Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,989,493 |
A→G |
Y243C (TAC→TGC) |
cyaA → |
adenylate cyclase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,989,493 | 0 | A | G | 100.0%
| 963.9
/ NA
| 272 | Y243C (TAC→TGC) | cyaA | adenylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (120/152); total (120/152) |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
ACTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTACTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCC > NC_000913/3989403‑3989581
|
acTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCt < 2:2832498/93‑1 (MQ=255)
acTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCt < 2:6010194/93‑1 (MQ=255)
cTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCtt < 1:3868233/93‑1 (MQ=255)
tATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCttt < 1:5703387/93‑1 (MQ=255)
tATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCttt > 2:4093612/1‑93 (MQ=255)
tATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCttt < 1:4134037/93‑1 (MQ=255)
aTGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTg > 1:2461905/1‑93 (MQ=255)
tgtgATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTgg > 2:332176/1‑93 (MQ=255)
tgtgATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTgg < 1:4437338/93‑1 (MQ=255)
gaCGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAg < 2:1415085/93‑1 (MQ=255)
aCGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGc > 2:5549410/1‑93 (MQ=255)
cGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCCGcc > 2:2514299/1‑93 (MQ=255)
gCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCt < 2:2347872/93‑1 (MQ=255)
gCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCt > 2:1867444/1‑93 (MQ=255)
cTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCtt < 2:2722516/93‑1 (MQ=255)
tttACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCttt < 2:3140883/93‑1 (MQ=255)
tttACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCttt > 1:794124/1‑93 (MQ=255)
tttACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCttt < 1:3579030/93‑1 (MQ=255)
ttACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTg < 2:1961548/93‑1 (MQ=255)
aCGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGc < 1:757247/93‑1 (MQ=255)
aCGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGc < 2:221069/93‑1 (MQ=255)
aCGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGc < 1:5061519/93‑1 (MQ=255)
gcgcATGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAg > 1:1334714/1‑93 (MQ=255)
cgcAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGc < 1:102080/93‑1 (MQ=255)
cgcAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGc < 2:3854403/93‑1 (MQ=255)
aGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGctct > 2:5979670/1‑93 (MQ=255)
gCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTTGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCCTTCTGCTGAAGAGCGCTTTGGTGCCCGCCTTTGGCAGCTCTACa > 2:6168572/1‑93 (MQ=255)
cGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACaa > 2:2869581/1‑93 (MQ=255)
cGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACaa < 2:3477445/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAag > 2:5573960/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAag > 2:3574681/1‑93 (MQ=255)
tGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAaga < 2:5887959/93‑1 (MQ=255)
gCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAagag > 1:3515218/1‑93 (MQ=255)
gCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAagag < 2:4364729/93‑1 (MQ=255)
gCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAagag > 1:4253978/1‑93 (MQ=255)
gCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAagag > 1:3004531/1‑93 (MQ=255)
tGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGTC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTa < 1:3776066/93‑1 (MQ=255)
tGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTa < 1:1050363/93‑1 (MQ=255)
tGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTa > 1:1925662/1‑93 (MQ=255)
tGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTa > 1:5134615/1‑93 (MQ=255)
tGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTa < 1:1975021/93‑1 (MQ=255)
gACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTAt < 1:6033590/93‑1 (MQ=255)
cGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCg < 1:6084502/93‑1 (MQ=255)
cGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCg < 1:4982559/93‑1 (MQ=255)
gCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCGGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCgt > 1:5368219/1‑92 (MQ=255)
gCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGa < 2:1762389/93‑1 (MQ=255)
gCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGa < 1:5112419/93‑1 (MQ=255)
ccAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGAt > 1:5328761/1‑93 (MQ=255)
cAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGAtt < 2:3796271/93‑1 (MQ=255)
aaaTGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTc > 2:4799341/1‑93 (MQ=255)
aatgGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCAt < 1:907195/93‑1 (MQ=255)
atgGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATa < 1:2019251/93‑1 (MQ=255)
tgGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATAc < 1:2753972/93‑1 (MQ=255)
tgGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATAc < 1:4949440/93‑1 (MQ=255)
tgGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATAc > 2:2787873/1‑93 (MQ=255)
cTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACaaa > 1:1237050/1‑93 (MQ=255)
cTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACaaa > 2:5100799/1‑93 (MQ=255)
tGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAg < 1:4020755/93‑1 (MQ=255)
ggATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAgg > 2:5347504/1‑92 (MQ=255)
ggATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGc > 1:6253155/1‑93 (MQ=255)
gATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCg > 1:2579641/1‑93 (MQ=255)
tctcGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGt > 1:680058/1‑93 (MQ=255)
ctcGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTa > 1:3886484/1‑93 (MQ=255)
tcGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTAc < 1:13171/93‑1 (MQ=255)
ggTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTg < 2:4439543/93‑1 (MQ=255)
gTGGCTTTAAGCTCTTTTTTTGCTGAAGAGTGTTTGGGTCCCACCTTTTGGCACCTCTACAAGATTATCTTTTCCCCATACAAAGCGGTACTg < 2:307394/93‑1 (MQ=255)
gTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGTAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGa < 1:3461208/93‑1 (MQ=255)
gTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGa > 1:3660434/1‑93 (MQ=255)
gTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGCATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGa > 1:1530146/1‑93 (MQ=255)
tGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGaa > 2:5205906/1‑93 (MQ=255)
ggC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGaaa < 2:1016843/93‑1 (MQ=255)
ggC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGaaa > 1:5582812/1‑93 (MQ=255)
gC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGaaaa < 2:2383390/93‑1 (MQ=255)
gC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGaaaa > 2:3658348/1‑93 (MQ=255)
gC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGaaaa < 1:6280249/93‑1 (MQ=255)
c‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTCAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAac > 2:6294766/1‑93 (MQ=255)
tAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAacac > 1:1357820/1‑93 (MQ=255)
aggCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACAct < 2:1206629/91‑1 (MQ=255)
aaGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACAct < 1:4745044/93‑1 (MQ=255)
aaGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACAct < 2:1819488/93‑1 (MQ=255)
aGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACActg > 2:4512106/1‑93 (MQ=255)
gCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACActgc < 1:2322940/93‑1 (MQ=255)
cTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACActgct < 1:5438689/93‑1 (MQ=255)
tCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACActgctg > 2:2606924/1‑93 (MQ=255)
ttCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGa < 2:1266446/93‑1 (MQ=255)
tCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGaa < 2:6433687/93‑1 (MQ=255)
ctgctgAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAg < 2:6222012/93‑1 (MQ=255)
tgAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTa > 2:4840057/1‑93 (MQ=255)
tgAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTa < 1:4825271/93‑1 (MQ=255)
tgAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTa > 1:329143/1‑93 (MQ=255)
gAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTAt < 1:2104435/93‑1 (MQ=255)
aaGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTAtt > 2:837601/1‑93 (MQ=255)
aaGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTAtt > 1:5959353/1‑93 (MQ=255)
aaGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTAtt > 2:1809348/1‑93 (MQ=255)
agagTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTc > 2:4978130/1‑93 (MQ=255)
agagTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTc > 1:173428/1‑93 (MQ=255)
agagTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTc < 2:1320077/93‑1 (MQ=255)
gagTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTcc > 2:4707236/1‑93 (MQ=255)
gagTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTcc > 2:3253815/1‑93 (MQ=255)
gagTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTcc < 2:2990236/93‑1 (MQ=255)
|
ACTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGC‑TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTACTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCC > NC_000913/3989403‑3989581
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGACTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTACTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCCTGGGA > NC_000913/3989401‑3989586
|
CGACTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGTCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGC < SRR4302537.4785921/94‑1 (MQ=60)
CGACTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGC > SRR4302537.3003322/1‑94 (MQ=60)
ACTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTT > SRR4302537.2069025/1‑94 (MQ=60)
CTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTT > SRR4302537.1708222/1‑94 (MQ=60)
CTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTT > SRR4302537.1563024/1‑94 (MQ=60)
CTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTT > SRR4302537.6365623/1‑94 (MQ=60)
CTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTT < SRR4302537.3895304/94‑1 (MQ=60)
CTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTT > SRR4302537.5158946/1‑94 (MQ=60)
TATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTG < SRR4302537.4162881/94‑1 (MQ=60)
TATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTG > SRR4302537.2479220/1‑94 (MQ=60)
TATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTG < SRR4302537.5742419/94‑1 (MQ=60)
ATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGG > SRR4302537.2529340/1‑94 (MQ=60)
ATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGG < SRR4302537.4485962/94‑1 (MQ=60)
TGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGT < SRR4302537.4467973/94‑1 (MQ=60)
TGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGT < SRR4302537.4012167/94‑1 (MQ=60)
GTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTG < SRR4302537.3579975/94‑1 (MQ=60)
GATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCC < SRR4302537.2390501/94‑1 (MQ=60)
GATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCC < SRR4302537.5114742/94‑1 (MQ=60)
ATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCA > SRR4302537.5961594/1‑94 (MQ=60)
ATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCA > SRR4302537.6264840/1‑94 (MQ=60)
TGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAG > SRR4302537.6045947/1‑94 (MQ=60)
TGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAG < SRR4302537.5400559/94‑1 (MQ=60)
ACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCC > SRR4302537.3886631/1‑94 (MQ=60)
GCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTT > SRR4302537.704406/1‑94 (MQ=60)
CTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTT < SRR4302537.3510405/94‑1 (MQ=60)
CTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTT < SRR4302537.4320176/94‑1 (MQ=60)
CTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTT > SRR4302537.799574/1‑94 (MQ=60)
CTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTT > SRR4302537.4894151/1‑94 (MQ=60)
TTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTG < SRR4302537.3604260/94‑1 (MQ=60)
TTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGG < SRR4302537.130911/94‑1 (MQ=60)
ACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCA < SRR4302537.5096366/94‑1 (MQ=60)
ACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCA < SRR4302537.5016494/94‑1 (MQ=60)
ACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCA > SRR4302537.1413262/1‑94 (MQ=60)
ACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCA < SRR4302537.762417/94‑1 (MQ=60)
CGCGCATGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAG > SRR4302537.1344012/1‑94 (MQ=60)
CGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAG > SRR4302537.1939497/1‑94 (MQ=60)
CGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAG > SRR4302537.3706812/1‑94 (MQ=60)
CGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAG < SRR4302537.1923348/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGT > SRR4302537.791513/1‑94 (MQ=60)
GCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGC < SRR4302537.4117678/94‑1 (MQ=60)
CGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCT < SRR4302537.102814/94‑1 (MQ=60)
CAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCT < SRR4302537.2208078/94‑1 (MQ=60)
CAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCT > SRR4302537.847311/1‑94 (MQ=60)
CAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCT > SRR4302537.6321367/1‑94 (MQ=60)
GGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTAC < SRR4302537.5445177/94‑1 (MQ=60)
GGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTAC < SRR4302537.979811/94‑1 (MQ=60)
GGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTAC < SRR4302537.3616379/94‑1 (MQ=60)
GCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAA < SRR4302537.1137147/94‑1 (MQ=60)
CGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAG < SRR4302537.3493769/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGA < SRR4302537.4164084/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGA > SRR4302537.1400452/1‑94 (MQ=60)
TGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAG > SRR4302537.4283546/1‑94 (MQ=60)
TGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAG < SRR4302537.1220722/94‑1 (MQ=60)
TGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAG > SRR4302537.3025457/1‑94 (MQ=60)
TGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAG > SRR4302537.3540086/1‑94 (MQ=60)
CTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTA > SRR4302537.1939026/1‑94 (MQ=60)
CTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTA > SRR4302537.5169993/1‑94 (MQ=60)
TGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGTCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTAT < SRR4302537.3802580/94‑1 (MQ=60)
TGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTAT < SRR4302537.1988751/94‑1 (MQ=60)
TGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTAT < SRR4302537.1940682/94‑1 (MQ=60)
TGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTAT < SRR4302537.1057606/94‑1 (MQ=60)
TGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTAT > SRR4302537.6233660/1‑94 (MQ=60)
GACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATC < SRR4302537.6075049/94‑1 (MQ=60)
GACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATC < SRR4302537.1344826/94‑1 (MQ=60)
GACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTAGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATC < SRR4302537.4181669/94‑1 (MQ=60)
CGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCGGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGT > SRR4302537.5404950/1‑94 (MQ=60)
CGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGA < SRR4302537.6126304/94‑1 (MQ=60)
CGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGA < SRR4302537.5016900/94‑1 (MQ=60)
GCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGAT > SRR4302537.5365319/1‑94 (MQ=60)
GCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGAT < SRR4302537.2867696/94‑1 (MQ=60)
GCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGAT < SRR4302537.5147659/94‑1 (MQ=60)
AATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATA > SRR4302537.4802324/1‑94 (MQ=60)
AATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATA < SRR4302537.913463/94‑1 (MQ=60)
ATGGCTTGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTTCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATAC < SRR4302537.502299/94‑1 (MQ=60)
ATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATAC < SRR4302537.2033332/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACA > SRR4302537.5275840/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACA < SRR4302537.4983558/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACA < SRR4302537.2773196/94‑1 (MQ=60)
GGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAA < SRR4302537.5458892/94‑1 (MQ=60)
GCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAA > SRR4302537.1245656/1‑94 (MQ=60)
CTGGATCTCGTTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAG < SRR4302537.2306155/94‑1 (MQ=60)
CTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAG < SRR4302537.5571711/94‑1 (MQ=60)
CTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAG < SRR4302537.1029211/94‑1 (MQ=60)
TGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGC < SRR4302537.3302799/94‑1 (MQ=60)
TGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGC > SRR4302537.5156477/1‑94 (MQ=60)
TGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGC < SRR4302537.4048908/94‑1 (MQ=60)
TGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGC > SRR4302537.6296114/1‑94 (MQ=60)
GGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCG < SRR4302537.887730/94‑1 (MQ=60)
GGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCG > SRR4302537.2597700/1‑94 (MQ=60)
GATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGG > SRR4302537.5188854/1‑94 (MQ=60)
ATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGT > SRR4302537.684721/1‑94 (MQ=60)
ATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGT > SRR4302537.5020773/1‑94 (MQ=60)
TCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTA > SRR4302537.3913670/1‑94 (MQ=60)
TTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTTCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTAC < SRR4302537.1326655/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTAC > SRR4302537.3662956/1‑94 (MQ=60)
TCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACT < SRR4302537.2374498/94‑1 (MQ=60)
TCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACT < SRR4302537.13270/94‑1 (MQ=60)
TCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACT < SRR4302537.2766098/94‑1 (MQ=60)
TCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACT > SRR4302537.4116003/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGA > SRR4302537.5705998/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGA > SRR4302537.3686199/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGCATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGA > SRR4302537.1540839/1‑94 (MQ=60)
GTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGTAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAA < SRR4302537.3485676/94‑1 (MQ=60)
GTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAA < SRR4302537.3930753/94‑1 (MQ=60)
GTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAA < SRR4302537.3691423/94‑1 (MQ=60)
GTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAA < SRR4302537.5902958/94‑1 (MQ=60)
TGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAA > SRR4302537.5620975/1‑94 (MQ=60)
GCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAAC < SRR4302537.6323325/94‑1 (MQ=60)
TTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACAC > SRR4302537.1367274/1‑94 (MQ=60)
AAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTG > SRR4302537.737986/1‑94 (MQ=60)
AAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTG < SRR4302537.4777831/94‑1 (MQ=60)
AGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGC < SRR4302537.6073319/94‑1 (MQ=60)
GCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCT < SRR4302537.6122562/94‑1 (MQ=60)
GCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCT < SRR4302537.2339340/94‑1 (MQ=60)
CTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTG < SRR4302537.3324116/94‑1 (MQ=60)
CTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTG > SRR4302537.3862256/1‑94 (MQ=60)
CTCGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTG < SRR4302537.5475791/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCT < SRR4302537.2000949/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCT < SRR4302537.2504358/94‑1 (MQ=60)
GCTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTG > SRR4302537.4996036/1‑94 (MQ=60)
CTTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGG < SRR4302537.4804143/94‑1 (MQ=60)
TTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGA < SRR4302537.1316262/94‑1 (MQ=60)
TTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGA < SRR4302537.3895937/94‑1 (MQ=60)
TTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGA > SRR4302537.5379346/1‑94 (MQ=60)
TTTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGA < SRR4302537.322114/94‑1 (MQ=60)
TTCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAA < SRR4302537.2109452/94‑1 (MQ=60)
TCTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAG < SRR4302537.1928537/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGC < SRR4302537.6381824/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGAAGAGTGCTTTGGTACCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGC > SRR4302537.4330990/1‑94 (MQ=60)
TGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGCTTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCC < SRR4302537.3477622/94‑1 (MQ=60)
TGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCC > SRR4302537.1343410/1‑94 (MQ=60)
TGCTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCC > SRR4302537.2817239/1‑94 (MQ=60)
CTGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTA > SRR4302537.331425/1‑94 (MQ=60)
TGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTAT < SRR4302537.4858599/94‑1 (MQ=60)
TGAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTAT > SRR4302537.5691531/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATT > SRR4302537.6000257/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATT < SRR4302537.2119269/94‑1 (MQ=60)
AAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTC > SRR4302537.174660/1‑94 (MQ=60)
AAGAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTC > SRR4302537.4967128/1‑94 (MQ=60)
GAGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCCT < SRR4302537.6314164/94‑1 (MQ=60)
AGTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCCTG > SRR4302537.1075028/1‑94 (MQ=60)
GTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCCTGG < SRR4302537.4191461/94‑1 (MQ=60)
GTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCCTGG < SRR4302537.613689/94‑1 (MQ=60)
GTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCCTGG > SRR4302537.5576593/1‑94 (MQ=60)
GTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCCTGG < SRR4302537.3135814/94‑1 (MQ=60)
GTGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCCTGG < SRR4302537.4074310/94‑1 (MQ=60)
TGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCCTGGG > SRR4302537.813049/1‑94 (MQ=60)
TGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCCTGGG > SRR4302537.4954927/1‑94 (MQ=60)
TGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCCTGGG < SRR4302537.4196407/94‑1 (MQ=60)
TGCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCCTGGG < SRR4302537.1043242/94‑1 (MQ=60)
GCTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCCTGGGA > SRR4302537.1664651/1‑94 (MQ=60)
|
CGACTATGTGATGACGCTTTACGCGCAGGGCGTGCTGACGCCAAATGAATGGCTGGATCTCGGTGGCTTAAGCTCGCTTTCTGCTGAAGAGTACTTTGGTGCCAGCCTTTGGCAGCTCTACAAGAGTATCGATTCCCCATACAAAGCGGTACTGAAAACACTGCTGCTGGAAGCCTATTCCTGGGA > NC_000913/3989401‑3989586
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |