Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
419,821 |
T→C |
L336P (CTG→CCG) |
brnQ → |
branched chain amino acid transport system II carrier protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 419,821 | 0 | T | C | 100.0%
| 631.1
/ NA
| 184 | L336P (CTG→CCG) | brnQ | branched chain amino acid transport system II carrier protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (98/86); total (98/86) |
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
TTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATA > NC_000913/419731‑419910
|
ttGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGa < 2:1448326/93‑1 (MQ=255)
tGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGAt < 1:78709/93‑1 (MQ=255)
ccAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCa > 2:5323189/1‑93 (MQ=255)
ccAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCa < 2:796671/93‑1 (MQ=255)
cAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAg > 2:2315940/1‑93 (MQ=255)
aGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGa > 2:436508/1‑93 (MQ=255)
aGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGa > 1:2852316/1‑93 (MQ=255)
aGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGa < 1:3645091/93‑1 (MQ=255)
gtacgtacCTCTCGCTTATCGGCCGGAGGTGTTTATCCTTGGCGCCGTCTCGATGGTGGTTTCGAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAt < 2:3569383/93‑1 (MQ=255)
acgtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAtct > 2:1509311/1‑93 (MQ=255)
cgtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAtctc < 2:4515718/93‑1 (MQ=255)
gtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGCCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGACTTAAGCCAGCCTATCCAGATCTcc < 2:2877497/93‑1 (MQ=255)
tacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCg > 1:650102/1‑93 (MQ=255)
ccGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTa > 1:5741643/1‑93 (MQ=255)
cGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTAc < 1:1826658/93‑1 (MQ=255)
cGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTAc < 1:2965996/93‑1 (MQ=255)
gCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTAcc > 1:3784327/1‑93 (MQ=255)
tctctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCgg < 2:158850/93‑1 (MQ=255)
tctctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCgg > 2:4789090/1‑93 (MQ=255)
ctTATCGTGCGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTCCTCGATGGTGGTTTCTACCCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGc < 2:5636295/93‑1 (MQ=255)
ctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGc > 2:367664/1‑93 (MQ=255)
ctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGc > 1:1728063/1‑93 (MQ=255)
tATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCGCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTg < 1:3928358/93‑1 (MQ=255)
aTCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGa > 1:6187955/1‑93 (MQ=255)
aTCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGa > 1:5428821/1‑93 (MQ=255)
tCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGAc > 1:4855192/1‑93 (MQ=255)
tCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTAGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGAc > 1:4668262/1‑93 (MQ=255)
gTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCg > 1:3096306/1‑93 (MQ=255)
gTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCg < 1:4733279/93‑1 (MQ=255)
gTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCg > 1:2668444/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGc < 2:1087507/93‑1 (MQ=255)
aCGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCt < 2:271656/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAt > 2:5515467/1‑93 (MQ=255)
cTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAtt > 2:4656957/1‑93 (MQ=255)
tGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAttt > 1:5084551/1‑93 (MQ=255)
ggTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTa < 2:482112/93‑1 (MQ=255)
tgtTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATc < 1:5249326/93‑1 (MQ=255)
gtTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATcc > 2:2609053/1‑93 (MQ=255)
gtTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATcc < 1:2404181/93‑1 (MQ=255)
tttATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATccg < 1:2691223/93‑1 (MQ=255)
ttATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATccgc > 1:2808860/1‑93 (MQ=255)
ttATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATccgc < 2:494573/93‑1 (MQ=255)
aTCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATccgccg < 1:309772/93‑1 (MQ=255)
tCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCgt > 2:6146843/1‑93 (MQ=255)
ccTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCgtg > 1:4360434/1‑93 (MQ=255)
ttggcggcTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTa < 1:1621071/91‑1 (MQ=255)
gcggcTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCg > 1:3434374/1‑93 (MQ=255)
ggcTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCa > 2:4125916/1‑93 (MQ=255)
cTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACt < 1:4896650/93‑1 (MQ=255)
cTTCTCGATGGTGGTTTATAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTGCCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACt < 1:4220351/93‑1 (MQ=255)
ttCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTg > 1:1007934/1‑93 (MQ=255)
ttCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTg > 1:1307017/1‑93 (MQ=255)
ttCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTg < 1:1001114/93‑1 (MQ=255)
ttCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTg < 1:3892637/93‑1 (MQ=255)
tctcGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTgg > 1:1545711/1‑93 (MQ=255)
tctcGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTgg > 2:5655043/1‑93 (MQ=255)
tcGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGtt < 2:5974101/93‑1 (MQ=255)
tcGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGtt < 1:4203889/93‑1 (MQ=255)
tcGATGGTGGTGTCTACCCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGtt < 1:2563690/93‑1 (MQ=255)
cGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTg < 2:201575/93‑1 (MQ=255)
gATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGt > 2:1940085/1‑93 (MQ=255)
tggtggTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTAt > 1:5364784/1‑93 (MQ=255)
tggtggTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTAt > 1:3966384/1‑93 (MQ=255)
gtggtTTCTACCCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGTCCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTa < 2:658755/93‑1 (MQ=255)
gtggtTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTa < 1:1127508/93‑1 (MQ=255)
gtggtTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTa > 1:851504/1‑93 (MQ=255)
tggtTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTaa > 2:2611817/1‑93 (MQ=255)
gtTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGt < 2:5876664/93‑1 (MQ=255)
tttCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGtt > 2:4088726/1‑93 (MQ=255)
ttCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGttt > 2:3977010/1‑93 (MQ=255)
ttCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGttt > 1:2176063/1‑93 (MQ=255)
ttatccTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTa < 2:511328/89‑1 (MQ=255)
cTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTa < 1:4774384/93‑1 (MQ=255)
tAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATTGCACTGGTTGTATTAAGTTTTac < 1:5653762/93‑1 (MQ=255)
tAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGttttgc < 1:4515170/93‑3 (MQ=255)
tAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTac < 2:1668646/93‑1 (MQ=255)
acccTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTaca < 2:6030215/91‑1 (MQ=255)
aaCCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTaca < 1:3698561/93‑1 (MQ=255)
aCCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTacac < 2:1509985/93‑1 (MQ=255)
aCCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGGTTTacac > 2:6257716/1‑93 (MQ=255)
cTCGGCTTAAGCCAGCCGCTCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGc < 2:849578/93‑1 (MQ=255)
cTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGc > 2:4332358/1‑93 (MQ=255)
tCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCt > 1:3262672/1‑93 (MQ=255)
tCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCt > 2:1255334/1‑93 (MQ=255)
tCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCt < 2:328830/93‑1 (MQ=255)
cGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTc > 1:1927824/1‑93 (MQ=255)
ggCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCa < 2:5766032/93‑1 (MQ=255)
gCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCAt < 1:5114245/93‑1 (MQ=255)
gCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCAt < 1:6132970/93‑1 (MQ=255)
cTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCAtg > 2:905136/1‑93 (MQ=255)
cTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCAtg > 2:2416913/1‑93 (MQ=255)
aacccAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCAtggtg < 2:580104/90‑1 (MQ=255)
aaGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCAtggtg < 1:4937351/93‑1 (MQ=255)
gCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGc > 1:4563448/1‑93 (MQ=255)
gCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGc > 1:2821398/1‑93 (MQ=255)
ccAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCGCTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCa < 2:3097041/93‑1 (MQ=255)
cAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCAt > 2:3724439/1‑93 (MQ=255)
cAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCAt > 1:6435050/1‑93 (MQ=255)
cAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCAt < 1:5815994/93‑1 (MQ=255)
aGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATa > 1:6355441/1‑93 (MQ=255)
|
TTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATA > NC_000913/419731‑419910
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTC > NC_000913/419728‑419914
|
TCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCC > SRR4302537.4902759/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCG > SRR4302537.2677487/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCG > SRR4302537.627022/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCG > SRR4302537.3666924/1‑94 (MQ=60)
TTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGGTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGA > SRR4302537.1595886/1‑94 (MQ=60)
TGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATC < SRR4302537.79286/94‑1 (MQ=60)
CCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAG < SRR4302537.2705075/94‑1 (MQ=60)
CAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGA > SRR4302537.2872300/1‑94 (MQ=60)
AGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAT > SRR4302537.3006485/1‑94 (MQ=60)
AGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAT < SRR4302537.3670755/94‑1 (MQ=60)
GTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATC > SRR4302537.6501755/1‑94 (MQ=60)
GTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATC > SRR4302537.1714675/1‑94 (MQ=60)
TACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGCTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGTCCATCCAGATCT > SRR4302537.5628856/1‑94 (MQ=60)
GTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCG > SRR4302537.654531/1‑94 (MQ=60)
GTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCG < SRR4302537.1793039/94‑1 (MQ=60)
GTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCG > SRR4302537.2722801/1‑94 (MQ=60)
ACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTA < SRR4302537.4793329/94‑1 (MQ=60)
ACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTA > SRR4302537.5780957/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACC < SRR4302537.1839386/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACC > SRR4302537.3810896/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACC < SRR4302537.2986802/94‑1 (MQ=60)
GCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCG < SRR4302537.2540340/94‑1 (MQ=60)
CTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGG > SRR4302537.4265386/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGG < SRR4302537.4604581/94‑1 (MQ=60)
CTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCTATCCAGATCTCCGTACCGGTG < SRR4302537.4441720/94‑1 (MQ=60)
TCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGC > SRR4302537.1740132/1‑94 (MQ=60)
TATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGA > SRR4302537.5465837/1‑94 (MQ=60)
TATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGA > SRR4302537.6230582/1‑94 (MQ=60)
TATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCGCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGA < SRR4302537.3955807/94‑1 (MQ=60)
ATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGAC > SRR4302537.4888694/1‑94 (MQ=60)
ATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTAGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGAC > SRR4302537.4700560/1‑94 (MQ=60)
TCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGTCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACC < SRR4302537.3402247/94‑1 (MQ=60)
TCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACC > SRR4302537.188191/1‑94 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG < SRR4302537.6402473/94‑1 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG > SRR4302537.5844771/1‑94 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG > SRR4302537.1258081/1‑94 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG > SRR4302537.3117915/1‑94 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG > SRR4302537.2687086/1‑94 (MQ=60)
GTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGC < SRR4302537.4765983/94‑1 (MQ=60)
TACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCT < SRR4302537.4905930/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAT < SRR4302537.3685053/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTT > SRR4302537.5119544/1‑94 (MQ=60)
TGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTA > SRR4302537.751420/1‑94 (MQ=60)
TGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCC < SRR4302537.5285450/94‑1 (MQ=60)
GTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCG < SRR4302537.2421105/94‑1 (MQ=60)
TTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGC > SRR4302537.2828495/1‑94 (MQ=60)
TTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGC < SRR4302537.2710004/94‑1 (MQ=60)
TTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCC > SRR4302537.3118820/1‑94 (MQ=60)
ATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGT < SRR4302537.311917/94‑1 (MQ=60)
TCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTG > SRR4302537.4390607/1‑94 (MQ=60)
CTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTA > SRR4302537.3147712/1‑94 (MQ=60)
TTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTAT < SRR4302537.1632404/94‑1 (MQ=60)
GGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCG > SRR4302537.3458681/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCA > SRR4302537.2384735/1‑94 (MQ=60)
GGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCAC > SRR4302537.3961262/1‑94 (MQ=60)
CTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTG < SRR4302537.4930455/94‑1 (MQ=60)
CTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTG > SRR4302537.1014887/1‑94 (MQ=60)
CTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTG > SRR4302537.1316117/1‑94 (MQ=60)
CTTCTCGATGGTGGTTTATAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTGCCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTG < SRR4302537.4249755/94‑1 (MQ=60)
CTTCTCGATGGTGGTTCCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTG > SRR4302537.4833390/1‑94 (MQ=60)
TTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGG < SRR4302537.1008025/94‑1 (MQ=60)
TTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGG < SRR4302537.3919855/94‑1 (MQ=60)
TTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGG > SRR4302537.1556503/1‑94 (MQ=60)
TTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGG < SRR4302537.414523/94‑1 (MQ=60)
CTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTT < SRR4302537.2625642/94‑1 (MQ=60)
CTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGAT > SRR4302537.1395625/1‑94 (MQ=60)
TCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTG < SRR4302537.4233236/94‑1 (MQ=60)
TCGATGGTGGTGTCTACCCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTG < SRR4302537.2581651/94‑1 (MQ=60)
CGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGT > SRR4302537.5182568/1‑94 (MQ=60)
CGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGT > SRR4302537.572933/1‑94 (MQ=60)
CGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGT < SRR4302537.5123774/94‑1 (MQ=60)
CGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGT < SRR4302537.3934053/94‑1 (MQ=60)
GATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTA < SRR4302537.6048093/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTAT > SRR4302537.3994135/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTAT < SRR4302537.6179842/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTAT > SRR4302537.5401500/1‑94 (MQ=60)
TGGTGGTTTCTAACCTCGTCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATT < SRR4302537.3730676/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTA > SRR4302537.857339/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTA < SRR4302537.505630/94‑1 (MQ=60)
GTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAA < SRR4302537.1135328/94‑1 (MQ=60)
GTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAA > SRR4302537.3892422/1‑94 (MQ=60)
GTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTT < SRR4302537.3500183/94‑1 (MQ=60)
GTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTT < SRR4302537.81607/94‑1 (MQ=60)
TTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTT > SRR4302537.2191400/1‑94 (MQ=60)
TTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTT < SRR4302537.2845685/94‑1 (MQ=60)
CTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTAC < SRR4302537.4807346/94‑1 (MQ=60)
CTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTAC < SRR4302537.5579953/94‑1 (MQ=60)
CTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTAC > SRR4302537.4970543/1‑94 (MQ=60)
TAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATTGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACA < SRR4302537.5692454/94‑1 (MQ=60)
TAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTGCA < SRR4302537.4546395/94‑1 (MQ=60)
AACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACAC < SRR4302537.3724586/94‑1 (MQ=60)
AACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACAC > SRR4302537.4592118/1‑94 (MQ=60)
CTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCT > SRR4302537.3285686/1‑94 (MQ=60)
TCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTC < SRR4302537.1032502/94‑1 (MQ=60)
TCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTC > SRR4302537.1941201/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCA > SRR4302537.2122529/1‑94 (MQ=60)
GGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCAT < SRR4302537.5362854/94‑1 (MQ=60)
GCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATG < SRR4302537.6175129/94‑1 (MQ=60)
GCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATG < SRR4302537.5149497/94‑1 (MQ=60)
GCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATG > SRR4302537.4750126/1‑94 (MQ=60)
TAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTG < SRR4302537.2968301/94‑1 (MQ=60)
AAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGG < SRR4302537.6236877/94‑1 (MQ=60)
AAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGG < SRR4302537.4971405/94‑1 (MQ=60)
AGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGC > SRR4302537.2841123/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGC > SRR4302537.4595036/1‑94 (MQ=60)
CCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCAT > SRR4302537.6478746/1‑94 (MQ=60)
CAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATA < SRR4302537.5855861/94‑1 (MQ=60)
CAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATA > SRR4302537.6398823/1‑94 (MQ=60)
GCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAAT < SRR4302537.4878980/94‑1 (MQ=60)
CCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATT < SRR4302537.2653441/94‑1 (MQ=60)
CGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTC < SRR4302537.1150635/94‑1 (MQ=60)
|
TCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTC > NC_000913/419728‑419914
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
