Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,300,826 |
G→A |
E239K (GAG→AAG) |
yhbV → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,300,826 | 0 | G | A | 100.0%
| 848.7
/ NA
| 236 | E239K (GAG→AAG) | yhbV | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (134/102); total (134/102) |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
GGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCT > NC_000913/3300736‑3300915
|
gcgcAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCt < 1:4406473/93‑1 (MQ=255)
gcAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTgg < 2:2452862/93‑1 (MQ=255)
gcAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTgg < 2:258863/93‑1 (MQ=255)
aaCGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCa > 2:1802911/1‑93 (MQ=255)
cGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATc < 1:6418346/93‑1 (MQ=255)
cGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATc < 2:2156183/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCa < 1:3783230/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCa > 2:1922200/1‑93 (MQ=255)
gCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCAt < 1:1544364/93‑1 (MQ=255)
gCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCAt < 2:3778826/93‑1 (MQ=255)
gTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCa > 2:1168626/1‑93 (MQ=255)
gTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCa > 1:3955206/1‑93 (MQ=255)
gTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCa > 1:1996584/1‑93 (MQ=255)
tCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAg < 1:2122401/93‑1 (MQ=255)
gCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAggg > 1:4182580/1‑93 (MQ=255)
cAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGc < 2:237220/93‑1 (MQ=255)
cAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGc > 2:1978623/1‑93 (MQ=255)
cAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGc > 1:600091/1‑93 (MQ=255)
aGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGcc < 1:1343768/93‑1 (MQ=255)
ggAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGccg > 2:2231275/1‑92 (MQ=255)
ggAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCt < 2:1269343/93‑1 (MQ=255)
aaaCCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGt < 2:1464801/93‑1 (MQ=255)
aaCCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGtt > 1:4896955/1‑93 (MQ=255)
ccAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGa > 1:4507481/1‑93 (MQ=255)
ccAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGa > 2:1703628/1‑93 (MQ=255)
caacaaGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGAt > 2:564299/1‑93 (MQ=255)
caacaaGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGAt > 2:3832289/1‑93 (MQ=255)
caaGTTTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGAtgtg < 2:4999597/93‑1 (MQ=255)
caaGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGAtgtg > 1:87156/1‑93 (MQ=255)
caaGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGAtgtg > 2:930314/1‑93 (MQ=255)
caaGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCAGGCAGGGCCTGGTTGAtgtg < 2:6312801/93‑1 (MQ=255)
gtgtTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTc > 2:3381818/1‑93 (MQ=255)
tgtTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTcc > 1:2988465/1‑93 (MQ=255)
tgtTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTcc > 2:6181295/1‑93 (MQ=255)
tttGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGc > 1:2781665/1‑93 (MQ=255)
tttGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGc > 1:2299875/1‑93 (MQ=255)
tttGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGCTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGc > 2:6251099/1‑93 (MQ=255)
tGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCt > 1:2661710/1‑93 (MQ=255)
gTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTg > 1:3182885/1‑93 (MQ=255)
tACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGt > 1:2899973/1‑93 (MQ=255)
cTNAATNNCATTCAGACCATGANCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCa < 1:5582667/93‑1 (MQ=255)
aTGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGc > 2:3875707/1‑93 (MQ=255)
aTGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGATGATGTGGTCCGCCTGTCACCGc > 2:1996921/1‑93 (MQ=255)
tGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCa > 1:111233/1‑93 (MQ=255)
ggCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAg > 2:4627405/1‑93 (MQ=255)
gCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAgg < 2:2555408/93‑1 (MQ=255)
gCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAgg < 1:1060740/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGt > 1:2645809/1‑93 (MQ=255)
aTTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGt > 1:3859029/1‑93 (MQ=255)
aTTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGt < 1:1298058/93‑1 (MQ=255)
ttCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTa < 2:5664845/93‑1 (MQ=255)
ttCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTa > 2:6132008/1‑93 (MQ=255)
ttCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTa > 1:6195603/1‑93 (MQ=255)
aGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTg > 2:1847800/1‑93 (MQ=255)
gACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATACATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGa < 2:5986459/93‑1 (MQ=255)
gACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCGGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGa < 2:6427328/93‑1 (MQ=255)
aTGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACt > 2:908025/1‑93 (MQ=255)
gAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACttt > 1:3506642/1‑93 (MQ=255)
aGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTc < 1:899006/93‑1 (MQ=255)
aGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTc > 1:5199683/1‑93 (MQ=255)
aGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTAACCGCAGGGTACTGACACTTTc < 1:6356043/93‑1 (MQ=255)
cGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTcgc < 1:3109492/93‑1 (MQ=255)
gCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGa > 1:1858636/1‑93 (MQ=255)
gCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGa > 1:3744323/1‑93 (MQ=255)
gCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGa > 2:5721187/1‑93 (MQ=255)
tACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATg < 2:4457252/93‑1 (MQ=255)
aCGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGc < 2:5373802/93‑1 (MQ=255)
aCGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGc > 2:4042472/1‑93 (MQ=255)
aCGTTTACAACCTCGGTAAAAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGc > 1:2220850/1‑93 (MQ=255)
cGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCt < 2:1015031/93‑1 (MQ=255)
cGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCt < 1:3223989/93‑1 (MQ=255)
gTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTc < 2:32229/93‑1 (MQ=255)
gTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTc < 1:793477/93‑1 (MQ=255)
ttACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGa > 1:4039187/1‑93 (MQ=255)
ttACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGa < 2:41588/93‑1 (MQ=255)
ttACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGa < 1:480943/93‑1 (MQ=255)
ttACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGa < 2:4864544/93‑1 (MQ=255)
tgacacCCTCGGTCGCAACCTGGCATCCATGCAGGCCCTGGTTGATGTGGTCCTCGTGTCACCGCAGGGTACTGTCTCTTTCGCGATGCTGGa < 2:2072946/91‑1 (MQ=255)
tACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGAc < 1:572857/93‑1 (MQ=255)
aCAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACg > 2:1367328/1‑93 (MQ=255)
cAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGc > 1:6256030/1‑93 (MQ=255)
aCCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCt < 1:958212/93‑1 (MQ=255)
aCCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCt > 2:5154370/1‑93 (MQ=255)
ccTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCtt < 2:3955206/93‑1 (MQ=255)
cTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTc < 2:2963854/93‑1 (MQ=255)
cTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTc > 2:2942100/1‑93 (MQ=255)
tCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTcc < 1:2348009/93‑1 (MQ=255)
tCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTcc > 1:1758579/1‑93 (MQ=255)
tCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTcc < 1:5276661/93‑1 (MQ=255)
ggTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCcgc > 2:5886835/1‑93 (MQ=255)
gTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCATCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCcgcg < 1:4556171/93‑1 (MQ=255)
tAACAAGCTGTCATCCATGCAGGTCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCgcgc < 2:4742069/93‑1 (MQ=255)
tAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCgcgc < 2:5481980/93‑1 (MQ=255)
tAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCgcgc > 2:5007650/1‑93 (MQ=255)
aaCAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCt > 1:1021196/1‑93 (MQ=255)
aaCAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCt > 2:1110146/1‑93 (MQ=255)
aaCAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCt < 1:5606601/93‑1 (MQ=255)
aaCAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCt > 1:1668318/1‑93 (MQ=255)
aaCAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCt > 2:597108/1‑93 (MQ=255)
aaCAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCt > 1:3445830/1‑93 (MQ=255)
|
GGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCT > NC_000913/3300736‑3300915
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATG > NC_000913/3300733‑3300919
|
CACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACA < SRR4302537.5197583/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACA > SRR4302537.5337861/1‑94 (MQ=60)
AACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACA < SRR4302537.2715574/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACA > SRR4302537.1524244/1‑94 (MQ=60)
ACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAA < SRR4302537.6350426/94‑1 (MQ=60)
GGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGC > SRR4302537.4397182/1‑94 (MQ=60)
GGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGC > SRR4302537.3048983/1‑94 (MQ=60)
GGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCT < SRR4302537.2214562/94‑1 (MQ=60)
GGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCT < SRR4302537.2245459/94‑1 (MQ=60)
GCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTG < SRR4302537.4436880/94‑1 (MQ=60)
CGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTTTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGG > SRR4302537.1759737/1‑94 (MQ=60)
ACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATC < SRR4302537.80499/94‑1 (MQ=60)
CGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCC < SRR4302537.6461986/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCA > SRR4302537.295397/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCA > SRR4302537.2704933/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCAT < SRR4302537.3809790/94‑1 (MQ=60)
GCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATG < SRR4302537.1555147/94‑1 (MQ=60)
GCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATG < SRR4302537.5068151/94‑1 (MQ=60)
TGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCA > SRR4302537.3982877/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCA > SRR4302537.2010465/1‑94 (MQ=60)
GTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAG < SRR4302537.12961/94‑1 (MQ=60)
GTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAG < SRR4302537.1227186/94‑1 (MQ=60)
TCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATTCAGG < SRR4302537.2384725/94‑1 (MQ=60)
TCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGG < SRR4302537.1589993/94‑1 (MQ=60)
TCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGG < SRR4302537.2137334/94‑1 (MQ=60)
CGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGG > SRR4302537.4211782/1‑94 (MQ=60)
GCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGC > SRR4302537.604196/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCC > SRR4302537.2853599/1‑94 (MQ=60)
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CAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCC > SRR4302537.5639493/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCC > SRR4302537.4573279/1‑94 (MQ=60)
AGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCT > SRR4302537.3284599/1‑94 (MQ=60)
AGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCT < SRR4302537.1353129/94‑1 (MQ=60)
AGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCT > SRR4302537.3810785/1‑94 (MQ=60)
GAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGG > SRR4302537.4579877/1‑94 (MQ=60)
AAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGT < SRR4302537.910418/94‑1 (MQ=60)
AAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTT > SRR4302537.4930761/1‑94 (MQ=60)
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ACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGA > SRR4302537.4538650/1‑94 (MQ=60)
ACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGA > SRR4302537.4203647/1‑94 (MQ=60)
ACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGA > SRR4302537.4650023/1‑94 (MQ=60)
CAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATG < SRR4302537.5253209/94‑1 (MQ=60)
AACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGT < SRR4302537.3613086/94‑1 (MQ=60)
ACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTG > SRR4302537.87788/1‑94 (MQ=60)
CAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGG > SRR4302537.5959914/1‑94 (MQ=60)
AAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGT < SRR4302537.1870207/94‑1 (MQ=60)
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GTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCC > SRR4302537.3009337/1‑94 (MQ=60)
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GGGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCC < SRR4302537.944921/94‑1 (MQ=60)
GTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGC > SRR4302537.2316108/1‑94 (MQ=60)
GTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGC > SRR4302537.2801110/1‑94 (MQ=60)
TTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCT > SRR4302537.2680303/1‑94 (MQ=60)
TGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTG > SRR4302537.3205256/1‑94 (MQ=60)
GTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGT < SRR4302537.3891429/94‑1 (MQ=60)
GTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGT > SRR4302537.2920348/1‑94 (MQ=60)
TACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTC > SRR4302537.5351893/1‑94 (MQ=60)
TACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTC > SRR4302537.2337233/1‑94 (MQ=60)
TACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTC > SRR4302537.2144036/1‑94 (MQ=60)
CTNAATNNCATTCAGACCATGANCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCAC < SRR4302537.5620829/94‑1 (MQ=60)
CTCAATGGCATTCAGACCATTAGCGGCTACGTTTACAACCTCTGTAACAAGCTGGCATCCATGCGGGGCCTGGTTGATGTGGTCCTCCTGTCAC > SRR4302537.1618938/1‑94 (MQ=60)
CTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCAC > SRR4302537.3082859/1‑94 (MQ=60)
TCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACC > SRR4302537.1436415/1‑94 (MQ=60)
TCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACC < SRR4302537.723635/94‑1 (MQ=60)
ATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCA > SRR4302537.112049/1‑94 (MQ=60)
TGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAG > SRR4302537.5865790/1‑94 (MQ=60)
TGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAG < SRR4302537.2677931/94‑1 (MQ=60)
GGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGG > SRR4302537.1093166/1‑94 (MQ=60)
GGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGG < SRR4302537.2429208/94‑1 (MQ=60)
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ATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTT > SRR4302537.4532283/1‑94 (MQ=60)
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TGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTT > SRR4302537.3531453/1‑94 (MQ=60)
GAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTC > SRR4302537.5235453/1‑94 (MQ=60)
AGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCG < SRR4302537.905204/94‑1 (MQ=60)
AGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCG > SRR4302537.898162/1‑94 (MQ=60)
AGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCG < SRR4302537.191435/94‑1 (MQ=60)
AGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTAACCGCAGGGTACTGACACTTTCG < SRR4302537.6399425/94‑1 (MQ=60)
CGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCG < SRR4302537.3131209/94‑1 (MQ=60)
GGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGA > SRR4302537.1871583/1‑94 (MQ=60)
GGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGA > SRR4302537.3770615/1‑94 (MQ=60)
GGCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGA > SRR4302537.2114111/1‑94 (MQ=60)
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GCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGCGCCTGGTTGAGGTGGTtcccccgttgccggagggggagggaactttggccgg > SRR4302537.4278790/1‑58 (MQ=60)
GCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGAT < SRR4302537.2691760/94‑1 (MQ=60)
GCTACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGAT < SRR4302537.3227911/94‑1 (MQ=60)
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TACGTTTACAACCTCGGTAAAAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGC > SRR4302537.2236500/1‑94 (MQ=60)
ACGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCT > SRR4302537.6092675/1‑94 (MQ=60)
CGTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTC < SRR4302537.3246680/94‑1 (MQ=60)
GTTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCG < SRR4302537.798924/94‑1 (MQ=60)
TTTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGA > SRR4302537.4067444/1‑94 (MQ=60)
TTACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGAC < SRR4302537.484238/94‑1 (MQ=60)
TACAACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACG < SRR4302537.576791/94‑1 (MQ=60)
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AACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCT > SRR4302537.3188553/1‑94 (MQ=60)
AACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCT < SRR4302537.514352/94‑1 (MQ=60)
ACCTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTT < SRR4302537.964822/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCC < SRR4302537.750476/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCC > SRR4302537.1770837/1‑94 (MQ=60)
TCGGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCG < SRR4302537.2364540/94‑1 (MQ=60)
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CGTAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCG < SRR4302537.989285/94‑1 (MQ=60)
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TAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCT > SRR4302537.3470203/1‑94 (MQ=60)
TAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCT > SRR4302537.1680006/1‑94 (MQ=60)
TAACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCT > SRR4302537.1028233/1‑94 (MQ=60)
AACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTA > SRR4302537.5692905/1‑94 (MQ=60)
AACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTA > SRR4302537.1071099/1‑94 (MQ=60)
AACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTA < SRR4302537.5644931/94‑1 (MQ=60)
AACAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACGTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTA > SRR4302537.6260275/1‑94 (MQ=60)
CAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAAT > SRR4302537.1614498/1‑94 (MQ=60)
CAAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAAT < SRR4302537.5463776/94‑1 (MQ=60)
AAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATG < SRR4302537.2375280/94‑1 (MQ=60)
AAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATG > SRR4302537.4956774/1‑94 (MQ=60)
|
AACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATG > NC_000913/3300733‑3300919
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
