Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC |
NC_000913 |
3,156,257 |
(CCA)2→1 |
coding (594‑596/930 nt) |
yqhG → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 3156256 | 1 (0.000) | 274 (1.120) |
126/178 |
0.2 |
99.6% |
coding (593/930 nt) |
yqhG |
hypothetical protein |
| ? | NC_000913 |
3156260 = |
1 (0.000) | coding (597/930 nt) |
yqhG |
hypothetical protein |
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
AAAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3156162‑3156256
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATC > NC_000913/3156260‑3156351
AAAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGC > 1:1542170/1‑93
AAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCC > 2:4635635/1‑93
AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA > 1:1585379/1‑93
CAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCG < 1:1293099/93‑1
GCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGT > 1:3091164/1‑93
GCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGT < 2:2878647/93‑1
GCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGT < 1:1209221/93‑1
CCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTT < 1:3240985/93‑1
CGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGGTA > 2:554720/1‑93
GGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAA > 1:4515036/1‑93
GAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAAT > 1:5729651/1‑93
GAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAAT > 2:1906313/1‑93
GAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAAT > 1:4284891/1‑93
GAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAAT < 2:3548687/93‑1
AAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTGCGACTCTTACAGCCAGGCGGTTAATG > 1:79489/1‑93
AAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATG > 2:6443663/1‑93
AAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATG > 2:4911690/1‑93
AGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGC > 2:3812094/1‑93
AGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGC > 1:5002678/1‑93
GCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCC > 1:6023243/1‑93
GCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCC > 1:377491/1‑93
CTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTT < 1:4132358/93‑1
TTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTC > 2:2973231/1‑93
TTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTC < 2:1548337/93‑1
TGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTA < 2:6043137/93‑1
TGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTA < 2:2099059/93‑1
GTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTAT < 2:1304988/93‑1
TTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATA < 2:3393532/93‑1
TTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATA > 1:285486/1‑93
GCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAA > 1:3026265/1‑93
GCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCAGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAA > 1:5863686/1‑93
GAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACC > 1:1098251/1‑93
GAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACC > 1:6139958/1‑93
GAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACC > 2:1682138/1‑93
AACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCA < 1:2773408/93‑1
AACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCA < 2:2264869/93‑1
CTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACC < 2:4806431/93‑1
CTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACC < 1:2944792/93‑1
TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCT < 1:538072/93‑1
TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCT > 1:2098103/1‑93
TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGAGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCT > 2:3236919/1‑93
CTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTT > 2:4564369/1‑93
TGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAA < 2:4866101/93‑1
TGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAA < 2:824577/93‑1
AACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGA > 2:3723942/1‑93
AACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGA < 1:1700115/93‑1
ATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGG > 1:2523143/1‑93
TTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCA < 2:5049259/93‑1
TTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCA < 2:2120274/93‑1
TGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAA < 1:1846406/93‑1
CTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATA < 1:6060903/93‑1
CTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATA > 1:3587644/1‑93
CTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATA > 1:5906902/1‑93
TGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAA > 1:290855/1‑93
GATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAAT > 1:5282313/1‑93
ATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATC < 1:1014490/93‑1
ATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATC < 1:924685/93‑1
TTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCC > 2:1189826/1‑93
TTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCC > 2:6341117/1‑93
TTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTGCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCC < 2:5146255/93‑1
TATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCC > 2:1819169/1‑93
TATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCC > 2:764951/1‑93
TAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGA < 1:4938814/93‑1
TAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGA < 1:4673247/93‑1
AGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGAT < 2:4783632/93‑1
AGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGAT < 2:4439630/93‑1
GCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATG < 1:5100701/93‑1
GCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATG > 2:5379667/1‑93
GCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATG > 1:3493870/1‑93
CTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGA > 2:5804437/1‑93
TGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTGAATGCCTTCTATAAACCCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAA < 2:3560431/93‑1
CGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATA > 2:1142276/1‑93
CGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATA > 2:3165804/1‑93
GTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATAT < 1:3879024/93‑1
TGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATG > 1:367912/1‑93
TGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATG > 2:4418899/1‑93
GACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCA > 2:5206568/1‑93
ACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAA > 2:4219191/1‑93
CGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAA < 2:2220198/93‑1
CGTGGGTGGTTGCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAA < 2:1361650/93‑1
TGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATA < 1:4322323/93‑1
GGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAG < 1:6005537/93‑1
GTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAA < 2:5949103/93‑1
GGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACG > 1:5624003/1‑93
GTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGG < 2:5306259/93‑1
TCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTGAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAA < 1:4189068/93‑1
TCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAA < 2:5025939/93‑1
TCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAA < 2:2624448/93‑1
GACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTT > 2:4390903/1‑93
ACTCTTACCGCCATGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTA > 1:1914864/1‑93
ACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTA > 1:4615385/1‑93
ACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTA < 2:6198934/93‑1
TCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATT > 2:2372468/1‑93
CTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTT > 1:6410600/1‑93
TTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAACTCCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTA < 1:2476383/93‑1
TTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTA < 1:5932740/93‑1
TTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTA > 2:3474385/1‑93
TACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTAC < 2:2299035/93‑1
TACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTAC > 2:2473418/1‑93
AGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATC > 1:4724585/1‑93
AAAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3156162‑3156256
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATC > NC_000913/3156260‑3156351
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAT > NC_000913/3156164‑3156350
|
AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAG < SRR4302537.5259177/94‑1 (MQ=60)
AGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGT > SRR4302537.3112725/1‑94 (MQ=60)
CCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTA < SRR4302537.3263827/94‑1 (MQ=60)
CGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAA > SRR4302537.4546258/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAAT > SRR4302537.4314676/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAAT > SRR4302537.4339361/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAAT > SRR4302537.5768874/1‑94 (MQ=60)
GAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTGCGACTCTTACAG‑‑‑CCAGGCGGTTAATG > SRR4302537.80072/1‑94 (MQ=60)
GAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATG < SRR4302537.4200210/94‑1 (MQ=60)
AAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGC < SRR4302537.5909299/94‑1 (MQ=60)
AAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGC > SRR4302537.5037138/1‑94 (MQ=60)
AGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCC > SRR4302537.6064625/1‑94 (MQ=60)
AGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCC > SRR4302537.380109/1‑94 (MQ=60)
AGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCC > SRR4302537.3905164/1‑94 (MQ=60)
AGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCC > SRR4302537.263940/1‑94 (MQ=60)
CCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTT < SRR4302537.1566413/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTT < SRR4302537.3581768/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTT < SRR4302537.3057035/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTT < SRR4302537.2410587/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTT > SRR4302537.6023129/1‑94 (MQ=60)
CTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTC < SRR4302537.3173690/94‑1 (MQ=60)
CTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTC < SRR4302537.4161198/94‑1 (MQ=60)
CTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTC > SRR4302537.4477446/1‑94 (MQ=60)
CTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTC > SRR4302537.1262487/1‑94 (MQ=60)
TTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCT < SRR4302537.2916655/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTA < SRR4302537.197414/94‑1 (MQ=60)
GTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATA > SRR4302537.397290/1‑94 (MQ=60)
GTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATA < SRR4302537.6110905/94‑1 (MQ=60)
GTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATA > SRR4302537.287475/1‑94 (MQ=60)
TGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAA > SRR4302537.3047362/1‑94 (MQ=60)
TGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCAGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAA > SRR4302537.5903904/1‑94 (MQ=60)
CCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAAC > SRR4302537.6097941/1‑94 (MQ=60)
CGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACC > SRR4302537.6182174/1‑94 (MQ=60)
CGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACC > SRR4302537.1105839/1‑94 (MQ=60)
GAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCA > SRR4302537.1823074/1‑94 (MQ=60)
AACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCAC < SRR4302537.2792792/94‑1 (MQ=60)
AACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCAC < SRR4302537.5915586/94‑1 (MQ=60)
ACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATACAAACACC > SRR4302537.5724384/1‑94 (MQ=60)
ACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACC > SRR4302537.4217826/1‑94 (MQ=60)
ACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACC > SRR4302537.3976281/1‑94 (MQ=60)
CTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCT > SRR4302537.2112902/1‑94 (MQ=60)
CTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCT < SRR4302537.2965460/94‑1 (MQ=60)
TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTT > SRR4302537.3245981/1‑94 (MQ=60)
TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTT < SRR4302537.541762/94‑1 (MQ=60)
TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTT > SRR4302537.1875414/1‑94 (MQ=60)
TTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCA < SRR4302537.2513927/94‑1 (MQ=60)
GAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGA < SRR4302537.3797762/94‑1 (MQ=60)
AACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAC < SRR4302537.1712001/94‑1 (MQ=60)
CATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGG > SRR4302537.3098403/1‑94 (MQ=60)
CATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGG > SRR4302537.2540858/1‑94 (MQ=60)
CATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGCTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGG > SRR4302537.171913/1‑94 (MQ=60)
ATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGC < SRR4302537.719245/94‑1 (MQ=60)
TATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCC < SRR4302537.936991/94‑1 (MQ=60)
TATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCC < SRR4302537.1146553/94‑1 (MQ=60)
TGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAAT < SRR4302537.1859252/94‑1 (MQ=60)
TGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAAT > SRR4302537.5486792/1‑94 (MQ=60)
GCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATA < SRR4302537.4992474/94‑1 (MQ=60)
GCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATA > SRR4302537.3612936/1‑94 (MQ=60)
GCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATA > SRR4302537.5947433/1‑94 (MQ=60)
CTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAA < SRR4302537.2403522/94‑1 (MQ=60)
CTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAA < SRR4302537.6102545/94‑1 (MQ=60)
CTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAA > SRR4302537.5277931/1‑94 (MQ=60)
CTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAA > SRR4302537.292881/1‑94 (MQ=60)
TGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAAT > SRR4302537.389556/1‑94 (MQ=60)
TGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAAT > SRR4302537.5318644/1‑94 (MQ=60)
TGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAAT > SRR4302537.635075/1‑94 (MQ=60)
GATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATC < SRR4302537.6059648/94‑1 (MQ=60)
GATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATC > SRR4302537.5972692/1‑94 (MQ=60)
GATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATC > SRR4302537.887781/1‑94 (MQ=60)
GATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATC > SRR4302537.5856883/1‑94 (MQ=60)
GTTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCTCCTTCAAGACGGCCAATAATCC < SRR4302537.4315167/94‑1 (MQ=60)
ATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCC < SRR4302537.1021477/94‑1 (MQ=60)
ATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCC > SRR4302537.2926406/1‑94 (MQ=60)
ATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCC < SRR4302537.931064/94‑1 (MQ=60)
TTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCC < SRR4302537.1435081/94‑1 (MQ=60)
TATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCG < SRR4302537.2759905/94‑1 (MQ=60)
TATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCG < SRR4302537.1668390/94‑1 (MQ=60)
ATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGA > SRR4302537.1601726/1‑94 (MQ=60)
ATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGA > SRR4302537.6079549/1‑94 (MQ=60)
TAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGAT < SRR4302537.4972877/94‑1 (MQ=60)
TAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGAT < SRR4302537.4705579/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATG > SRR4302537.3518590/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATG < SRR4302537.3581034/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATG > SRR4302537.4571915/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGA < SRR4302537.5135844/94‑1 (MQ=60)
CTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAA < SRR4302537.5794849/94‑1 (MQ=60)
TGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAG < SRR4302537.6030170/94‑1 (MQ=60)
TGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAG < SRR4302537.5061432/94‑1 (MQ=60)
CCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATA < SRR4302537.2818806/94‑1 (MQ=60)
CGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATAT < SRR4302537.502515/94‑1 (MQ=60)
CGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATAT < SRR4302537.3040520/94‑1 (MQ=60)
GTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATG > SRR4302537.1299204/1‑94 (MQ=60)
GTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATG > SRR4302537.370463/1‑94 (MQ=60)
GTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATG < SRR4302537.2514166/94‑1 (MQ=60)
GTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATG > SRR4302537.5403988/1‑94 (MQ=60)
GTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATG < SRR4302537.3906154/94‑1 (MQ=60)
GGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTGTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCA < SRR4302537.188730/94‑1 (MQ=60)
ACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAA > SRR4302537.2966853/1‑94 (MQ=60)
ACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAA > SRR4302537.1813593/1‑94 (MQ=60)
CGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAAT < SRR4302537.4231722/94‑1 (MQ=60)
GTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATA < SRR4302537.4753748/94‑1 (MQ=60)
GTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATA < SRR4302537.1578994/94‑1 (MQ=60)
TGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAG < SRR4302537.4352374/94‑1 (MQ=60)
GGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGA < SRR4302537.6046794/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAA < SRR4302537.6332361/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAA < SRR4302537.3625838/94‑1 (MQ=60)
GTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAAC > SRR4302537.2952144/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACG > SRR4302537.5662464/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACG > SRR4302537.5358663/1‑94 (MQ=60)
GGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGG > SRR4302537.3337156/1‑94 (MQ=60)
GTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGC > SRR4302537.3707891/1‑94 (MQ=60)
GTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGC < SRR4302537.3509566/94‑1 (MQ=60)
TCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTGAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAAT < SRR4302537.4218323/94‑1 (MQ=60)
TCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAAT < SRR4302537.2052984/94‑1 (MQ=60)
CCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATT > SRR4302537.1522059/1‑94 (MQ=60)
CCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATT > SRR4302537.5068922/1‑94 (MQ=60)
CGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTT < SRR4302537.1066435/94‑1 (MQ=60)
GACTCTTACCG‑‑‑CCATGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTA > SRR4302537.1928153/1‑94 (MQ=60)
GACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTA > SRR4302537.4647349/1‑94 (MQ=60)
ACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTAT < SRR4302537.4675900/94‑1 (MQ=60)
ACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTAT > SRR4302537.767677/1‑94 (MQ=60)
TCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTT < SRR4302537.4869197/94‑1 (MQ=60)
TCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTT > SRR4302537.6454217/1‑94 (MQ=60)
CTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTA < SRR4302537.117264/94‑1 (MQ=60)
CTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTA < SRR4302537.3638876/94‑1 (MQ=60)
TTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAACTCCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTAC < SRR4302537.2493792/94‑1 (MQ=60)
TTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTAC < SRR4302537.5973453/94‑1 (MQ=60)
TACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACG < SRR4302537.5495286/94‑1 (MQ=60)
cttaccgCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTA > SRR4302537.6104344/8‑94 (MQ=60)
CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAT < SRR4302537.2549392/94‑1 (MQ=60)
|
AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAT > NC_000913/3156164‑3156350
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
