Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,608,595 |
2 bp→GC |
intergenic (+23/‑369) |
prfC → / → osmY |
peptide chain release factor RF‑3/OsmY |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,608,595 | 0 | C | G | 100.0%
| 602.8
/ NA
| 195 | intergenic (+23/‑370) | prfC/osmY | peptide chain release factor RF‑3/OsmY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (85/110); total (85/110) |
| * | NC_000913 | 4,608,596 | 0 | G | C | 99.5%
| 615.0
/ NA
| 195 | intergenic (+24/‑369) | prfC/osmY | peptide chain release factor RF‑3/OsmY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (84/110); minor base T (1/0); total (85/110) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.36e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
AACCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTACGCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATA > NC_000913/4608510‑4608682
||
tGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGccc > 1:162523/1‑93 (MQ=255)
cgcCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTACAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTg > 1:2521742/1‑93 (MQ=255)
gcCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGt < 2:3701418/93‑1 (MQ=255)
ccTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTc > 2:334207/1‑93 (MQ=255)
cTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCa > 2:351289/1‑93 (MQ=255)
ggCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAt > 2:2756430/1‑93 (MQ=255)
ggCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAt < 1:3378942/93‑1 (MQ=255)
ggCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAt < 1:4151181/93‑1 (MQ=255)
ggCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAt > 1:2323126/1‑93 (MQ=255)
gCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAtt < 1:3102480/93‑1 (MQ=255)
cacaGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAttt < 2:4590646/93‑1 (MQ=255)
acaGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTc > 1:802155/1‑93 (MQ=255)
aGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTccc < 1:3596815/93‑1 (MQ=255)
aaCGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGAATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCccttc > 1:880360/1‑93 (MQ=255)
aCGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCccttcc > 1:2731509/1‑93 (MQ=255)
cGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCccttcct < 1:2994669/93‑1 (MQ=255)
ttATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCtta < 2:2338907/93‑1 (MQ=255)
ttATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCtta < 1:1121052/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCttatt < 2:799491/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCttatt < 1:2185658/93‑1 (MQ=255)
tCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCttatta < 2:546948/93‑1 (MQ=255)
tCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCttatta < 2:4254470/93‑1 (MQ=255)
tCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCttatta < 2:3241122/93‑1 (MQ=255)
ccGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATGCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAg < 1:1014323/93‑1 (MQ=255)
cGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGc < 1:2972809/93‑1 (MQ=255)
ggACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGcc < 1:2412364/93‑1 (MQ=255)
ggACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGcc < 1:4346686/93‑1 (MQ=255)
aCGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGc < 2:439858/93‑1 (MQ=255)
cGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCt < 2:1823622/93‑1 (MQ=255)
gTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCtt > 1:366955/1‑93 (MQ=255)
gTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCtt > 1:4083695/1‑93 (MQ=255)
ttCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTa > 1:4502930/1‑93 (MQ=255)
ttCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTa > 2:100078/1‑93 (MQ=255)
tCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTAc > 2:4325241/1‑93 (MQ=255)
tCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTAc < 1:1192394/93‑1 (MQ=255)
tCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTAc < 2:2543516/93‑1 (MQ=255)
tCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTAc > 2:4536899/1‑93 (MQ=255)
cAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACg < 1:2273959/93‑1 (MQ=255)
gTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGa > 2:4116042/1‑93 (MQ=255)
gTTCCACCAGAACCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGGCCTGTCAATTTCACTTCCTTATTAGACGCTTACgta > 2:4013530/1‑91 (MQ=255)
ttCCACCAGACCCGGGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGaa < 1:916282/93‑1 (MQ=255)
ttCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGaa < 1:540196/93‑1 (MQ=255)
tCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTTCCTCCAGTGCTCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTGCCTTATTAGCCGCTTACGGAAt < 2:2306159/93‑1 (MQ=255)
tCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAAt < 1:713752/93‑1 (MQ=255)
ccaccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATg > 2:71354/1‑93 (MQ=255)
ccaccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATg > 1:181149/1‑93 (MQ=255)
caccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGt < 2:2133939/93‑1 (MQ=255)
caccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGt > 2:1600186/1‑93 (MQ=255)
caccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGt > 1:4294705/1‑93 (MQ=255)
caccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGt < 1:1486496/93‑1 (MQ=255)
caccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGt < 1:3203399/93‑1 (MQ=255)
caccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGATTACGGAATGt > 2:1500932/1‑93 (MQ=255)
accaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGtt < 2:4512489/93‑1 (MQ=255)
accaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGtt < 2:3449131/93‑1 (MQ=255)
ccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTc < 2:3524650/93‑1 (MQ=255)
ccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTc > 1:2746376/1‑93 (MQ=255)
aGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCtt > 1:1474864/1‑93 (MQ=255)
gACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTa > 2:178948/1‑93 (MQ=255)
gACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTa > 2:2704871/1‑93 (MQ=255)
gACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTa > 2:4059803/1‑93 (MQ=255)
aCCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTaa < 1:4093896/93‑1 (MQ=255)
aCCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTaa < 1:2374958/93‑1 (MQ=255)
ccGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTaaaa < 1:4233500/93‑1 (MQ=255)
ccGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTaaaa > 2:4355859/1‑93 (MQ=255)
ccGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTaaaa > 1:4636845/1‑93 (MQ=255)
ccGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTaaaa < 2:222994/93‑1 (MQ=255)
cgcgAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAAc > 1:2608890/1‑93 (MQ=255)
gcgAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACa > 1:3637099/1‑93 (MQ=255)
gcgAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACa > 2:324920/1‑93 (MQ=255)
gAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACAtt < 1:3800426/93‑1 (MQ=255)
gAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACAtt > 2:3102938/1‑93 (MQ=255)
aGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTc > 2:2108759/1‑93 (MQ=255)
gCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCa > 1:2459725/1‑93 (MQ=255)
aTTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACt < 1:3334247/93‑1 (MQ=255)
tAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACttt > 1:2888157/1‑93 (MQ=255)
aaTTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACtttt < 1:1790087/93‑1 (MQ=255)
aTTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTg > 2:389387/1‑93 (MQ=255)
ttCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGc < 2:1404413/93‑1 (MQ=255)
ttCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGc < 2:4182602/93‑1 (MQ=255)
tCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCt > 1:1077653/1‑93 (MQ=255)
ttGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTa < 2:761118/93‑1 (MQ=255)
ttGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTa < 2:3275767/93‑1 (MQ=255)
tGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTAt < 1:1310100/93‑1 (MQ=255)
gCCTCCAGGGGGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTGCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATg < 2:3698011/93‑1 (MQ=255)
gCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATg > 2:4578449/1‑93 (MQ=255)
ccTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGt > 2:2618844/1‑93 (MQ=255)
cTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGtt > 2:2977331/1‑93 (MQ=255)
cTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGtt < 1:4265846/93‑1 (MQ=255)
cTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGtt < 1:3447698/93‑1 (MQ=255)
tCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGttt > 1:4307285/1‑93 (MQ=255)
tCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGttt < 1:4160537/93‑1 (MQ=255)
ccAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGtttt > 2:2870922/1‑93 (MQ=255)
cAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTc > 1:3017386/1‑93 (MQ=255)
cAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTc < 2:1349516/93‑1 (MQ=255)
gggCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGc < 1:195415/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTg < 2:2423326/93‑1 (MQ=255)
cgcgGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGa < 2:3625071/93‑1 (MQ=255)
cgGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGata < 1:967254/93‑1 (MQ=255)
cgGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGata < 1:3982198/93‑1 (MQ=255)
cgGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGata < 1:3520296/93‑1 (MQ=255)
||
AACCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTACGCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATA > NC_000913/4608510‑4608682
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AACCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTACGCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATC > NC_000913/4608510‑4608684
|
AACCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCG > SRR4302535.238360/1‑94 (MQ=60)
ACCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGC > SRR4302535.4054058/1‑94 (MQ=60)
ACCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGC > SRR4302535.3481864/1‑94 (MQ=60)
CCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCC < SRR4302535.1613979/94‑1 (MQ=60)
CTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCC > SRR4302535.3890277/1‑94 (MQ=60)
CTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCC > SRR4302535.1750854/1‑94 (MQ=60)
CTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCC > SRR4302535.163658/1‑94 (MQ=60)
GCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCAGGAGCCGCTGCGCCCTG > SRR4302535.1224138/1‑94 (MQ=60)
GCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTACAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTG > SRR4302535.2539913/1‑94 (MQ=60)
CTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAA < SRR4302535.4599719/94‑1 (MQ=60)
TGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAT < SRR4302535.1000396/94‑1 (MQ=60)
TGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAT > SRR4302535.2339748/1‑94 (MQ=60)
GGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATT < SRR4302535.3402435/94‑1 (MQ=60)
GGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATT < SRR4302535.4179605/94‑1 (MQ=60)
GGCACAGCAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCCCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATT < SRR4302535.930383/94‑1 (MQ=60)
GCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTT < SRR4302535.3124077/94‑1 (MQ=60)
CACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTC > SRR4302535.807791/1‑94 (MQ=60)
ACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCC > SRR4302535.4326579/1‑94 (MQ=60)
AGGAACGTTATCCGTACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCT < SRR4302535.2413017/94‑1 (MQ=60)
AGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCT < SRR4302535.3621776/94‑1 (MQ=60)
AGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCT < SRR4302535.3045992/94‑1 (MQ=60)
GAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTC < SRR4302535.180533/94‑1 (MQ=60)
GAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGAATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTC > SRR4302535.886593/1‑94 (MQ=60)
AACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCC > SRR4302535.1914235/1‑94 (MQ=60)
AACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCC > SRR4302535.2751009/1‑94 (MQ=60)
CGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTT < SRR4302535.3015663/94‑1 (MQ=60)
GTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTA > SRR4302535.3013882/1‑94 (MQ=60)
TTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTAT < SRR4302535.1129046/94‑1 (MQ=60)
TATCCGCGCGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATT < SRR4302535.2228591/94‑1 (MQ=60)
ATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTA < SRR4302535.2201235/94‑1 (MQ=60)
CCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGTCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGC < SRR4302535.2533832/94‑1 (MQ=60)
CCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATGCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGC < SRR4302535.1021533/94‑1 (MQ=60)
CGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCC < SRR4302535.2993673/94‑1 (MQ=60)
CGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCC < SRR4302535.2638568/94‑1 (MQ=60)
GGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCG < SRR4302535.4376426/94‑1 (MQ=60)
GGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCG < SRR4302535.2429729/94‑1 (MQ=60)
GACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGC > SRR4302535.4273131/1‑94 (MQ=60)
ACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCT < SRR4302535.3667499/94‑1 (MQ=60)
CGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTT > SRR4302535.369486/1‑94 (MQ=60)
CGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTT > SRR4302535.4111621/1‑94 (MQ=60)
GTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTA > SRR4302535.4533849/1‑94 (MQ=60)
GTTCAGTGCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGTCGCTGCGCTCTGGCAATTTCTCTTCCTTATTAGCCGCTTA > SRR4302535.4716087/1‑94 (MQ=60)
TTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTAC > SRR4302535.4167527/1‑94 (MQ=60)
TTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTAC < SRR4302535.3378806/94‑1 (MQ=60)
TCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACG < SRR4302535.1200934/94‑1 (MQ=60)
CAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGG > SRR4302535.745411/1‑94 (MQ=60)
CAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGG < SRR4302535.2290187/94‑1 (MQ=60)
AGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGA < SRR4302535.3565603/94‑1 (MQ=60)
AGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGA < SRR4302535.636044/94‑1 (MQ=60)
TTCCACCAGACCCGGGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAAT < SRR4302535.922784/94‑1 (MQ=60)
TTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAAT < SRR4302535.543965/94‑1 (MQ=60)
cccgccagccccgcgattattaattctgcccgccgGGGCGCGGTACCCGCTGCCCCCTTTCATTTCCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATG < SRR4302535.3264868/59‑1 (MQ=34)
TCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATG > SRR4302535.182407/1‑94 (MQ=60)
TCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATG < SRR4302535.718767/94‑1 (MQ=60)
CCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGT > SRR4302535.4324091/1‑94 (MQ=60)
CCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGT < SRR4302535.4365160/94‑1 (MQ=60)
CCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGT > SRR4302535.1108513/1‑94 (MQ=60)
CACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTT > SRR4302535.229878/1‑94 (MQ=60)
CACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTT < SRR4302535.3225580/94‑1 (MQ=60)
CACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTT < SRR4302535.1497138/94‑1 (MQ=60)
CACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTT > SRR4302535.3464094/1‑94 (MQ=60)
ACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTT > SRR4302535.2957383/1‑94 (MQ=60)
ACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTC > SRR4302535.2765950/1‑94 (MQ=60)
CAGGCCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTT < SRR4302535.3024468/94‑1 (MQ=60)
CAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTT > SRR4302535.1485423/1‑94 (MQ=60)
ACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAA < SRR4302535.4121912/94‑1 (MQ=60)
ACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAA < SRR4302535.2392022/94‑1 (MQ=60)
CCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAA > SRR4302535.4668298/1‑94 (MQ=60)
CCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAAC > SRR4302535.1296929/1‑94 (MQ=60)
CCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAAC < SRR4302535.4262470/94‑1 (MQ=60)
CCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAAC > SRR4302535.2627611/1‑94 (MQ=60)
CGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACA < SRR4302535.3203094/94‑1 (MQ=60)
CGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACA > SRR4302535.3662302/1‑94 (MQ=60)
GCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACAT < SRR4302535.833693/94‑1 (MQ=60)
CGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGTGCGGTAGCTGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATT < SRR4302535.2876271/94‑1 (MQ=60)
CGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATT > SRR4302535.3760086/1‑94 (MQ=60)
CGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATT < SRR4302535.1485788/94‑1 (MQ=60)
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GAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTC < SRR4302535.116708/94‑1 (MQ=60)
AGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCA > SRR4302535.2477460/1‑94 (MQ=60)
ATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTT < SRR4302535.3357470/94‑1 (MQ=60)
ATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTT > SRR4302535.3255692/1‑94 (MQ=60)
TTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTT > SRR4302535.2908591/1‑94 (MQ=60)
AATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTG < SRR4302535.1803035/94‑1 (MQ=60)
AATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTG < SRR4302535.4180294/94‑1 (MQ=60)
TTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCT > SRR4302535.1085321/1‑94 (MQ=60)
TTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCATGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCT < SRR4302535.1325289/94‑1 (MQ=60)
TTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTAT < SRR4302535.4261868/94‑1 (MQ=60)
TGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATG < SRR4302535.1319465/94‑1 (MQ=60)
TGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATG > SRR4302535.2475482/1‑94 (MQ=60)
GCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGT < SRR4302535.2762347/94‑1 (MQ=60)
CCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTT > SRR4302535.4112330/1‑94 (MQ=60)
CTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTT < SRR4302535.4295057/94‑1 (MQ=60)
CTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTT > SRR4302535.4336750/1‑94 (MQ=60)
CTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTT < SRR4302535.3471669/94‑1 (MQ=60)
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TCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTT < SRR4302535.4189013/94‑1 (MQ=60)
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CCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTC < SRR4302535.262607/94‑1 (MQ=60)
CAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCG < SRR4302535.4314952/94‑1 (MQ=60)
GGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCT < SRR4302535.196758/94‑1 (MQ=60)
CGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATAT < SRR4302535.974126/94‑1 (MQ=60)
CGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATAT < SRR4302535.3544747/94‑1 (MQ=60)
CGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATAT < SRR4302535.4009407/94‑1 (MQ=60)
GGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATC > SRR4302535.2722474/1‑94 (MQ=60)
GGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATC > SRR4302535.3155662/1‑94 (MQ=60)
GGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATC < SRR4302535.3881382/94‑1 (MQ=60)
|
AACCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTACGCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATC > NC_000913/4608510‑4608684
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
