Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
540,420 |
A→G |
Y211C (TAC→TGC) |
ybbY → |
putative transport |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 540,420 | 0 | A | G | 100.0%
| 735.6
/ NA
| 214 | Y211C (TAC→TGC) | ybbY | putative transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (118/96); total (118/96) |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
GCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAA > NC_000913/540330‑540509
|
ccTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCtt < 1:2500916/93‑1 (MQ=255)
cTGGTAGTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCttt < 2:4130934/93‑1 (MQ=255)
cTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCttt > 2:3444567/1‑93 (MQ=255)
tGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCtttt < 2:3539548/93‑1 (MQ=255)
tGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCtttt < 1:4300655/93‑1 (MQ=255)
tGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCtttt < 2:5255702/93‑1 (MQ=255)
tGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCtttt > 2:461818/1‑93 (MQ=255)
gTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGc < 2:5046206/93‑1 (MQ=255)
gTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGc < 1:524750/93‑1 (MQ=255)
aCTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCtt < 1:3151667/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGtgcttttgcttt > 1:318997/1‑93 (MQ=255)
tGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTc < 1:5193805/93‑1 (MQ=255)
ggCGATGATTATGTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCTTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTcc < 2:4295185/93‑1 (MQ=255)
ggCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTcc < 1:3777687/93‑1 (MQ=255)
gCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCct > 2:4972692/1‑93 (MQ=255)
gCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCct < 2:677664/93‑1 (MQ=255)
cGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCctt < 2:1743668/93‑1 (MQ=255)
gatgatTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCcttc > 2:1889315/1‑93 (MQ=255)
gatgatTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCcatc < 2:1209623/93‑1 (MQ=255)
atgatTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCcttct > 2:5533738/1‑93 (MQ=255)
tgatTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCcttctt > 1:6387705/1‑93 (MQ=255)
gatTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCttcttc < 1:880525/93‑1 (MQ=255)
gatTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCttcttc < 2:3433700/93‑1 (MQ=255)
tATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCa > 1:5497992/1‑93 (MQ=255)
tATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTCTCCTTCTTCGCa < 1:2555686/93‑1 (MQ=255)
aTCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCAc > 1:3938121/1‑93 (MQ=255)
aTCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCAc < 2:463745/93‑1 (MQ=255)
cTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTc < 1:3542146/93‑1 (MQ=255)
cTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTc > 1:1045748/1‑93 (MQ=255)
ttCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTcc > 2:5625336/1‑92 (MQ=255)
tCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGc < 1:4407822/93‑1 (MQ=255)
cTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGctc > 2:5369270/1‑93 (MQ=255)
cTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGctc > 1:1820591/1‑93 (MQ=255)
cTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGctc < 1:4662696/93‑1 (MQ=255)
cTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGctc > 2:2124116/1‑93 (MQ=255)
ttccGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGctct > 1:2019625/3‑93 (MQ=255)
tGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGctct < 2:6008767/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCC‑TCTTCGCACTCGCtctc < 1:1993955/93‑1 (MQ=255)
gCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCtctc < 1:1518978/93‑1 (MQ=255)
gCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCtctc > 1:1112568/1‑93 (MQ=255)
gCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCtctc > 1:1086551/1‑93 (MQ=255)
ccGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTcc < 2:3632498/93‑1 (MQ=255)
gCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCgg > 2:780152/1‑93 (MQ=255)
gCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCgg < 2:4060933/93‑1 (MQ=255)
cAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGt < 2:943503/93‑1 (MQ=255)
aaCGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTg < 2:1168343/93‑1 (MQ=255)
aaCGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTg > 2:5920038/1‑93 (MQ=255)
cGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAg > 1:5780245/1‑93 (MQ=255)
gTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGt < 1:6186808/93‑1 (MQ=255)
gTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGt < 2:6346776/93‑1 (MQ=255)
ttttGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGtt < 2:2873837/93‑1 (MQ=255)
tttGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTg > 2:3234407/1‑93 (MQ=255)
gCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCAc > 2:2594913/1‑93 (MQ=255)
gCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTATTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCAc > 2:4224566/1‑93 (MQ=255)
ccGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTg > 2:3605570/1‑93 (MQ=255)
ccGTTATGGCCTACTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTg > 1:3487560/1‑93 (MQ=255)
gTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGc > 2:750634/1‑93 (MQ=255)
gTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGc < 2:3890482/93‑1 (MQ=255)
tATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAg < 1:3849359/93‑1 (MQ=255)
aTGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGt > 1:2656786/1‑93 (MQ=255)
aTGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGt < 1:6091684/93‑1 (MQ=255)
aTGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGt > 1:700971/1‑93 (MQ=255)
tGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCATTg < 2:244783/93‑1 (MQ=255)
gctgGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTccc < 1:2208366/93‑1 (MQ=255)
ctgGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCg > 1:6311187/1‑93 (MQ=255)
ggTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCt > 1:4007543/1‑93 (MQ=255)
gTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTc > 2:632352/1‑93 (MQ=255)
gTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTc > 1:5699177/1‑93 (MQ=255)
gTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTc < 1:5971310/93‑1 (MQ=255)
tCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCg > 2:4443596/1‑93 (MQ=255)
tCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCg > 2:5782989/1‑93 (MQ=255)
tCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGGGGGGCCCGCTCg > 2:2505168/1‑93 (MQ=255)
ggCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGc > 1:3388503/1‑93 (MQ=255)
cACCATAACCGTCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAg < 2:1333252/93‑1 (MQ=255)
atatCCGGCTGGTTGTTGTGCTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGc < 1:3731691/93‑1 (MQ=255)
agccGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCCCTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCgg < 1:2757557/91‑1 (MQ=255)
aaCCGCCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGTTGAGTTGCTCTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCgg < 2:3821688/93‑1 (MQ=255)
cGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGc > 2:1921912/1‑93 (MQ=255)
ggCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCt > 1:973632/1‑93 (MQ=255)
ggCGGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCt < 1:4477077/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCtt > 2:145935/1‑93 (MQ=255)
gCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCtt > 1:5868781/1‑93 (MQ=255)
tGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTg > 1:779832/1‑93 (MQ=255)
tGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTg > 1:3475501/1‑93 (MQ=255)
ggTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGt < 1:2849994/93‑1 (MQ=255)
ggTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGCGGCGGGGCTTTGt > 1:1576310/1‑93 (MQ=255)
gttgttGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTc > 1:3252029/1‑93 (MQ=255)
gttgttGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTc < 1:2523395/93‑1 (MQ=255)
gttgttGTGGTGCTTTTGATTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTTCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGTTAGGCAGTGGAGGTGCTTTGtt > 2:2263746/1‑92 (MQ=255)
tgttgtGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGc < 2:3324111/93‑1 (MQ=255)
tgttgtGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGc > 2:6125053/1‑93 (MQ=255)
gttgtGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGcc > 1:6263035/1‑93 (MQ=255)
ttgtGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCg > 1:1955355/1‑93 (MQ=255)
tgtgGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCgg < 2:3954481/93‑1 (MQ=255)
tgtgGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCgg > 1:4935105/1‑93 (MQ=255)
tgtgGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCgg < 2:2303641/93‑1 (MQ=255)
tgtgGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCgg < 2:1805555/93‑1 (MQ=255)
gtggtgCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCggg < 1:531818/93‑1 (MQ=255)
tgGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGa < 1:257687/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGaa > 2:1394992/1‑93 (MQ=255)
|
GCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAA > NC_000913/540330‑540509
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTAT > NC_000913/540327‑540513
|
TGTGCCTGGTACTGGCGTTGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTG < SRR4302537.3203417/94‑1 (MQ=60)
GTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGC > SRR4302537.1032324/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTT < SRR4302537.2518512/94‑1 (MQ=60)
CCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTT > SRR4302537.1113335/1‑94 (MQ=60)
TGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTG < SRR4302537.4330544/94‑1 (MQ=60)
GTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCT < SRR4302537.528351/94‑1 (MQ=60)
GTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCT > SRR4302537.4446095/1‑94 (MQ=60)
ACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTT > SRR4302537.329215/1‑94 (MQ=60)
ACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTT > SRR4302537.321206/1‑94 (MQ=60)
ACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTT < SRR4302537.4876607/94‑1 (MQ=60)
ACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTT < SRR4302537.3173800/94‑1 (MQ=60)
TGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCC > SRR4302537.386510/1‑94 (MQ=60)
TGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCC < SRR4302537.5229514/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTGATTTTCTTCCTGCCGCAGCGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCT < SRR4302537.1241940/94‑1 (MQ=60)
GGCGATGTTTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCT < SRR4302537.3209800/94‑1 (MQ=60)
GGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCT < SRR4302537.3804214/94‑1 (MQ=60)
ggaataATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTT < SRR4302537.5825495/88‑1 (MQ=60)
GCGATGATTATCTTCCTGCCGCCACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATGACCGGCTGGCTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTT > SRR4302537.4890411/1‑94 (MQ=60)
CGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTC < SRR4302537.557157/94‑1 (MQ=60)
GATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCT < SRR4302537.6103320/94‑1 (MQ=60)
GATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCT > SRR4302537.3638068/1‑94 (MQ=60)
GATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCT < SRR4302537.795138/94‑1 (MQ=60)
GATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCT > SRR4302537.5801852/1‑94 (MQ=60)
ATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTT > SRR4302537.6431233/1‑94 (MQ=60)
GATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCG < SRR4302537.886584/94‑1 (MQ=60)
ATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGC > SRR4302537.6150820/1‑94 (MQ=60)
TTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCA > SRR4302537.4335472/1‑94 (MQ=60)
TTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCA > SRR4302537.5535527/1‑94 (MQ=60)
TATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCAC > SRR4302537.3965654/1‑94 (MQ=60)
TATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCAC > SRR4302537.1934657/1‑94 (MQ=60)
TATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTCTCCTTCTTCGCAC < SRR4302537.2573602/94‑1 (MQ=60)
TCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTC > SRR4302537.1052966/1‑94 (MQ=60)
CTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCG < SRR4302537.3567169/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCT < SRR4302537.4438243/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTC > SRR4302537.1833280/1‑94 (MQ=60)
