Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
949,435 |
A→G |
Y182C (TAT→TGT) |
ycaK → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 949,435 | 0 | A | G | 98.8%
| 859.5
/ ‑1.2
| 247 | Y182C (TAT→TGT) | ycaK | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/2); new base G (126/118); total (127/120) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.13e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.21e-01 |
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
TGTGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAA > NC_000913/949345‑949525
|
gtgCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCa < 1:5815816/93‑1 (MQ=255)
gtgCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCa < 1:1384771/93‑1 (MQ=255)
gtgCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCa < 1:5998810/93‑1 (MQ=255)
gtgCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCa < 2:5186767/93‑1 (MQ=255)
gCATTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCAATTTCTTGTGTAATACAGTTGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGt < 1:5149603/93‑1 (MQ=255)
gCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGt > 1:881378/1‑93 (MQ=255)
aGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCg > 1:1743727/1‑93 (MQ=255)
aGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCg > 2:6261/1‑93 (MQ=255)
aGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCg > 2:1303267/1‑93 (MQ=255)
aGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCg < 2:3495556/93‑1 (MQ=255)
gTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGt < 1:2153081/93‑1 (MQ=255)
ttATCTTGGTATTGAAGATGCCTATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGtt < 1:2562701/93‑1 (MQ=255)
ttATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGtt > 1:5562618/1‑93 (MQ=255)
aTCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGttat > 1:3726848/1‑93 (MQ=255)
tCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGttatt > 1:1952787/1‑93 (MQ=255)
tCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGttatt > 1:5515575/1‑93 (MQ=255)
cTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGttatta < 1:840823/93‑1 (MQ=255)
ttGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTtattat < 2:42380/93‑1 (MQ=255)
gTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTAtctc > 2:5054722/1‑93 (MQ=255)
gTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTAtctc < 2:5321270/93‑1 (MQ=255)
tATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGGGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGACCTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCa < 1:1444800/93‑1 (MQ=255)
aTTGAAGATGCTGATGTCTCTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAg < 2:3812342/93‑1 (MQ=255)
aTTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAg > 1:4292822/1‑93 (MQ=255)
gAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTa > 1:1069633/1‑93 (MQ=255)
aaGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTAc < 2:1495310/93‑1 (MQ=255)
aGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACg > 1:76106/1‑93 (MQ=255)
aGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACg < 1:2369188/93‑1 (MQ=255)
aGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACg > 1:5421032/1‑93 (MQ=255)
gATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACgg > 1:4087989/1‑93 (MQ=255)
gATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACgg > 1:6167668/1‑93 (MQ=255)
tGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGa > 2:5206705/1‑93 (MQ=255)
tGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGa < 2:3390546/93‑1 (MQ=255)
gCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGat < 2:2180924/93‑1 (MQ=255)
ccGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGata < 2:433354/93‑1 (MQ=255)
cGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGatat < 2:2507447/93‑1 (MQ=255)
cGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGatat < 2:4160853/93‑1 (MQ=255)
gATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATg < 1:5479302/93‑1 (MQ=255)
gATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATg < 2:4827778/93‑1 (MQ=255)
aTGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATgg < 2:1320914/93‑1 (MQ=255)
aTGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATgg > 2:1603362/1‑93 (MQ=255)
tGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGt > 1:3422393/1‑93 (MQ=255)
tGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGt > 2:5388728/1‑93 (MQ=255)
tGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGt > 2:3264125/1‑93 (MQ=255)
gTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTa > 1:4184228/1‑93 (MQ=255)
gTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTa < 2:3638712/93‑1 (MQ=255)
gTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTa < 2:5805660/93‑1 (MQ=255)
cTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATg < 1:4471516/93‑1 (MQ=255)
tCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCAc < 1:4985042/93‑1 (MQ=255)
tCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCAc < 2:3346934/93‑1 (MQ=255)
cTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACt > 1:5595051/1‑93 (MQ=255)
ttGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACta < 1:276110/93‑1 (MQ=255)
gtgtAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACtata > 1:3682308/1‑93 (MQ=255)
gtgtAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACtata < 2:6413099/93‑1 (MQ=255)
gtgtAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACtata > 2:1130632/1‑93 (MQ=255)
tgtAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATaa > 1:2954941/1‑93 (MQ=255)
gtAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAg > 1:6422844/1‑93 (MQ=255)
tAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGa > 1:3226334/1‑93 (MQ=255)
tAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGa < 2:2637753/93‑1 (MQ=255)
aaTACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGAt < 2:61475/93‑1 (MQ=255)
aTACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGAtg > 2:2080248/1‑93 (MQ=255)
aCAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGAtgtg > 1:5263643/1‑93 (MQ=255)
cAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATgtgt > 1:3152910/1‑93 (MQ=255)
cAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATgtgt < 2:5631104/93‑1 (MQ=255)
gTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTa > 2:3580533/1‑93 (MQ=255)
gTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTa > 1:1163418/1‑93 (MQ=255)
tGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTaa > 1:1834982/1‑93 (MQ=255)
tGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTaa < 2:1873559/93‑1 (MQ=255)
ggTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTaaa > 1:2719931/1‑93 (MQ=255)
ggTAATCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTaaa < 1:1943414/93‑1 (MQ=255)
tATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTaaaaa < 1:5079952/93‑1 (MQ=255)
ttCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACg > 1:491581/1‑93 (MQ=255)
aTGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGt < 1:3762782/93‑1 (MQ=255)
aTGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGt < 2:1249108/93‑1 (MQ=255)
tGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTa > 2:1203323/1‑93 (MQ=255)
tGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTa > 1:3498966/1‑93 (MQ=255)
tGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTa > 1:679510/1‑93 (MQ=255)
tGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTa < 1:2305635/93‑1 (MQ=255)
tGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTa > 2:2872759/1‑93 (MQ=255)
gggAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGc < 1:6325827/93‑1 (MQ=255)
gggAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGc > 2:4553013/1‑93 (MQ=255)
gaagaaCTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAg > 1:3861306/1‑93 (MQ=255)
aagaaCTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGa < 1:6255978/93‑1 (MQ=255)
gaaCTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAAt > 1:4687810/1‑93 (MQ=255)
gaaCTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAAt < 2:2101044/93‑1 (MQ=255)
aCTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGAGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGa > 1:4560709/1‑93 (MQ=255)
ttCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAg > 1:2636620/1‑93 (MQ=255)
ttCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAg > 2:1057258/1‑93 (MQ=255)
ttCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAg < 2:1723242/93‑1 (MQ=255)
tCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAgc > 2:2197804/1‑93 (MQ=255)
aCGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAgcgc < 2:2001919/93‑1 (MQ=255)
cgAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGa < 2:5527582/93‑1 (MQ=255)
aGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAAt > 2:464171/1‑93 (MQ=255)
aGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAAt < 1:5376038/93‑1 (MQ=255)
aGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAAt > 2:3927360/1‑93 (MQ=255)
gCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATa < 2:6478024/93‑1 (MQ=255)
gCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGAACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATa > 2:3159814/1‑93 (MQ=255)
attgtCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATaaaa > 2:5464099/1‑93 (MQ=255)
attgtCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATaaaa < 2:6226297/93‑1 (MQ=255)
attgtCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGAATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATaaaa < 1:4776082/93‑1 (MQ=255)
ttatCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATaaaaa < 2:907027/93‑1 (MQ=255)
|
TGTGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAA > NC_000913/949345‑949525
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATATGTGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGC > NC_000913/949342‑949528
|
ATATGTGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTG > SRR4302537.5111426/1‑94 (MQ=60)
TATGTGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGT > SRR4302537.932915/1‑94 (MQ=60)
TATGTGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGT > SRR4302537.666455/1‑94 (MQ=60)
ATGTGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTC > SRR4302537.2685554/1‑94 (MQ=60)
ATGTGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTC > SRR4302537.4648477/1‑94 (MQ=60)
ATGTGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTC < SRR4302537.5546745/94‑1 (MQ=60)
ATGTGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTC < SRR4302537.91889/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAG < SRR4302537.5855683/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAG < SRR4302537.1394429/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAG < SRR4302537.6040017/94‑1 (MQ=60)
TGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGT > SRR4302537.887440/1‑94 (MQ=60)
GCATTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCAATTTCTTGTGTAATACAGTTGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTC < SRR4302537.5185091/94‑1 (MQ=60)
CAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCG > SRR4302537.1755883/1‑94 (MQ=60)
CAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCG > SRR4302537.3620054/1‑94 (MQ=60)
CAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCG < SRR4302537.1933270/94‑1 (MQ=60)
GTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTT > SRR4302537.5600630/1‑94 (MQ=60)
GTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTT > SRR4302537.723773/1‑94 (MQ=60)
GTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTT < SRR4302537.2168259/94‑1 (MQ=60)
TTATCTTGGTATTGAAGATGCCTATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTA < SRR4302537.2580653/94‑1 (MQ=60)
TATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTAT > SRR4302537.6304029/1‑94 (MQ=60)
TATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTAT > SRR4302537.6233871/1‑94 (MQ=60)
TATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTAT > SRR4302537.3753030/1‑94 (MQ=60)
TATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTAT > SRR4302537.5137410/1‑94 (MQ=60)
TATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTAT < SRR4302537.5417382/94‑1 (MQ=60)
ATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATT > SRR4302537.1966370/1‑94 (MQ=60)
ATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATT < SRR4302537.4954588/94‑1 (MQ=60)
ATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATT > SRR4302537.5553235/1‑94 (MQ=60)
CTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTAT < SRR4302537.846582/94‑1 (MQ=60)
GTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCA > SRR4302537.2203808/1‑94 (MQ=60)
GTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCA > SRR4302537.5540119/1‑94 (MQ=60)
GTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCA < SRR4302537.2075307/94‑1 (MQ=60)
GTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCA < SRR4302537.2587758/94‑1 (MQ=60)
GTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCA > SRR4302537.1896364/1‑94 (MQ=60)
TATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAG > SRR4302537.875524/1‑94 (MQ=60)
TATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAG > SRR4302537.4322659/1‑94 (MQ=60)
TATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGGGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGACCTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAG < SRR4302537.1454864/94‑1 (MQ=60)
ATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGG > SRR4302537.815189/1‑94 (MQ=60)
ATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGG < SRR4302537.1441763/94‑1 (MQ=60)
ATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGG < SRR4302537.2544192/94‑1 (MQ=60)
ATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTAACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGG > SRR4302537.3712816/1‑94 (MQ=60)
TGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTA < SRR4302537.4130713/94‑1 (MQ=60)
TGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTA > SRR4302537.1077008/1‑94 (MQ=60)
GAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTAC > SRR4302537.4010267/1‑94 (MQ=60)
GAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTAC > SRR4302537.5753240/1‑94 (MQ=60)
AAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACG > SRR4302537.5457972/1‑94 (MQ=60)
AAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACG > SRR4302537.76667/1‑94 (MQ=60)
AGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGG < SRR4302537.3198489/94‑1 (MQ=60)
AGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGG > SRR4302537.4116539/1‑94 (MQ=60)
AGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGG > SRR4302537.6210138/1‑94 (MQ=60)
AGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGG < SRR4302537.2385886/94‑1 (MQ=60)
GATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGG < SRR4302537.6412159/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGAT > SRR4302537.3136697/1‑94 (MQ=60)
CCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATAT < SRR4302537.834014/94‑1 (MQ=60)
CCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATAT < SRR4302537.66315/94‑1 (MQ=60)
CGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATG < SRR4302537.4871188/94‑1 (MQ=60)
GATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGG < SRR4302537.5516712/94‑1 (MQ=60)
ATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGT > SRR4302537.4195242/1‑94 (MQ=60)
ATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGT < SRR4302537.4291713/94‑1 (MQ=60)
ATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGT > SRR4302537.3446622/1‑94 (MQ=60)
TGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTA > SRR4302537.4213440/1‑94 (MQ=60)
TGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTA > SRR4302537.3262816/1‑94 (MQ=60)
GTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAG < SRR4302537.2703949/94‑1 (MQ=60)
TACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGAT < SRR4302537.5709116/94‑1 (MQ=60)
CACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGAT > SRR4302537.1389384/1‑94 (MQ=60)
CTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGC < SRR4302537.4502446/94‑1 (MQ=60)
TTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCAC > SRR4302537.2871720/1‑94 (MQ=60)
TCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACT < SRR4302537.5019402/94‑1 (MQ=60)
TCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACT < SRR4302537.2567509/94‑1 (MQ=60)
TCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACT > SRR4302537.5633307/1‑94 (MQ=60)
CTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTA > SRR4302537.6250130/1‑94 (MQ=60)
CTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTA < SRR4302537.588785/94‑1 (MQ=60)
CTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTA > SRR4302537.5595466/1‑94 (MQ=60)
TTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTAT < SRR4302537.278043/94‑1 (MQ=60)
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TGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATA > SRR4302537.3708206/1‑94 (MQ=60)
TGTGTAATACAGTGCTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATA < SRR4302537.3186135/94‑1 (MQ=60)
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TGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAG < SRR4302537.1531800/94‑1 (MQ=60)
TGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAG > SRR4302537.6466497/1‑94 (MQ=60)
GGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAG < SRR4302537.5170172/94‑1 (MQ=60)
GTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGA > SRR4302537.3249038/1‑94 (MQ=60)
TAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGAT < SRR4302537.6452165/94‑1 (MQ=60)
ATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGT < SRR4302537.3766247/94‑1 (MQ=60)
TACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTG > SRR4302537.2278239/1‑94 (MQ=60)
TACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTG > SRR4302537.1077960/1‑94 (MQ=60)
TACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTG > SRR4302537.5299865/1‑94 (MQ=60)
ACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGT < SRR4302537.2344629/94‑1 (MQ=60)
ACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGT > SRR4302537.3175048/1‑94 (MQ=60)
CAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTT < SRR4302537.4718192/94‑1 (MQ=60)
AGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTA > SRR4302537.1171506/1‑94 (MQ=60)
AGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTA < SRR4302537.4822011/94‑1 (MQ=60)
AGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGACGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTA > SRR4302537.4588953/1‑94 (MQ=60)
AGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGATATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTA > SRR4302537.5509968/1‑94 (MQ=60)
GTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAA > SRR4302537.5062670/1‑94 (MQ=60)
GTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAA > SRR4302537.1847757/1‑94 (MQ=60)
TGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAA > SRR4302537.2738929/1‑94 (MQ=60)
GGTAATCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAA < SRR4302537.1956926/94‑1 (MQ=60)
GTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAA < SRR4302537.5595378/94‑1 (MQ=60)
TATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAAC < SRR4302537.5114922/94‑1 (MQ=60)
TATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAAC > SRR4302537.3955120/1‑94 (MQ=60)
ATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACG > SRR4302537.494961/1‑94 (MQ=60)
ATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACG > SRR4302537.4764729/1‑94 (MQ=60)
ATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACG > SRR4302537.3448252/1‑94 (MQ=60)
ATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGCACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACG > SRR4302537.3848242/1‑94 (MQ=60)
CGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTG > SRR4302537.182226/1‑94 (MQ=60)
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TGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAG < SRR4302537.5352964/94‑1 (MQ=60)
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GGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCA < SRR4302537.6369095/94‑1 (MQ=60)
GGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCA > SRR4302537.2895954/1‑94 (MQ=60)
GGAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAG > SRR4302537.3888334/1‑94 (MQ=60)
GAAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGA < SRR4302537.2771030/94‑1 (MQ=60)
AAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAA > SRR4302537.5496874/1‑94 (MQ=60)
AAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAA < SRR4302537.6298949/94‑1 (MQ=60)
AAGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAA > SRR4302537.5943713/1‑94 (MQ=60)
AGAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAAT > SRR4302537.4720240/1‑94 (MQ=60)
GAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATG > SRR4302537.6106576/1‑94 (MQ=60)
GAACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATG > SRR4302537.4452814/1‑94 (MQ=60)
AACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGA > SRR4302537.3339267/1‑94 (MQ=60)
AACTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGAGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGA > SRR4302537.4592275/1‑94 (MQ=60)
CTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAG > SRR4302537.5222917/1‑94 (MQ=60)
CTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAG > SRR4302537.2148264/1‑94 (MQ=60)
CTTCACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAG > SRR4302537.2655067/1‑94 (MQ=60)
CACGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGC < SRR4302537.698507/94‑1 (MQ=60)
CGCGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGG > SRR4302537.5055691/1‑94 (MQ=60)
CGAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAA > SRR4302537.1187013/1‑94 (MQ=60)
GAGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAAT < SRR4302537.4354483/94‑1 (MQ=60)
AGCTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATA < SRR4302537.5412820/94‑1 (MQ=60)
CTATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAA < SRR4302537.1958698/94‑1 (MQ=60)
ATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAA > SRR4302537.714229/1‑94 (MQ=60)
ATTGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGAATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAA < SRR4302537.4809054/94‑1 (MQ=60)
TGTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAG > SRR4302537.6058541/1‑94 (MQ=60)
GTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGC < SRR4302537.1743059/94‑1 (MQ=60)
GTCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGC < SRR4302537.5274125/94‑1 (MQ=60)
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ATATGTGCAGTTATCTTGGTATTGAAGATGCCGATGTCACTTTCTTGTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGC > NC_000913/949342‑949528
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
