Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,529,882 |
A→G |
intergenic (‑663/+123) |
sgcX ← / ← yjhP |
putative lyase/synthase/putative methyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,529,882 | 0 | A | G | 100.0%
| 1160.7
/ NA
| 325 | intergenic (‑663/+123) | sgcX/yjhP | putative lyase/synthase/putative methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (114/211); total (114/211) |
Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
CGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGATGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTCG > NC_000913/4529792‑4529971
|
cGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATatggtg > 2:3511486/1‑93 (MQ=255)
gCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGc > 1:3582860/1‑93 (MQ=255)
cacaATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCt > 2:629678/1‑93 (MQ=255)
cacaATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCt > 2:5618625/1‑93 (MQ=255)
acaATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTc < 1:3274325/93‑1 (MQ=255)
caATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTcc < 2:5433700/93‑1 (MQ=255)
aaTATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCt < 2:498136/93‑1 (MQ=255)
atatTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCtt > 1:4254861/1‑93 (MQ=255)
ttGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATg < 2:5124467/93‑1 (MQ=255)
gATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGt < 1:1407756/93‑1 (MQ=255)
tCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGa > 1:1341999/1‑93 (MQ=255)
cACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGAc > 2:4926245/1‑93 (MQ=255)
aCTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACa < 2:2694931/93‑1 (MQ=255)
aCTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACa < 2:4556031/93‑1 (MQ=255)
aCTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACa < 2:3699529/93‑1 (MQ=255)
tGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATc < 1:4862844/93‑1 (MQ=255)
gCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCtt < 2:1615203/93‑1 (MQ=255)
aCTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGa > 1:5924438/1‑93 (MQ=255)
cTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGAt < 2:4313378/93‑1 (MQ=255)
gtgtgCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATta < 2:58237/93‑1 (MQ=255)
gtgCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATtaat < 2:1000674/93‑1 (MQ=255)
gtgCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATtaat > 1:3342187/1‑93 (MQ=255)
ggCATCTGGTGCCGACAGCGGCATGCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATtaata < 1:4504916/92‑1 (MQ=255)
gCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATtaataa < 2:6061542/93‑1 (MQ=255)
gCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATtaataa < 1:5787646/93‑1 (MQ=255)
cATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATaaa < 1:793517/93‑1 (MQ=255)
cATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATaaa > 1:5085561/1‑93 (MQ=255)
cATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATaaa < 1:1776907/93‑1 (MQ=255)
aTCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAAc < 1:874615/93‑1 (MQ=255)
aTCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAAc > 1:3140570/1‑93 (MQ=255)
aTCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAAc > 1:5133354/1‑93 (MQ=255)
tCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACa > 1:5682077/1‑93 (MQ=255)
tCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACa < 2:3130462/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACa > 1:3227372/1‑93 (MQ=255)
tGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATa > 1:6464093/1‑93 (MQ=255)
gTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACt < 2:2187935/93‑1 (MQ=255)
cGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGATCTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAat < 2:6356425/93‑1 (MQ=255)
gACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAata < 1:3843323/93‑1 (MQ=255)
aCATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAatat < 2:1398475/93‑1 (MQ=255)
aCATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAatat > 1:5005889/1‑93 (MQ=255)
aTCTGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGt < 2:2502353/93‑1 (MQ=255)
tCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTa > 2:879906/1‑93 (MQ=255)
tCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTa > 1:2758778/1‑93 (MQ=255)
tCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTa > 1:3989190/1‑93 (MQ=255)
tCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTa < 1:1530078/93‑1 (MQ=255)
cGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTAt < 2:6184031/93‑1 (MQ=255)
cGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTAt < 2:3641240/93‑1 (MQ=255)
cGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTAt < 1:2162910/93‑1 (MQ=255)
gCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATtg > 1:1040074/1‑93 (MQ=255)
gCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATtg < 2:4150282/93‑1 (MQ=255)
gCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATtg < 2:4708539/93‑1 (MQ=255)
gCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATtg < 2:6349065/93‑1 (MQ=255)
gCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATtg < 1:6375036/93‑1 (MQ=255)
aTTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATtgtg < 1:2355812/93‑1 (MQ=255)
tCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCa < 1:455924/93‑1 (MQ=255)
tCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCa < 1:2281155/93‑1 (MQ=255)
ccGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAg < 1:1596876/93‑1 (MQ=255)
cGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAgg < 2:1539991/93‑1 (MQ=255)
cGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAgg < 1:2685424/93‑1 (MQ=255)
gCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGt < 2:4188988/93‑1 (MQ=255)
gCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGt < 1:6093854/93‑1 (MQ=255)
aaGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGa > 1:3692427/1‑93 (MQ=255)
aGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGAt > 2:1831456/1‑93 (MQ=255)
gCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATa < 2:734187/93‑1 (MQ=255)
gCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATa > 1:5633668/1‑93 (MQ=255)
gCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATa < 1:1260947/93‑1 (MQ=255)
gCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATa > 1:4909121/1‑93 (MQ=255)
ccTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATAc < 2:3015512/93‑1 (MQ=255)
ccTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATAc < 1:5324885/93‑1 (MQ=255)
cTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACa < 2:669522/93‑1 (MQ=255)
tGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACAt > 1:2561311/1‑93 (MQ=255)
gACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATc < 2:525879/93‑1 (MQ=255)
cAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAg > 1:6025430/1‑93 (MQ=255)
cAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAg < 2:2989025/93‑1 (MQ=255)
cAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAg < 1:5718970/93‑1 (MQ=255)
aGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGa < 2:3863199/93‑1 (MQ=255)
aGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGa < 2:308327/93‑1 (MQ=255)
gAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGAt > 2:450620/1‑93 (MQ=255)
gAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGAt < 1:4331292/93‑1 (MQ=255)
aaCTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATc > 2:5414860/1‑93 (MQ=255)
aaCTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATc < 1:3754260/93‑1 (MQ=255)
aCTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATca > 2:3814150/1‑93 (MQ=255)
tGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATcaaa < 2:4798562/93‑1 (MQ=255)
tGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATcaaa < 2:4042187/93‑1 (MQ=255)
tGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATcaaa > 2:2869641/1‑93 (MQ=255)
gTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATcaaag < 2:273157/93‑1 (MQ=255)
cATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATcaaagcaa < 1:1832443/93‑1 (MQ=255)
aTGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATcaaagcaaa < 2:4656794/93‑1 (MQ=255)
tgttgtGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATcaaagcaaag < 1:2925732/93‑1 (MQ=255)
ttgtGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGt < 2:1915748/93‑1 (MQ=255)
gtgACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTaa > 2:5946897/1‑93 (MQ=255)
tgACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTaaa > 2:4247647/1‑93 (MQ=255)
gACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAg > 2:3546580/1‑93 (MQ=255)
gACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAg < 2:3331627/93‑1 (MQ=255)
aCATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGc < 2:1648793/93‑1 (MQ=255)
aCATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGc < 2:5542759/93‑1 (MQ=255)
cATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGcc < 1:3409416/93‑1 (MQ=255)
cATATGGTGCTCATTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGcc > 1:5263330/1‑93 (MQ=255)
atatGGTGCTCCTTATGGTGACATTTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCt > 1:6256547/1‑93 (MQ=255)
tatGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTc > 2:1242836/1‑93 (MQ=255)
|
CGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGATGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTCG > NC_000913/4529792‑4529971
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTACGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGATGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTCGATAT > NC_000913/4529789‑4529975
|
TTACGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGG > SRR4302537.3454584/1‑94 (MQ=60)
TTACGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGG < SRR4302537.5957486/94‑1 (MQ=60)
TACGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGT > SRR4302537.5908505/1‑94 (MQ=60)
ACGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTG < SRR4302537.6350152/94‑1 (MQ=60)
ACGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTG < SRR4302537.551420/94‑1 (MQ=60)
ACGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTG < SRR4302537.5603245/94‑1 (MQ=60)
ACGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTG < SRR4302537.237155/94‑1 (MQ=60)
ACGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATACCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTG < SRR4302537.5928062/94‑1 (MQ=60)
CGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGC > SRR4302537.3608115/1‑94 (MQ=60)
GCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCT > SRR4302537.3410669/1‑94 (MQ=60)
CACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTC > SRR4302537.3315874/1‑94 (MQ=60)
CACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTC < SRR4302537.4978972/94‑1 (MQ=60)
ACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCC < SRR4302537.3297433/94‑1 (MQ=60)
AATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTT > SRR4302537.4284437/1‑94 (MQ=60)
AATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTT < SRR4302537.4906109/94‑1 (MQ=60)
ATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTA < SRR4302537.76073/94‑1 (MQ=60)
ATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATG < SRR4302537.4290480/94‑1 (MQ=60)
ATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATG < SRR4302537.2325449/94‑1 (MQ=60)
ATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATG > SRR4302537.3298956/1‑94 (MQ=60)
ATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATG < SRR4302537.4649931/94‑1 (MQ=60)
ATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATG < SRR4302537.1805686/94‑1 (MQ=60)
ATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATG < SRR4302537.1640505/94‑1 (MQ=60)
TTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGG < SRR4302537.6016266/94‑1 (MQ=60)
TTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGG < SRR4302537.3859614/94‑1 (MQ=60)
TTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGG < SRR4302537.1358777/94‑1 (MQ=60)
TTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGG < SRR4302537.2352812/94‑1 (MQ=60)
GATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTG < SRR4302537.1417561/94‑1 (MQ=60)
GATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTG < SRR4302537.6074672/94‑1 (MQ=60)
GATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTG < SRR4302537.6338220/94‑1 (MQ=60)
ATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGA > SRR4302537.4243998/1‑94 (MQ=60)
ATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGA > SRR4302537.1351346/1‑94 (MQ=60)
TCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGAC < SRR4302537.3723409/94‑1 (MQ=60)
CACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACA > SRR4302537.5911698/1‑94 (MQ=60)
CACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACA < SRR4302537.380655/94‑1 (MQ=60)
ACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACAT < SRR4302537.1372416/94‑1 (MQ=60)
ACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACAT > SRR4302537.2716993/1‑94 (MQ=60)
CTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATC < SRR4302537.5162778/94‑1 (MQ=60)
CTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGACTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATC > SRR4302537.4580598/1‑94 (MQ=60)
TGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCT < SRR4302537.4896393/94‑1 (MQ=60)
GGACTGTGTGCATCTGGTGCCGGCATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTG < SRR4302537.3700746/94‑1 (MQ=60)
GCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTG < SRR4302537.1481540/94‑1 (MQ=60)
CACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGA > SRR4302537.5965095/1‑94 (MQ=60)
CTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATT > SRR4302537.6484184/1‑94 (MQ=60)
CTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATT > SRR4302537.5787002/1‑94 (MQ=60)
TGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTA < SRR4302537.3745902/94‑1 (MQ=60)
GTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAA > SRR4302537.5698888/1‑94 (MQ=60)
TGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAAT > SRR4302537.3365850/1‑94 (MQ=60)
GTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATA > SRR4302537.1482138/1‑94 (MQ=60)
GTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATA < SRR4302537.1304045/94‑1 (MQ=60)
GTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATA > SRR4302537.2231501/1‑94 (MQ=60)
GTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATA < SRR4302537.4918335/94‑1 (MQ=60)
GTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATA < SRR4302537.5752200/94‑1 (MQ=60)
GTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATA > SRR4302537.2836799/1‑94 (MQ=60)
GGCATCTGGTGCCGACAGCGGCATGCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAA < SRR4302537.4536068/94‑1 (MQ=60)
GCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAA < SRR4302537.3111398/94‑1 (MQ=60)
GCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAA < SRR4302537.5827334/94‑1 (MQ=60)
GCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAA > SRR4302537.5120569/1‑94 (MQ=60)
GCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAA > SRR4302537.5120570/1‑94 (MQ=60)
GCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAA < SRR4302537.151055/94‑1 (MQ=60)
GCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAA < SRR4302537.3992703/94‑1 (MQ=60)
CATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAAC < SRR4302537.798964/94‑1 (MQ=60)
CATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAAC > SRR4302537.5168725/1‑94 (MQ=60)
CATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAAC > SRR4302537.3162611/1‑94 (MQ=60)
CATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAAC < SRR4302537.1789287/94‑1 (MQ=60)
ATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACA < SRR4302537.880628/94‑1 (MQ=60)
ATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACA > SRR4302537.3250086/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACA > SRR4302537.5720941/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATA < SRR4302537.1641820/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATA > SRR4302537.6507882/1‑94 (MQ=60)
GGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACT < SRR4302537.3286238/94‑1 (MQ=60)
GTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTG < SRR4302537.5325474/94‑1 (MQ=60)
TGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGA > SRR4302537.3593337/1‑94 (MQ=60)
TGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGA > SRR4302537.1964575/1‑94 (MQ=60)
GCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAA < SRR4302537.3379964/94‑1 (MQ=60)
CCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAAT > SRR4302537.3090559/1‑94 (MQ=60)
CCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAAT < SRR4302537.183539/94‑1 (MQ=60)
CCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATCGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAAT > SRR4302537.527036/1‑94 (MQ=60)
GACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATAT > SRR4302537.5040362/1‑94 (MQ=60)
GACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATAT > SRR4302537.4400009/1‑94 (MQ=60)
GACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATAT < SRR4302537.1082386/94‑1 (MQ=60)
GACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATAT < SRR4302537.3870239/94‑1 (MQ=60)
CATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGT < SRR4302537.5043283/94‑1 (MQ=60)
CATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGT > SRR4302537.6409180/1‑94 (MQ=60)
CATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGT < SRR4302537.1115105/94‑1 (MQ=60)
ATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTA > SRR4302537.2778036/1‑94 (MQ=60)
ATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTA > SRR4302537.4017126/1‑94 (MQ=60)
ATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTA > SRR4302537.6273807/1‑94 (MQ=60)
ATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTA > SRR4302537.4862096/1‑94 (MQ=60)
TCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTAT < SRR4302537.3247015/94‑1 (MQ=60)
TCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTAT < SRR4302537.1540771/94‑1 (MQ=60)
CGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATT < SRR4302537.3936605/94‑1 (MQ=60)
CGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATT < SRR4302537.2178151/94‑1 (MQ=60)
GGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTG < SRR4302537.3202056/94‑1 (MQ=60)
GGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTG > SRR4302537.1047232/1‑94 (MQ=60)
GGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTACTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTG < SRR4302537.2611857/94‑1 (MQ=60)
GCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGT < SRR4302537.6418515/94‑1 (MQ=60)
CATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTG < SRR4302537.62253/94‑1 (MQ=60)
CATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTG > SRR4302537.57605/1‑94 (MQ=60)
ATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGC > SRR4302537.2192241/1‑94 (MQ=60)
ATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGC < SRR4302537.2372422/94‑1 (MQ=60)
TTCCGCGAGCCTGACAGAACTCTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCA < SRR4302537.4296283/94‑1 (MQ=60)
TTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCA < SRR4302537.3721100/94‑1 (MQ=60)
TCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAG < SRR4302537.242399/94‑1 (MQ=60)
TCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAG < SRR4302537.2297254/94‑1 (MQ=60)
TCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAG < SRR4302537.459069/94‑1 (MQ=60)
CCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGG < SRR4302537.1608032/94‑1 (MQ=60)
CGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGT < SRR4302537.2704168/94‑1 (MQ=60)
CGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGT > SRR4302537.910230/1‑94 (MQ=60)
CGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGT < SRR4302537.2107508/94‑1 (MQ=60)
GCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTG < SRR4302537.6135728/94‑1 (MQ=60)
GCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTG < SRR4302537.2441784/94‑1 (MQ=60)
GCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTG < SRR4302537.6135729/94‑1 (MQ=60)
GCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTG < SRR4302537.1606228/94‑1 (MQ=60)
GCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTG < SRR4302537.825215/94‑1 (MQ=60)
CAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGA > SRR4302537.3718414/1‑94 (MQ=60)
AAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGAT < SRR4302537.128781/94‑1 (MQ=60)
AGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATA < SRR4302537.4071833/94‑1 (MQ=60)
AGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATA > SRR4302537.4943008/1‑94 (MQ=60)
AGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATA > SRR4302537.5672214/1‑94 (MQ=60)
GCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATAC < SRR4302537.1269717/94‑1 (MQ=60)
GCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATAC < SRR4302537.5874918/94‑1 (MQ=60)
GCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATAC > SRR4302537.4567368/1‑94 (MQ=60)
GCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATAA > SRR4302537.988983/1‑94 (MQ=60)
CCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACA < SRR4302537.5361425/94‑1 (MQ=60)
CCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTACTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACA < SRR4302537.4155522/94‑1 (MQ=60)
CTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACAT > SRR4302537.2579254/1‑94 (MQ=60)
GACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCA < SRR4302537.5127200/94‑1 (MQ=60)
ACAGAGCTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAG < SRR4302537.3291500/94‑1 (MQ=60)
ACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAG > SRR4302537.5642439/1‑94 (MQ=60)
ACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAG > SRR4302537.6066833/1‑94 (MQ=60)
ACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAG < SRR4302537.2913110/94‑1 (MQ=60)
CAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGA < SRR4302537.3129955/94‑1 (MQ=60)
CAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGA < SRR4302537.5758112/94‑1 (MQ=60)
CAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGA < SRR4302537.6004853/94‑1 (MQ=60)
AGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGAT < SRR4302537.4696749/94‑1 (MQ=60)
AGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGAT > SRR4302537.4457167/1‑94 (MQ=60)
AGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGAT < SRR4302537.841978/94‑1 (MQ=60)
AGAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGAT > SRR4302537.5170147/1‑94 (MQ=60)
GAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATC < SRR4302537.3326371/94‑1 (MQ=60)
GAACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATC < SRR4302537.4361380/94‑1 (MQ=60)
AACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCCGATCA > SRR4302537.259295/1‑94 (MQ=60)
AACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCA < SRR4302537.3780626/94‑1 (MQ=60)
ACTGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAA < SRR4302537.5691300/94‑1 (MQ=60)
TGTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAG > SRR4302537.5453541/1‑94 (MQ=60)
GTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTTATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGC > SRR4302537.3534197/1‑94 (MQ=60)
GTTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGC < SRR4302537.2382031/94‑1 (MQ=60)
TTCATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCA < SRR4302537.2707663/94‑1 (MQ=60)
CATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAA < SRR4302537.1845203/94‑1 (MQ=60)
ATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAG < SRR4302537.5141596/94‑1 (MQ=60)
ATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAG < SRR4302537.2027249/94‑1 (MQ=60)
ATGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAG < SRR4302537.626724/94‑1 (MQ=60)
TGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGG < SRR4302537.5876676/94‑1 (MQ=60)
TGTTGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGG < SRR4302537.2946279/94‑1 (MQ=60)
TGTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAA > SRR4302537.5783022/1‑94 (MQ=60)
GTGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAA < SRR4302537.5597122/94‑1 (MQ=60)
TGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAG > SRR4302537.156551/1‑94 (MQ=60)
TGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAG < SRR4302537.534098/94‑1 (MQ=60)
TGACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAG > SRR4302537.682168/1‑94 (MQ=60)
GACATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGC < SRR4302537.6419798/94‑1 (MQ=60)
ACATATGGTGCTCATTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCC > SRR4302537.5299546/1‑94 (MQ=60)
CATATGGTGCTCCTTATGGTGACATTTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCT > SRR4302537.6299521/1‑94 (MQ=60)
CATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCT < SRR4302537.3433568/94‑1 (MQ=60)
CATATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCT < SRR4302537.3670231/94‑1 (MQ=60)
TATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTCG < SRR4302537.834472/94‑1 (MQ=60)
TATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTCG > SRR4302537.4961807/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTCGA > SRR4302537.739573/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTCGAT < SRR4302537.4924755/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTCGAT < SRR4302537.4771774/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTCGAT < SRR4302537.3946753/94‑1 (MQ=60)
GTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTCGATAT < SRR4302537.6129233/94‑1 (MQ=60)
GTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTCGATAT < SRR4302537.2666631/94‑1 (MQ=60)
GTGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTCGATAT < SRR4302537.550017/94‑1 (MQ=60)
|
TTACGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGATGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTCGATAT > NC_000913/4529789‑4529975
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
