Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,026,175 |
A→G |
V166V (GTA→GTG) |
ygfR → |
putative oxidoreductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,026,175 | 0 | A | G | 100.0%
| 656.8
/ NA
| 189 | V166V (GTA→GTG) | ygfR | putative oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (64/125); total (64/125) |
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
CGGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTAGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTACGT > NC_000913/3026085‑3026264
|
cGGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGt < 2:899924/93‑1 (MQ=255)
ggCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCgtggtg < 1:3801499/93‑1 (MQ=255)
gCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGtggtgg > 2:5877737/1‑93 (MQ=255)
gCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGtggtgg < 1:544922/93‑1 (MQ=255)
gCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGtggtgg < 2:3899811/93‑1 (MQ=255)
gCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGtggtgg > 2:2674242/1‑93 (MQ=255)
gCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGGAAAACAGGTTTAACCGCAACCGtggtgg > 1:4764309/1‑93 (MQ=255)
ccTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGACGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTggg > 2:1813007/1‑93 (MQ=255)
ccTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATAGCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTggg < 2:1641398/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTgggg < 2:3264164/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTgggg < 2:2548059/93‑1 (MQ=255)
tggtggGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTggggg < 1:4581550/93‑1 (MQ=255)
gtggGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCg < 1:6449280/93‑1 (MQ=255)
gggCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGtt < 2:5271766/93‑1 (MQ=255)
gggCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGtt > 2:5058819/1‑93 (MQ=255)
gggCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGtt < 2:5829043/93‑1 (MQ=255)
gcgcAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAAGCGCCGCCCGGGGGAAAACAGGGTTAACCGCAACCGGGGGGGGGGCGTTAt > 2:48881/1‑93 (MQ=255)
cgcAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTAtt < 1:3170256/93‑1 (MQ=255)
gcAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTc < 1:2712223/93‑1 (MQ=255)
aGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCt < 2:5105463/93‑1 (MQ=255)
gcgcCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTg < 1:5737398/93‑1 (MQ=255)
cgcCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGt < 1:2855177/93‑1 (MQ=255)
cccGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTa > 2:382871/1‑93 (MQ=255)
ccGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTaa > 2:4543229/1‑93 (MQ=255)
cGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAAt > 2:738425/1‑93 (MQ=255)
gCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAAtt < 2:5773252/93‑1 (MQ=255)
ccAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAAtt < 1:2252531/92‑1 (MQ=255)
cAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTc < 2:2586121/93‑1 (MQ=255)
cAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTc > 2:1627286/1‑93 (MQ=255)
cAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTc > 1:5962755/1‑93 (MQ=255)
aGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCt < 1:4404597/93‑1 (MQ=255)
gCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTg > 1:1400836/1‑93 (MQ=255)
gCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTg > 1:3616220/1‑93 (MQ=255)
cGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGt > 2:5514552/1‑93 (MQ=255)
ggTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGtt > 2:4879284/1‑93 (MQ=255)
ggTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGtt < 1:1803138/93‑1 (MQ=255)
gTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGttt > 1:2144064/1‑93 (MQ=255)
tttATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGtttt < 2:689600/93‑1 (MQ=255)
tttATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGtttt < 1:1563683/93‑1 (MQ=255)
tttATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGtttt > 2:5134429/1‑93 (MQ=255)
tttATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGtttt < 1:5553178/93‑1 (MQ=255)
ttATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGttttt < 1:4132043/93‑1 (MQ=255)
tataTCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTa < 1:6340824/93‑1 (MQ=255)
tataTCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTa < 1:2423125/93‑1 (MQ=255)
tataTCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGGTTAACCGCAACCGTGGGGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTa > 1:103747/1‑93 (MQ=255)
tatCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATc < 2:6132775/93‑1 (MQ=255)
tatCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATc < 1:561412/93‑1 (MQ=255)
tatCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATc < 1:4182618/93‑1 (MQ=255)
tCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCAc < 1:3922843/93‑1 (MQ=255)
tCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCAc < 2:2482168/93‑1 (MQ=255)
cGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCAcc < 2:2054640/93‑1 (MQ=255)
gAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCg > 1:1966674/1‑93 (MQ=255)
aaTCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGc < 1:2394186/93‑1 (MQ=255)
aaTCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGc < 1:1978397/93‑1 (MQ=255)
tCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCCCCCCTg > 2:2847642/1‑93 (MQ=255)
tCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTg > 2:1937546/1‑93 (MQ=255)
gCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCa < 1:3018339/93‑1 (MQ=255)
ggCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCAtt < 2:4313044/93‑1 (MQ=255)
ggCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCAtt < 1:3794933/93‑1 (MQ=255)
gCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTGTTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCAttt > 1:5842867/1‑93 (MQ=255)
gCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCAttt > 2:226685/1‑93 (MQ=255)
gCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCAttt < 2:1847493/93‑1 (MQ=255)
cAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCAtttt > 1:554471/1‑93 (MQ=255)
aGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCAttttt > 1:4344199/1‑93 (MQ=255)
aGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCAttttt > 1:5108342/1‑93 (MQ=255)
gAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGa < 2:2933106/93‑1 (MQ=255)
aaCCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGAt > 2:358785/1‑93 (MQ=255)
aaCCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGAt < 1:1474359/93‑1 (MQ=255)
aaCCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGAt < 1:5484550/93‑1 (MQ=255)
ccgccgccgGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATGTTTGATcc < 2:6329803/93‑1 (MQ=255)
cgccgccgGTGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATccc < 1:2550846/93‑1 (MQ=255)
cgccgccgGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATccc < 2:1412718/93‑1 (MQ=255)
gccgccgGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCt < 2:5159242/93‑1 (MQ=255)
gccgccgGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGGTATTCCTGTTAATTCTTTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCt > 1:5198640/1‑93 (MQ=255)
cccgccgGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCt < 1:3240414/92‑1 (MQ=255)
gccgGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGt < 2:4707953/93‑1 (MQ=255)
gccgGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGt < 2:2194113/93‑1 (MQ=255)
gccgGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGt < 2:3783842/93‑1 (MQ=255)
cgGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTa > 2:4918325/1‑93 (MQ=255)
tAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCAc < 1:3349155/93‑1 (MQ=255)
aaaCAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTg < 1:2330152/93‑1 (MQ=255)
aaCAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGc < 2:3123468/93‑1 (MQ=255)
aaCAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGc < 2:4512338/93‑1 (MQ=255)
cAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCAc > 2:54194/1‑93 (MQ=255)
aGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCAcc < 2:3669606/93‑1 (MQ=255)
aGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCAcc < 1:3569735/93‑1 (MQ=255)
gTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCg > 1:2911865/1‑93 (MQ=255)
ttAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGct < 2:4046901/93‑1 (MQ=255)
tAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGctc < 1:1235915/93‑1 (MQ=255)
tAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGctc < 1:429063/93‑1 (MQ=255)
aaCCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGctct > 2:1052300/1‑93 (MQ=255)
ccGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGa < 2:5640767/93‑1 (MQ=255)
ccGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGa > 1:792562/1‑93 (MQ=255)
cAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATGACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGt > 1:3461883/1‑93 (MQ=255)
aaCCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTa > 1:491976/1‑93 (MQ=255)
aCCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTAc < 2:4111741/93‑1 (MQ=255)
ccGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTACg > 1:5769795/1‑93 (MQ=255)
ccGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTACg < 2:6028141/93‑1 (MQ=255)
cGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTACGt > 1:4653152/1‑93 (MQ=255)
cGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTACGt < 1:2509570/93‑1 (MQ=255)
|
CGGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTAGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTACGT > NC_000913/3026085‑3026264
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTCCGGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTAGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTACGTAGGT > NC_000913/3026082‑3026268
|
CTCCGGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTACAACAGGTTTAACCGCAACCGTG > SRR4302537.4918040/1‑94 (MQ=60)
CTCCGGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTG < SRR4302537.5996797/94‑1 (MQ=60)
CTCCGGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTG < SRR4302537.1912794/94‑1 (MQ=60)
CTCCGGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGGAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTG > SRR4302537.4996613/1‑94 (MQ=60)
TCCGGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGG < SRR4302537.4304291/94‑1 (MQ=60)
CCGGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGTAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGAAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGT < SRR4302537.2786429/94‑1 (MQ=60)
CCGGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGT < SRR4302537.4469361/94‑1 (MQ=60)
CCGGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGT < SRR4302537.2088829/94‑1 (MQ=60)
CGGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTG < SRR4302537.4502374/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGG < SRR4302537.3828170/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGGAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGG > SRR4302537.4797214/1‑94 (MQ=60)
GCCTGGTGGGCGCAGCGCGCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGG < SRR4302537.4631965/94‑1 (MQ=60)
GCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGG < SRR4302537.548667/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGG > SRR4302537.4166037/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGG < SRR4302537.5543414/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGTGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGC < SRR4302537.3052620/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGC < SRR4302537.4613243/94‑1 (MQ=60)
GGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCG < SRR4302537.6495359/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGT < SRR4302537.6493020/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATT < SRR4302537.4154948/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTC < SRR4302537.3192529/94‑1 (MQ=60)
GCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCC < SRR4302537.2731165/94‑1 (MQ=60)
AGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTG > SRR4302537.2972113/1‑94 (MQ=60)
GCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGT > SRR4302537.4997879/1‑94 (MQ=60)
GCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGT < SRR4302537.5776681/94‑1 (MQ=60)
ggcaCGCAGCGGTGTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTT < SRR4302537.1455066/90‑1 (MQ=60)
CGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTT < SRR4302537.2875192/94‑1 (MQ=60)
GCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAAGCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGGTTAACCGCAACCGAGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTA > SRR4302537.2384466/1‑94 (MQ=60)
CCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAA < SRR4302537.1883230/94‑1 (MQ=60)
GCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTC > SRR4302537.6003682/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTC < SRR4302537.2268431/94‑1 (MQ=60)
CAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCT < SRR4302537.5621924/94‑1 (MQ=60)
AGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGGATCGGCGCCCGGGGTAAAACAGGTGTAACCGCAACCGTGGTGGCGGCGTgtctcctgctaattatg > SRR4302537.1856701/1‑77 (MQ=45)
AGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTG < SRR4302537.4434988/94‑1 (MQ=60)
AGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTG > SRR4302537.3641717/1‑94 (MQ=60)
AGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTG > SRR4302537.1410597/1‑94 (MQ=60)
GGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTT > SRR4302537.2159149/1‑94 (MQ=60)
GGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTT < SRR4302537.1815720/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTT > SRR4302537.6501813/1‑94 (MQ=60)
GTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTT > SRR4302537.225047/1‑94 (MQ=60)
TTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTT < SRR4302537.2453404/94‑1 (MQ=60)
TTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTT < SRR4302537.1574592/94‑1 (MQ=60)
TTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTT < SRR4302537.5591097/94‑1 (MQ=60)
TTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTA < SRR4302537.4160880/94‑1 (MQ=60)
TTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGGTTAACCGCAACCGTGGGGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTA > SRR4302537.104496/1‑94 (MQ=60)
TTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGGAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGCGGGGGCGTTATTCCTGTTGATTCTGTTTTTA > SRR4302537.5964637/1‑94 (MQ=60)
TATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTAT < SRR4302537.2440196/94‑1 (MQ=60)
TATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTAT < SRR4302537.2910044/94‑1 (MQ=60)
TATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTAT < SRR4302537.6384150/94‑1 (MQ=60)
ATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATC < SRR4302537.4928408/94‑1 (MQ=60)
TATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCA < SRR4302537.4211821/94‑1 (MQ=60)
TATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCA < SRR4302537.565276/94‑1 (MQ=60)
TCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACC < SRR4302537.3950254/94‑1 (MQ=60)
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AATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCT < SRR4302537.2411048/94‑1 (MQ=60)
AATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCT < SRR4302537.1992144/94‑1 (MQ=60)
GCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCAT < SRR4302537.3039381/94‑1 (MQ=60)
GGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTGTTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTT > SRR4302537.5882929/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTT > SRR4302537.3639494/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTT < SRR4302537.3821565/94‑1 (MQ=60)
GCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTT > SRR4302537.558288/1‑94 (MQ=60)
CAGGACCCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTT < SRR4302537.120709/94‑1 (MQ=60)
CAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTT > SRR4302537.5143543/1‑94 (MQ=60)
CAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTT > SRR4302537.4374326/1‑94 (MQ=60)
AGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTG < SRR4302537.1524735/94‑1 (MQ=60)
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AGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTG > SRR4302537.4262458/1‑94 (MQ=60)
AGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTG < SRR4302537.2566117/94‑1 (MQ=60)
GGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGA > SRR4302537.5682721/1‑94 (MQ=60)
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GCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTT < SRR4302537.3353965/94‑1 (MQ=60)
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GTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCAC > SRR4302537.2426640/1‑94 (MQ=60)
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CAGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACC > SRR4302537.4360110/1‑94 (MQ=60)
AGGTTTAACCGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCC < SRR4302537.3594907/94‑1 (MQ=60)
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CGCAACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATG > SRR4302537.1607206/1‑94 (MQ=60)
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AACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTAC > SRR4302537.3794348/1‑94 (MQ=60)
ACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTACG < SRR4302537.3395766/94‑1 (MQ=60)
ACCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTACG > SRR4302537.5809342/1‑94 (MQ=60)
CCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTACGT < SRR4302537.5927737/94‑1 (MQ=60)
CCGTGGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTACGT > SRR4302537.4685329/1‑94 (MQ=60)
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GGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTACGTAGGT > SRR4302537.5352689/1‑94 (MQ=60)
AGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTACGTAGGT > SRR4302537.323403/1‑94 (MQ=60)
|
CTCCGGCCTGGTGGGCGCAGCGCCCGCAGCGGTTTATATCGAATCAGCGGCAGGAACCGCCGCCGGGGGTAAAACAGGTTTAACCGCAACCGTAGTGGGGGCGTTATTCCTGTTAATTCTGTTTTTATCACCGCTGTCATTTTTGATCCCTGGTTACGCCACTGCACCCGCTCTGATGTACGTAGGT > NC_000913/3026082‑3026268
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
