Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
484,670 |
A→G |
G58G (GGT→GGC) |
acrA ← |
acridine efflux pump |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 484,670 | 0 | A | G | 100.0%
| 679.3
/ NA
| 196 | G58G (GGT→GGC) | acrA | acridine efflux pump |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (108/88); total (108/88) |
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
TTCGATGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGACCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGGGCCT > NC_000913/484580‑484758
|
tGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGaa < 1:16433/93‑1 (MQ=255)
gCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTc < 2:5661271/93‑1 (MQ=255)
gCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTc < 2:2846266/93‑1 (MQ=255)
gCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTc > 1:2637416/1‑93 (MQ=255)
cTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCg > 1:1230781/1‑93 (MQ=255)
cTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCg > 2:5155659/1‑93 (MQ=255)
cTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCg > 2:6359354/1‑93 (MQ=255)
cTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCg > 2:4787714/1‑93 (MQ=255)
aCCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGt < 2:289408/93‑1 (MQ=255)
aCCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGt > 1:3022183/1‑93 (MQ=255)
ccTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGtt > 2:1747410/1‑93 (MQ=255)
cttcttTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTtg > 1:176084/1‑93 (MQ=255)
cttcttTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTtg > 1:2265299/1‑93 (MQ=255)
cttcttTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTtg < 1:3561739/93‑1 (MQ=255)
cttcttTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTtg < 1:954217/93‑1 (MQ=255)
ttcttTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTtgt > 2:3961754/1‑93 (MQ=255)
ttcttTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTtgt < 2:2176364/93‑1 (MQ=255)
tcttTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTtgtg < 1:4358376/93‑1 (MQ=255)
tcttTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTtgtg > 1:1726481/1‑93 (MQ=255)
cttTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGa > 1:1132952/1‑93 (MQ=255)
cttTGAAATTACGCTTCAGGATAACCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGa < 2:5852955/93‑1 (MQ=255)
tttGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGAt < 2:5039654/93‑1 (MQ=255)
tttGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGAt > 1:1045559/1‑93 (MQ=255)
ttGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATc < 2:4342058/93‑1 (MQ=255)
tGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCt > 1:4457476/1‑93 (MQ=255)
gAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTg < 1:3094265/93‑1 (MQ=255)
gAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTg > 1:5088770/1‑93 (MQ=255)
aaaTTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGGTCTGc > 2:2072692/1‑93 (MQ=255)
aaaTTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGc > 2:4861570/1‑93 (MQ=255)
aaaTTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGc > 1:1449039/1‑93 (MQ=255)
aaaTTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGc < 1:4604533/93‑1 (MQ=255)
aaTTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCa > 2:4186190/1‑93 (MQ=255)
aTTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGCTGTGATCTGCag > 1:3371521/1‑93 (MQ=255)
ttACGCTTCAGGATAATCCCGCTAGCTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCaga < 1:6044247/93‑1 (MQ=255)
tACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCagag < 1:5419401/93‑1 (MQ=255)
cGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGt < 1:2113298/93‑1 (MQ=255)
gCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGtt < 1:2345761/93‑1 (MQ=255)
gCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGtt > 2:2480395/1‑93 (MQ=255)
cTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTc < 1:636694/93‑1 (MQ=255)
ttCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCa < 1:4892526/93‑1 (MQ=255)
ttCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCa > 2:2338517/1‑93 (MQ=255)
tCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAg < 1:5218969/93‑1 (MQ=255)
tCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGGTCAg > 1:1277052/1‑93 (MQ=255)
aGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGtt < 2:1960582/93‑1 (MQ=255)
ggATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGttt > 1:3304843/1‑93 (MQ=255)
aTAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTg > 2:4018714/1‑93 (MQ=255)
aTCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACt > 1:6235171/1‑93 (MQ=255)
aTCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACt > 2:6146740/1‑93 (MQ=255)
aTCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACt < 2:3918327/93‑1 (MQ=255)
aTCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACt > 2:4878310/1‑93 (MQ=255)
aTCCCGCTAACTGGAGGACGAACGTCGGCGAGCCGGTAAGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGGTGGGATCGGCAGAGGTTCAGTTTTGACt < 2:6062549/93‑1 (MQ=255)
aTCCAGATAACATGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCAGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGATTCAGTTTTGACt < 2:291149/93‑1 (MQ=255)
tCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTg > 2:2125078/1‑93 (MQ=255)
ccGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGtt > 1:2243816/1‑93 (MQ=255)
ccGCTAACGTGAGAACGATCTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGtt < 1:4180488/93‑1 (MQ=255)
cGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTta < 1:90140/93‑1 (MQ=255)
cGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTta > 1:686074/1‑93 (MQ=255)
gCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTtac < 2:2647698/93‑1 (MQ=255)
gCTAACTCGAGGACGACCTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTtac < 1:5655433/93‑1 (MQ=255)
cTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTtact < 2:3554644/93‑1 (MQ=255)
tAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTtacta > 2:6306667/1‑93 (MQ=255)
tAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTtacta < 1:595435/93‑1 (MQ=255)
aaCTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTtactac > 1:1541421/1‑93 (MQ=255)
aaCTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTtactac < 1:3614457/93‑1 (MQ=255)
cgtGAGGACGAGCTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGc < 1:4957218/91‑1 (MQ=255)
cTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGc > 2:305474/1‑93 (MQ=255)
cTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGc < 2:3452771/93‑1 (MQ=255)
cTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGANCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGc > 2:4682760/1‑93 (MQ=255)
ttGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGcc < 2:6135456/93‑1 (MQ=255)
aGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAAc > 2:6405363/1‑93 (MQ=255)
aGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAAc > 2:3829761/1‑93 (MQ=255)
ggACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAAcg > 2:3108800/1‑93 (MQ=255)
ggACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAAcg > 1:560282/1‑93 (MQ=255)
gACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAAcgg > 1:5442239/1‑93 (MQ=255)
aCGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAAcggc < 1:1905773/93‑1 (MQ=255)
aCGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAAcggc > 2:1426168/1‑93 (MQ=255)
aCGAACTTCGGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAAcggc < 2:455992/93‑1 (MQ=255)
cGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAAcggcg < 2:659042/93‑1 (MQ=255)
aCTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGc > 2:2500361/1‑93 (MQ=255)
cTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCa < 2:718673/93‑1 (MQ=255)
ttCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGGAt > 1:846728/1‑93 (MQ=255)
tCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATc < 1:5854735/93‑1 (MQ=255)
cGATCCGGTAGGTACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATctgct > 2:5447599/1‑93 (MQ=255)
gATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATctgctg > 2:2275126/1‑93 (MQ=255)
aTCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTgg > 1:2710645/1‑93 (MQ=255)
ggTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCCTCTGCTGGCCAc > 1:5489233/1‑93 (MQ=255)
tAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCt < 2:5606374/93‑1 (MQ=255)
aGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCtt < 1:2796166/93‑1 (MQ=255)
ggCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCttg < 1:6417222/93‑1 (MQ=255)
gCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCttgt < 2:3726794/93‑1 (MQ=255)
cACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCttgtt < 2:4417657/93‑1 (MQ=255)
ccTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCttgttg < 1:3982841/92‑1 (MQ=255)
aCTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCttgttg < 2:1011613/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTgg < 1:2018479/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTgg < 1:2921742/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTgg < 1:3321191/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTgg > 1:1678276/1‑93 (MQ=255)
cTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTgg < 1:4025843/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTgg > 2:3328751/1‑93 (MQ=255)
tGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGGGCCt < 2:1480390/93‑1 (MQ=255)
|
TTCGATGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGACCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGGGCCT > NC_000913/484580‑484758
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGCTTCGATGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGACCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGGGCCTGTTT > NC_000913/484577‑484762
|
TGCTTCGATGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGG > SRR4302537.1700544/1‑94 (MQ=60)
GCTTCGATGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGC > SRR4302537.903795/1‑94 (MQ=60)
CTTCGATGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCC < SRR4302537.3936495/94‑1 (MQ=60)
CTTCGATGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCC > SRR4302537.4162897/1‑94 (MQ=60)
TCGATGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCG < SRR4302537.3220405/94‑1 (MQ=60)
TCGATGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCG > SRR4302537.6436014/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGG > SRR4302537.1111621/1‑94 (MQ=60)
GATGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGA > SRR4302537.6023272/1‑94 (MQ=60)
ATGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAA < SRR4302537.6363785/94‑1 (MQ=60)
TGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAG > SRR4302537.1263784/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAG < SRR4302537.16568/94‑1 (MQ=60)
GTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGC < SRR4302537.5937982/94‑1 (MQ=60)
CGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTC > SRR4302537.2655864/1‑94 (MQ=60)
GCTTCCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGCCGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCG < SRR4302537.814535/94‑1 (MQ=60)
GCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCG > SRR4302537.1239339/1‑94 (MQ=60)
TACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGT > SRR4302537.5612785/1‑94 (MQ=60)
TACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGT > SRR4302537.4942625/1‑94 (MQ=60)
TACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGT > SRR4302537.2945256/1‑94 (MQ=60)
TACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGT > SRR4302537.3043249/1‑94 (MQ=60)
ACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTT > SRR4302537.1001445/1‑94 (MQ=60)
CCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTG > SRR4302537.2281296/1‑94 (MQ=60)
CCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTG > SRR4302537.177331/1‑94 (MQ=60)
CTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGT > SRR4302537.4492699/1‑94 (MQ=60)
CTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGT < SRR4302537.960804/94‑1 (MQ=60)
CTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGT < SRR4302537.3586863/94‑1 (MQ=60)
CTTCTTTGAAATTACGATTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGAACTGGTGCGGCCGGGAAGCTCGGTTGT > SRR4302537.1668416/1‑94 (MQ=60)
TTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTG > SRR4302537.3357120/1‑94 (MQ=60)
TTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTG > SRR4302537.1738544/1‑94 (MQ=60)
TCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGA > SRR4302537.1140817/1‑94 (MQ=60)
TCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGA < SRR4302537.4388538/94‑1 (MQ=60)
CTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTTTGAT > SRR4302537.2201283/1‑94 (MQ=60)
CTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGAT > SRR4302537.1052776/1‑94 (MQ=60)
TTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCT > SRR4302537.4488262/1‑94 (MQ=60)
TGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTG > SRR4302537.5123802/1‑94 (MQ=60)
GAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGC > SRR4302537.1459134/1‑94 (MQ=60)
GAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGC < SRR4302537.3115850/94‑1 (MQ=60)
AAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCA < SRR4302537.4636414/94‑1 (MQ=60)
AATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGCTGTGATCTGCAG > SRR4302537.3395412/1‑94 (MQ=60)
TTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAGCTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAG < SRR4302537.6085762/94‑1 (MQ=60)
TACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGG < SRR4302537.5456335/94‑1 (MQ=60)
TACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGG > SRR4302537.3563449/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGT < SRR4302537.3102938/94‑1 (MQ=60)
CGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTT < SRR4302537.2128191/94‑1 (MQ=60)
GCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTC < SRR4302537.2362277/94‑1 (MQ=60)
GCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTC > SRR4302537.3595304/1‑94 (MQ=60)
CTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCA < SRR4302537.641025/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAG < SRR4302537.4926307/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGGTCAG > SRR4302537.1285927/1‑94 (MQ=60)
TCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGT < SRR4302537.5254864/94‑1 (MQ=60)
CAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTT > SRR4302537.3342283/1‑94 (MQ=60)
AGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTT > SRR4302537.3328208/1‑94 (MQ=60)
GGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGCTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTT > SRR4302537.2098071/1‑94 (MQ=60)
GATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTG > SRR4302537.5043370/1‑94 (MQ=60)
GATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTG > SRR4302537.1544509/1‑94 (MQ=60)
ATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGA > SRR4302537.2717511/1‑94 (MQ=60)
AATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACT > SRR4302537.6278053/1‑94 (MQ=60)
ATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTG < SRR4302537.1766410/94‑1 (MQ=60)
CCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTT > SRR4302537.2259642/1‑94 (MQ=60)
CCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTA > SRR4302537.690779/1‑94 (MQ=60)
CCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTA < SRR4302537.1579714/94‑1 (MQ=60)
CCGCTAACGTGAGAACGATCTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTA < SRR4302537.4209667/94‑1 (MQ=60)
CGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTAC > SRR4302537.857379/1‑94 (MQ=60)
CGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTAC < SRR4302537.90799/94‑1 (MQ=60)
GCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACT < SRR4302537.1293193/94‑1 (MQ=60)
GCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACT > SRR4302537.4795266/1‑94 (MQ=60)
GCTAACTCGAGGACGACCTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACT < SRR4302537.5694135/94‑1 (MQ=60)
CTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTC > SRR4302537.5729518/1‑94 (MQ=60)
CTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTA > SRR4302537.6212145/1‑94 (MQ=60)
CTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTA > SRR4302537.2858962/1‑94 (MQ=60)
CTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTA > SRR4302537.3880277/1‑94 (MQ=60)
CTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTA > SRR4302537.2768675/1‑94 (MQ=60)
TAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTAC < SRR4302537.599507/94‑1 (MQ=60)
TAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTAC > SRR4302537.1552181/1‑94 (MQ=60)
AACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACG < SRR4302537.3639935/94‑1 (MQ=60)
CGTGAGGACGAGCTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCC < SRR4302537.4991392/94‑1 (MQ=60)
TTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCA < SRR4302537.6513511/94‑1 (MQ=60)
AGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACG > SRR4302537.920598/1‑94 (MQ=60)
AGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACG > SRR4302537.564141/1‑94 (MQ=60)
AGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACG > SRR4302537.2590801/1‑94 (MQ=60)
GGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGG > SRR4302537.5479363/1‑94 (MQ=60)
ACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCG > SRR4302537.2260346/1‑94 (MQ=60)
ACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCG > SRR4302537.897499/1‑94 (MQ=60)
ACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCG < SRR4302537.1919013/94‑1 (MQ=60)
CGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGG < SRR4302537.2301622/94‑1 (MQ=60)
CTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGGAT > SRR4302537.852528/1‑94 (MQ=60)
TCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCT < SRR4302537.5659021/94‑1 (MQ=60)
TCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCT < SRR4302537.5894892/94‑1 (MQ=60)
CGATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTG > SRR4302537.1707775/1‑94 (MQ=60)
GATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGG > SRR4302537.3541182/1‑94 (MQ=60)
GATCCGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGG > SRR4302537.2729577/1‑94 (MQ=60)
CGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCGTCTGCTGGGCAC > SRR4302537.1154682/1‑94 (MQ=60)
CGGTAGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCCTCTGCTGGCCAC > SRR4302537.5526706/1‑94 (MQ=60)
AGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTG > SRR4302537.5141351/1‑94 (MQ=60)
AGGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTG < SRR4302537.2815716/94‑1 (MQ=60)
GGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGT < SRR4302537.6460861/94‑1 (MQ=60)
GGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGT < SRR4302537.4235430/94‑1 (MQ=60)
GGCACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGT < SRR4302537.4401064/94‑1 (MQ=60)
CACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTG > SRR4302537.531549/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGG < SRR4302537.4010723/94‑1 (MQ=60)
ACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGG < SRR4302537.5473926/94‑1 (MQ=60)
ACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGG < SRR4302537.4010724/94‑1 (MQ=60)
ACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGG > SRR4302537.1690025/1‑94 (MQ=60)
ACTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGG < SRR4302537.5516198/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGGG < SRR4302537.2032552/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGGG < SRR4302537.3344683/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGGG < SRR4302537.4054028/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGGG < SRR4302537.2942271/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGGGC < SRR4302537.1923707/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGGGCCT > SRR4302537.1906885/1‑94 (MQ=60)
CGGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGGGCCTGTT < SRR4302537.566355/94‑1 (MQ=60)
GGCCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGGGCCTGTTT < SRR4302537.4554762/94‑1 (MQ=60)
|
TGCTTCGATGTCGCTACCTTCTTTGAAATTACGCTTCAGGATAATCCCGCTAACTTGAGGACGAACTTCTGCGATCCGGTAGGCACTGGTGCGACCCGGAAGCTCGGTTGTGATCTGCAGAGGTTCAGTTTTGACTGTTACTACGCCAACGGCGGGCATCTGCTGGCCACCTTGTTGGGCCTGTTT > NC_000913/484577‑484762
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
