Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
695,815 |
T→C |
noncoding (25/75 nt) |
glnV ← |
tRNA‑Gln |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 695,815 | 0 | T | C | 97.8%
| 729.7
/ 3.8
| 225 | noncoding (25/75 nt) | glnV | tRNA‑Gln |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/3); new base C (85/135); total (87/138) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.31e-01 |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
CAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGAT > NC_000913/695726‑695904
|
cAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGcc < 1:4245024/93‑1 (MQ=255)
aCTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGGCGGAATCAGAATCCGGCGCCtt > 1:1626569/1‑93 (MQ=255)
cTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTa > 1:6217894/1‑93 (MQ=255)
tGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTAc < 2:5005102/93‑1 (MQ=255)
gggTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTAAGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTAcc > 2:5308216/1‑93 (MQ=255)
gTGCACTTACAAGGTAAGCATCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGc < 1:1745601/93‑1 (MQ=255)
tGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCt < 2:3024259/93‑1 (MQ=255)
gCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCtt < 2:6101249/93‑1 (MQ=255)
taCTTACAAGGTAAGCGGTTAGAATAAAGTCACTGAGGTACGAGGATTCGATCCTCGTAATGCCGGAATCAATATCCGGCGCCTTTCCGCTTg < 2:3169518/92‑1 (MQ=9)
cTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGc < 2:6278363/93‑1 (MQ=255)
cTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGc < 1:6117076/93‑1 (MQ=255)
cTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGc < 2:3479659/93‑1 (MQ=255)
ttACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCg > 1:5815347/1‑93 (MQ=255)
tACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGTGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGa < 1:2894596/93‑1 (MQ=255)
aCAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGAt > 2:3963643/1‑93 (MQ=255)
aCAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGAt < 2:6268912/93‑1 (MQ=255)
cAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATa < 1:72477/93‑1 (MQ=255)
cAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATa > 2:190920/1‑93 (MQ=255)
cAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATa > 1:914353/1‑93 (MQ=255)
aaGGTAAGCGTCTTTAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATAc < 2:2088650/93‑1 (MQ=255)
aGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATAcc > 1:6382180/1‑93 (MQ=255)
ggTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATAccc > 2:5335653/1‑93 (MQ=255)
gTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATAcccc > 1:5535677/1‑93 (MQ=255)
gTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATAcccc < 1:3582851/93‑1 (MQ=255)
gTAAGCATCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATAcccc < 1:710425/93‑1 (MQ=255)
tAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCca < 2:4682011/93‑1 (MQ=255)
aGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCcaac > 2:1213319/1‑93 (MQ=255)
aGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCcaac > 2:1872193/1‑93 (MQ=255)
gTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACaaa > 1:631445/1‑93 (MQ=255)
cTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAAtt < 1:3679090/93‑1 (MQ=255)
cTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAAtt > 2:2440252/1‑93 (MQ=255)
cTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAAtt > 1:2127181/1‑93 (MQ=255)
ttGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTg > 2:2256680/1‑93 (MQ=255)
ttGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTg < 1:1180639/93‑1 (MQ=255)
ttGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTg > 1:3208749/1‑93 (MQ=255)
tGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTgg < 2:5905668/93‑1 (MQ=255)
tGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTgg < 1:2909024/93‑1 (MQ=255)
gAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGt > 1:2759745/1‑93 (MQ=255)
aaTAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGtt > 1:1338730/1‑93 (MQ=255)
aTAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGttt < 2:912944/93‑1 (MQ=255)
tAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGtttt > 1:1877150/1‑93 (MQ=255)
tAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGtttt > 2:2902065/1‑93 (MQ=255)
tAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGtttt > 1:4343407/1‑93 (MQ=255)
tAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACACCAACAAATTGGtttt > 2:4801689/1‑93 (MQ=255)
aaTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGa > 2:1938451/1‑93 (MQ=255)
aTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGaa > 2:3325007/1‑93 (MQ=255)
ttGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAAt < 2:5430560/93‑1 (MQ=255)
gtGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAAt < 2:3279877/92‑1 (MQ=255)
ggCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAAttt > 1:4758548/1‑93 (MQ=255)
gCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTg < 1:403724/93‑1 (MQ=255)
tGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGcc < 1:4644850/93‑1 (MQ=255)
ggTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGaa < 2:1431792/93‑1 (MQ=255)
ggTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGaa < 2:177491/93‑1 (MQ=255)
tACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACa < 2:5194656/93‑1 (MQ=255)
tACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACa < 1:5378261/93‑1 (MQ=255)
tACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACa < 1:2228647/93‑1 (MQ=255)
aCGAGAATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATCCCCCAAAAAATTGTTTTTGAATTTGCCGAACat < 2:1555245/93‑1 (MQ=18)
gAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACatat < 1:5100762/93‑1 (MQ=255)
aGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATAtt < 2:5587402/93‑1 (MQ=255)
aGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATAtt > 1:2504422/1‑93 (MQ=255)
gATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCg > 1:2274976/1‑93 (MQ=255)
aTTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGa < 1:2017782/93‑1 (MQ=255)
ttCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGAt > 2:5153887/1‑93 (MQ=255)
ttCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGAt > 2:4892452/1‑93 (MQ=255)
ttCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGAt > 2:1096084/1‑93 (MQ=255)
tCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATa > 1:5033745/1‑93 (MQ=255)
gAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACa > 2:4332593/1‑93 (MQ=255)
aaCCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACAt > 1:3167894/1‑93 (MQ=255)
aCCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACAtt < 2:5943643/93‑1 (MQ=255)
aCCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACAtt < 2:3369351/93‑1 (MQ=255)
aCCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACAtt < 1:2413588/93‑1 (MQ=255)
ccTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTc < 2:4476920/93‑1 (MQ=255)
ccTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTc < 2:2804529/93‑1 (MQ=255)
ccTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTc < 1:3552964/93‑1 (MQ=255)
cTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCa < 1:5613591/93‑1 (MQ=255)
cTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCa < 1:4817900/93‑1 (MQ=255)
cGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGa < 1:4161674/93‑1 (MQ=255)
ggAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGaa < 2:5796535/93‑1 (MQ=255)
gAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAAt < 1:5661002/93‑1 (MQ=255)
aaTGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAAtt < 2:3073997/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAAttt > 1:3777629/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAAttt > 1:1020687/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTtg > 1:5347430/1‑93 (MQ=255)
ccGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTtggt < 2:4058471/93‑1 (MQ=255)
ccGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTtggt > 2:723229/1‑93 (MQ=255)
ccGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTtggt > 2:3854150/1‑93 (MQ=255)
cGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTtggtg < 1:4488113/93‑1 (MQ=255)
cGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTtggtg < 1:5464552/93‑1 (MQ=255)
cGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTtggtg < 1:452526/93‑1 (MQ=255)
ggAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTtggtgg < 2:4964119/93‑1 (MQ=255)
gAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGc > 1:3868180/1‑93 (MQ=255)
gAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGc < 2:1347576/93‑1 (MQ=255)
gAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCCTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGCATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGc > 2:4514153/1‑93 (MQ=255)
aTCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTa > 2:3561350/1‑93 (MQ=255)
tCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTac < 2:4752675/93‑1 (MQ=255)
aGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTacga < 1:3457709/93‑1 (MQ=255)
aGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTacga < 1:4575126/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACgg < 2:4736617/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACgg < 2:6428813/93‑1 (MQ=255)
ccGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGa < 2:5691922/93‑1 (MQ=255)
|
CAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGAT > NC_000913/695726‑695904
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGA > NC_000913/695723‑695908
|
CCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCG < SRR4302537.972140/94‑1 (MQ=60)
CCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCG > SRR4302537.4626659/1‑94 (MQ=60)
CCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCG < SRR4302537.845139/94‑1 (MQ=60)
CCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTTGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATTAGAATTCGGCGCC > SRR4302537.2198528/1‑94 (MQ=60)
CAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCT < SRR4302537.4274528/94‑1 (MQ=60)
AACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGGCGGAATCAGAATCCGGCGCCTT > SRR4302537.1637945/1‑94 (MQ=60)
AACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTT < SRR4302537.3781098/94‑1 (MQ=60)
ACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTA > SRR4302537.6260706/1‑94 (MQ=60)
CTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTAC > SRR4302537.3718815/1‑94 (MQ=60)
GGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGC > SRR4302537.3192556/1‑94 (MQ=60)
GTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCT > SRR4302537.4767910/1‑94 (MQ=60)
GTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCT < SRR4302537.782963/94‑1 (MQ=60)
GTGCACTTACAAGGTAAGCATCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCT < SRR4302537.1757775/94‑1 (MQ=60)
TGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTT < SRR4302537.2058186/94‑1 (MQ=60)
GCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTG < SRR4302537.3704862/94‑1 (MQ=60)
GCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTG < SRR4302537.4819965/94‑1 (MQ=60)
CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGG > SRR4302537.4663331/1‑94 (MQ=60)
ACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGA > SRR4302537.6246447/1‑94 (MQ=60)
CTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCG > SRR4302537.5855212/1‑94 (MQ=60)
CTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCG < SRR4302537.504937/94‑1 (MQ=60)
CTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCG > SRR4302537.1918754/1‑94 (MQ=60)
CTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCG < SRR4302537.6159116/94‑1 (MQ=60)
CTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCG < SRR4302537.6277130/94‑1 (MQ=60)
CTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCG > SRR4302537.3283851/1‑94 (MQ=60)
TACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGTGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGAT < SRR4302537.2914915/94‑1 (MQ=60)
ACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATA > SRR4302537.920665/1‑94 (MQ=60)
CAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATAC < SRR4302537.73009/94‑1 (MQ=58)
AAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACC > SRR4302537.6425687/1‑94 (MQ=55)
AGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCC < SRR4302537.2263683/94‑1 (MQ=53)
AGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCC > SRR4302537.2921947/1‑94 (MQ=53)
GGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCC > SRR4302537.5573464/1‑94 (MQ=50)
GGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCC > SRR4302537.4234566/1‑94 (MQ=50)
GTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCA > SRR4302537.3957425/1‑94 (MQ=48)
GTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCA < SRR4302537.3608106/94‑1 (MQ=48)
GTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCA > SRR4302537.1554570/1‑94 (MQ=48)
GTAAGCATCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCA < SRR4302537.715289/94‑1 (MQ=34)
TAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA > SRR4302537.465738/1‑94 (MQ=45)
TAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA < SRR4302537.3229452/94‑1 (MQ=45)
AGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACA < SRR4302537.1424228/94‑1 (MQ=43)
AGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACA < SRR4302537.243428/94‑1 (MQ=43)
AGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACA > SRR4302537.5123677/1‑94 (MQ=43)
CGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAA > SRR4302537.635737/1‑94 (MQ=43)
GTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAAT > SRR4302537.4110321/1‑94 (MQ=43)
GTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAAT < SRR4302537.6423038/94‑1 (MQ=43)
GTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAAT > SRR4302537.4550256/1‑94 (MQ=43)
TCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATT > SRR4302537.2142142/1‑94 (MQ=43)
CTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTG > SRR4302537.3231309/1‑94 (MQ=43)
CTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTG < SRR4302537.3704974/94‑1 (MQ=43)
TTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGG < SRR4302537.1188853/94‑1 (MQ=43)
TTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGG < SRR4302537.5964809/94‑1 (MQ=43)
TGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGT > SRR4302537.2779004/1‑94 (MQ=43)
TGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGT > SRR4302537.4085879/1‑94 (MQ=43)
TGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGT < SRR4302537.2408056/94‑1 (MQ=43)
TGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGT < SRR4302537.2929463/94‑1 (MQ=43)
GAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT > SRR4302537.1348054/1‑94 (MQ=43)
AATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTT < SRR4302537.3835352/94‑1 (MQ=43)
AATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTT < SRR4302537.5692083/94‑1 (MQ=43)
AATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTT < SRR4302537.3648098/94‑1 (MQ=43)
ATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTT > SRR4302537.4373528/1‑94 (MQ=43)
ATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTT > SRR4302537.1890207/1‑94 (MQ=43)
TAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTG > SRR4302537.837799/1‑94 (MQ=43)
AATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAA < SRR4302537.540183/94‑1 (MQ=43)
ATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAAT < SRR4302537.296364/94‑1 (MQ=43)
TTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATT < SRR4302537.4411296/94‑1 (MQ=43)
TGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTT > SRR4302537.4791414/1‑94 (MQ=43)
GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGC < SRR4302537.1231698/94‑1 (MQ=48)
GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGC < SRR4302537.406526/94‑1 (MQ=48)
CTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCC < SRR4302537.6472396/94‑1 (MQ=50)
CTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCC < SRR4302537.2880883/94‑1 (MQ=50)
TGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCG < SRR4302537.4676969/94‑1 (MQ=53)
TGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCG < SRR4302537.2613060/94‑1 (MQ=53)
GGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGA > SRR4302537.3868378/1‑94 (MQ=55)
GGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAGTGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAA > SRR4302537.2066309/1‑94 (MQ=55)
TACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACAT < SRR4302537.5415050/94‑1 (MQ=60)
TACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACAT < SRR4302537.2244362/94‑1 (MQ=60)
CGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATAT < SRR4302537.4460963/94‑1 (MQ=60)
GAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATT > SRR4302537.2522039/1‑94 (MQ=60)
GAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATT < SRR4302537.5135905/94‑1 (MQ=60)
GAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATT < SRR4302537.3505991/94‑1 (MQ=60)
AGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTC > SRR4302537.1137834/1‑94 (MQ=60)
GGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCG > SRR4302537.2291038/1‑94 (MQ=60)
GATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGA < SRR4302537.5596801/94‑1 (MQ=60)
ATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGAT < SRR4302537.2031850/94‑1 (MQ=60)
ATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGAT < SRR4302537.3586078/94‑1 (MQ=60)
TTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATA < SRR4302537.5914513/94‑1 (MQ=60)
TTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATA < SRR4302537.4591421/94‑1 (MQ=60)
TTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATA > SRR4302537.5068399/1‑94 (MQ=60)
GAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACAT > SRR4302537.3190146/1‑94 (MQ=60)
AACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATT < SRR4302537.3494684/94‑1 (MQ=60)
ACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTC > SRR4302537.541470/1‑94 (MQ=60)
ACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTC < SRR4302537.6365996/94‑1 (MQ=60)
ACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTC < SRR4302537.2430573/94‑1 (MQ=60)
CCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCA > SRR4302537.527683/1‑94 (MQ=60)
CCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCA < SRR4302537.3578049/94‑1 (MQ=60)
CTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAG < SRR4302537.5651973/94‑1 (MQ=60)
CTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAG < SRR4302537.4851168/94‑1 (MQ=60)
CGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAA < SRR4302537.4190738/94‑1 (MQ=60)
GGAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTTAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAAT < SRR4302537.717666/94‑1 (MQ=60)
GAATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATT < SRR4302537.5699742/94‑1 (MQ=60)
AATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTT > SRR4302537.1027720/1‑94 (MQ=60)
AATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTT > SRR4302537.3804155/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTG > SRR4302537.5384068/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAGCAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTG < SRR4302537.5492458/94‑1 (MQ=60)
GCCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGT > SRR4302537.5580776/1‑94 (MQ=60)
CCGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTG < SRR4302537.631089/94‑1 (MQ=60)
CGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGG < SRR4302537.455657/94‑1 (MQ=60)
CGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGG < SRR4302537.4519160/94‑1 (MQ=60)
CGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGG < SRR4302537.3179562/94‑1 (MQ=60)
CGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGG < SRR4302537.5501823/94‑1 (MQ=60)
CGGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGG < SRR4302537.1659784/94‑1 (MQ=60)
GGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGC > SRR4302537.3895250/1‑94 (MQ=60)
GGAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGC < SRR4302537.4311759/94‑1 (MQ=60)
GAATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCT < SRR4302537.2589302/94‑1 (MQ=60)
AATCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTA < SRR4302537.1888191/94‑1 (MQ=60)
TCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACG < SRR4302537.2272181/94‑1 (MQ=60)
TCAGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACG < SRR4302537.190657/94‑1 (MQ=60)
AGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC < SRR4302537.5701355/94‑1 (MQ=60)
AGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC < SRR4302537.3482154/94‑1 (MQ=60)
AGAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC < SRR4302537.4606791/94‑1 (MQ=60)
GAATCCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGCACATATTCGATACCTTCAGAATTTGGTGGCTACGACG > SRR4302537.5527726/1‑94 (MQ=60)
AATCCGGCGCCTTACAGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGG < SRR4302537.4875062/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATT > SRR4302537.2778423/1‑94 (MQ=60)
GGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGGCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTC > SRR4302537.6500884/1‑94 (MQ=60)
GCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCG < SRR4302537.4531704/94‑1 (MQ=60)
TGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGA > SRR4302537.4612205/1‑94 (MQ=60)
|
CCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGA > NC_000913/695723‑695908
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
