Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
950,532 |
T→C |
Q749R (CAG→CGG) |
pflB ← |
formate acetyltransferase 1 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 950,532 | 0 | T | C | 99.6%
| 803.8
/ NA
| 249 | Q749R (CAG→CGG) | pflB | formate acetyltransferase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (130/118); minor base A (1/0); total (131/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
TTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATC > NC_000913/950442‑950621
|
ttCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCccgc < 1:5090883/93‑1 (MQ=255)
ttCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCccgc < 1:5885055/93‑1 (MQ=255)
gTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCccgctgc < 1:3076806/93‑1 (MQ=255)
gTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCccgctgc < 1:2525641/93‑1 (MQ=255)
tGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCccgctgct > 2:4701929/1‑93 (MQ=255)
tGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCccgctgct > 1:5775917/1‑93 (MQ=255)
ggAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCccgctgctg > 1:1132079/1‑93 (MQ=255)
gAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGCAATAACGTCCCGCTGCTGt > 1:4585535/1‑93 (MQ=255)
aGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGtt > 2:2359364/1‑93 (MQ=255)
gCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCCAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGttt > 1:4434445/1‑92 (MQ=255)
cTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCtt > 2:4388285/1‑93 (MQ=255)
cTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCtt > 2:3416603/1‑93 (MQ=255)
cTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGATGTTCtt > 1:837672/1‑93 (MQ=255)
tttATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCttt > 1:2340440/1‑93 (MQ=255)
tttATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCttt > 1:3361875/1‑93 (MQ=255)
ttATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAGTCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTa < 2:3610079/93‑1 (MQ=255)
ttGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTc > 1:1682248/1‑93 (MQ=255)
tGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCa > 1:1437803/1‑93 (MQ=255)
gTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAg < 2:5965547/93‑1 (MQ=255)
tACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGc < 2:1854939/93‑1 (MQ=255)
tACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGc < 2:1213080/93‑1 (MQ=255)
cGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGa < 1:4852916/93‑1 (MQ=255)
gCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAg > 1:5238703/1‑93 (MQ=255)
gCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAg < 1:2711533/93‑1 (MQ=255)
cTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGt > 1:2229807/1‑93 (MQ=255)
tttttACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGtt < 2:3052135/93‑1 (MQ=255)
tttttACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGtt < 2:1108423/93‑1 (MQ=255)
tttttACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGtt > 1:6133207/1‑93 (MQ=255)
tttttACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGtt < 1:3622531/93‑1 (MQ=255)
ttttACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTg < 1:623018/93‑1 (MQ=255)
ttttACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGGTg > 2:149506/1‑93 (MQ=255)
aCTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAAc > 1:2105407/1‑93 (MQ=255)
tGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGt > 2:4783648/1‑93 (MQ=255)
tGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGt < 2:600372/93‑1 (MQ=255)
gTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTa < 1:2627913/93‑1 (MQ=255)
tACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTAc < 2:4291960/93‑1 (MQ=255)
aCGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACt < 2:4478958/93‑1 (MQ=255)
cGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTg < 1:5922928/93‑1 (MQ=255)
gATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGc < 2:5761701/93‑1 (MQ=255)
gATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGc < 1:5574461/93‑1 (MQ=255)
tCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAg < 2:1820409/93‑1 (MQ=255)
tCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAg < 1:4384616/93‑1 (MQ=255)
cAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGc > 2:5331248/1‑93 (MQ=255)
aGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGcc < 2:3895670/93‑1 (MQ=255)
aGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGcc > 1:1407763/1‑93 (MQ=255)
aGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGcc > 1:4775270/1‑93 (MQ=255)
aaaTCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGACACGTACTGCGTAGCCAGAt < 2:6139322/93‑1 (MQ=255)
aaaTCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGAt < 1:184751/93‑1 (MQ=255)
aaTCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCCGATa > 2:6177224/1‑93 (MQ=255)
aaTCTAATTACATAGAATGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCAAACTGCTGTTCTTTGGTCAGCGAGGCTATACGTACTGCGTAGCCAGAtt > 2:1133782/1‑92 (MQ=255)
tCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATaca < 2:2864042/93‑1 (MQ=255)
tCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATaca > 1:5159098/1‑93 (MQ=255)
tAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACg < 2:1333082/93‑1 (MQ=255)
tAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACg > 2:250423/1‑93 (MQ=255)
aaTTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACgg < 1:1325244/93‑1 (MQ=255)
aTTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGa > 1:384414/1‑93 (MQ=255)
aTTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGa > 2:1601047/1‑93 (MQ=255)
ttACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGAt < 1:2944436/93‑1 (MQ=255)
ttACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGAt < 2:3686535/93‑1 (MQ=255)
ttACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGAt < 2:3165056/93‑1 (MQ=255)
ttACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGAt < 2:5227529/93‑1 (MQ=255)
ttACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGAt < 1:5362522/93‑1 (MQ=255)
tACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGGGTAGCCAGATTCACGGATg < 2:6153824/93‑1 (MQ=255)
cATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGt < 1:958657/93‑1 (MQ=255)
aTAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTc > 1:6087597/1‑93 (MQ=255)
aTAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTGAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTc < 2:4562093/93‑1 (MQ=255)
tAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCa < 1:734339/93‑1 (MQ=255)
aGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAg < 1:3637174/93‑1 (MQ=255)
ttGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTg > 1:1209589/1‑93 (MQ=255)
tGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTgg > 1:3957283/1‑92 (MQ=255)
tGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGc > 1:1880835/1‑93 (MQ=255)
tGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGc < 1:5692112/93‑1 (MQ=255)
gAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCg > 2:5166105/1‑93 (MQ=255)
aGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCgg > 2:771436/1‑93 (MQ=255)
gTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGa < 2:2220273/93‑1 (MQ=255)
gTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGa < 1:4359428/93‑1 (MQ=255)
tGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTCAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGat < 2:3495079/93‑1 (MQ=255)
gAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGata < 1:2062875/93‑1 (MQ=255)
gAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGata < 2:418279/93‑1 (MQ=255)
ggTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATAttt > 2:857877/1‑93 (MQ=255)
gTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATAtttt < 2:3991273/93‑1 (MQ=255)
gTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATAtttt > 2:3803085/1‑93 (MQ=255)
aCGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTc > 1:2390099/1‑93 (MQ=255)
aCGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTc < 2:5849376/93‑1 (MQ=255)
aCGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATAAACGGATGGTCAGCTGCGGAGATTTTTc > 1:2615478/1‑93 (MQ=255)
gAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCg > 2:2627838/1‑93 (MQ=255)
gAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCg > 1:5436879/1‑93 (MQ=255)
gTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCggg < 2:139541/93‑1 (MQ=255)
taataaCGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGt > 2:4044379/1‑93 (MQ=255)
aataaCGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGtt < 2:5580027/93‑1 (MQ=255)
aataaCGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGtt < 1:5050738/93‑1 (MQ=255)
aataaCGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGGTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGGCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGtg > 2:2437408/1‑92 (MQ=21)
aaCGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTc > 1:2252014/1‑93 (MQ=255)
aaCGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTc < 2:5213214/93‑1 (MQ=255)
aCGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTcc < 1:2405553/93‑1 (MQ=255)
cGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCa < 1:4139928/93‑1 (MQ=255)
gTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCAt < 1:3302065/93‑1 (MQ=255)
gTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCAt > 1:3808210/1‑93 (MQ=255)
tCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATc > 2:5532260/1‑93 (MQ=255)
tCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATc < 1:5030669/93‑1 (MQ=255)
|
TTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATC > NC_000913/950442‑950621
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATCGCGT > NC_000913/950440‑950625
|
CTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCG > SRR4302533.4233378/1‑94 (MQ=60)
TTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGC > SRR4302533.2262458/1‑94 (MQ=60)
TTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCT < SRR4302533.5121641/94‑1 (MQ=60)
TTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCT < SRR4302533.5920618/94‑1 (MQ=60)
TTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCT < SRR4302533.2414203/94‑1 (MQ=60)
CGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGC > SRR4302533.5242097/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCT > SRR4302533.4818107/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCT > SRR4302533.4306944/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCT < SRR4302533.3095689/94‑1 (MQ=60)
GTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCT > SRR4302533.2750934/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCT > SRR4302533.5865317/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCT > SRR4302533.5810799/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCT < SRR4302533.2541192/94‑1 (MQ=60)
TGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTG > SRR4302533.1138810/1‑94 (MQ=60)
GGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGT > SRR4302533.5638350/1‑94 (MQ=60)
GGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGCAATAACGTCCCGCTGCTGT > SRR4302533.4613314/1‑94 (MQ=60)
GAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTT < SRR4302533.506554/94‑1 (MQ=60)
GAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTT < SRR4302533.5112870/94‑1 (MQ=60)
AGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTC > SRR4302533.4763721/1‑94 (MQ=60)
AGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTC > SRR4302533.5971255/1‑94 (MQ=60)
AGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTC > SRR4302533.5557099/1‑94 (MQ=60)
AGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCCAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTT > SRR4302533.4461253/1‑94 (MQ=60)
CCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGATGTTCTT > SRR4302533.842580/1‑94 (MQ=60)
CTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTT > SRR4302533.3382643/1‑94 (MQ=60)
CTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTT > SRR4302533.2354932/1‑94 (MQ=60)
TTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTA < SRR4302533.979373/94‑1 (MQ=60)
TTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAG < SRR4302533.181826/94‑1 (MQ=60)
TATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGT > SRR4302533.127323/1‑94 (MQ=60)
TATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGT < SRR4302533.238121/94‑1 (MQ=60)
ATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTC < SRR4302533.3086533/94‑1 (MQ=60)
ATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTC > SRR4302533.1692437/1‑94 (MQ=60)
TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCA > SRR4302533.2353683/1‑94 (MQ=60)
TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCA > SRR4302533.1446483/1‑94 (MQ=60)
TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCA < SRR4302533.3552701/94‑1 (MQ=60)
TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCA < SRR4302533.2213599/94‑1 (MQ=60)
TGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAG > SRR4302533.4020368/1‑94 (MQ=60)
TGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAG > SRR4302533.6160096/1‑94 (MQ=60)
TGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAG > SRR4302533.706102/1‑94 (MQ=60)
TGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCACGCTGCTGTTCTTTAGTCAG > SRR4302533.4391686/1‑94 (MQ=60)
GTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGC < SRR4302533.3724797/94‑1 (MQ=60)
TACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCG < SRR4302533.3802278/94‑1 (MQ=60)
TACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCG > SRR4302533.708885/1‑94 (MQ=60)
TACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCG > SRR4302533.3379454/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGA > SRR4302533.1463059/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAG < SRR4302533.1428516/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAG > SRR4302533.5270202/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAG < SRR4302533.4882326/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGT > SRR4302533.2243569/1‑94 (MQ=60)
GCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGT < SRR4302533.2728179/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGT < SRR4302533.2157292/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGT > SRR4302533.625826/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTT > SRR4302533.6170160/1‑94 (MQ=60)
TTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTG < SRR4302533.3644824/94‑1 (MQ=60)
TTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTG < SRR4302533.3644823/94‑1 (MQ=60)
TTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGA < SRR4302533.3912443/94‑1 (MQ=60)
TTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGA < SRR4302533.626677/94‑1 (MQ=60)
TTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGA < SRR4302533.5063938/94‑1 (MQ=60)
TTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAA > SRR4302533.139425/1‑94 (MQ=60)
TACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAAC < SRR4302533.2267765/94‑1 (MQ=60)
TACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAAC > SRR4302533.2118391/1‑94 (MQ=60)
ACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACG > SRR4302533.2383983/1‑94 (MQ=60)
CTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGT > SRR4302533.2823112/1‑94 (MQ=60)
TGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTA > SRR4302533.533649/1‑94 (MQ=60)
TGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTA > SRR4302533.3313107/1‑94 (MQ=60)
TGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTA > SRR4302533.2980227/1‑94 (MQ=60)
GTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTAC < SRR4302533.2644032/94‑1 (MQ=60)
ACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTG > SRR4302533.1771997/1‑94 (MQ=60)
ACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTG > SRR4302533.2635242/1‑94 (MQ=60)
CGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGC < SRR4302533.5958730/94‑1 (MQ=60)
CGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGC > SRR4302533.6222309/1‑94 (MQ=60)
GATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCG < SRR4302533.5608149/94‑1 (MQ=60)
TTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAG > SRR4302533.3832283/1‑94 (MQ=60)
TTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAG < SRR4302533.3581376/94‑1 (MQ=60)
TCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGC < SRR4302533.4411087/94‑1 (MQ=60)
TCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGC > SRR4302533.2450752/1‑94 (MQ=60)
CAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCC > SRR4302533.4804200/1‑94 (MQ=60)
CAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCC > SRR4302533.1416274/1‑94 (MQ=60)
CGTCAAATCTAATTACATAGGTTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCA < SRR4302533.1354550/94‑1 (MQ=60)
AGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCA > SRR4302533.3853875/1‑94 (MQ=60)
GTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAG < SRR4302533.5405962/94‑1 (MQ=60)
TCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGA > SRR4302533.5188367/1‑94 (MQ=60)
TCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGA > SRR4302533.4949614/1‑94 (MQ=60)
AAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATA < SRR4302533.185899/94‑1 (MQ=60)
AATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATACCGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATAC < SRR4302533.5940310/94‑1 (MQ=60)
ATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACA > SRR4302533.5190239/1‑94 (MQ=60)
TCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACAC < SRR4302533.530684/94‑1 (MQ=60)
TAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGG > SRR4302533.3378759/1‑94 (MQ=60)
AATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGA < SRR4302533.1333195/94‑1 (MQ=60)
AATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGA > SRR4302533.386733/1‑94 (MQ=60)
AATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGA > SRR4302533.1606449/1‑94 (MQ=60)
ATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGAT < SRR4302533.4008045/94‑1 (MQ=60)
ATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGAT < SRR4302533.4496845/94‑1 (MQ=60)
TTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATG < SRR4302533.2962406/94‑1 (MQ=60)
TTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATG < SRR4302533.5394729/94‑1 (MQ=60)
TTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATG > SRR4302533.2114301/1‑94 (MQ=60)
TACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGG < SRR4302533.2548134/94‑1 (MQ=60)
TACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGG < SRR4302533.5265091/94‑1 (MQ=60)
ACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGT > SRR4302533.2680482/1‑94 (MQ=60)
ACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGT < SRR4302533.1941806/94‑1 (MQ=60)
CATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTC > SRR4302533.1218531/1‑94 (MQ=60)
CATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTC > SRR4302533.6157902/1‑94 (MQ=60)
CATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTC > SRR4302533.6124397/1‑94 (MQ=60)
CATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTC < SRR4302533.964294/94‑1 (MQ=60)
ATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCA > SRR4302533.4400399/1‑94 (MQ=60)
TAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAG < SRR4302533.738660/94‑1 (MQ=60)
AGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGC < SRR4302533.3659536/94‑1 (MQ=60)
GATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCT < SRR4302533.4451868/94‑1 (MQ=60)
GATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCT < SRR4302533.4804072/94‑1 (MQ=60)
ATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTG > SRR4302533.2715969/1‑94 (MQ=60)
ATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTG > SRR4302533.5817631/1‑94 (MQ=60)
ATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTG < SRR4302533.1958435/94‑1 (MQ=60)
ATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTG > SRR4302533.1216852/1‑94 (MQ=60)
TTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGG > SRR4302533.3981402/1‑94 (MQ=60)
TTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGC > SRR4302533.1892290/1‑94 (MQ=60)
TGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCG < SRR4302533.5726490/94‑1 (MQ=60)
GAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGG > SRR4302533.5606226/1‑94 (MQ=60)
GAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGG < SRR4302533.905812/94‑1 (MQ=60)
GTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGAT < SRR4302533.4385741/94‑1 (MQ=60)
TGAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATA > SRR4302533.5029387/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATAT < SRR4302533.2075594/94‑1 (MQ=60)
AGGTACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTT < SRR4302533.512977/94‑1 (MQ=60)
TACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTC > SRR4302533.2404859/1‑94 (MQ=60)
TACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATAAACGGATGGTCAGCTGCGGAGATTTTTC > SRR4302533.2631531/1‑94 (MQ=60)
ACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCC < SRR4302533.5648950/94‑1 (MQ=60)
ACGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCC > SRR4302533.5785239/1‑94 (MQ=60)
CGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCG > SRR4302533.5469624/1‑94 (MQ=60)
CGAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTGCCG < SRR4302533.2574963/94‑1 (MQ=60)
GAGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGG > SRR4302533.2105030/1‑94 (MQ=60)
AGTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGG > SRR4302533.1200273/1‑94 (MQ=60)
GTAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGT > SRR4302533.2497563/1‑94 (MQ=60)
TAATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTT > SRR4302533.812202/1‑94 (MQ=60)
AATAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTT < SRR4302533.5081282/94‑1 (MQ=60)
TAACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTC > SRR4302533.2265937/1‑94 (MQ=60)
ACGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCA < SRR4302533.2420412/94‑1 (MQ=60)
CGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCAT > SRR4302533.867909/1‑94 (MQ=60)
CGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCAT > SRR4302533.3831506/1‑94 (MQ=60)
CGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCAT < SRR4302533.4165038/94‑1 (MQ=60)
CGTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCAT < SRR4302533.1861345/94‑1 (MQ=60)
GTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATC < SRR4302533.5939311/94‑1 (MQ=60)
GTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATC < SRR4302533.4553364/94‑1 (MQ=60)
GTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATC > SRR4302533.4374033/1‑94 (MQ=60)
GTCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATC < SRR4302533.3322453/94‑1 (MQ=60)
TCCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATCG < SRR4302533.5061129/94‑1 (MQ=60)
CCCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATCGC > SRR4302533.6157628/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATCGCG < SRR4302533.6337128/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATCGCG > SRR4302533.288605/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATCGCG > SRR4302533.445437/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATCGCGT > SRR4302533.5240822/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATCGCGT > SRR4302533.5020369/1‑94 (MQ=60)
|
CTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGGTTTTCCATCGCGT > NC_000913/950440‑950625
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
