‑93 (MQ=255)
tGTTTATTGCATTCAACAGGCCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTaa > 2:1510984/1‑93 (MQ=255)
gTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTaaa < 2:599458/93‑1 (MQ=255)
gTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTaaa > 1:2389539/1‑93 (MQ=255)
tttATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAg < 2:1500660/93‑1 (MQ=255)
ttATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGa < 2:2312282/93‑1 (MQ=255)
tATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGAACAATCGATGTCTAAAGaa < 2:4573402/93‑1 (MQ=255)
aTTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaa > 2:1875384/1‑93 (MQ=255)
ttGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaaa < 1:347818/93‑1 (MQ=255)
ttGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaaa < 2:3471877/93‑1 (MQ=255)
tGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAg > 1:3384277/1‑93 (MQ=255)
gCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGt < 2:1476205/93‑1 (MQ=255)
aTTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGttt < 2:1411854/93‑1 (MQ=255)
tCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGGGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGa > 1:4217690/1‑93 (MQ=255)
aacagGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAAc < 2:3564230/93‑1 (MQ=255)
aacagGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAAc < 1:2609179/93‑1 (MQ=255)
acagGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACg > 1:2405155/1‑93 (MQ=255)
|
GGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACG > NC_000913/4173366‑4173545
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACGTACA > NC_000913/4173363‑4173549
|
CTTGGTAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAG > SRR4302535.248238/1‑94 (MQ=60)
CTTGGTAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAG < SRR4302535.3175630/94‑1 (MQ=60)
CTTGGTAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAG > SRR4302535.260158/1‑94 (MQ=60)
CTTGGTAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAG > SRR4302535.3404992/1‑94 (MQ=60)
CTTGGTAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAG < SRR4302535.452709/94‑1 (MQ=60)
CTTGGTAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAG < SRR4302535.3550970/94‑1 (MQ=60)
CTTGGTAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAG < SRR4302535.4083458/94‑1 (MQ=60)
TTGGTAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGG < SRR4302535.3337386/94‑1 (MQ=60)
TGGTAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGT < SRR4302535.3939462/94‑1 (MQ=60)
TGGTAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGT < SRR4302535.892826/94‑1 (MQ=60)
GTAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCG < SRR4302535.399722/94‑1 (MQ=60)
GTAAGGGTGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCG < SRR4302535.2799341/94‑1 (MQ=60)
TGGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGT < SRR4302535.148151/94‑1 (MQ=60)
GGGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTT < SRR4302535.4530756/94‑1 (MQ=60)
GGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTG < SRR4302535.3408242/94‑1 (MQ=60)
GGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTG > SRR4302535.902722/1‑94 (MQ=60)
GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCC < SRR4302535.1797289/94‑1 (MQ=60)
TCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCT < SRR4302535.3558917/94‑1 (MQ=60)
GGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGG < SRR4302535.3681938/94‑1 (MQ=60)
GGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGG < SRR4302535.2557635/94‑1 (MQ=60)
GGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTCG > SRR4302535.1749412/1‑94 (MQ=60)
CAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTT < SRR4302535.1561952/94‑1 (MQ=60)
AGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTTCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTG > SRR4302535.1532323/1‑94 (MQ=60)
AGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTG < SRR4302535.2953883/94‑1 (MQ=60)
AGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTG > SRR4302535.3130452/1‑94 (MQ=60)
AGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTG > SRR4302535.3232097/1‑94 (MQ=60)
TTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGAT < SRR4302535.2330898/94‑1 (MQ=60)
TCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATG < SRR4302535.1769468/94‑1 (MQ=60)
CGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGT < SRR4302535.441661/94‑1 (MQ=60)
GAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTG < SRR4302535.1845787/94‑1 (MQ=60)
GAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTG > SRR4302535.2127624/1‑94 (MQ=60)
GAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTG < SRR4302535.2248917/94‑1 (MQ=60)
AATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGG < SRR4302535.62890/94‑1 (MQ=60)
ATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGT > SRR4302535.999386/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGT < SRR4302535.3337168/94‑1 (MQ=60)
TCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTG < SRR4302535.3598207/94‑1 (MQ=60)
CTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGA > SRR4302535.530947/1‑94 (MQ=60)
TGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGAT < SRR4302535.2155740/94‑1 (MQ=60)
TGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGAT > SRR4302535.804585/1‑94 (MQ=60)
CCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATAT > SRR4302535.329853/1‑94 (MQ=60)
CCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATAT > SRR4302535.1625770/1‑94 (MQ=60)
TCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACC > SRR4302535.1077399/1‑94 (MQ=60)
CAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATACCACCG < SRR4302535.1747205/94‑1 (MQ=60)
AGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGA > SRR4302535.1453261/1‑94 (MQ=60)
AGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGA > SRR4302535.1982491/1‑94 (MQ=60)
AGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGA > SRR4302535.3241783/1‑94 (MQ=60)
GCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGAT < SRR4302535.614796/94‑1 (MQ=60)
GCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGAT < SRR4302535.291562/94‑1 (MQ=60)
CACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATT > SRR4302535.1608822/1‑94 (MQ=60)
CACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATT < SRR4302535.2803911/94‑1 (MQ=60)
ACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTT > SRR4302535.1267629/1‑94 (MQ=60)
CCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTA < SRR4302535.2961396/94‑1 (MQ=60)
CACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTAT < SRR4302535.105861/94‑1 (MQ=60)
CACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTAT > SRR4302535.4398880/1‑94 (MQ=60)
CACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTAT < SRR4302535.2907856/94‑1 (MQ=60)
ACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATC < SRR4302535.2515314/94‑1 (MQ=60)
CTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCC < SRR4302535.491044/94‑1 (MQ=60)
CTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCC < SRR4302535.491043/94‑1 (MQ=60)
CTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCC > SRR4302535.2220471/1‑94 (MQ=60)
TCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGT < SRR4302535.4449236/94‑1 (MQ=60)
TCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGT > SRR4302535.4583516/1‑94 (MQ=60)
TTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGAGTC > SRR4302535.1700069/1‑94 (MQ=60)
TTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCT > SRR4302535.3497643/1‑94 (MQ=60)
TTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCT < SRR4302535.2272239/94‑1 (MQ=60)
CTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTA < SRR4302535.286605/94‑1 (MQ=60)
CTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTA > SRR4302535.4403907/1‑94 (MQ=60)
CTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTA < SRR4302535.163874/94‑1 (MQ=60)
TCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAG < SRR4302535.3269516/94‑1 (MQ=60)
TCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAG < SRR4302535.3978244/94‑1 (MQ=60)
CCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGA > SRR4302535.1977092/1‑94 (MQ=60)
CCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGA < SRR4302535.4476213/94‑1 (MQ=60)
CTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAG < SRR4302535.2658491/94‑1 (MQ=60)
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CCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGG < SRR4302535.1400714/94‑1 (MQ=60)
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CTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGAC > SRR4302535.3656102/1‑94 (MQ=60)
GTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAA > SRR4302535.2958885/1‑94 (MQ=60)
GTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAA > SRR4302535.1230925/1‑94 (MQ=60)
TTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAAT < SRR4302535.2371538/94‑1 (MQ=60)
TTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAAT < SRR4302535.2409060/94‑1 (MQ=60)
TTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAAT < SRR4302535.1810021/94‑1 (MQ=60)
TTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCG < SRR4302535.4474391/94‑1 (MQ=60)
TTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCG < SRR4302535.3417710/94‑1 (MQ=60)
TCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATG < SRR4302535.436475/94‑1 (MQ=60)
TCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGT < SRR4302535.3191881/94‑1 (MQ=60)
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CCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGT < SRR4302535.348104/94‑1 (MQ=60)
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CCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGT > SRR4302535.17202/1‑94 (MQ=60)
CCTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGT < SRR4302535.53925/94‑1 (MQ=60)
CTTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTC > SRR4302535.3227256/1‑94 (MQ=60)
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TTCTGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCT < SRR4302535.2240741/94‑1 (MQ=60)
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TGTTTATTGCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAA > SRR4302535.2406717/1‑94 (MQ=60)
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GCATTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTT > SRR4302535.2437364/1‑94 (MQ=60)
TTCAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGGGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGA > SRR4302535.4246553/1‑94 (MQ=60)
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CAACAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAAC < SRR4302535.2148585/94‑1 (MQ=60)
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CAGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACGTA < SRR4302535.4435025/94‑1 (MQ=60)
AGGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACGTAC > SRR4302535.352438/1‑94 (MQ=60)
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CTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACGTACA > NC_000913/4173363‑4173549
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
