Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,579,808 |
T→C |
S271G (AGC→GGC) |
hsdM ← |
DNA methylase M |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,579,808 | 0 | T | C | 97.7%
| 707.8
/ 1.2
| 215 | S271G (AGC→GGC) | hsdM | DNA methylase M |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/3); new base C (107/103); total (109/106) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.80e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
GCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCC > NC_000913/4579718‑4579898
|
gCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGcgccgc < 2:666241/93‑1 (MQ=255)
gCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGcgccgc < 2:2984804/93‑1 (MQ=255)
gCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGcgccgc > 2:4113475/1‑93 (MQ=255)
gCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGcgccgc > 2:1161630/1‑93 (MQ=255)
gCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGcgccgc < 1:5362199/93‑1 (MQ=255)
gCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGcgccgc > 1:4904647/1‑93 (MQ=255)
gCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGcgccgc < 1:1589826/93‑1 (MQ=255)
aGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCa > 2:5922642/1‑93 (MQ=255)
gCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCaa > 1:497423/1‑93 (MQ=255)
cGTTTCGATAATATGCTGCATATAGCATAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCaaa < 1:4239984/93‑1 (MQ=255)
gTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGTTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAc > 1:1496512/1‑93 (MQ=255)
gTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAc > 1:2089971/1‑93 (MQ=255)
gTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAc > 2:5958224/1‑93 (MQ=255)
tttCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAcg > 1:573885/1‑93 (MQ=255)
tttCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAcg > 1:325095/1‑93 (MQ=255)
ttCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAcgg < 2:3743121/93‑1 (MQ=255)
tCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAcggc < 1:5537893/93‑1 (MQ=255)
cGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAcggcg < 1:164688/93‑1 (MQ=255)
gATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAcggcgg < 1:2662458/93‑1 (MQ=255)
gATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAcggcgg > 2:3241547/1‑93 (MQ=255)
gATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAcggcgg < 2:5522918/93‑1 (MQ=255)
ataataTGATGCATAAAGCAAAACTGTTTGTTGCTGGTCCGGGGAACAAAGGCGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGGCGCCAAACGGCggg > 2:3334858/1‑93 (MQ=255)
taataTGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAcggcggtt < 2:6376040/93‑3 (MQ=255)
taataTGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGt > 2:1212786/1‑93 (MQ=255)
taataTGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGt > 1:1256180/1‑93 (MQ=255)
taataTGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGt < 1:3380807/93‑1 (MQ=255)
taataTGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGt < 2:3675699/93‑1 (MQ=255)
aataTGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGtt < 1:192217/93‑1 (MQ=255)
tatGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAg < 2:4332209/93‑1 (MQ=255)
tatGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAg > 1:2983335/1‑93 (MQ=255)
atGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGt > 1:6403894/1‑93 (MQ=255)
tgctgcATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTg < 2:4520117/93‑1 (MQ=255)
tgctgcATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTg < 1:1784040/93‑1 (MQ=255)
gctgcATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTgg > 2:3367757/1‑93 (MQ=255)
gctgcATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTgg > 1:2018404/1‑93 (MQ=255)
gcATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGa < 1:4441724/93‑1 (MQ=255)
cATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGAc > 2:4181873/1‑93 (MQ=255)
tAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACaa > 1:3277070/1‑93 (MQ=255)
tAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGAcca > 1:778957/1‑91 (MQ=255)
aGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAatat < 2:3968380/93‑1 (MQ=255)
acaACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTTCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATgcg < 2:3192559/93‑1 (MQ=255)
caACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATgcgc < 1:3164124/93‑1 (MQ=255)
caACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATccgc > 2:4848586/1‑93 (MQ=255)
caACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGCGCGGGGAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATgcgc > 1:1740820/1‑93 (MQ=255)
aaCTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGcc < 2:1606871/93‑1 (MQ=255)
aCTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCt < 2:2025898/93‑1 (MQ=255)
aCTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCt > 1:4052449/1‑93 (MQ=255)
tgtttgttGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGAGCCTTc > 2:5443021/1‑93 (MQ=255)
tgttggttGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTc < 2:5423088/93‑1 (MQ=255)
tttgttGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCgg < 1:5638317/93‑1 (MQ=255)
ttgttgCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGc > 1:6092182/1‑93 (MQ=255)
tgttgCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCa < 2:5277602/93‑1 (MQ=255)
ttgCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAgg < 2:4436838/93‑1 (MQ=255)
tgCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGt < 1:3664561/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGtt < 2:1911366/93‑1 (MQ=255)
tGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGGCAATATACGCCTTCGGCAGGtctt > 1:4539160/1‑93 (MQ=255)
tGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGtttt > 1:2726855/1‑93 (MQ=255)
tGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGtttt > 1:2256466/1‑93 (MQ=255)
ggTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTc > 1:2318459/1‑93 (MQ=255)
cgtgTGAACAAAGGTGCGGCTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGCATTTCAcc < 2:6364972/90‑1 (MQ=255)
cGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCAcc < 1:3492109/93‑1 (MQ=255)
gTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTc < 1:3009739/93‑1 (MQ=255)
gTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTc < 2:210944/93‑1 (MQ=255)
tGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGGCg > 2:2435902/1‑93 (MQ=255)
aCAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTa > 1:479393/1‑93 (MQ=255)
aCAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGCTTTCACCGTCGCTa > 1:5887309/1‑93 (MQ=255)
cAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTAc < 1:3656873/93‑1 (MQ=255)
cAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTAc < 1:6157140/93‑1 (MQ=255)
ggTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCag < 1:5717877/93‑1 (MQ=255)
gTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCaga < 2:793857/93‑1 (MQ=255)
gTGCGGGTAATGTGGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCaga < 1:3851804/93‑1 (MQ=255)
tGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTTACCGTCGCTACCCagag > 1:5184429/1‑93 (MQ=255)
gggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGGCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCAGAgtgt > 1:1190379/1‑93 (MQ=255)
gggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAgtgt > 2:2328250/1‑93 (MQ=255)
tAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGc < 1:930806/93‑1 (MQ=255)
tAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCCCCGTCGGTACCCAGAGTGTTGc > 2:5724596/1‑93 (MQ=255)
aaTGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGcc > 1:5014350/1‑93 (MQ=255)
aaTGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCCACCATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCGACGTCGCTACCCAGAGTGTTGcc > 2:6233866/1‑93 (MQ=255)
tGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCa < 2:244579/93‑1 (MQ=255)
tGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCa < 1:3726778/93‑1 (MQ=255)
gTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGccccg > 1:1024281/1‑91 (MQ=255)
gTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAg < 2:4567846/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGa < 1:435402/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGa < 2:6199031/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGa > 2:4540948/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGa > 1:4596578/1‑93 (MQ=255)
gTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACgg > 1:296348/1‑93 (MQ=255)
tGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGa > 2:1961358/1‑93 (MQ=255)
tGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGa < 2:4305392/93‑1 (MQ=255)
gCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCTAACCAGAGTGTTGTCCAGACGGAt > 2:2786980/1‑93 (MQ=255)
ccTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGAtt < 1:5961002/93‑1 (MQ=255)
ccTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGAtt < 2:5620013/93‑1 (MQ=255)
ccTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGAtt < 2:5082692/93‑1 (MQ=255)
ccTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAAAGTGTTGCCCTGACGGAtt < 2:6329716/93‑1 (MQ=255)
cTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTg > 1:6205308/1‑93 (MQ=255)
cTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTg < 1:2417444/93‑1 (MQ=255)
tGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTgc < 2:1408033/93‑1 (MQ=255)
cggcgCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTgcgc < 2:6029353/93‑1 (MQ=255)
cggcgCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTgcgc < 2:3055805/93‑1 (MQ=255)
ggcgCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGcgcc < 2:3534694/93‑1 (MQ=255)
|
GCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCC > NC_000913/4579718‑4579898
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTG > NC_000913/4579715‑4579901
|
GATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCC > SRR4302537.476725/1‑94 (MQ=60)
GATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCC > SRR4302537.1350103/1‑94 (MQ=60)
ATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCG > SRR4302537.2850642/1‑94 (MQ=60)
ATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCG > SRR4302537.2962039/1‑94 (MQ=60)
TGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGC > SRR4302537.4938501/1‑94 (MQ=60)
GCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCC < SRR4302537.5398908/94‑1 (MQ=60)
GCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCC < SRR4302537.1600942/94‑1 (MQ=60)
CAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCA < SRR4302537.959002/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAA > SRR4302537.500845/1‑94 (MQ=60)
AGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAA > SRR4302537.3332539/1‑94 (MQ=60)
CGTTTCGATAATATGCTGCATATAGCATAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAC < SRR4302537.4269465/94‑1 (MQ=60)
CGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGTTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAC > SRR4302537.1506948/1‑94 (MQ=60)
CGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAC > SRR4302537.2104711/1‑94 (MQ=60)
CGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAC < SRR4302537.6484506/94‑1 (MQ=60)
CGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAC < SRR4302537.1803144/94‑1 (MQ=60)
CGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAC < SRR4302537.6427229/94‑1 (MQ=60)
CGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAAC > SRR4302537.1375156/1‑94 (MQ=60)
GTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACG > SRR4302537.327349/1‑94 (MQ=60)
GTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACG < SRR4302537.3541568/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACG > SRR4302537.577825/1‑94 (MQ=60)
TCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCG < SRR4302537.5615696/94‑1 (MQ=60)
TCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCG < SRR4302537.5575697/94‑1 (MQ=60)
CGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGG > SRR4302537.1696418/1‑94 (MQ=60)
CGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGG < SRR4302537.165858/94‑1 (MQ=60)
CGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGG > SRR4302537.4056241/1‑94 (MQ=60)
GATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGG < SRR4302537.1793081/94‑1 (MQ=60)
GATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGG < SRR4302537.2681059/94‑1 (MQ=60)
ATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGT > SRR4302537.1264920/1‑94 (MQ=60)
ATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGT > SRR4302537.226845/1‑94 (MQ=60)
ATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGAGGGTGATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAGACGGAGGGT > SRR4302537.2270529/1‑94 (MQ=60)
TAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTT < SRR4302537.3404761/94‑1 (MQ=60)
AATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTA < SRR4302537.193581/94‑1 (MQ=60)
ATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAG < SRR4302537.5195286/94‑1 (MQ=60)
ATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAG > SRR4302537.4983829/1‑94 (MQ=60)
ATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAG > SRR4302537.523760/1‑94 (MQ=60)
ATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAG > SRR4302537.3004188/1‑94 (MQ=60)
ATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAG > SRR4302537.4281352/1‑94 (MQ=60)
TATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGT > SRR4302537.6447483/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTG < SRR4302537.2355864/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGG < SRR4302537.1796481/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGG < SRR4302537.3238255/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGG > SRR4302537.2032476/1‑94 (MQ=60)
GCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGAC < SRR4302537.4472399/94‑1 (MQ=60)
CATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTGGGGGCGACA > SRR4302537.3969489/1‑94 (MQ=60)
CATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACA > SRR4302537.604903/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAaggggggaca > SRR4302537.3099135/1‑84 (MQ=60)
ATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAA > SRR4302537.3300196/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAA < SRR4302537.3450189/94‑1 (MQ=60)
ATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACCA > SRR4302537.784304/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAA > SRR4302537.561867/1‑94 (MQ=60)
TAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAAT < SRR4302537.2637568/94‑1 (MQ=60)
AAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATAT < SRR4302537.2272694/94‑1 (MQ=60)
ACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGC > SRR4302537.4596059/1‑94 (MQ=60)
ACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGCGCGGGGAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGCGC > SRR4302537.1752953/1‑94 (MQ=60)
CAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCC < SRR4302537.3186342/94‑1 (MQ=60)
AACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCT > SRR4302537.3092247/1‑94 (MQ=60)
AACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCT > SRR4302537.5749178/1‑94 (MQ=60)
AACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCT > SRR4302537.4080786/1‑94 (MQ=60)
AACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGCGCCT > SRR4302537.4459368/1‑94 (MQ=60)
AACTGTTTGTTGCGGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGGCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCT < SRR4302537.1170260/94‑1 (MQ=60)
ACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTT > SRR4302537.3686053/1‑94 (MQ=60)
ACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTT < SRR4302537.3791292/94‑1 (MQ=60)
ACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTT > SRR4302537.6264663/1‑94 (MQ=60)
TGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCG < SRR4302537.5106798/94‑1 (MQ=60)
TTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGC < SRR4302537.5676903/94‑1 (MQ=60)
TTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGC > SRR4302537.6134041/1‑94 (MQ=60)
TTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCTGCA > SRR4302537.3005133/1‑94 (MQ=60)
TGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAG < SRR4302537.2989650/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGT < SRR4302537.6185443/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTT < SRR4302537.4613857/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTT < SRR4302537.3690357/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTT > SRR4302537.2708733/1‑94 (MQ=60)
CTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTT > SRR4302537.2028941/1‑94 (MQ=60)
CTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGGCAATATACGCCTTCGGCAGGTCTT > SRR4302537.4570581/1‑94 (MQ=60)
CTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTT > SRR4302537.2272392/1‑94 (MQ=60)
CTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTT > SRR4302537.2745898/1‑94 (MQ=60)
CTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAAAATGCGCCTTCGGCAGGTTTT > SRR4302537.4306452/1‑94 (MQ=60)
TGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTC > SRR4302537.5020034/1‑94 (MQ=60)
TGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTC > SRR4302537.2334831/1‑94 (MQ=60)
TGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTC < SRR4302537.1605353/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCG < SRR4302537.3516809/94‑1 (MQ=60)
GGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGT < SRR4302537.4942321/94‑1 (MQ=60)
GTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCG < SRR4302537.3030683/94‑1 (MQ=60)
GTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCG < SRR4302537.1693111/94‑1 (MQ=60)
GAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCAACGTCGGT > SRR4302537.1320383/1‑94 (MQ=60)
AACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTA > SRR4302537.482680/1‑94 (MQ=60)
AACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGCTTTCACCGTCGCTA > SRR4302537.5927702/1‑94 (MQ=60)
CAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACC < SRR4302537.3682610/94‑1 (MQ=60)
CAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACC < SRR4302537.6199514/94‑1 (MQ=60)
CAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACC > SRR4302537.3000614/1‑94 (MQ=60)
AAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCA > SRR4302537.4837061/1‑94 (MQ=60)
AAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGAGCCTTCGGgccggcttcaccctcgccatcca > SRR4302537.5513702/1‑71 (MQ=60)
AGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAG < SRR4302537.3104417/94‑1 (MQ=60)
GGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGA < SRR4302537.5757010/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTTACCGTCGCTACCCAGAG > SRR4302537.5220093/1‑94 (MQ=60)
GTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAG > SRR4302537.2042412/1‑94 (MQ=60)
GTGCGGGTAATGTGGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAG < SRR4302537.3878771/94‑1 (MQ=60)
TGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCcgcgg > SRR4302537.3549138/1‑89 (MQ=60)
TGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGT < SRR4302537.5872453/94‑1 (MQ=60)
CGGTTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGATAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGT < SRR4302537.790081/94‑1 (MQ=60)
CGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGGCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGT > SRR4302537.1198647/1‑94 (MQ=60)
TAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCC < SRR4302537.937220/94‑1 (MQ=60)
TAATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCC > SRR4302537.5048888/1‑94 (MQ=60)
AATGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATACGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGGCGCTACCCAGAGTGGTGCCC > SRR4302537.3727571/1‑94 (MQ=60)
TGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCCG > SRR4302537.1031329/1‑94 (MQ=60)
TGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAG < SRR4302537.3752959/94‑1 (MQ=60)
TGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAG < SRR4302537.4225325/94‑1 (MQ=60)
TGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAG < SRR4302537.5826079/94‑1 (MQ=60)
TGTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAG < SRR4302537.5968534/94‑1 (MQ=60)
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GTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGA > SRR4302537.2943257/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGA > SRR4302537.4628392/1‑94 (MQ=60)
TTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGAC < SRR4302537.2541025/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGAC < SRR4302537.438438/94‑1 (MQ=60)
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GGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGG < SRR4302537.1533460/94‑1 (MQ=60)
GGTGCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCCTCGGCAGGGTTTCACCGGCGCTACCCCGAGTGTTGCCCAGACGG > SRR4302537.4051452/1‑94 (MQ=60)
GCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATT < SRR4302537.4568591/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATT < SRR4302537.878088/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATT < SRR4302537.4648243/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTG < SRR4302537.6001917/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTG < SRR4302537.3280838/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTG > SRR4302537.6248071/1‑94 (MQ=60)
CCTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTG > SRR4302537.576229/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGC < SRR4302537.2434450/94‑1 (MQ=60)
TGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCG > SRR4302537.6216014/1‑94 (MQ=60)
TGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCG > SRR4302537.604675/1‑94 (MQ=60)
TGCGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCG > SRR4302537.3379625/1‑94 (MQ=60)
CGGCGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCC < SRR4302537.3687241/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCC < SRR4302537.1211828/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCC > SRR4302537.1172477/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGGGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCC > SRR4302537.1665369/1‑94 (MQ=60)
CGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTG < SRR4302537.1456704/94‑1 (MQ=60)
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GATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTG > NC_000913/4579715‑4579901
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
