Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,431,925 |
A→G |
I79V (ATC→GTC) |
b4212 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,431,925 | 0 | A | G | 100.0%
| 762.9
/ NA
| 239 | I79V (ATC→GTC) | b4212 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (120/119); total (120/119) |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
AGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGAC > NC_000913/4431835‑4432014
|
aGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTc < 1:1623093/93‑1 (MQ=255)
aCCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑Gt > 1:3575658/1‑93 (MQ=255)
ccTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTa < 2:3889832/93‑1 (MQ=255)
ccTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTa < 1:1188853/93‑1 (MQ=255)
ccTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTa > 2:3142883/1‑93 (MQ=255)
gcggcgCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATcc < 1:2376007/93‑1 (MQ=255)
gcggcgCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATcc < 2:2604616/93‑1 (MQ=255)
cgcAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCggtg < 2:627857/93‑1 (MQ=255)
gcAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCggtgg < 1:5198042/93‑1 (MQ=255)
gcAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCggtgg < 2:1768202/93‑1 (MQ=255)
cAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCggtggt > 2:3638728/1‑93 (MQ=255)
aaaTCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTgc < 1:687668/93‑1 (MQ=255)
aaaTCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTgc > 1:2756935/1‑93 (MQ=255)
aaaTCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTgc < 2:1678021/93‑1 (MQ=255)
aaTCGGTGGGG‑GAGTGAAAAGATGCTTGGGCAGGCGGTACCAGCGGTTGGACAAGGTGGGTTTCTTTACCCTGTCGCGGTTTCGGGGGGTgcc > 2:141392/1‑93 (MQ=255)
aTCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTgccg > 1:5357748/1‑93 (MQ=255)
tCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTgccac < 1:1258299/93‑3 (MQ=255)
cGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTgccgcc < 2:2167159/93‑1 (MQ=255)
ggTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGccgccg > 1:5712238/1‑93 (MQ=255)
ggggTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCAt > 1:3228242/1‑93 (MQ=255)
gggTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCAtg < 2:5379769/93‑1 (MQ=255)
gtaagtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTAGAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCAtgtg < 2:2653306/90‑1 (MQ=255)
gagtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGa < 2:4603416/93‑1 (MQ=255)
gtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAat > 2:2441907/1‑93 (MQ=255)
gtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAat > 2:665352/1‑93 (MQ=255)
tgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAata > 1:82413/1‑93 (MQ=255)
gaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAatat < 1:4746545/93‑1 (MQ=255)
aaaaGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAAtata > 1:1128395/1‑93 (MQ=255)
aaaGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAg > 2:2710656/1‑93 (MQ=255)
aaaGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAg > 2:3696022/1‑93 (MQ=255)
aaaGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAg > 1:4214080/1‑93 (MQ=255)
aaaGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAg > 1:1990345/1‑93 (MQ=255)
aaGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGc > 1:2671172/1‑93 (MQ=255)
aGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGcc < 1:3103696/93‑1 (MQ=255)
aGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGCTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGcc > 2:3989359/1‑93 (MQ=255)
gATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCt > 1:1785981/1‑93 (MQ=255)
gATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCt < 2:4218198/93‑1 (MQ=255)
gATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCt < 1:1808304/93‑1 (MQ=255)
gATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCt > 2:3019366/1‑93 (MQ=255)
aTGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTc > 2:1083866/1‑93 (MQ=255)
tGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCa < 2:5224693/93‑1 (MQ=255)
gCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAc < 2:1129842/93‑1 (MQ=255)
ctGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAcgc < 1:1470031/92‑1 (MQ=255)
gcgcAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAcgccg < 1:984131/93‑1 (MQ=255)
gcAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCt > 1:2996711/1‑93 (MQ=255)
cAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTg > 1:6061684/1‑93 (MQ=255)
cAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTg < 2:2545341/93‑1 (MQ=255)
cAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTg < 2:2133236/93‑1 (MQ=255)
cAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTg < 1:5425610/93‑1 (MQ=255)
aGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTgg < 1:1379160/93‑1 (MQ=255)
gTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTggg > 1:2105354/1‑93 (MQ=255)
gTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTggg > 1:5949859/1‑93 (MQ=255)
gTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTggg < 2:365282/93‑1 (MQ=255)
tCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGc > 2:2794637/1‑93 (MQ=255)
tCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGc > 2:741053/1‑93 (MQ=255)
gTTACAGGCGTTAGAACCGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGa > 2:1038788/1‑93 (MQ=255)
gTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGa > 2:2285482/1‑93 (MQ=255)
ttACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAg > 1:1754783/1‑93 (MQ=255)
tACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGc > 1:625055/1‑93 (MQ=255)
tACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGc < 2:5634224/93‑1 (MQ=255)
tACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGc < 2:5482821/93‑1 (MQ=255)
tACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGc < 2:3464369/93‑1 (MQ=255)
aCAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCa > 2:4962840/1‑93 (MQ=255)
aCAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCa < 2:914661/93‑1 (MQ=255)
aCAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCa < 1:3923193/93‑1 (MQ=255)
aCAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCa < 1:1923844/93‑1 (MQ=255)
cAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAg > 2:3322464/1‑93 (MQ=255)
aGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAgg < 2:584920/93‑1 (MQ=255)
aGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAgg < 1:2524267/93‑1 (MQ=255)
ggCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGt > 2:5791771/1‑93 (MQ=255)
ggCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGt > 1:4660834/1‑93 (MQ=255)
gCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTg > 2:4887650/1‑93 (MQ=255)
cGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGa < 1:6102736/93‑1 (MQ=255)
cGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGa < 1:2251727/93‑1 (MQ=255)
ttAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTTGGCGAGCAGGTGAGc > 1:4366619/1‑93 (MQ=255)
ttAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGc > 1:4431086/1‑93 (MQ=255)
ttAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGGGCCGCCGCCTGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCCGGGGAgg > 2:4283947/1‑92 (MQ=255)
aGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGa > 2:4481704/1‑93 (MQ=255)
gAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCCCGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGaa > 1:1572073/1‑93 (MQ=255)
aCAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGaaaa < 1:6194347/93‑1 (MQ=255)
ggATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGt > 1:2928561/1‑93 (MQ=255)
ggATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGt < 1:3081795/93‑1 (MQ=255)
ggATGGTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGt > 1:1043390/1‑93 (MQ=255)
ggTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtgct > 1:3677591/1‑93 (MQ=255)
ggTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtgcc < 2:5596910/93‑2 (MQ=255)
gTTTTCTTATCCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtgctg < 1:5105351/93‑1 (MQ=255)
gTTTTCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtgctg > 1:2442365/1‑93 (MQ=255)
ttttCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtgctgc > 1:3793145/1‑93 (MQ=255)
ttCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCAc > 1:5476987/1‑93 (MQ=255)
ttCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCAc < 2:3254406/93‑1 (MQ=255)
tCTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACt > 1:4975233/1‑93 (MQ=255)
cTTAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTg > 1:5127206/1‑93 (MQ=255)
ttAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTgg < 2:4015362/93‑1 (MQ=255)
ttAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGGTGCTGCACTgg > 2:3106719/1‑93 (MQ=255)
ctAACCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTgg < 1:1292520/92‑1 (MQ=255)
aaCCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCg < 1:2876082/93‑1 (MQ=255)
aCCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCgg > 2:3538741/1‑93 (MQ=255)
aCCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCgg > 1:4252289/1‑93 (MQ=255)
aCCGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCgg < 1:5991572/93‑1 (MQ=255)
cGTGTCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGAc > 1:583230/1‑93 (MQ=255)
|
AGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGC‑GTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGAC > NC_000913/4431835‑4432014
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTTAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGA > NC_000913/4431832‑4432018
|
TTTAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTG < SRR4302533.2118666/94‑1 (MQ=60)
TTTAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTG > SRR4302533.46526/1‑94 (MQ=60)
TTAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGT < SRR4302533.1761340/94‑1 (MQ=60)
TAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTC < SRR4302533.4085562/94‑1 (MQ=60)
AGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCG < SRR4302533.1632924/94‑1 (MQ=60)
CGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCG < SRR4302533.5152573/94‑1 (MQ=60)
GACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGT > SRR4302533.1213053/1‑94 (MQ=60)
GACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGT > SRR4302533.3597698/1‑94 (MQ=60)
CCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTAT > SRR4302533.982495/1‑94 (MQ=60)
CCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTAT < SRR4302533.1195990/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATC > SRR4302533.2535544/1‑94 (MQ=60)
GCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCG < SRR4302533.3210755/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCG < SRR4302533.2390707/94‑1 (MQ=60)
GGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGT > SRR4302533.788170/1‑94 (MQ=60)
GGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGT > SRR4302533.5793876/1‑94 (MQ=60)
GCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTG < SRR4302533.179993/94‑1 (MQ=60)
GCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTG < SRR4302533.1478935/94‑1 (MQ=60)
GCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTG < SRR4302533.5511753/94‑1 (MQ=60)
GCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGT < SRR4302533.542292/94‑1 (MQ=60)
GCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGT < SRR4302533.5229389/94‑1 (MQ=60)
AAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGC > SRR4302533.2773841/1‑94 (MQ=60)
AAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCC < SRR4302533.691735/94‑1 (MQ=60)
AATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCG > SRR4302533.5389908/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGC > SRR4302533.1819098/1‑94 (MQ=60)
TCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCC > SRR4302533.4447110/1‑94 (MQ=60)
TCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCACC < SRR4302533.1265825/94‑1 (MQ=60)
CGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCG < SRR4302533.4854726/94‑1 (MQ=60)
CGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCG > SRR4302533.5746744/1‑94 (MQ=60)
TGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCAT > SRR4302533.3248143/1‑94 (MQ=60)
GGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATG < SRR4302533.728239/94‑1 (MQ=60)
GGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGT < SRR4302533.2826242/94‑1 (MQ=60)
GTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGG < SRR4302533.4045605/94‑1 (MQ=60)
TGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGA < SRR4302533.5017946/94‑1 (MQ=60)
GTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATA > SRR4302533.82934/1‑94 (MQ=60)
GTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATA > SRR4302533.3277109/1‑94 (MQ=60)
TGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATAT > SRR4302533.4347841/1‑94 (MQ=60)
GAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATA < SRR4302533.4775323/94‑1 (MQ=60)
GAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATA > SRR4302533.1259120/1‑94 (MQ=60)
GAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATA > SRR4302533.1135100/1‑94 (MQ=60)
AAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAG > SRR4302533.2002534/1‑94 (MQ=60)
AAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAG > SRR4302533.4239575/1‑94 (MQ=60)
AAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAG < SRR4302533.131072/94‑1 (MQ=60)
AAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGC > SRR4302533.2687555/1‑94 (MQ=60)
AAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCC < SRR4302533.2996215/94‑1 (MQ=60)
AAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCC < SRR4302533.30454/94‑1 (MQ=60)
AGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCT < SRR4302533.3641652/94‑1 (MQ=60)
AGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCT < SRR4302533.3122779/94‑1 (MQ=60)
AGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCT > SRR4302533.1796841/1‑94 (MQ=60)
GATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTC < SRR4302533.1819309/94‑1 (MQ=60)
TGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAC < SRR4302533.4298595/94‑1 (MQ=60)
TGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAC < SRR4302533.3842666/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACG > SRR4302533.1655934/1‑94 (MQ=60)
CTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGC > SRR4302533.4597210/1‑94 (MQ=60)
TTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCC > SRR4302533.4931655/1‑94 (MQ=60)
CTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCC < SRR4302533.1478890/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGC < SRR4302533.989899/94‑1 (MQ=60)
CGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCT > SRR4302533.3015034/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCT > SRR4302533.3029492/1‑94 (MQ=60)
GCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTG > SRR4302533.6098379/1‑94 (MQ=60)
CAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGG < SRR4302533.5458286/94‑1 (MQ=60)
CAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGG < SRR4302533.1395861/94‑1 (MQ=60)
CAGTCGTTACAGGCGTTAGAAAAGGAGGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGG < SRR4302533.469558/94‑1 (MQ=60)
AGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGG > SRR4302533.5215585/1‑94 (MQ=60)
AGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGG > SRR4302533.5985843/1‑94 (MQ=60)
AGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGG > SRR4302533.2118337/1‑94 (MQ=60)
AGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGG < SRR4302533.1387457/94‑1 (MQ=60)
AGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGG < SRR4302533.547579/94‑1 (MQ=60)
AGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGG > SRR4302533.126961/1‑94 (MQ=60)
AGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGG < SRR4302533.5271060/94‑1 (MQ=60)
AGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGCG < SRR4302533.5980581/94‑1 (MQ=60)
GTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAG > SRR4302533.1765470/1‑94 (MQ=60)
GTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAG < SRR4302533.1348694/94‑1 (MQ=60)
GTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAG < SRR4302533.4053296/94‑1 (MQ=60)
GTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAG > SRR4302533.2389407/1‑94 (MQ=60)
GTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTAGCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAG < SRR4302533.4263285/94‑1 (MQ=60)
TTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGC > SRR4302533.628725/1‑94 (MQ=60)
TTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGC < SRR4302533.1644230/94‑1 (MQ=60)
TACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCA < SRR4302533.2899814/94‑1 (MQ=60)
TACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCA < SRR4302533.1060213/94‑1 (MQ=60)
TACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCA < SRR4302533.6203245/94‑1 (MQ=60)
ACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAG < SRR4302533.3947146/94‑1 (MQ=60)
ACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAG < SRR4302533.1935582/94‑1 (MQ=60)
ACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAG < SRR4302533.2388986/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGG < SRR4302533.2767778/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGG > SRR4302533.2696589/1‑94 (MQ=60)
AGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGT > SRR4302533.4689078/1‑94 (MQ=60)
AGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGT < SRR4302533.3380398/94‑1 (MQ=60)
AGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGT < SRR4302533.2539815/94‑1 (MQ=60)
GGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTG > SRR4302533.1140472/1‑94 (MQ=60)
GGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTG < SRR4302533.659500/94‑1 (MQ=60)
GCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGA < SRR4302533.240613/94‑1 (MQ=60)
CGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAG < SRR4302533.6139577/94‑1 (MQ=60)
CGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAG > SRR4302533.6115773/1‑94 (MQ=60)
CGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAG < SRR4302533.4674310/94‑1 (MQ=60)
CGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAG < SRR4302533.6207061/94‑1 (MQ=60)
CGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAG < SRR4302533.2265648/94‑1 (MQ=60)
GTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTTGGCGAGCAGGTGAGC > SRR4302533.4392978/1‑94 (MQ=60)
GTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGC > SRR4302533.4457873/1‑94 (MQ=60)
GTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGC > SRR4302533.1499006/1‑94 (MQ=60)
TTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCG > SRR4302533.521523/1‑94 (MQ=60)
AGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCCCGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAA > SRR4302533.1581542/1‑94 (MQ=60)
AGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAA < SRR4302533.2499972/94‑1 (MQ=60)
AACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAA > SRR4302533.5020050/1‑94 (MQ=60)
ACATGATTGTTTTCTTACCCGTGTCGCGGATCCGGGTGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAG < SRR4302533.1165190/94‑1 (MQ=60)
ACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAG < SRR4302533.6231515/94‑1 (MQ=60)
ACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAG < SRR4302533.3727874/94‑1 (MQ=60)
ACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAG < SRR4302533.6086990/94‑1 (MQ=60)
CAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGT > SRR4302533.2060931/1‑94 (MQ=60)
CAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGG < SRR4302533.554953/94‑1 (MQ=60)
AGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGT > SRR4302533.1049524/1‑94 (MQ=60)
AGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGT > SRR4302533.2034943/1‑94 (MQ=60)
AGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGT > SRR4302533.2946474/1‑94 (MQ=60)
GGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTT < SRR4302533.3100702/94‑1 (MQ=60)
GATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTG > SRR4302533.1591461/1‑94 (MQ=60)
GATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTG > SRR4302533.1901414/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGC > SRR4302533.2249293/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGC > SRR4302533.5419006/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCT > SRR4302533.3700195/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCT < SRR4302533.3726138/94‑1 (MQ=60)
GGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTG > SRR4302533.6271177/1‑94 (MQ=60)
GGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTG > SRR4302533.2457443/1‑94 (MQ=60)
GTTTTCTTATCCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGC < SRR4302533.5136190/94‑1 (MQ=60)
GTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGC > SRR4302533.3816361/1‑94 (MQ=60)
TTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCAC > SRR4302533.5510000/1‑94 (MQ=60)
TTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACT > SRR4302533.5005398/1‑94 (MQ=60)
TCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTG < SRR4302533.2914308/94‑1 (MQ=60)
TCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTG > SRR4302533.5158180/1‑94 (MQ=60)
CTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGG > SRR4302533.2550392/1‑94 (MQ=60)
TTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGC < SRR4302533.6039714/94‑1 (MQ=60)
TTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGC > SRR4302533.5987048/1‑94 (MQ=60)
CTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGC < SRR4302533.1300305/94‑1 (MQ=60)
TAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCG < SRR4302533.5920701/94‑1 (MQ=60)
AACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGG > SRR4302533.4277937/1‑94 (MQ=60)
AACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGG < SRR4302533.2893779/94‑1 (MQ=60)
AACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTCAGCGAAAAGCATGCTGCACTTGCGG > SRR4302533.3105262/1‑94 (MQ=60)
ACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGA < SRR4302533.6027863/94‑1 (MQ=60)
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CGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCTCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACT < SRR4302533.1939214/94‑1 (MQ=60)
GTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTG < SRR4302533.2968349/94‑1 (MQ=60)
GTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTG > SRR4302533.2927535/1‑94 (MQ=60)
GTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTG < SRR4302533.1515878/94‑1 (MQ=60)
GTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGA < SRR4302533.4222793/94‑1 (MQ=60)
GTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGA < SRR4302533.4610809/94‑1 (MQ=60)
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TTTAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGA > NC_000913/4431832‑4432018
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
