Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,154,554 |
Δ1 bp |
coding (126/1374 nt) |
argH → |
argininosuccinate lyase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,154,552 | 0 | A | . | 100.0%
| 992.8
/ NA
| 210 | coding (124/1374 nt) | argH | argininosuccinate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (121/89); total (121/89) |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
AGCAGATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCCAAAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTCGCG > NC_000913/4154461‑4154639
|
agcagATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCCaa > 2:14385/1‑93 (MQ=255)
gcagATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCCaag > 2:438234/1‑92 (MQ=255)
gcagATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCCaag > 2:1456162/1‑92 (MQ=255)
gcagATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCCaag < 2:1938720/93‑2 (MQ=255)
agATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCCaagcc < 2:3521239/93‑4 (MQ=255)
gATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCCaagccc > 1:2924110/1‑89 (MQ=255)
gATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCCCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCGCTGCGGCCTAGTCCaagccc > 2:4020122/1‑89 (MQ=255)
aTCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCt < 1:2048657/93‑1 (MQ=255)
aTCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCt < 1:3742894/93‑1 (MQ=255)
tCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTg > 2:6076736/1‑93 (MQ=255)
aaCGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGt > 1:73540/1‑93 (MQ=255)
cGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCa < 1:1334123/93‑1 (MQ=255)
cGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCa > 2:535592/1‑93 (MQ=255)
ttCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTTGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACgg < 2:685071/93‑1 (MQ=255)
ttCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACgg > 1:3231560/1‑93 (MQ=255)
ttCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACgg > 1:909200/1‑93 (MQ=255)
tCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGt > 1:1723474/1‑93 (MQ=255)
aaaCAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAg > 1:5873366/1‑93 (MQ=255)
aaaCAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAg > 2:399664/1‑93 (MQ=255)
aaCAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAgg > 1:413626/1‑93 (MQ=255)
aCAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGc > 1:5673160/1‑93 (MQ=255)
aCAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGc < 2:1499895/93‑1 (MQ=255)
aaTTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCgt > 1:432236/1‑93 (MQ=255)
aTTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCgtg > 2:4941630/1‑93 (MQ=255)
aTTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCgtg < 1:4821364/93‑1 (MQ=255)
aTTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCgtg < 2:6217599/93‑1 (MQ=255)
aTTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGCTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCgtg > 1:2233481/1‑93 (MQ=255)
ttCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCgtgt > 1:6277543/1‑93 (MQ=255)
tCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGtt < 1:4053653/93‑1 (MQ=255)
tCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGtt > 1:6097718/1‑93 (MQ=255)
tCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGtt < 1:4916791/93‑1 (MQ=255)
cAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTa > 2:2467329/1‑93 (MQ=255)
aaCGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTaa > 1:4671014/1‑93 (MQ=255)
aaCGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTaa < 2:806796/93‑1 (MQ=255)
aCGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAAc > 1:1045694/1‑93 (MQ=255)
gACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCg > 2:183727/1‑93 (MQ=255)
gACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCg < 1:3836486/93‑1 (MQ=255)
cTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAACAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCa < 1:4701970/93‑1 (MQ=255)
tCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCag > 1:340045/1‑93 (MQ=255)
tCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCag > 1:189973/1‑93 (MQ=255)
cACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCaga < 2:4648038/93‑1 (MQ=255)
aCTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCagaa > 1:4948618/1‑93 (MQ=255)
aCTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCagaa > 1:2494534/1‑93 (MQ=255)
cTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAAGCGCcgaag > 2:5971211/1‑93 (MQ=255)
cTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCagaag < 2:5830319/93‑1 (MQ=255)
tGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCagaaga < 2:4561721/93‑1 (MQ=255)
tGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGGAGGCGTGGTAACCGCagaaga > 1:3319784/1‑93 (MQ=255)
cgcTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGc > 2:585567/1‑93 (MQ=255)
gcTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCa > 2:4807274/1‑93 (MQ=255)
gcTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCa < 1:1099268/93‑1 (MQ=255)
cTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAg > 2:507026/1‑93 (MQ=255)
tttGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAgg < 1:307558/93‑1 (MQ=255)
tttGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAgg < 1:788428/93‑1 (MQ=255)
tttGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAgg > 2:4170449/1‑93 (MQ=255)
ttGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGgc > 1:4279869/1‑93 (MQ=255)
tGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGgcg < 2:4053670/93‑1 (MQ=255)
gATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGgcgc > 2:1133062/1‑93 (MQ=255)
gATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGgcgc > 2:4986437/1‑93 (MQ=255)
gATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGgcgc > 1:5627668/1‑93 (MQ=255)
aCCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACt > 1:3590193/1‑93 (MQ=255)
aCCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACt > 2:4485135/1‑93 (MQ=255)
ccGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTg > 1:2799141/1‑93 (MQ=255)
ccGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTg < 1:6426190/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGa > 1:5479430/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGa > 1:5406772/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAaga < 2:3602340/93‑1 (MQ=255)
ggCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAagag < 2:751797/93‑1 (MQ=255)
gCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAgg < 2:2325688/93‑1 (MQ=255)
ggAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGgcg > 2:3717274/1‑93 (MQ=255)
gAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGgcgc > 1:183186/1‑93 (MQ=255)
aGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCt > 2:5183516/1‑93 (MQ=255)
gCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTg > 2:929180/1‑93 (MQ=255)
gCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTg > 2:6126612/1‑93 (MQ=255)
aGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGaa > 2:6370639/1‑93 (MQ=255)
aGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGaa > 2:367698/1‑93 (MQ=255)
aGGATATTGTTGGCTATGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGaa > 2:2023829/1‑93 (MQ=255)
ggATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAAc < 1:1979614/93‑1 (MQ=255)
gATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACg > 1:5241916/1‑93 (MQ=255)
gATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACg > 2:3813895/1‑93 (MQ=255)
atatTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACgt > 1:4200594/1‑93 (MQ=255)
tatTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACgtg > 2:3144838/1‑93 (MQ=255)
tatTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACgtg > 1:228822/1‑93 (MQ=255)
atTGTTGGCTCTGTGTCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACgtgt < 2:4201971/93‑1 (MQ=255)
atTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACgtgt < 2:857167/93‑1 (MQ=255)
atTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACgtgt < 2:1640203/93‑1 (MQ=255)
atTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACgtgt < 2:5524075/93‑1 (MQ=255)
tgttgGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTg > 2:1288913/1‑93 (MQ=255)
gttgGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGc < 1:2620662/93‑1 (MQ=255)
gttgGCTCTGTGGCCGGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGc < 2:3424570/93‑1 (MQ=255)
gtgGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCt < 1:1617690/92‑1 (MQ=255)
tgGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTg < 2:2218560/93‑1 (MQ=255)
tctGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAg > 2:5100658/1‑93 (MQ=255)
tctGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAg > 1:3557042/1‑93 (MQ=255)
ctGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGa < 1:2189226/93‑1 (MQ=255)
ctGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGa > 1:4540487/1‑93 (MQ=255)
gtgGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATg > 2:2014357/1‑93 (MQ=255)
gtgGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATg < 2:2824523/93‑1 (MQ=255)
tgGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGt > 2:5313777/1‑93 (MQ=255)
gCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTc < 1:3475033/93‑1 (MQ=255)
gCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTc > 2:2378913/1‑93 (MQ=255)
|
AGCAGATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCCAAAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTCGCG > NC_000913/4154461‑4154639
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGCAGATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCCAAAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTCGCGCCAGGCCA > NC_000913/4154461‑4154647
|
AGCAGATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCCAAG < SRR4302537.1668399/94‑1 (MQ=60)
AGATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCC > SRR4302537.2944650/1‑94 (MQ=60)
GATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCT < SRR4302537.2095652/94‑1 (MQ=60)
GATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCT < SRR4302537.6327436/94‑1 (MQ=60)
GTCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTG > SRR4302537.2526771/1‑94 (MQ=60)
ATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTG < SRR4302537.3769177/94‑1 (MQ=60)
ATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTG < SRR4302537.2063023/94‑1 (MQ=60)
TCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGG < SRR4302537.5692219/94‑1 (MQ=60)
CAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGT > SRR4302537.74081/1‑94 (MQ=60)
CAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGT < SRR4302537.1960030/94‑1 (MQ=60)
CGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCAC < SRR4302537.2288263/94‑1 (MQ=60)
CGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCAC > SRR4302537.129425/1‑94 (MQ=60)
CGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCAC < SRR4302537.1343413/94‑1 (MQ=60)
GGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACG > SRR4302537.2207671/1‑94 (MQ=60)
GGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACG > SRR4302537.6481013/1‑94 (MQ=60)
GTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGG > SRR4302537.3254333/1‑94 (MQ=60)
GTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGG > SRR4302537.1793118/1‑94 (MQ=60)
GTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGG > SRR4302537.915479/1‑94 (MQ=60)
TTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGT > SRR4302537.1735517/1‑94 (MQ=60)
CAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAG > SRR4302537.5913657/1‑94 (MQ=60)
AAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGG > SRR4302537.416492/1‑94 (MQ=60)
AAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGG < SRR4302537.5014437/94‑1 (MQ=60)
AACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGG > SRR4302537.4756202/1‑94 (MQ=60)
AACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGC > SRR4302537.5711977/1‑94 (MQ=60)
CAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGT > SRR4302537.435248/1‑94 (MQ=60)
AATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTG > SRR4302537.1872940/1‑94 (MQ=60)
AATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGCTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTG > SRR4302537.2249238/1‑94 (MQ=60)
ATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGT > SRR4302537.6320609/1‑94 (MQ=60)
ATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGT < SRR4302537.4854665/94‑1 (MQ=60)
TTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTT > SRR4302537.6139619/1‑94 (MQ=60)
TCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTA < SRR4302537.2780862/94‑1 (MQ=60)
TCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTA < SRR4302537.4081994/94‑1 (MQ=60)
TCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTA < SRR4302537.4950716/94‑1 (MQ=60)
CAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAA > SRR4302537.4703334/1‑94 (MQ=60)
AACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAAC < SRR4302537.5604744/94‑1 (MQ=60)
AACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAAC > SRR4302537.1052912/1‑94 (MQ=60)
CGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCG > SRR4302537.4893937/1‑94 (MQ=60)
GACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGC < SRR4302537.3863369/94‑1 (MQ=60)
CTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAG > SRR4302537.342403/1‑94 (MQ=60)
CTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAG > SRR4302537.3871469/1‑94 (MQ=60)
CTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAG > SRR4302537.191325/1‑94 (MQ=60)
CTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAG > SRR4302537.3082380/1‑94 (MQ=60)
CTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAACAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAG < SRR4302537.4734498/94‑1 (MQ=60)
TCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGA < SRR4302537.6192603/94‑1 (MQ=60)
CACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAA > SRR4302537.4982732/1‑94 (MQ=60)
CACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAA > SRR4302537.2512097/1‑94 (MQ=60)
ACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAG > SRR4302537.4138086/1‑94 (MQ=60)
ACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAG > SRR4302537.3445098/1‑94 (MQ=60)
CTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGGAGGCGTGGTAACCGCAGAAGA > SRR4302537.3343263/1‑94 (MQ=60)
TGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAG > SRR4302537.4972669/1‑94 (MQ=60)
GCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGC < SRR4302537.6129591/94‑1 (MQ=60)
GCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGC < SRR4302537.5440708/94‑1 (MQ=60)
GCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAAGCGCAGAAGAGCAG > SRR4302537.216899/1‑94 (MQ=60)
GCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAG < SRR4302537.2001338/94‑1 (MQ=60)
GCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAG > SRR4302537.3589205/1‑94 (MQ=60)
GCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAG < SRR4302537.1106862/94‑1 (MQ=60)
TTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGC > SRR4302537.4309621/1‑94 (MQ=60)
TTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGC < SRR4302537.3436074/94‑1 (MQ=60)
TTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGC < SRR4302537.309691/94‑1 (MQ=60)
TTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGC < SRR4302537.793839/94‑1 (MQ=60)
TTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCG < SRR4302537.88761/94‑1 (MQ=60)
TTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCC > SRR4302537.5292378/1‑94 (MQ=60)
TGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGC > SRR4302537.5666167/1‑94 (MQ=60)
TGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGC > SRR4302537.14684/1‑94 (MQ=60)
TGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGC < SRR4302537.2429541/94‑1 (MQ=60)
GATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCA < SRR4302537.3222964/94‑1 (MQ=60)
ATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAA < SRR4302537.236594/94‑1 (MQ=60)
TACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACT < SRR4302537.6086759/94‑1 (MQ=60)
TACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACT > SRR4302537.4729920/1‑94 (MQ=60)
TACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACT > SRR4302537.3615501/1‑94 (MQ=60)
ACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTG > SRR4302537.2818712/1‑94 (MQ=60)
CCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGG < SRR4302537.6469855/94‑1 (MQ=60)
CGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGA > SRR4302537.5443651/1‑94 (MQ=60)
CGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGA > SRR4302537.5516840/1‑94 (MQ=60)
CGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGA > SRR4302537.3155687/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGA < SRR4302537.3393998/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAG < SRR4302537.4277511/94‑1 (MQ=60)
GGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGG < SRR4302537.3308129/94‑1 (MQ=60)
CGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCG < SRR4302537.494842/94‑1 (MQ=60)
GGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGC > SRR4302537.1060567/1‑94 (MQ=60)
GGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGC > SRR4302537.184489/1‑94 (MQ=60)
AGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTG < SRR4302537.937275/94‑1 (MQ=60)
AGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTG > SRR4302537.2826949/1‑94 (MQ=60)
GCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGA > SRR4302537.4382352/1‑94 (MQ=60)
CAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAA > SRR4302537.4613584/1‑94 (MQ=60)
CAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAA > SRR4302537.3541846/1‑94 (MQ=60)
AGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAAC > SRR4302537.420286/1‑94 (MQ=60)
AGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAAC > SRR4302537.1868643/1‑94 (MQ=60)
GGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACG < SRR4302537.4014223/94‑1 (MQ=60)
GGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACG < SRR4302537.1993369/94‑1 (MQ=60)
GGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACG > SRR4302537.5277991/1‑94 (MQ=60)
GATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGT > SRR4302537.4229922/1‑94 (MQ=60)
GATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGT < SRR4302537.3619123/94‑1 (MQ=60)
ATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTG > SRR4302537.230443/1‑94 (MQ=60)
TATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGT > SRR4302537.5759584/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTT < SRR4302537.5497344/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTG < SRR4302537.5568678/94‑1 (MQ=60)
GTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCT < SRR4302537.2638996/94‑1 (MQ=60)
GTTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCT > SRR4302537.3743465/1‑94 (MQ=60)
GTGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTG < SRR4302537.1628989/94‑1 (MQ=60)
TGGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGG > SRR4302537.4621300/1‑94 (MQ=60)
GGCTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGA > SRR4302537.3852471/1‑94 (MQ=60)
CTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAG > SRR4302537.3582144/1‑94 (MQ=60)
CTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAG < SRR4302537.2693460/94‑1 (MQ=60)
CTCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAG > SRR4302537.4301237/1‑94 (MQ=60)
TCTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGA > SRR4302537.4571914/1‑94 (MQ=60)
CTGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGAT < SRR4302537.2204647/94‑1 (MQ=60)
TGTGGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATG > SRR4302537.775698/1‑94 (MQ=60)
GGCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTC < SRR4302537.1536310/94‑1 (MQ=60)
GCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTCG < SRR4302537.4346078/94‑1 (MQ=60)
GCCTGGTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTCG < SRR4302537.3499624/94‑1 (MQ=60)
GTCC‑AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTCGCGCCA < SRR4302537.3951823/94‑1 (MQ=60)
CCAAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTCGCGCCAGG < SRR4302537.3121397/94‑1 (MQ=60)
CCAAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTCGCGCCAGG < SRR4302537.1745111/94‑1 (MQ=60)
CCAAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTCGCGCCAGG > SRR4302537.1726688/1‑94 (MQ=60)
AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTCGCGCCCGGCC > SRR4302537.3999721/1‑94 (MQ=60)
AAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTCGCGCCAGGCC < SRR4302537.3401573/94‑1 (MQ=60)
AGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTCGCGCCAGGCCA > SRR4302537.6441476/1‑94 (MQ=60)
AGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTCGCGCCAGGCCA > SRR4302537.1571524/1‑94 (MQ=60)
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AGCAGATCAACGGTTCAAACAATTCAACGACTCACTGCGCTTTGATTACCGTCTGGCGGAGCAGGATATTGTTGGCTCTGTGGCCTGGTCCAAAGCCCTGGTCACGGTAGGCGTGTTAACCGCAGAAGAGCAGGCGCAACTGGAAGAGGCGCTGAACGTGTTGCTGGAAGATGTTCGCGCCAGGCCA > NC_000913/4154461‑4154647
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
