Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,013,176 |
C→G |
G182R (GGA→CGA) |
ysgA ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,013,176 | 0 | C | G | 100.0%
| 728.2
/ NA
| 226 | G182R (GGA→CGA) | ysgA | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (118/108); total (118/108) |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
TTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCCG‑GCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCAC > NC_000913/4013092‑4013260
|
ttAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATCGGCGCGTTa > 1:1622097/1‑93 (MQ=255)
tAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTaa < 2:2144228/93‑1 (MQ=255)
tAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTaa > 2:4451194/1‑93 (MQ=255)
tAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTaa < 1:5482619/93‑1 (MQ=255)
agcagcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAg < 2:2699179/93‑1 (MQ=255)
gcagcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGa < 2:735088/93‑1 (MQ=255)
gcagcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATCGGCGCGTTAAGa > 1:2025954/1‑93 (MQ=255)
agcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATc > 1:2183834/1‑93 (MQ=255)
gcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCg > 1:4658190/1‑93 (MQ=255)
gcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCg > 1:4237204/1‑93 (MQ=255)
cccGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTTTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCgg < 1:4333123/93‑1 (MQ=255)
cccGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCgg < 2:5549908/93‑1 (MQ=255)
cccGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCgg < 2:5894943/93‑1 (MQ=255)
cctcAGCGCCGGGCGCATGGTTTCACCGTTCTCCGGCGGATTGCTGTTATCCTGCCCCCCATATAAGCGGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGt < 2:5362903/90‑1 (MQ=255)
ccGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGt < 2:3991345/93‑1 (MQ=255)
cGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGtt < 1:5601473/93‑1 (MQ=255)
gCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTg > 1:1237850/1‑93 (MQ=255)
cAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGc < 2:911385/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGa < 1:1945952/93‑1 (MQ=255)
gcCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGata > 1:4360107/1‑93 (MQ=255)
gcCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGCTAAGATCGGTTGCGtta > 2:691751/1‑93 (MQ=255)
tGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCa > 1:4715318/1‑93 (MQ=255)
gcATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAg < 2:4681681/93‑1 (MQ=255)
gcATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAg > 1:1327812/1‑93 (MQ=255)
gcATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAg > 1:3869832/1‑93 (MQ=255)
gcATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAg < 1:865141/93‑1 (MQ=255)
cATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAgg > 1:3212956/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgt > 1:2788442/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgt > 1:4787976/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCGACAGgtt > 1:5065030/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgtt > 1:3833709/1‑93 (MQ=255)
ggTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgttg < 2:3479501/93‑1 (MQ=255)
gTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGTCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgttgt > 2:4624257/1‑93 (MQ=255)
tttCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgttgtt < 1:4491726/93‑1 (MQ=255)
tttCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgttgtt > 1:6020591/1‑93 (MQ=255)
ttCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGttt < 1:2817162/93‑1 (MQ=255)
tCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTTTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTc < 1:5358783/93‑1 (MQ=255)
tCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTc < 2:4218349/93‑1 (MQ=255)
cAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCg > 2:1718296/1‑93 (MQ=255)
aagcctctCCAGCGGAATGCTGTTATCCTGACCCCCATATAAGCCGAGAATCGGCCCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCgg < 2:780736/89‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCgg > 1:2543272/1‑93 (MQ=255)
aCGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGt > 1:83512/1‑93 (MQ=255)
aCGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGt < 1:1396907/93‑1 (MQ=255)
aCGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGt > 2:861741/1‑93 (MQ=255)
aCGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCgga > 2:5663387/1‑92 (MQ=255)
cGCTCTCCTGCGGAAAGCTCTTATCCTGACCACCATATAACCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCCGTTGCGATATCAACAGGATGTTTCGGTg > 2:1446288/1‑93 (MQ=255)
gtctcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGaa > 1:5944771/2‑93 (MQ=255)
tctcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAAt < 1:1131195/93‑1 (MQ=255)
tctcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAAt > 2:5127516/1‑93 (MQ=255)
ctcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAAtt < 2:1869392/93‑1 (MQ=255)
ctcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAAtt > 2:1252292/1‑93 (MQ=255)
tcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTc < 2:483589/93‑1 (MQ=255)
tcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTc > 1:4116695/1‑93 (MQ=255)
cTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAg < 2:6276678/93‑1 (MQ=255)
cTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAg > 2:1850041/1‑93 (MQ=255)
tGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGc > 2:2948309/1‑93 (MQ=255)
tGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGc < 1:1286139/93‑1 (MQ=255)
tGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGc < 1:4740567/93‑1 (MQ=255)
tGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGc < 2:573013/93‑1 (MQ=255)
cgtaaTGCTGTTATCCTGACCACCATATAGGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGa < 1:2727309/90‑1 (MQ=255)
cGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGa < 1:5869894/93‑1 (MQ=255)
cGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGa > 1:5129639/1‑93 (MQ=255)
ggAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGAc > 2:2388475/1‑93 (MQ=255)
aTGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTg < 1:719103/93‑1 (MQ=255)
aTGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTg > 2:1795440/1‑93 (MQ=255)
aTGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTg < 2:2109456/93‑1 (MQ=255)
aTGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTg > 1:2384279/1‑93 (MQ=255)
tGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGt > 1:3420009/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTc < 2:3600964/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTc > 1:2335576/1‑93 (MQ=255)
cTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCg > 2:2846173/1‑93 (MQ=255)
gTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGcc > 2:1572495/1‑93 (MQ=255)
gTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGcc < 1:1018645/93‑1 (MQ=255)
ttATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGccc < 1:1739177/93‑1 (MQ=255)
ttATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGccc > 2:1106606/1‑93 (MQ=255)
ttATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGccc > 2:3941109/1‑93 (MQ=255)
tCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCCGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTc > 1:1875615/1‑93 (MQ=255)
ccTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCa < 1:4999067/93‑1 (MQ=255)
ccTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCa < 2:4144369/93‑1 (MQ=255)
ccTCACCACCAGATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCa < 2:4715629/93‑1 (MQ=255)
cTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAg < 1:6282882/93‑1 (MQ=255)
tGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGt < 1:4621100/93‑1 (MQ=255)
caccaTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGc < 1:261155/93‑1 (MQ=255)
accaTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGcc < 1:2960990/93‑1 (MQ=255)
ccaTATAGGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCg > 2:5984816/1‑93 (MQ=255)
ccaTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCg > 2:1291485/1‑93 (MQ=255)
caTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGt > 1:5454559/1‑93 (MQ=255)
atatAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTa > 2:6100529/1‑93 (MQ=255)
tataAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTAc > 2:6103321/1‑93 (MQ=255)
ataAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTAcc < 1:1083417/93‑1 (MQ=255)
taAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCa < 1:4023757/93‑1 (MQ=255)
taAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCa > 1:6119215/1‑93 (MQ=255)
taAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCa < 1:1962513/93‑1 (MQ=255)
aaGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCAc < 2:1266207/93‑1 (MQ=255)
aaGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCAc < 2:318019/93‑1 (MQ=255)
aGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCAcc > 2:5017173/1‑92 (MQ=255)
gCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGc < 1:597019/93‑1 (MQ=255)
cGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCa < 2:5221639/93‑1 (MQ=255)
gagaATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCAc < 2:6190695/93‑1 (MQ=255)
gagaATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCAc < 2:3817068/93‑1 (MQ=255)
|
TTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCCG‑GCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCAC > NC_000913/4013092‑4013260
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCCG‑GCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCACTG > NC_000913/4013084‑4013262
|
CTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGG > SRR4302533.4898556/1‑94 (MQ=60)
CTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGG < SRR4302533.2443290/94‑1 (MQ=60)
CTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGG < SRR4302533.4486514/94‑1 (MQ=60)
TTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAAT‑CG‑GC < SRR4302533.358242/94‑1 (MQ=60)
TCCGCCTTAGCATCCCACAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAAT‑CG‑GCG < SRR4302533.4265468/94‑1 (MQ=60)
ATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATCGGCGCGTTA > SRR4302533.1631926/1‑94 (MQ=60)
TAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAG < SRR4302533.5515669/94‑1 (MQ=60)
AGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGA > SRR4302533.3104466/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGA > SRR4302533.2830299/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATCGGCGCGTTAAGA > SRR4302533.2038462/1‑94 (MQ=60)
CAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATC > SRR4302533.410490/1‑94 (MQ=60)
CAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATC > SRR4302533.2197298/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCG < SRR4302533.2086567/94‑1 (MQ=60)
AGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCG < SRR4302533.2436870/94‑1 (MQ=60)
AGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCG > SRR4302533.4262798/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCG > SRR4302533.237971/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCG > SRR4302533.4686418/1‑94 (MQ=60)
CCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTTTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGT < SRR4302533.4359232/94‑1 (MQ=60)
CCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTT < SRR4302533.1893729/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTG < SRR4302533.5422705/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTG > SRR4302533.4377808/1‑94 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTG < SRR4302533.5635321/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTG < SRR4302533.4711411/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTG > SRR4302533.1245245/1‑94 (MQ=60)
GCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGC > SRR4302533.6016827/1‑94 (MQ=60)
GCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGC > SRR4302533.5081284/1‑94 (MQ=60)
GCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGC > SRR4302533.5573640/1‑94 (MQ=60)
GCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGC < SRR4302533.1923253/94‑1 (MQ=60)
AGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGA > SRR4302533.6289901/1‑94 (MQ=60)
GCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGAT < SRR4302533.1957818/94‑1 (MQ=60)
CGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATA > SRR4302533.3172199/1‑94 (MQ=60)
CGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATA > SRR4302533.4386426/1‑94 (MQ=60)
GCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATAT < SRR4302533.4626655/94‑1 (MQ=60)
CCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATC > SRR4302533.2476225/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCA > SRR4302533.4743900/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCA > SRR4302533.3891669/1‑94 (MQ=60)
gggcgcagtGTTTCAACGCTCTCCGGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAA < SRR4302533.1275365/85‑1 (MQ=60)
GCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACA < SRR4302533.3359429/94‑1 (MQ=60)
GCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACA < SRR4302533.2838542/94‑1 (MQ=60)
CGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAG < SRR4302533.6018523/94‑1 (MQ=60)
CGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAG > SRR4302533.1335780/1‑94 (MQ=60)
CGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAG > SRR4302533.3893456/1‑94 (MQ=60)
GCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGG > SRR4302533.3232751/1‑94 (MQ=60)
GCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGG < SRR4302533.870206/94‑1 (MQ=60)
GCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGG > SRR4302533.3702542/1‑94 (MQ=60)
CATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGT > SRR4302533.4816977/1‑94 (MQ=60)
CATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGT > SRR4302533.2805577/1‑94 (MQ=60)
CATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGT > SRR4302533.1123041/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCGACAGGTT > SRR4302533.5095624/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTT > SRR4302533.3857140/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTT > SRR4302533.3878779/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTT < SRR4302533.5993787/94‑1 (MQ=60)
ATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTT > SRR4302533.4274189/1‑94 (MQ=60)
GTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTT > SRR4302533.6057074/1‑94 (MQ=60)
TTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTT < SRR4302533.4518927/94‑1 (MQ=60)
TTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTT < SRR4302533.1198565/94‑1 (MQ=60)
TTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTC < SRR4302533.2834503/94‑1 (MQ=60)
TTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTC < SRR4302533.1247653/94‑1 (MQ=60)
TCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTTTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCG < SRR4302533.5390951/94‑1 (MQ=60)
TCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCG > SRR4302533.5122985/1‑94 (MQ=60)
TCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCG < SRR4302533.215911/94‑1 (MQ=60)
CAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGG > SRR4302533.2558923/1‑94 (MQ=60)
AACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGT > SRR4302533.84043/1‑94 (MQ=60)
ACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTG < SRR4302533.1405327/94‑1 (MQ=60)
GGTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAA > SRR4302533.5980721/1‑94 (MQ=60)
TCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATT < SRR4302533.1137921/94‑1 (MQ=60)
TCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATT > SRR4302533.131907/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTC > SRR4302533.614395/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTC > SRR4302533.4141702/1‑94 (MQ=60)
TCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCA < SRR4302533.2786239/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAG > SRR4302533.753780/1‑94 (MQ=60)
CCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAG > SRR4302533.4673890/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGC > SRR4302533.2249061/1‑94 (MQ=60)
TGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCG < SRR4302533.1293878/94‑1 (MQ=60)
TGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCG < SRR4302533.4769311/94‑1 (MQ=60)
GCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGA > SRR4302533.5160628/1‑94 (MQ=60)
CGTAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAGGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGAC < SRR4302533.2744041/94‑1 (MQ=60)
CGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGAC < SRR4302533.5905374/94‑1 (MQ=60)
CGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGAC > SRR4302533.4559372/1‑94 (MQ=60)
GTAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACT < SRR4302533.5799012/94‑1 (MQ=60)
GGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACT > SRR4302533.2671221/1‑94 (MQ=60)
GGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACT > SRR4302533.5072742/1‑94 (MQ=60)
GGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACT < SRR4302533.6346166/94‑1 (MQ=60)
GAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTT < SRR4302533.1788330/94‑1 (MQ=60)
AATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTG > SRR4302533.2399016/1‑94 (MQ=60)
AATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTG < SRR4302533.1348255/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGT > SRR4302533.3441141/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGT < SRR4302533.723345/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGT > SRR4302533.4006279/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTC > SRR4302533.2350033/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCG > SRR4302533.5511799/1‑94 (MQ=60)
CTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGC < SRR4302533.5347541/94‑1 (MQ=60)
TGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCC > SRR4302533.854751/1‑94 (MQ=60)
TGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCC > SRR4302533.4406899/1‑94 (MQ=60)
GTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCC < SRR4302533.1024634/94‑1 (MQ=60)
GTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCC > SRR4302533.4780020/1‑94 (MQ=60)
TTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCG < SRR4302533.1749725/94‑1 (MQ=60)
ATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTC < SRR4302533.1991388/94‑1 (MQ=60)
ATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCCGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTC > SRR4302533.1887045/1‑94 (MQ=60)
CCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAG < SRR4302533.5029371/94‑1 (MQ=60)
CTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGT < SRR4302533.6320376/94‑1 (MQ=60)
TGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTT > SRR4302533.4766624/1‑94 (MQ=60)
TGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTT < SRR4302533.4649107/94‑1 (MQ=60)
GACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTT < SRR4302533.4834850/94‑1 (MQ=60)
GACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTT > SRR4302533.2793569/1‑94 (MQ=60)
CACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCC < SRR4302533.262739/94‑1 (MQ=60)
CACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCC > SRR4302533.1560892/1‑94 (MQ=60)
ACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCG > SRR4302533.1971671/1‑94 (MQ=60)
ACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCG < SRR4302533.2979092/94‑1 (MQ=60)
CCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGT > SRR4302533.5487417/1‑94 (MQ=60)
CCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGT < SRR4302533.1606845/94‑1 (MQ=60)
ATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTAC > SRR4302533.4182807/1‑94 (MQ=60)
ATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTAC > SRR4302533.5709546/1‑94 (MQ=60)
ATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTAC > SRR4302533.1737122/1‑94 (MQ=60)
TATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACC > SRR4302533.1076162/1‑94 (MQ=60)
ATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCA > SRR4302533.6156118/1‑94 (MQ=60)
ATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCA < SRR4302533.1089807/94‑1 (MQ=60)
TAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCAC < SRR4302533.4048253/94‑1 (MQ=60)
TAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCAC < SRR4302533.1974492/94‑1 (MQ=60)
TAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGATGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCAC < SRR4302533.5951302/94‑1 (MQ=60)
GCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCC < SRR4302533.600539/94‑1 (MQ=60)
GCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCC < SRR4302533.4749576/94‑1 (MQ=60)
GCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCC < SRR4302533.2624716/94‑1 (MQ=60)
CCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCA > SRR4302533.5434142/1‑94 (MQ=60)
CGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGATGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGACAC > SRR4302533.720111/1‑94 (MQ=60)
GAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCACT < SRR4302533.4351227/94‑1 (MQ=60)
GAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCACT > SRR4302533.2245955/1‑94 (MQ=60)
GAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCACT > SRR4302533.1183946/1‑94 (MQ=60)
AGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCACTG < SRR4302533.2613097/94‑1 (MQ=60)
AGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCACTG < SRR4302533.764767/94‑1 (MQ=60)
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CTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCCG‑GCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCACTG > NC_000913/4013084‑4013262
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
