Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,032,764 |
C→T |
R144H (CGT→CAT) |
lysS ← |
lysine tRNA synthetase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,032,764 | 0 | C | T | 100.0%
| 765.7
/ NA
| 214 | R144H (CGT→CAT) | lysS | lysine tRNA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (99/115); total (99/115) |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
AGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGACGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCATTTT > NC_000913/3032674‑3032853
|
agatCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGc > 1:603918/1‑93 (MQ=255)
gatCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCa < 2:3315009/93‑1 (MQ=255)
atCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCaa < 1:5440302/93‑1 (MQ=255)
tCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAAc < 2:2741458/93‑1 (MQ=255)
cGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACt < 1:2745472/93‑1 (MQ=255)
gagaTAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTc < 1:102577/93‑1 (MQ=255)
agaTAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCg < 2:5102713/93‑1 (MQ=255)
agaTAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCg > 1:1193944/1‑93 (MQ=255)
agaTAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCg < 2:1983588/93‑1 (MQ=255)
gaTAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCgg < 1:2082831/93‑1 (MQ=255)
gaTAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCgg < 2:6082771/93‑1 (MQ=255)
aTAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGt > 1:4055383/1‑93 (MQ=255)
aaCGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGc < 2:4735702/93‑1 (MQ=255)
aCGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCa > 1:5194471/1‑93 (MQ=255)
aCGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCa < 2:5891527/93‑1 (MQ=255)
gCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGt < 2:2678803/93‑1 (MQ=255)
gCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACACGGTGCAGt < 1:5849373/93‑1 (MQ=255)
cTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTg > 2:5851149/1‑93 (MQ=255)
tGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTgg > 1:2673362/1‑93 (MQ=255)
gACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGa < 1:4669452/93‑1 (MQ=255)
gACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGa > 1:1653107/1‑93 (MQ=255)
aCGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGAt < 1:6366063/93‑1 (MQ=255)
cGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATa > 2:2879453/1‑93 (MQ=255)
gATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAg > 1:760598/1‑93 (MQ=255)
gATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAg < 1:399179/93‑1 (MQ=255)
gATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAg > 2:4177317/1‑93 (MQ=255)
tAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGAc > 2:3038359/1‑93 (MQ=255)
tAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGAc > 2:5635793/1‑93 (MQ=255)
tAGCGCGCTGCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGAc < 2:3863110/93‑1 (MQ=255)
gcgcgcTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAg < 1:3498133/93‑1 (MQ=255)
cgcgcTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGt < 2:3378998/93‑1 (MQ=255)
cgcgcTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGATCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGt < 1:3318573/93‑1 (MQ=255)
gcgcTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGtt < 1:5542419/93‑1 (MQ=255)
gcgcTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGtt < 1:1076284/93‑1 (MQ=255)
cTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGc < 2:5258216/93‑1 (MQ=255)
ttCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGcc > 1:817438/1‑93 (MQ=255)
tCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGCTAGACAGTTCGCCg > 1:5334019/1‑93 (MQ=255)
cTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggt < 1:1542286/93‑1 (MQ=255)
cTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggt > 2:1352521/1‑93 (MQ=255)
cTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGT‑GATAGACAGTTCGCCgggt > 2:233377/1‑91 (MQ=255)
gATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggttt < 1:5042755/93‑1 (MQ=255)
aTCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTTGATAGACAGTTCGCCggtttt > 1:6423658/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggtttt > 1:1782463/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggtttt > 1:1982/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggtttt > 1:5943109/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggtttt > 1:4334071/1‑93 (MQ=255)
tCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggttttg > 2:4453589/1‑93 (MQ=255)
tCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggttttg > 1:6102166/1‑93 (MQ=255)
tCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggttttg > 1:1300373/1‑93 (MQ=255)
ccTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggttttgg < 2:2402465/93‑1 (MQ=255)
cTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggttttggt < 2:2539756/93‑1 (MQ=255)
cTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggttttggt > 2:2326091/1‑93 (MQ=255)
gCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggttttggttt > 1:3210070/1‑93 (MQ=255)
cAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggttttggtttt < 2:3214093/93‑1 (MQ=255)
cAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCggttttggtttt < 1:4963021/93‑1 (MQ=255)
aaGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGgttttggttttg > 1:1563638/1‑93 (MQ=255)
gCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGaa > 1:4099218/1‑93 (MQ=255)
cGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACa < 2:1315044/93‑1 (MQ=255)
tGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGc < 2:4962375/93‑1 (MQ=255)
tGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGc < 2:4310202/93‑1 (MQ=255)
ggAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCt < 2:2996162/93‑1 (MQ=255)
gAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCtt > 2:2806651/1‑93 (MQ=255)
aaTTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTa < 2:903393/93‑1 (MQ=255)
aTTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTAc > 2:5834489/1‑93 (MQ=255)
aTTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTAc > 1:940659/1‑93 (MQ=255)
tttATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTAcc > 2:822179/1‑93 (MQ=255)
ttATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCt < 2:641337/93‑1 (MQ=255)
ttATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCt < 1:450664/93‑1 (MQ=255)
ttATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCt < 2:3750196/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCttt < 1:3592165/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCttt < 1:3806856/93‑1 (MQ=255)
tCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTc < 2:2251574/93‑1 (MQ=255)
tCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTc < 1:1414946/93‑1 (MQ=255)
ccGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTcg > 1:3895980/1‑93 (MQ=255)
cGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTcgc > 1:2796056/1‑93 (MQ=255)
cGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTcgc > 2:1706479/1‑93 (MQ=255)
gCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCgcgc > 1:5845890/1‑93 (MQ=255)
gCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGa < 1:2886058/93‑1 (MQ=255)
gACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGa < 1:4262804/93‑1 (MQ=255)
gCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGt > 2:6178418/1‑93 (MQ=255)
cAGCGCTTTGGCCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACCGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTCCCTTTCGCGCCGAGGATGTc < 1:23665/93‑1 (MQ=255)
aGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCg > 1:2187361/1‑93 (MQ=255)
gTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGc < 2:4514015/93‑1 (MQ=255)
tGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGcc > 2:3254957/1‑93 (MQ=255)
tGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGcc > 1:502113/1‑93 (MQ=255)
gCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCg < 2:4601698/93‑1 (MQ=255)
gCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCg > 1:4806708/1‑93 (MQ=255)
gCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACACCTTACCTTTCCCGCCGACGATGTCGCCg > 1:5644189/1‑93 (MQ=255)
tttGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAg < 1:489901/93‑1 (MQ=255)
tttGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAg > 2:360713/1‑93 (MQ=255)
ttGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAgg > 2:5056707/1‑93 (MQ=255)
ttGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAgg > 1:5287710/1‑93 (MQ=255)
gTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTcc < 1:2928640/93‑1 (MQ=255)
cagcagATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCa > 1:1992215/1‑93 (MQ=255)
agcagATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCAt > 2:6369313/1‑93 (MQ=255)
gcagATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCAtt < 1:1907689/93‑1 (MQ=255)
gcagATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCAtt > 2:3651674/1‑93 (MQ=255)
gcagATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCAtt > 1:3271157/1‑93 (MQ=255)
gcagATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCAtt < 2:141826/93‑1 (MQ=255)
agATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCAtttt > 2:1196858/1‑93 (MQ=255)
|
AGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGACGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCATTTT > NC_000913/3032674‑3032853
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATGAGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGACGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCATTTTTTGA > NC_000913/3032671‑3032857
|
ATTAGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGAT < SRR4302537.2685978/94‑1 (MQ=60)
ATGAGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGAT > SRR4302537.5078371/1‑94 (MQ=60)
ATGAGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGAT > SRR4302537.2491241/1‑94 (MQ=60)
ATGAGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGAT > SRR4302537.2550698/1‑94 (MQ=60)
TGAGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATG > SRR4302537.6441500/1‑94 (MQ=60)
TGAGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATG < SRR4302537.2514511/94‑1 (MQ=60)
TGAGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATG < SRR4302537.1004887/94‑1 (MQ=60)
GAGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGC > SRR4302537.608047/1‑94 (MQ=60)
AGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCA > SRR4302537.4780688/1‑94 (MQ=60)
AGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCA > SRR4302537.1948910/1‑94 (MQ=60)
AGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCA > SRR4302537.6432423/1‑94 (MQ=60)
AGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCA < SRR4302537.2229605/94‑1 (MQ=60)
GAACGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAA < SRR4302537.5057774/94‑1 (MQ=60)
ATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAAC < SRR4302537.5477412/94‑1 (MQ=60)
tcagGATAACGCTGACGAGAGCGCGCTTCCTGATCCGGCAAGCCGTGGAATTGATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACT < SRR4302537.112433/90‑1 (MQ=60)
TCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACT < SRR4302537.3028932/94‑1 (MQ=60)
TCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACT < SRR4302537.5657459/94‑1 (MQ=60)
CGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTC < SRR4302537.2764621/94‑1 (MQ=60)
CGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTC > SRR4302537.6132126/1‑94 (MQ=60)
GAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCG < SRR4302537.3791264/94‑1 (MQ=60)
GAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCG < SRR4302537.103316/94‑1 (MQ=60)
GAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCG > SRR4302537.1202233/1‑94 (MQ=60)
GAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCG < SRR4302537.1762449/94‑1 (MQ=60)
AGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGG > SRR4302537.79892/1‑94 (MQ=60)
AGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGG < SRR4302537.5230425/94‑1 (MQ=60)
GATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGT > SRR4302537.4083726/1‑94 (MQ=60)
GATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGT < SRR4302537.2097500/94‑1 (MQ=60)
ATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTG < SRR4302537.1554639/94‑1 (MQ=60)
ATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTG > SRR4302537.3017055/1‑94 (MQ=60)
ATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTG < SRR4302537.929391/94‑1 (MQ=60)
ATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTG < SRR4302537.4179481/94‑1 (MQ=60)
ATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTG < SRR4302537.4644373/94‑1 (MQ=60)
TAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGAGGAATTTATCCGGCAGCGGACGTAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGC > SRR4302537.2978006/1‑94 (MQ=60)
AACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCA > SRR4302537.5798740/1‑94 (MQ=60)
AACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCA > SRR4302537.5230181/1‑94 (MQ=60)
GCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACACGGTGCAGTG < SRR4302537.5889489/94‑1 (MQ=60)
CTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGG > SRR4302537.2692032/1‑94 (MQ=60)
TGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGA > SRR4302537.1664696/1‑94 (MQ=60)
GACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGAT < SRR4302537.4222837/94‑1 (MQ=60)
GACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGAT < SRR4302537.4701757/94‑1 (MQ=60)
ACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATA < SRR4302537.6409482/94‑1 (MQ=60)
CGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAG < SRR4302537.6217416/94‑1 (MQ=60)
CGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAG > SRR4302537.765797/1‑94 (MQ=60)
GATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGA < SRR4302537.401947/94‑1 (MQ=60)
ATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGAC < SRR4302537.4932688/94‑1 (MQ=60)
AGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAG < SRR4302537.5337657/94‑1 (MQ=60)
GCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGT < SRR4302537.3522885/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGATCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTT < SRR4302537.3342050/94‑1 (MQ=60)
GCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTC < SRR4302537.1083700/94‑1 (MQ=60)
GCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTC < SRR4302537.1639718/94‑1 (MQ=60)
GCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTC < SRR4302537.5580264/94‑1 (MQ=60)
GCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGC < SRR4302537.1073932/94‑1 (MQ=60)
CTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCC > SRR4302537.823053/1‑94 (MQ=60)
CTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCC > SRR4302537.1294319/1‑94 (MQ=60)
TTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGCTAGACAGTTCGCCG > SRR4302537.5370598/1‑94 (MQ=60)
TCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGG < SRR4302537.5886156/94‑1 (MQ=60)
CCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGT > SRR4302537.5276799/1‑94 (MQ=60)
CTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTT < SRR4302537.1553053/94‑1 (MQ=60)
GATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTTGATAGACAGTTCGCCGGTTTT > SRR4302537.6467312/1‑94 (MQ=60)
GATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTT > SRR4302537.1794886/1‑94 (MQ=60)
GATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTT < SRR4302537.5077483/94‑1 (MQ=60)
GATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTT > SRR4302537.1995/1‑94 (MQ=60)
GATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTT > SRR4302537.4364173/1‑94 (MQ=60)
GATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTT > SRR4302537.1443439/1‑94 (MQ=60)
GATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTT > SRR4302537.5983895/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTG > SRR4302537.6144092/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTG > SRR4302537.2770322/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTG > SRR4302537.1309414/1‑94 (MQ=60)
TCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGG > SRR4302537.1467027/1‑94 (MQ=60)
CCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGT < SRR4302537.2930201/94‑1 (MQ=60)
CCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGCTCGCCGGTTTTGGT > SRR4302537.1331549/1‑94 (MQ=60)
TGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTT > SRR4302537.3232642/1‑94 (MQ=60)
CAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTG > SRR4302537.1574547/1‑94 (MQ=60)
CAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTG < SRR4302537.4997231/94‑1 (MQ=60)
CAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTG < SRR4302537.4362643/94‑1 (MQ=60)
CAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTG < SRR4302537.2881840/94‑1 (MQ=60)
AGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAA > SRR4302537.4127835/1‑94 (MQ=60)
CCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACA > SRR4302537.2172754/1‑94 (MQ=60)
CCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACA > SRR4302537.2068171/1‑94 (MQ=60)
CGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAG > SRR4302537.4848043/1‑94 (MQ=60)
CGAGGAATTTTTCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCGGGTTTTGGTTTTGAACAG < SRR4302537.5703956/94‑1 (MQ=60)
GTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGC > SRR4302537.2678419/1‑94 (MQ=60)
GGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTT < SRR4302537.330889/94‑1 (MQ=60)
AATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTAC > SRR4302537.947146/1‑94 (MQ=60)
AATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTAC < SRR4302537.183697/94‑1 (MQ=60)
AATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTAC < SRR4302537.3533596/94‑1 (MQ=60)
TTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTT < SRR4302537.453781/94‑1 (MQ=60)
TTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGCCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTT < SRR4302537.5020131/94‑1 (MQ=60)
TATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTT < SRR4302537.5756929/94‑1 (MQ=60)
ATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTC > SRR4302537.2739750/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTC < SRR4302537.3617488/94‑1 (MQ=60)
ATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTC < SRR4302537.3833547/94‑1 (MQ=60)
TCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCG < SRR4302537.1424795/94‑1 (MQ=60)
TCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCG > SRR4302537.3923215/1‑94 (MQ=60)
CCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGC < SRR4302537.6208303/94‑1 (MQ=60)
CCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGC > SRR4302537.2815604/1‑94 (MQ=60)
CGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCG < SRR4302537.3715525/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCG < SRR4302537.4015326/94‑1 (MQ=60)
GGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGC > SRR4302537.5885973/1‑94 (MQ=60)
GCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAG < SRR4302537.3917252/94‑1 (MQ=60)
GCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAG < SRR4302537.2906315/94‑1 (MQ=60)
GGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGA < SRR4302537.3267202/94‑1 (MQ=60)
GACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGAT < SRR4302537.4292426/94‑1 (MQ=60)
ACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATG > SRR4302537.6520364/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGT < SRR4302537.4956248/94‑1 (MQ=60)
CGCAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGT < SRR4302537.5560633/94‑1 (MQ=60)
CAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCG > SRR4302537.2202770/1‑94 (MQ=60)
CAGTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCG > SRR4302537.5891529/1‑94 (MQ=60)
CAGCGCTTTGGCCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACCGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTCCCTTTCGCGCCGAGGATGTCG < SRR4302537.23849/94‑1 (MQ=60)
GTGCTTTGGTCAGCAGATGCAAGTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCC < SRR4302537.200273/94‑1 (MQ=60)
GTGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCC > SRR4302537.505563/1‑94 (MQ=60)
TGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCG > SRR4302537.4839860/1‑94 (MQ=60)
TGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCG > SRR4302537.1972408/1‑94 (MQ=60)
TGCTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACACCTTACCTTTCCCGCCGACGATGTCGCCG > SRR4302537.5682819/1‑94 (MQ=60)
CTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAG < SRR4302537.5431068/94‑1 (MQ=60)
CTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAG > SRR4302537.5159327/1‑94 (MQ=60)
CTTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTCGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAG < SRR4302537.5818351/94‑1 (MQ=60)
CTTTGGTCAGCAGAGGCAAATGGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAG < SRR4302537.4503849/94‑1 (MQ=60)
TTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGG < SRR4302537.493265/94‑1 (MQ=60)
TTTGGTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGG > SRR4302537.5324063/1‑94 (MQ=60)
GTCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCC < SRR4302537.2949207/94‑1 (MQ=60)
TCAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCA > SRR4302537.2006064/1‑94 (MQ=60)
CAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCAT > SRR4302537.1418669/1‑94 (MQ=60)
CAGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCAT < SRR4302537.4101398/94‑1 (MQ=60)
AGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCATT > SRR4302537.2459939/1‑94 (MQ=60)
AGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCATT > SRR4302537.3294243/1‑94 (MQ=60)
AGCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCATT < SRR4302537.3515252/94‑1 (MQ=60)
GCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCATTT < SRR4302537.4051399/94‑1 (MQ=60)
GCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCATTT < SRR4302537.1920938/94‑1 (MQ=60)
GCAGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGCTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGGCCCATCT > SRR4302537.6034948/1‑94 (MQ=60)
AGATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCATTTTT > SRR4302537.2112825/1‑94 (MQ=60)
GATGCAACGCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCATTTTTT < SRR4302537.263492/94‑1 (MQ=60)
ATGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCATTTTTTG > SRR4302537.217668/1‑94 (MQ=60)
TGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCATTTTTTGA > SRR4302537.5095290/1‑94 (MQ=60)
|
ATGAGATCGAGATAACGCTGACGATAGCGCGCTTCCTGATCCTGCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAGCGGACGCAGTGCTTTGGTCAGCAGACGCAACTCGGTGCAGTGGATAGACAGTTCGCCGGTTTTGGTTTTGAACAGCTTACCTTTCGCGCCGAGGATGTCGCCGAGGTCCCATTTTTTGA > NC_000913/3032671‑3032857
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