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CTTCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCT > SRR4302537.2033710/1‑94 (MQ=60)
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CGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGG < SRR4302537.3443203/94‑1 (MQ=60)
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GTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTT < SRR4302537.6229425/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTT > SRR4302537.972799/1‑94 (MQ=60)
TGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCAC > SRR4302537.4564539/1‑94 (MQ=60)
GCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACT > SRR4302537.5905960/1‑94 (MQ=60)
CCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTG < SRR4302537.3308511/94‑1 (MQ=60)
CCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTG > SRR4302537.6193071/1‑94 (MQ=60)
CCCGTTATGGCCTACTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTG > SRR4302537.3512225/1‑94 (MQ=60)
CGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGC > SRR4302537.286652/1‑94 (MQ=60)
GTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCA > SRR4302537.3214485/1‑94 (MQ=60)
GTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCA > SRR4302537.3510879/1‑94 (MQ=60)
GTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCA > SRR4302537.2019687/1‑94 (MQ=60)
TTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAG < SRR4302537.2428856/94‑1 (MQ=60)
TATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGT < SRR4302537.3790755/94‑1 (MQ=60)
TATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGT > SRR4302537.705767/1‑94 (MQ=60)
TATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGT < SRR4302537.3876316/94‑1 (MQ=60)
TATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGT > SRR4302537.2675355/1‑94 (MQ=60)
TATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGT > SRR4302537.3712602/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTG > SRR4302537.1642657/1‑94 (MQ=60)
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CTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCC > SRR4302537.4135711/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGGGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGCTCC > SRR4302537.6515963/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCC < SRR4302537.2685346/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCG > SRR4302537.6232992/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCG < SRR4302537.2223934/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCG > SRR4302537.5320026/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCG > SRR4302537.6354392/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCG > SRR4302537.6354393/1‑94 (MQ=60)
TGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCT < SRR4302537.5230619/94‑1 (MQ=60)
TGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCT > SRR4302537.4035594/1‑94 (MQ=60)
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CGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGC > SRR4302537.3412503/1‑94 (MQ=60)
GGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCA < SRR4302537.5753208/94‑1 (MQ=60)
CCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGG > SRR4302537.1087754/1‑94 (MQ=60)
CATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGC > SRR4302537.3566484/1‑94 (MQ=60)
ATATCCGGCTGGTTGTTGTGCTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCG < SRR4302537.3757903/94‑1 (MQ=60)
AGCCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCCCTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGT < SRR4302537.2776806/94‑1 (MQ=60)
AACCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGT < SRR4302537.4008863/94‑1 (MQ=60)
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CCGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGC > SRR4302537.3904421/1‑94 (MQ=60)
CGGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCT > SRR4302537.980346/1‑94 (MQ=60)
GGCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTT > SRR4302537.5909042/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTT < SRR4302537.4508049/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTT > SRR4302537.198358/1‑94 (MQ=60)
CTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTG > SRR4302537.785185/1‑94 (MQ=60)
CTGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTG > SRR4302537.3500094/1‑94 (MQ=60)
TGGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGCGGCGGGGCTTTGT > SRR4302537.1587301/1‑94 (MQ=60)
ggtgtTTGTGGTTCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCCCTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTC < SRR4302537.4194891/89‑1 (MQ=60)
GGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTC > SRR4302537.263174/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTC < SRR4302537.2869953/94‑1 (MQ=60)
GGTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTC > SRR4302537.3274954/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCG < SRR4302537.2541114/94‑1 (MQ=60)
GTTGTTGTGGTGCTTGTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCG < SRR4302537.631345/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGC > SRR4302537.4177624/1‑94 (MQ=60)
TGTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCC > SRR4302537.6306029/1‑94 (MQ=60)
GTTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCG > SRR4302537.1968953/1‑94 (MQ=60)
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TTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGG > SRR4302537.4969143/1‑94 (MQ=60)
TTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGG < SRR4302537.2513920/94‑1 (MQ=60)
TTGTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGCGCTTTGTCGCCGG > SRR4302537.2762076/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGA < SRR4302537.535468/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAA < SRR4302537.259513/94‑1 (MQ=60)
GTGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATT < SRR4302537.3354902/94‑1 (MQ=60)
TGCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTA < SRR4302537.3089791/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGGATTAT > SRR4302537.1125057/1‑94 (MQ=60)
GCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTAT < SRR4302537.1226864/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCCGTGCTTTGTCGTCGGGAATTAT > SRR4302537.4007559/1‑94 (MQ=60)
|
TGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTAT > NC_000913/540327‑540513
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
