Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,779,534 |
T→C |
D448G (GAC→GGC) |
ypjA ← |
putative ATP‑binding component of a transport system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,779,534 | 0 | T | C | 100.0%
| 609.8
/ NA
| 189 | D448G (GAC→GGC) | ypjA | putative ATP‑binding component of a transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (90/99); total (90/99) |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
ATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA > NC_000913/2779444‑2779623
|
aTCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCa < 1:6143645/93‑1 (MQ=255)
cAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGc > 1:1078992/1‑93 (MQ=255)
gCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCtt > 1:237810/1‑93 (MQ=255)
gCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCtt > 2:900284/1‑93 (MQ=255)
gAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTc > 1:684827/1‑93 (MQ=255)
gAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTc < 2:5311770/93‑1 (MQ=255)
gCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTccc < 2:2403438/93‑1 (MQ=255)
tCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCccgcc > 2:1617110/1‑93 (MQ=255)
ccGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCccgccg > 2:1015636/1‑93 (MQ=255)
cGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCcgccgc < 1:3825581/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCt < 2:2694500/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCt > 1:5412629/1‑93 (MQ=255)
gcgcTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCtt > 2:5556168/1‑93 (MQ=255)
gcgcTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCtt < 1:1005058/93‑1 (MQ=255)
cgcTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCttt > 2:5966452/1‑93 (MQ=255)
gcTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCtttt > 1:5976271/1‑93 (MQ=255)
tAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGa > 1:3313923/1‑93 (MQ=255)
aaTATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGat > 2:6248754/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATAttt > 1:2484810/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATAttt > 1:5462487/1‑93 (MQ=255)
gctgcCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTg < 1:5504748/93‑1 (MQ=255)
cctcccAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTg < 1:4356694/89‑1 (MQ=255)
ctgcCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGc < 1:1025104/93‑1 (MQ=255)
ctgcCAATTCCCGTCCCATCTTTCTCAACAACCTGCCGCCTCCCGGAGAATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGc < 2:2931268/93‑1 (MQ=255)
ccAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACACCCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGtt < 2:3445238/93‑1 (MQ=255)
ccAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGtt > 2:3787077/1‑93 (MQ=255)
ccAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGtt > 2:1640207/1‑93 (MQ=255)
ccAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGtt > 1:4071017/1‑93 (MQ=255)
cAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTc > 2:134661/1‑93 (MQ=255)
aaTTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTcc > 1:1136272/1‑93 (MQ=255)
aaTTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTcc < 1:1534772/93‑1 (MQ=255)
aTTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCg > 2:4636894/1‑93 (MQ=255)
aTTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCg > 2:6113398/1‑93 (MQ=255)
tGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCt < 1:2660065/93‑1 (MQ=255)
ccGTCCCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCGGGAGGATATAATTGTTTTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGt < 1:3380382/93‑1 (MQ=255)
ccGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGt > 1:4160929/1‑93 (MQ=255)
cGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGtt > 1:2851951/1‑93 (MQ=255)
cGTACCATCTTTCTCAACAACCAGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGtt < 2:3683282/93‑1 (MQ=255)
gTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTg < 2:5757455/93‑1 (MQ=255)
gTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTg > 2:5372876/1‑93 (MQ=255)
gTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTg < 2:1039237/93‑1 (MQ=255)
gTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTg > 1:4689311/1‑93 (MQ=255)
tACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGa < 2:385111/93‑1 (MQ=255)
ccATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGata > 1:6268018/1‑93 (MQ=255)
aTCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATAtt > 2:3512815/1‑93 (MQ=255)
tCTTTCTCAACACCCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTg < 2:4017526/93‑1 (MQ=255)
tCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGCTATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTg > 2:5211596/1‑93 (MQ=255)
tCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTg > 2:3589284/1‑93 (MQ=255)
cTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTgg < 1:1809776/93‑1 (MQ=255)
cTTTCTCAACAACCGGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTgg < 2:3970119/93‑1 (MQ=255)
tttCTCAACACCCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGt < 1:1890127/93‑1 (MQ=255)
ctcAACACCCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGGGCTAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGcc < 1:1919069/93‑1 (MQ=255)
ctcAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGcc > 1:2868951/1‑93 (MQ=255)
tcAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCt < 2:5980206/93‑1 (MQ=255)
caacaaCCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCtg > 2:1881912/1‑93 (MQ=255)
aacaacCTGCGGTCGCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTGTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCtgt < 1:998640/93‑1 (MQ=255)
aacaacCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCttt > 1:3510371/1‑91 (MQ=255)
aacaacCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCtgt < 1:2067261/93‑1 (MQ=255)
cacccTGCCGGCTCCGGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTgg < 1:3689239/90‑1 (MQ=255)
cacccTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTgg < 2:1542524/90‑1 (MQ=255)
caacCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTgg > 1:535605/1‑93 (MQ=255)
acccTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGc < 2:3274757/91‑1 (MQ=255)
aacCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGc > 1:5509328/1‑93 (MQ=255)
ccTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTa < 2:5031627/93‑1 (MQ=255)
ccTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTa > 1:5224915/1‑93 (MQ=255)
ccTGCCGCCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTa < 2:4826476/93‑1 (MQ=255)
ccGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGcc > 1:2995491/1‑93 (MQ=255)
cGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCa < 1:1440407/93‑1 (MQ=255)
gCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATa > 2:1510198/1‑93 (MQ=255)
cTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATaa < 2:2220182/93‑1 (MQ=255)
cTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATaa < 2:5938135/93‑1 (MQ=255)
tCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAat < 1:5272925/93‑1 (MQ=255)
tCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAat > 1:807743/1‑93 (MQ=255)
ccagggaggaTATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAat < 1:4227168/89‑1 (MQ=255)
cccGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTCCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAatt < 1:34122/93‑1 (MQ=255)
cGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAattat > 2:2091782/1‑93 (MQ=255)
ggaggaTATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAattatt < 2:5133581/93‑1 (MQ=255)
ggagaaTATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAattatt < 2:4332613/93‑1 (MQ=255)
gaggaTATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAAttatta < 2:2410959/93‑1 (MQ=255)
gaggaTATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAAttatta > 2:2277933/1‑93 (MQ=255)
aggaTATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTaa < 2:2025697/93‑1 (MQ=255)
ggaTATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAat < 1:4467491/93‑1 (MQ=255)
ggaTATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAat > 2:6026938/1‑93 (MQ=255)
ggaTATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAat > 1:458714/1‑93 (MQ=255)
ggaTATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAat < 1:737620/93‑1 (MQ=255)
ggaTATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGACATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAat < 1:5556168/93‑1 (MQ=255)
gaTATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAata > 2:2670793/1‑93 (MQ=255)
atatAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAatat < 1:319245/93‑1 (MQ=255)
ataATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTc < 1:2309716/93‑1 (MQ=255)
taATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCt > 1:1061038/1‑93 (MQ=255)
taATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCt < 2:750279/93‑1 (MQ=255)
taATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCt < 1:2005830/93‑1 (MQ=255)
aaTTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCtg > 1:5820338/1‑93 (MQ=255)
aaTTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCtg < 2:3017807/93‑1 (MQ=255)
aaTTGTTGTGCAAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCtg < 2:1181371/93‑1 (MQ=255)
aTTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCtgt < 2:3308763/93‑1 (MQ=255)
tgttgtGCGAGCTTGCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCtgtgt < 1:139855/93‑1 (MQ=255)
gttgtGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCtgtgtg < 2:1796820/93‑1 (MQ=255)
tgtgCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGcc > 1:591822/1‑93 (MQ=255)
gtgcCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGcca > 2:4500433/1‑93 (MQ=255)
|
ATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA > NC_000913/2779444‑2779623
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCA > NC_000913/2779442‑2779626
|
CAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATGTAATTGTTGTGCC > SRR4302533.2089983/1‑94 (MQ=60)
AATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCA > SRR4302533.858748/1‑94 (MQ=60)
AATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCA < SRR4302533.1848574/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAG < SRR4302533.6180638/94‑1 (MQ=60)
TCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGC > SRR4302533.1085351/1‑94 (MQ=60)
TCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGC < SRR4302533.287962/94‑1 (MQ=60)
AGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTT > SRR4302533.239282/1‑94 (MQ=60)
CGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTC > SRR4302533.688878/1‑94 (MQ=60)
CGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTC < SRR4302533.1140173/94‑1 (MQ=60)
AGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCC < SRR4302533.5546149/94‑1 (MQ=60)
AGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCC > SRR4302533.1510981/1‑94 (MQ=60)
GCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCG < SRR4302533.4222053/94‑1 (MQ=60)
CTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCC > SRR4302533.1055725/1‑94 (MQ=60)
CTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCC > SRR4302533.4751267/1‑94 (MQ=60)
TCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCG > SRR4302533.4371292/1‑94 (MQ=60)
CCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGC < SRR4302533.2165829/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCTATTATTGCTGCCAATTGCCGTACTATCTTTCTCAACAACCTGCGGGCCCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCT < SRR4302533.1865499/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCT < SRR4302533.3848970/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCT > SRR4302533.5445176/1‑94 (MQ=60)
CGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCT < SRR4302533.193238/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTT > SRR4302533.5643724/1‑94 (MQ=60)
GCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTT < SRR4302533.1010936/94‑1 (MQ=60)
GCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTT < SRR4302533.1443234/94‑1 (MQ=60)
CGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTT > SRR4302533.5402239/1‑94 (MQ=60)
CGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTT > SRR4302533.6012455/1‑94 (MQ=60)
CGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTT > SRR4302533.6012456/1‑94 (MQ=60)
CTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGA > SRR4302533.3334383/1‑94 (MQ=60)
ATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATAT > SRR4302533.2357473/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTT > SRR4302533.5495397/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTT > SRR4302533.2500121/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTG < SRR4302533.5992486/94‑1 (MQ=60)
cctcCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGC < SRR4302533.4382991/90‑1 (MQ=60)
GCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGC > SRR4302533.3063495/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGC < SRR4302533.5537964/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTATTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGC < SRR4302533.731324/94‑1 (MQ=60)
CTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCG < SRR4302533.1031129/94‑1 (MQ=60)
TGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACACCCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGT < SRR4302533.5882648/94‑1 (MQ=60)
GCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTT > SRR4302533.4095799/1‑94 (MQ=60)
CAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCC > SRR4302533.1143026/1‑94 (MQ=60)
CAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCC > SRR4302533.4084585/1‑94 (MQ=60)
AATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCG < SRR4302533.1543994/94‑1 (MQ=60)
AATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCG < SRR4302533.190722/94‑1 (MQ=60)
TGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTG < SRR4302533.2676400/94‑1 (MQ=60)
GCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGT > SRR4302533.4186146/1‑94 (MQ=60)
CCGTCCCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCGGGAGGATATAATTGTTTTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTT < SRR4302533.3401250/94‑1 (MQ=60)
CCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTT > SRR4302533.2869494/1‑94 (MQ=60)
CGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTG > SRR4302533.4717738/1‑94 (MQ=60)
GTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGA > SRR4302533.4584047/1‑94 (MQ=60)
GTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGA > SRR4302533.5520483/1‑94 (MQ=60)
ACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATT > SRR4302533.3822110/1‑94 (MQ=60)
ACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATA > SRR4302533.6305473/1‑94 (MQ=60)
ATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTG > SRR4302533.3269381/1‑94 (MQ=60)
CTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGT < SRR4302533.369033/94‑1 (MQ=60)
CTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGT < SRR4302533.1820790/94‑1 (MQ=60)
TTTCTCAACACCCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTG < SRR4302533.1901668/94‑1 (MQ=60)
TTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGC > SRR4302533.3421449/1‑94 (MQ=60)
TTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGC < SRR4302533.1630828/94‑1 (MQ=60)
TCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCC > SRR4302533.2886602/1‑94 (MQ=60)
CTCAACACCCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGGGCTAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCT < SRR4302533.1930785/94‑1 (MQ=60)
CTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCT < SRR4302533.788217/94‑1 (MQ=60)
TCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTG > SRR4302533.272990/1‑94 (MQ=60)
CAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTTT > SRR4302533.3532012/1‑94 (MQ=60)
CAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGT < SRR4302533.3438986/94‑1 (MQ=60)
accacCCTGCCGGCGCCCGGAGGATATAATTTTTGTGCCAGCTTCCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTG < SRR4302533.5943734/89‑1 (MQ=60)
AACAACCTGCGGTCGCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTGTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTG < SRR4302533.1004469/94‑1 (MQ=60)
AACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTG < SRR4302533.2079997/94‑1 (MQ=60)
AACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTG < SRR4302533.5260346/94‑1 (MQ=60)
ACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGG > SRR4302533.538787/1‑94 (MQ=60)
CACCCTGCCGGCTCCGGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGC < SRR4302533.3711907/94‑1 (MQ=60)
CAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGC > SRR4302533.5542587/1‑94 (MQ=60)
ACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTA > SRR4302533.5256358/1‑94 (MQ=60)
CCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTCTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTAT < SRR4302533.3396684/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGGTATTGGTGCCTGTGGCTATG > SRR4302533.4170400/1‑94 (MQ=60)
GCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCC > SRR4302533.3013810/1‑94 (MQ=60)
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CGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCAT < SRR4302533.54677/94‑1 (MQ=60)
CGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCAT < SRR4302533.254814/94‑1 (MQ=60)
GGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATA > SRR4302533.1143142/1‑94 (MQ=60)
GCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAA > SRR4302533.4661968/1‑94 (MQ=60)
GCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAA < SRR4302533.2470156/94‑1 (MQ=60)
CTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAAT < SRR4302533.2020224/94‑1 (MQ=60)
CTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAAT > SRR4302533.812491/1‑94 (MQ=60)
CTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTCCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAAT < SRR4302533.2969819/94‑1 (MQ=60)
ccagGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATT < SRR4302533.4252728/90‑1 (MQ=60)
TCCCGGAGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATT < SRR4302533.5304543/94‑1 (MQ=60)
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AGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAAT < SRR4302533.6262677/94‑1 (MQ=60)
AGGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAAT > SRR4302533.461455/1‑94 (MQ=60)
GGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATA < SRR4302533.741963/94‑1 (MQ=60)
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GGATATAATTGTTGTGCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGACATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATA < SRR4302533.5589746/94‑1 (MQ=60)
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GCCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCA > SRR4302533.667459/1‑94 (MQ=60)
|
CAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCATCTTTCTCAACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCA > NC_000913/2779442‑2779626
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
