Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
510,293 |
A→G |
L104P (CTG→CCG) |
ybaR ← |
putative ATPase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 510,293 | 0 | A | G | 95.4%
| 621.7
/ 13.6
| 196 | L104P (CTG→CCG) | ybaR | putative ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (6/3); new base G (97/90); total (103/93) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.03e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
AGGTTTACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCAGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCC > NC_000913/510203‑510385
|
tttACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAAc < 2:4878287/93‑1 (MQ=255)
tttACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAAc > 1:864251/1‑93 (MQ=255)
ttACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAAct > 2:600295/1‑93 (MQ=255)
aCCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAActgc < 1:5120528/93‑1 (MQ=255)
aCCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAActgc < 2:1749809/93‑1 (MQ=255)
cccGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAActgct < 1:1987037/93‑1 (MQ=255)
cccGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAActgct > 1:2554757/1‑93 (MQ=255)
cccGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCAGCAActgct > 2:3063576/1‑93 (MQ=255)
ccGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAActgctg < 2:3480527/93‑1 (MQ=255)
gTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCAGCAACTgctggc < 1:3786654/93‑1 (MQ=255)
tGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTgctggct > 2:2451229/1‑93 (MQ=255)
gCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTgctggctg < 1:1560205/93‑1 (MQ=255)
gCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTgctggctg < 2:3054749/93‑1 (MQ=255)
ccTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTgt < 2:1317226/93‑1 (MQ=255)
tGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCAGCAACTGCTGGCTgtca > 2:5721941/1‑93 (MQ=255)
tGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGACGCTCAGCGGCAACTGCTCGCTgtca > 2:717979/1‑93 (MQ=255)
gAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTgtcat < 1:1509330/93‑1 (MQ=255)
aGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTgtcatc < 2:2910941/93‑1 (MQ=255)
gTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTgtcatcg < 1:1002593/93‑1 (MQ=255)
gTGACGCCCGGTAAGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTgtcatcg > 2:6357594/1‑93 (MQ=255)
tGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTgtcatcgt < 1:1686301/93‑1 (MQ=255)
aCGCCCGGTGCGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTgtcatcgtca < 2:4579061/93‑1 (MQ=255)
aCGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTgtcatcgtca < 1:5885121/93‑1 (MQ=255)
aCGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTgtcatcgtca > 2:1391048/1‑93 (MQ=255)
cGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTgtcatcgtcat > 1:1231342/1‑93 (MQ=255)
gCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTgtcatcgtcatc < 2:3591669/93‑1 (MQ=255)
gCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTgtcatcgtcatc < 2:2524660/93‑1 (MQ=255)
gCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTgtcatcgtcatc > 1:6415365/1‑93 (MQ=255)
cGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATcggc < 2:3668276/93‑1 (MQ=255)
cGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATcggc < 1:542162/93‑1 (MQ=255)
tACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGt > 1:4609882/1‑93 (MQ=255)
tACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGt < 1:4720834/93‑1 (MQ=255)
tACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGt > 1:6318612/1‑93 (MQ=255)
tACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTAAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGt > 2:3991821/1‑93 (MQ=255)
aCGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATcggcgggc > 1:5809450/1‑91 (MQ=255)
cGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCg > 1:4195978/1‑93 (MQ=255)
cGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCAGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCg > 1:4370973/1‑93 (MQ=255)
gCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGgcgc > 2:2095288/1‑93 (MQ=255)
gCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTctc < 2:6126358/93‑3 (MQ=255)
gCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGc > 1:5748114/1‑93 (MQ=255)
cTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCt > 2:2327613/1‑93 (MQ=255)
tttGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCtc > 1:732590/1‑92 (MQ=255)
tttGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTg > 2:1456082/1‑93 (MQ=255)
tttGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGGCGCTg > 2:1204189/1‑93 (MQ=255)
tttGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCAGCAACTGATGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTg > 2:4236799/1‑93 (MQ=255)
ttGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGc < 1:4104569/93‑1 (MQ=255)
tGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGcc < 1:8135/93‑1 (MQ=255)
cAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCgg > 2:4656205/1‑93 (MQ=255)
aGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGa < 1:4873793/93‑1 (MQ=255)
aGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGa > 1:1475329/1‑93 (MQ=255)
gcgcATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGaa > 1:6076147/1‑93 (MQ=255)
gcATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCTCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAgc < 2:1967909/93‑1 (MQ=255)
gtccgcgGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGCTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAg < 2:4107940/90‑1 (MQ=255)
gTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAg > 1:493447/1‑93 (MQ=255)
gTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAg < 2:5315874/93‑1 (MQ=255)
tACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGa > 2:1129987/1‑93 (MQ=255)
cgcgGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGaaa > 2:3463398/1‑93 (MQ=255)
gcgGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAAc < 2:4524302/93‑1 (MQ=255)
gcgGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAAc < 2:2699594/93‑1 (MQ=255)
cgGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGGAGCGGCTCAGAAAcc > 1:2632730/1‑93 (MQ=255)
cgGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAAcc > 1:1293850/1‑93 (MQ=255)
cgGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAAcc > 2:5525776/1‑93 (MQ=255)
ggTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGc < 1:282778/93‑1 (MQ=255)
ggTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGc < 2:5910835/93‑1 (MQ=255)
gTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCt > 1:2068019/1‑93 (MQ=255)
tGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTg < 1:1921880/93‑1 (MQ=255)
tGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTg > 1:238017/1‑93 (MQ=255)
tGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTg > 2:4455077/1‑93 (MQ=255)
tGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTg < 1:5681355/93‑1 (MQ=255)
cacaGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCa > 1:1064507/1‑93 (MQ=255)
acaGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCTTCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAg > 2:4837808/1‑93 (MQ=255)
acaGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAg > 2:193863/1‑93 (MQ=255)
acaGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAg > 1:6209697/1‑93 (MQ=255)
acaGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAg < 1:5979391/93‑1 (MQ=255)
agagggCGCAGCGCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTg < 1:2045524/89‑1 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCCGAAACCGCTGTCAGTg > 1:2452154/1‑93 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTg < 2:3169635/93‑1 (MQ=255)
aGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTCTCAGTg > 2:3891876/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGc < 1:558755/93‑1 (MQ=255)
tGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCtt < 1:3699668/93‑1 (MQ=255)
ggCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGCAACCGCTGTCAGTGCTTc > 1:4830307/1‑93 (MQ=255)
gcgcAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTcc < 1:5489050/93‑1 (MQ=255)
aGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACg > 2:3335350/1‑93 (MQ=255)
gCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACgg > 1:3573523/1‑93 (MQ=255)
cTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCCGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACcgg > 1:2889543/1‑93 (MQ=255)
tCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGa > 2:168972/1‑93 (MQ=255)
cATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGAt < 1:2592165/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGAtt > 2:2677796/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATtg > 2:1805584/1‑93 (MQ=255)
gCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATtga < 1:5957913/93‑1 (MQ=255)
gCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATtga < 2:668145/93‑1 (MQ=255)
gCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATtga > 2:1545402/1‑93 (MQ=255)
cGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATtgatg > 2:6083382/1‑93 (MQ=255)
gCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATtgatga < 2:2870435/93‑1 (MQ=255)
gCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATtgatga < 2:940910/93‑1 (MQ=255)
cTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGAc > 2:4408546/1‑93 (MQ=255)
tCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACt > 1:4270336/1‑93 (MQ=255)
tCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACt > 2:3713436/1‑93 (MQ=255)
cagcggCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTc < 1:3479478/93‑1 (MQ=255)
agcggcAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTcc < 1:5162431/93‑1 (MQ=255)
|
AGGTTTACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCAGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCC > NC_000913/510203‑510385
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCCAGGTTTACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCAGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGC > NC_000913/510200‑510384
|
GCCAGGTTTACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCG > SRR4302537.105791/1‑94 (MQ=60)
GCCAGGTTTACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCG < SRR4302537.6286690/94‑1 (MQ=60)
AGGTTTACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGGAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCA > SRR4302537.3652963/1‑94 (MQ=60)
GGTTTACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAA > SRR4302537.5288656/1‑94 (MQ=60)
GTTTACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAAC > SRR4302537.870180/1‑94 (MQ=60)
GTTTACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAAC < SRR4302537.3202842/94‑1 (MQ=60)
TTACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTG < SRR4302537.1561088/94‑1 (MQ=60)
ACCCGTGCCTTAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCTGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCT < SRR4302537.2074175/94‑1 (MQ=60)
ACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCT < SRR4302537.5155821/94‑1 (MQ=60)
ACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCT > SRR4302537.2572671/1‑94 (MQ=60)
CCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTG < SRR4302537.2000853/94‑1 (MQ=60)
GTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCT < SRR4302537.5272976/94‑1 (MQ=60)
GTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCT > SRR4302537.98716/1‑94 (MQ=60)
GTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCAGCAACTGCTGGCT < SRR4302537.3813241/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTG > SRR4302537.6175590/1‑94 (MQ=60)
GCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGT < SRR4302537.1571092/94‑1 (MQ=60)
CCTGAGTGACGCCCGGTACGC‑TTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCCGGCTGTCA > SRR4302537.2043764/1‑94 (MQ=60)
GAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATC < SRR4302537.6266186/94‑1 (MQ=60)
GAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATC < SRR4302537.1519885/94‑1 (MQ=60)
GAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATC < SRR4302537.2643959/94‑1 (MQ=60)
GTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGT < SRR4302537.1009514/94‑1 (MQ=60)
TGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTC < SRR4302537.1698110/94‑1 (MQ=60)
ACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCAT < SRR4302537.5925503/94‑1 (MQ=60)
ACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCAT < SRR4302537.3792396/94‑1 (MQ=60)
ACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCAT > SRR4302537.1239903/1‑94 (MQ=60)
CGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATC > SRR4302537.6458999/1‑94 (MQ=60)
GCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCG < SRR4302537.4753105/94‑1 (MQ=60)
GCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCG < SRR4302537.3941023/94‑1 (MQ=60)
GCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACCCGGGTGACACAGCTGGGGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCG > SRR4302537.2055835/1‑94 (MQ=60)
CCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGG < SRR4302537.1244546/94‑1 (MQ=60)
CGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCG < SRR4302537.545895/94‑1 (MQ=60)
GTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGT > SRR4302537.6361848/1‑94 (MQ=60)
GTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGT > SRR4302537.4641799/1‑94 (MQ=60)
GTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGT > SRR4302537.1448707/1‑94 (MQ=60)
GTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTACTGGCTGTCATCATCATCGcaggt > SRR4302537.5010203/1‑89 (MQ=60)
TACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTC < SRR4302537.4753473/94‑1 (MQ=60)
TACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGGC > SRR4302537.5849282/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCG > SRR4302537.4225283/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCAGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCG > SRR4302537.4401176/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGC > SRR4302537.5787479/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGC > SRR4302537.5903338/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTG > SRR4302537.3546146/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTG > SRR4302537.517366/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTC > SRR4302537.737590/1‑94 (MQ=60)
TTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGC < SRR4302537.1577170/94‑1 (MQ=60)
TTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCC > SRR4302537.2731367/1‑94 (MQ=60)
TTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCC < SRR4302537.4133241/94‑1 (MQ=60)
TGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCG > SRR4302537.5518664/1‑94 (MQ=60)
TGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCG < SRR4302537.8191/94‑1 (MQ=60)
CAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGA > SRR4302537.5761848/1‑94 (MQ=60)
CAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGA > SRR4302537.1485581/1‑94 (MQ=60)
AGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTTGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGGA > SRR4302537.4846512/1‑94 (MQ=60)
AGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAA < SRR4302537.4907429/94‑1 (MQ=60)
AGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAA > SRR4302537.6117902/1‑94 (MQ=60)
CGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGC > SRR4302537.5554946/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCC > SRR4302537.5823607/1‑94 (MQ=60)
TTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCA < SRR4302537.4984740/94‑1 (MQ=60)
TTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCA < SRR4302537.2284847/94‑1 (MQ=60)
TGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAG > SRR4302537.496848/1‑94 (MQ=60)
TACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAA < SRR4302537.241195/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAAC > SRR4302537.1016297/1‑94 (MQ=60)
CGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAAC < SRR4302537.4936690/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGGAGCGGCTCAGAAACC > SRR4302537.2651159/1‑94 (MQ=60)
GCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACC > SRR4302537.1302845/1‑94 (MQ=60)
CGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCC > SRR4302537.4871670/1‑94 (MQ=60)
GGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGC > SRR4302537.5686342/1‑94 (MQ=60)
GGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCT > SRR4302537.2082549/1‑94 (MQ=60)
GGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCT < SRR4302537.284748/94‑1 (MQ=60)
GTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTG > SRR4302537.239699/1‑94 (MQ=60)
GTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTG < SRR4302537.715330/94‑1 (MQ=60)
TGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGT < SRR4302537.5720214/94‑1 (MQ=60)
TGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGT < SRR4302537.1935226/94‑1 (MQ=60)
ACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCA > SRR4302537.1071840/1‑94 (MQ=60)
CACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAG < SRR4302537.1514516/94‑1 (MQ=60)
CACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAG > SRR4302537.6252478/1‑94 (MQ=60)
CACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCAGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAG < SRR4302537.4313296/94‑1 (MQ=60)
ACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGT < SRR4302537.6020434/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCCGAAACCGCTGTCAGTG > SRR4302537.2469407/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTG < SRR4302537.6394959/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTG < SRR4302537.4406747/94‑1 (MQ=60)
agagGGCGCAGCGCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGC < SRR4302537.2059859/90‑1 (MQ=60)
AGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGC > SRR4302537.5991437/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGC < SRR4302537.6005676/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCT < SRR4302537.562601/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCT > SRR4302537.838693/1‑94 (MQ=60)
TGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGCAACCGCTGTCAGTGCTTC > SRR4302537.4863668/1‑94 (MQ=60)
TGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAACCCGCTGTCAGTGCTTC < SRR4302537.4139328/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTC < SRR4302537.2244483/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTC < SRR4302537.3725696/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCG < SRR4302537.5526521/94‑1 (MQ=60)
GCAGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGAC > SRR4302537.2890582/1‑94 (MQ=60)
AGCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGG > SRR4302537.3598724/1‑94 (MQ=60)
GCTCATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCCGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACCGG > SRR4302537.2909823/1‑94 (MQ=60)
CATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATT < SRR4302537.6344508/94‑1 (MQ=60)
CATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATT < SRR4302537.2610300/94‑1 (MQ=60)
CATGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATT < SRR4302537.1092532/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGA > SRR4302537.79027/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGAT < SRR4302537.5998806/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGAT > SRR4302537.4291022/1‑94 (MQ=60)
CCGCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATG > SRR4302537.4101206/1‑94 (MQ=60)
CGATCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGA < SRR4302537.2606429/94‑1 (MQ=60)
GCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGAC > SRR4302537.6032233/1‑94 (MQ=60)
GCTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGAC < SRR4302537.1999679/94‑1 (MQ=60)
CTCAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACT > SRR4302537.4300003/1‑94 (MQ=60)
CAGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCC < SRR4302537.3504096/94‑1 (MQ=60)
AGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCG < SRR4302537.2519863/94‑1 (MQ=60)
AGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCG < SRR4302537.1795430/94‑1 (MQ=60)
AGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCG < SRR4302537.5198015/94‑1 (MQ=60)
AGCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCC > SRR4302537.4863302/1‑94 (MQ=60)
GCGGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGC < SRR4302537.2978769/94‑1 (MQ=60)
|
GCCAGGTTTACCCGTGCCTGAGTGACGCCCGGTACGCTTTGCAGCGCATTTTGTACGCGGGTGACACAGCTGGCGCAGCTCATGCCGCTCAGCAGCAACTGCTGGCTGTCATCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGC > NC_000913/510200‑510384
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
