Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,087,418 |
A→G |
V372V (GTA→GTG) |
galP → |
galactose‑proton symport of transport system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,087,418 | 0 | A | G | 100.0%
| 794.3
/ NA
| 232 | V372V (GTA→GTG) | galP | galactose‑proton symport of transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (130/102); total (130/102) |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
TCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTT > NC_000913/3087328‑3087505
|
cACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCtg < 1:5233560/93‑1 (MQ=255)
cctctCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCtgt < 2:3735266/92‑1 (MQ=255)
ctctCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCtgtg > 2:597181/1‑93 (MQ=255)
ctctCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCtgtg > 1:4442704/1‑93 (MQ=255)
ctctCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGATGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCtgtg < 1:6180274/93‑1 (MQ=255)
tctcCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGc > 2:3854562/1‑93 (MQ=255)
tctcCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGc > 1:5897663/1‑93 (MQ=255)
gctcCGTCTCCGCAGTATTTCGCGGTCGGCATGCGGCTGATGTTTATTGGCGGTCGTGTCATGATAGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGc > 2:6139646/2‑93 (MQ=255)
ctcCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGgtgctgtgct > 2:3103741/1‑93 (MQ=255)
tcCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGATc > 1:5042472/1‑93 (MQ=255)
ccGTCGGCGCAGTATTTCGTCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTcc > 1:903925/1‑93 (MQ=255)
cGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCg < 1:5633741/93‑1 (MQ=255)
gTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGACGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGa > 2:3253146/1‑93 (MQ=255)
tCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGaa > 2:1581470/1‑93 (MQ=255)
cGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGaaa < 2:1895600/93‑1 (MQ=255)
ggCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAAt > 2:586386/1‑93 (MQ=255)
ggCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAAt > 1:4241837/1‑93 (MQ=255)
gcgcAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAAtt < 2:1994534/93‑1 (MQ=255)
cgcAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTc < 2:1199185/93‑1 (MQ=255)
cgcAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTc < 2:3488242/93‑1 (MQ=255)
cgcAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTc > 2:4701614/1‑93 (MQ=255)
gcAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCa > 2:3009462/1‑93 (MQ=255)
cAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAg > 1:5775917/1‑93 (MQ=255)
aGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGc < 1:1099793/93‑1 (MQ=255)
gTATTCCGCCATCGCCATGCGGCTGATGTTTATTGTCGGTTGTGCCATGAGTGCGGGTCGGCTGATTGGGGTGCTGTGCTGCGAAATTCAGcc < 2:2723079/93‑1 (MQ=255)
tATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCg > 2:2190786/1‑93 (MQ=255)
aTTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGGGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGc > 1:335167/1‑93 (MQ=255)
ttCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTg < 2:1362218/93‑1 (MQ=255)
tcgccatcgccaTGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGa > 1:4317103/1‑93 (MQ=255)
tcgccatcgccaTGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGa < 1:5285240/93‑1 (MQ=255)
gccatcgccatGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCTCTGaaa < 2:5370894/93‑1 (MQ=255)
gccatcgccatGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGaaa < 1:4825352/93‑1 (MQ=255)
ccatcgccatGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGACAg > 2:3630276/1‑93 (MQ=255)
ccatcgccatGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAg < 2:4591693/93‑1 (MQ=255)
atcgccatGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGc > 1:4589493/1‑93 (MQ=255)
tcgccatGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGcc < 2:3263343/93‑1 (MQ=255)
tcgccatGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGcc > 1:5555322/1‑93 (MQ=255)
cgccatGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCcg < 2:4262108/93‑1 (MQ=255)
ccatGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCcgcg > 1:2679032/1‑93 (MQ=255)
catGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGa < 1:3969860/93‑1 (MQ=255)
catGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGa > 1:2012545/1‑93 (MQ=255)
catGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGa > 1:1638170/1‑93 (MQ=255)
catGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGa > 2:5799050/1‑93 (MQ=255)
tgctgcTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGAtt < 1:6406350/93‑1 (MQ=255)
tgctgcTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGAtt > 1:716383/1‑93 (MQ=255)
tgctgcTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGAtt < 1:1671577/93‑1 (MQ=255)
gctgctGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGAttt < 2:3435772/93‑1 (MQ=255)
ctgctgATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGAtttt > 1:2951587/1‑93 (MQ=255)
ctgctgATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGAtttt > 1:1776126/1‑93 (MQ=255)
tgctgATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTg > 2:5838351/1‑93 (MQ=255)
tgctgATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTg > 2:4864602/1‑93 (MQ=255)
tgATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCa > 1:1690583/1‑93 (MQ=255)
gATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGCCAt > 1:804635/1‑93 (MQ=255)
aTGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATc < 1:1008202/93‑1 (MQ=255)
aTGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATc > 2:2284614/1‑93 (MQ=255)
tGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCa < 2:1481395/93‑1 (MQ=255)
gTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCAc > 2:4066819/1‑93 (MQ=255)
tttATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTCGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCAcc > 2:443348/1‑93 (MQ=255)
ttATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCGGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCt < 2:2929623/93‑1 (MQ=255)
ttGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCt > 1:5075186/1‑93 (MQ=255)
ttGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCt < 1:1875632/93‑1 (MQ=255)
ttGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCt < 2:5191596/93‑1 (MQ=255)
tGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTc < 2:749212/93‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCAc < 2:895368/93‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCAc < 1:1953625/93‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCAc < 1:6030359/93‑1 (MQ=255)
ttttGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGc > 1:3653857/1‑93 (MQ=255)
ttttGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGc < 2:1681545/93‑1 (MQ=255)
ttttGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGc > 2:3656794/1‑93 (MQ=255)
ttttGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGc < 2:4419500/93‑1 (MQ=255)
tttGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGcc > 1:5822676/1‑93 (MQ=255)
tGCCATGAGGGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTGGGCATCACCTGCTCCACTGccac < 1:285802/93‑1 (MQ=255)
ccATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGccacca > 1:2246414/1‑93 (MQ=255)
aTGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAAc < 1:4710875/93‑1 (MQ=255)
aTGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAAc > 1:2410055/1‑93 (MQ=255)
tGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACt > 2:5196370/1‑93 (MQ=255)
tGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACt < 2:5927524/93‑1 (MQ=255)
gAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTg < 1:4476530/93‑1 (MQ=255)
gAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTg > 1:1153201/1‑93 (MQ=255)
gAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTg < 2:2097982/93‑1 (MQ=255)
tGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGAt < 1:6369045/93‑1 (MQ=255)
tCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCaa < 1:2459547/93‑1 (MQ=255)
cGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCTCCAACTGGATTGCCAACa > 2:4845152/1‑93 (MQ=255)
gCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACAt > 1:3479821/1‑93 (MQ=255)
gCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACAt < 1:5316534/93‑1 (MQ=255)
cTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATg < 2:3933416/93‑1 (MQ=255)
cTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATg < 2:1798058/93‑1 (MQ=255)
tGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGa < 1:6291484/93‑1 (MQ=255)
tGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGa > 1:6259706/1‑93 (MQ=255)
tGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGa > 2:1316608/1‑93 (MQ=255)
gATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGAt > 2:5603792/1‑93 (MQ=255)
aTTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATc > 1:3701472/1‑93 (MQ=255)
aTTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATc > 2:2578243/1‑93 (MQ=255)
aTTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATc > 1:1513615/1‑93 (MQ=255)
aTTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATc < 1:2650365/93‑1 (MQ=255)
tttggTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTCGATTTACAACATGATCGt > 2:2446596/4‑93 (MQ=25)
ttGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGt < 1:937937/93‑1 (MQ=255)
ttGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGt < 2:6291512/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGtt < 2:453959/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGtt < 2:2644450/93‑1 (MQ=255)
|
TCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTT > NC_000913/3087328‑3087505
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCA > NC_000913/3087326‑3087511
|
ATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGC < SRR4302537.6022636/94‑1 (MQ=60)
TTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCT > SRR4302537.4194712/1‑94 (MQ=60)
TTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCT < SRR4302537.491676/94‑1 (MQ=60)
TCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTG > SRR4302537.3644583/1‑94 (MQ=60)
CACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGT < SRR4302537.5269562/94‑1 (MQ=60)
ACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTG > SRR4302537.4473389/1‑94 (MQ=60)
ACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTG < SRR4302537.2656001/94‑1 (MQ=60)
CTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGC > SRR4302537.5938130/1‑94 (MQ=60)
CTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGATGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGC < SRR4302537.6222845/94‑1 (MQ=60)
TCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCT > SRR4302537.584170/1‑94 (MQ=60)
CTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTC < SRR4302537.2603668/94‑1 (MQ=60)
CTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTC > SRR4302537.5329466/1‑94 (MQ=60)
CTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGATC > SRR4302537.5077195/1‑94 (MQ=60)
TCCGTCGGCGCAGTATTTCGTCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCC > SRR4302537.910163/1‑94 (MQ=60)
TCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTGC > SRR4302537.519782/1‑94 (MQ=60)
TCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCC > SRR4302537.4350695/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGA < SRR4302537.5672288/94‑1 (MQ=60)
GTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAA > SRR4302537.1980092/1‑94 (MQ=60)
TCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAA < SRR4302537.4178585/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAAT > SRR4302537.4271330/1‑94 (MQ=60)
CGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAAT < SRR4302537.6325431/94‑1 (MQ=60)
GGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATT > SRR4302537.840179/1‑94 (MQ=60)
GCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTC < SRR4302537.2377806/94‑1 (MQ=60)
GCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGCTGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAG < SRR4302537.6259602/94‑1 (MQ=60)
GCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAG > SRR4302537.5815508/1‑94 (MQ=60)
AGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCC < SRR4302537.5576078/94‑1 (MQ=60)
AGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCC < SRR4302537.1107391/94‑1 (MQ=60)
TATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGGGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGC > SRR4302537.337485/1‑94 (MQ=60)
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TCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAA < SRR4302537.5321584/94‑1 (MQ=60)
CGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGACA > SRR4302537.1782126/1‑94 (MQ=60)
CGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAA < SRR4302537.5224387/94‑1 (MQ=60)
GCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGTGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAG > SRR4302537.1917236/1‑94 (MQ=60)
GCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAG < SRR4302537.4858681/94‑1 (MQ=60)
CCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGG > SRR4302537.4781144/1‑94 (MQ=60)
CCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGG < SRR4302537.6103425/94‑1 (MQ=60)
CATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGC > SRR4302537.3376046/1‑94 (MQ=60)
CATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGC > SRR4302537.2688429/1‑94 (MQ=60)
CATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGC < SRR4302537.4525632/94‑1 (MQ=60)
CATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGC > SRR4302537.4621232/1‑94 (MQ=60)
CATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGC > SRR4302537.1976579/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCC > SRR4302537.5593251/1‑94 (MQ=60)
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CGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGC > SRR4302537.4410652/1‑94 (MQ=60)
GCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCG > SRR4302537.2697737/1‑94 (MQ=60)
CCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGA > SRR4302537.2026573/1‑94 (MQ=60)
CCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGA > SRR4302537.1649647/1‑94 (MQ=60)
CCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGA > SRR4302537.2881616/1‑94 (MQ=60)
CATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGAT < SRR4302537.3997640/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATT > SRR4302537.721276/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTACGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATT > SRR4302537.1090596/1‑94 (MQ=60)
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TGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTT < SRR4302537.1683282/94‑1 (MQ=60)
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GCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTT > SRR4302537.2972299/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTG > SRR4302537.5307098/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTG < SRR4302537.1707742/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTG > SRR4302537.1321082/1‑94 (MQ=60)
gcgtgTGTTTATTGTCGGTTTTCCCATGAGTCCCGGTCCGGTGAGTTGGGTGCCGTGCTCCGAAATTTAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGC < SRR4302537.3973535/89‑1 (MQ=60)
CTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCA > SRR4302537.1702418/1‑94 (MQ=60)
TGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCAC > SRR4302537.492928/1‑94 (MQ=60)
TGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGCCAT > SRR4302537.810159/1‑94 (MQ=60)
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TGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCTCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCAC > SRR4302537.638817/1‑94 (MQ=60)
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ATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCT > SRR4302537.5104427/1‑94 (MQ=60)
ATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCT > SRR4302537.3883793/1‑94 (MQ=60)
TTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTC < SRR4302537.1888679/94‑1 (MQ=60)
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CGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACT < SRR4302537.1967215/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGC > SRR4302537.3679572/1‑94 (MQ=60)
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TGCCATGAGGGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTGGGCATCACCTGCTCCACTGCCACC < SRR4302537.287794/94‑1 (MQ=60)
GCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCA > SRR4302537.2262266/1‑94 (MQ=60)
GCCATGAGTGCCGGTCCGCCGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCA > SRR4302537.4672117/1‑94 (MQ=60)
CCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAA > SRR4302537.1122414/1‑94 (MQ=60)
CCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAA > SRR4302537.859589/1‑94 (MQ=60)
CCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAA > SRR4302537.3708700/1‑94 (MQ=60)
CATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAAC > SRR4302537.2427025/1‑94 (MQ=60)
ATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACT > SRR4302537.4638896/1‑94 (MQ=60)
ATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACT > SRR4302537.370818/1‑94 (MQ=60)
ATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACT > SRR4302537.1814779/1‑94 (MQ=60)
ATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACT < SRR4302537.4743466/94‑1 (MQ=60)
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TGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTG > SRR4302537.5765711/1‑94 (MQ=60)
GAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGG < SRR4302537.4507496/94‑1 (MQ=60)
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GCCGGTCCGCTTATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTG < SRR4302537.765838/94‑1 (MQ=60)
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GTCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAA < SRR4302537.1568201/94‑1 (MQ=60)
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TCCGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAAC < SRR4302537.2476844/94‑1 (MQ=60)
CGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACAT > SRR4302537.3243660/1‑94 (MQ=60)
CGCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACAT > SRR4302537.3504441/1‑94 (MQ=60)
GCTGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATG < SRR4302537.5353040/94‑1 (MQ=60)
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TGATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGAT < SRR4302537.6334597/94‑1 (MQ=60)
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TATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATC > SRR4302537.1524191/1‑94 (MQ=60)
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GATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATC > SRR4302537.3727509/1‑94 (MQ=60)
ATTTGGGTGCTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCG < SRR4302537.2668904/94‑1 (MQ=60)
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ATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCA > NC_000913/3087326‑3087511
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
