Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,110,991 |
A→G |
D40G (GAT→GGT) |
yiiT → |
putative regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,110,991 | 0 | A | G | 84.4%
| 729.9
/ 127.8
| 315 | D40G (GAT→GGT) | yiiT | putative regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (20/29); new base G (143/123); total (163/152) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.20e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.51e-01 |
Only 100 of 338 total aligned reads displayed.
AATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTG > NC_000913/4110899‑4111082
|
aaTTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtga < 1:6266845/93‑1 (MQ=255)
tttCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtggtg > 1:4430217/1‑93 (MQ=255)
tttCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtggtg > 2:3739754/1‑93 (MQ=255)
ttCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtggtga < 1:655147/93‑1 (MQ=255)
ttCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtggtga < 2:4440081/93‑1 (MQ=255)
tCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTggtgat > 2:6462969/1‑93 (MQ=255)
tCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTggtgat < 1:2289259/93‑1 (MQ=255)
cGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTCACGTTAATTCATATTGGTGATgg > 1:5034771/1‑93 (MQ=255)
gggAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGc < 1:1214774/93‑1 (MQ=255)
gAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCtt > 1:6650360/1‑93 (MQ=255)
aTGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTaa < 2:2147182/93‑1 (MQ=255)
aTGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTaa < 2:436214/93‑1 (MQ=255)
tGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGTCTTAAg < 2:6990279/93‑1 (MQ=255)
tGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAg < 1:5579635/93‑1 (MQ=255)
tGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAg > 1:930521/1‑93 (MQ=255)
gaagaaGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGc > 1:1990046/1‑93 (MQ=255)
gaagaaGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGc > 2:2540511/1‑93 (MQ=255)
gaagaaGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGc > 2:405003/1‑93 (MQ=255)
agaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGa < 2:4956450/93‑1 (MQ=255)
agaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGa > 2:5580618/1‑93 (MQ=255)
gaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAg > 1:4692836/1‑93 (MQ=255)
aagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGt < 1:6932190/93‑1 (MQ=255)
gaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTg > 2:1624555/1‑93 (MQ=255)
tGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTa > 2:6200565/1‑93 (MQ=255)
tGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTa < 2:7316482/93‑1 (MQ=255)
gCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTAt < 1:4981565/93‑1 (MQ=255)
cTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATcc < 1:4300459/93‑1 (MQ=255)
ttACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCg > 2:5500970/1‑93 (MQ=255)
ttACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCg > 2:2858099/1‑93 (MQ=255)
ttACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCg > 2:4289842/1‑93 (MQ=255)
tACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCgg < 2:1408013/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGt < 2:3658694/93‑1 (MQ=255)
tGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTa > 2:2422015/1‑93 (MQ=255)
tGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTa > 2:3891112/1‑93 (MQ=255)
tGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCAAATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCgtgca > 1:1607129/1‑89 (MQ=255)
gTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATc < 1:7464069/93‑1 (MQ=255)
gTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATc > 1:3605445/1‑93 (MQ=255)
gAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTa > 2:835919/1‑93 (MQ=255)
aaTAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTAc < 2:2248322/93‑1 (MQ=255)
aTAAAGCCCTGGAGCTCACCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACt < 1:4149657/93‑1 (MQ=255)
tAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACtt > 2:6273665/1‑93 (MQ=255)
tAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACtt > 1:2454765/1‑93 (MQ=255)
tAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACtt > 1:4885033/1‑93 (MQ=255)
tAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACtt > 1:575638/1‑93 (MQ=255)
tAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACtt > 1:455987/1‑93 (MQ=255)
aaaGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATCACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTc > 2:5140186/1‑93 (MQ=255)
aaGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTcc > 2:2652123/1‑93 (MQ=255)
aGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTccc < 1:2930775/93‑1 (MQ=255)
aGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTccc < 1:6320696/93‑1 (MQ=255)
tGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGTGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCaa > 1:7083757/1‑93 (MQ=255)
gAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACa > 1:774164/1‑93 (MQ=255)
gAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACa < 2:174877/93‑1 (MQ=255)
gCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACaga > 1:6807996/1‑93 (MQ=255)
cTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACagaa > 2:5086867/1‑93 (MQ=255)
cTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACagaa < 1:3829510/93‑1 (MQ=255)
gCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGat > 1:5633776/1‑93 (MQ=255)
ccAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGata < 2:4101637/93‑1 (MQ=255)
cAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGGGTTGTATCCGGGAATCTACTTCCCTGCAACAGAAGatat > 1:1838296/1‑93 (MQ=255)
cAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGatat > 2:2005172/1‑93 (MQ=255)
cAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGatat < 2:5434987/93‑1 (MQ=255)
gACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATAttc > 2:5891647/1‑93 (MQ=255)
gACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATAttc > 2:1011354/1‑93 (MQ=255)
gACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATAttc < 2:1789394/93‑1 (MQ=255)
gACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATAtt < 2:2976519/92‑1 (MQ=255)
aTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATAttcttc < 1:1313478/93‑1 (MQ=255)
aTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATAttcttc < 1:2371593/93‑1 (MQ=255)
aTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATAttcttc > 1:3943662/1‑93 (MQ=255)
tAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCCACAGAAGATATTCTTCa < 2:4904086/93‑1 (MQ=255)
tGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAAtt > 2:419348/1‑93 (MQ=255)
gCTCACCTGACGTTTATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAAttgttg > 1:6081881/1‑93 (MQ=255)
cTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTga < 2:6699141/93‑1 (MQ=255)
cTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTga < 1:2045259/93‑1 (MQ=255)
tCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTgaa > 2:7431585/1‑93 (MQ=255)
tCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTgaa > 1:7267141/1‑93 (MQ=255)
tCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTgaa < 2:3334178/93‑1 (MQ=255)
aCCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTgaaga > 2:6845359/1‑93 (MQ=255)
aCCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTgaaga < 2:7340502/93‑1 (MQ=255)
ccTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTgaagaa < 2:6405133/93‑1 (MQ=255)
ccTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTgaagaa > 1:3015208/1‑93 (MQ=255)
cTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAAt > 2:3491351/1‑93 (MQ=255)
cTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAAt > 1:2606862/1‑93 (MQ=255)
cTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAAt > 1:6453494/1‑93 (MQ=255)
tGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATa < 1:1004859/93‑1 (MQ=255)
tGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATa < 2:5267434/93‑1 (MQ=255)
gACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATaa < 1:1696786/93‑1 (MQ=255)
aCGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAg < 2:6093488/93‑1 (MQ=255)
cGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGt < 1:3483382/93‑1 (MQ=255)
cGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGt < 1:523086/93‑1 (MQ=255)
gTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTc < 2:7516979/93‑1 (MQ=255)
gTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTc < 2:3157827/93‑1 (MQ=255)
ttAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCg > 1:7382295/1‑93 (MQ=255)
aTTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGAt > 1:6193288/1‑93 (MQ=255)
ttCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATa > 1:4444265/1‑93 (MQ=255)
tCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATaa < 2:1961618/93‑1 (MQ=255)
atatTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACa < 2:502793/93‑1 (MQ=255)
atatTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACa > 2:1536174/1‑93 (MQ=255)
tatTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACaa < 1:5251309/93‑1 (MQ=255)
tatTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACaa > 2:4741497/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGc < 2:14474/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGc > 2:6001000/1‑93 (MQ=255)
|
AATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTG > NC_000913/4110899‑4111082
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTA > NC_000913/4110898‑4111084
|
CAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGG > SRR4302542.2989018/1‑94 (MQ=60)
CAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGA > SRR4302542.1902768/1‑94 (MQ=60)
AATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGT > SRR4302542.6940175/1‑94 (MQ=60)
AATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGT > SRR4302542.6587451/1‑94 (MQ=60)
AATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGAT < SRR4302542.6328607/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTG > SRR4302542.1165759/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTG < SRR4302542.2115178/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTG > SRR4302542.4541330/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTG > SRR4302542.282220/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTG > SRR4302542.4473721/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATG < SRR4302542.5820884/94‑1 (MQ=60)
TTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGAT < SRR4302542.660803/94‑1 (MQ=60)
TCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATG < SRR4302542.2308927/94‑1 (MQ=60)
TCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATG < SRR4302542.6609564/94‑1 (MQ=60)
CCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTCACGTTAATTCATATTGGTGATGG > SRR4302542.5083653/1‑94 (MQ=60)
GGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCT < SRR4302542.1225232/94‑1 (MQ=60)
GGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTT > SRR4302542.6664056/1‑94 (MQ=60)
GGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTT > SRR4302542.6715896/1‑94 (MQ=60)
AATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAA < SRR4302542.5773779/94‑1 (MQ=60)
AATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAA > SRR4302542.363761/1‑94 (MQ=60)
AATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAA > SRR4302542.2989680/1‑94 (MQ=60)
ATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAG < SRR4302542.261180/94‑1 (MQ=60)
ATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAG > SRR4302542.938526/1‑94 (MQ=60)
TGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGC < SRR4302542.5633854/94‑1 (MQ=60)
TGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGC > SRR4302542.2007218/1‑94 (MQ=60)
TGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGC > SRR4302542.733623/1‑94 (MQ=60)
TGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGC > SRR4302542.3609182/1‑94 (MQ=60)
AAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGA > SRR4302542.5426178/1‑94 (MQ=60)
AAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGA < SRR4302542.490450/94‑1 (MQ=60)
AGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAG < SRR4302542.6504490/94‑1 (MQ=60)
AGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAG > SRR4302542.4738658/1‑94 (MQ=60)
AGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAG < SRR4302542.3463577/94‑1 (MQ=60)
AAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTT > SRR4302542.2311858/1‑94 (MQ=60)
AAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTT < SRR4302542.7000253/94‑1 (MQ=60)
AAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTT < SRR4302542.7409186/94‑1 (MQ=60)
AAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTT > SRR4302542.74696/1‑94 (MQ=60)
AGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTG > SRR4302542.4484206/1‑94 (MQ=60)
AGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTG < SRR4302542.3551580/94‑1 (MQ=60)
GATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGT > SRR4302542.840831/1‑94 (MQ=60)
TGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTAT < SRR4302542.2413344/94‑1 (MQ=60)
TGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTAT < SRR4302542.4518610/94‑1 (MQ=60)
GCCTTCCTGGTGAATAAAGCCCTGGACCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATC < SRR4302542.4087169/94‑1 (MQ=60)
GCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATC < SRR4302542.5029917/94‑1 (MQ=60)
CTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑G > SRR4302542.5990959/1‑94 (MQ=60)
CTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑G > SRR4302542.6768280/1‑94 (MQ=60)
CTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑G > SRR4302542.7395212/1‑94 (MQ=60)
CTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑G < SRR4302542.4342746/94‑1 (MQ=60)
TTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GG > SRR4302542.941593/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTA < SRR4302542.4989080/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCAAATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑Gtgca > SRR4302542.1621008/1‑90 (MQ=60)
GGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATC > SRR4302542.3639043/1‑94 (MQ=60)
GTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCT < SRR4302542.7537194/94‑1 (MQ=60)
TGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTA < SRR4302542.563024/94‑1 (MQ=60)
AATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACT < SRR4302542.6317805/94‑1 (MQ=60)
AATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACT < SRR4302542.1823424/94‑1 (MQ=60)
AATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACT < SRR4302542.1956379/94‑1 (MQ=60)
ATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTT > SRR4302542.580585/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTT > SRR4302542.459929/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTT > SRR4302542.2478632/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTT > SRR4302542.4932567/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTT > SRR4302542.6616588/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGCCCTGGAGCTCACCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTT < SRR4302542.4190529/94‑1 (MQ=60)
TAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTC > SRR4302542.2899536/1‑94 (MQ=60)
AGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCT < SRR4302542.2958847/94‑1 (MQ=60)
AGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCT < SRR4302542.6382989/94‑1 (MQ=60)
CCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGC < SRR4302542.3717886/94‑1 (MQ=60)
CCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCA > SRR4302542.515069/1‑94 (MQ=60)
CCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCA > SRR4302542.1504022/1‑94 (MQ=60)
CCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCA < SRR4302542.5164878/94‑1 (MQ=60)
CCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCA > SRR4302542.4473764/1‑94 (MQ=60)
CTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGTGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAA > SRR4302542.7153263/1‑94 (MQ=60)
CTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGGTATCTCCTTCCCTGCA > SRR4302542.6233322/1‑94 (MQ=60)
CTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAA > SRR4302542.6871228/1‑94 (MQ=60)
CTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAA > SRR4302542.6887855/1‑94 (MQ=60)
TGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAAC < SRR4302542.6881058/94‑1 (MQ=60)
TGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAAC > SRR4302542.4859042/1‑94 (MQ=60)
GGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACA > SRR4302542.780849/1‑94 (MQ=60)
GAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAG < SRR4302542.5284653/94‑1 (MQ=60)
GAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAG < SRR4302542.504620/94‑1 (MQ=60)
GAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAG < SRR4302542.971267/94‑1 (MQ=60)
AGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGA > SRR4302542.6874930/1‑94 (MQ=60)
AGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGA > SRR4302542.1592770/1‑94 (MQ=60)
CTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAG < SRR4302542.3874080/94‑1 (MQ=60)
CTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAG < SRR4302542.6347940/94‑1 (MQ=60)
CTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAG < SRR4302542.5478212/94‑1 (MQ=60)
CTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAG < SRR4302542.3867387/94‑1 (MQ=60)
CGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGAT < SRR4302542.2405829/94‑1 (MQ=60)
CGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGAT > SRR4302542.5688480/1‑94 (MQ=60)
CGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGAT > SRR4302542.4906063/1‑94 (MQ=60)
CGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGAT < SRR4302542.129224/94‑1 (MQ=60)
GCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATA > SRR4302542.3140278/1‑94 (MQ=60)
GCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATA < SRR4302542.5145016/94‑1 (MQ=60)
GCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATA < SRR4302542.1411126/94‑1 (MQ=60)
GCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATA > SRR4302542.3906145/1‑94 (MQ=60)
CCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGGGTTGTATCC‑GGGAATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATAT > SRR4302542.1854207/1‑94 (MQ=60)
CAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATT > SRR4302542.6333398/1‑94 (MQ=60)
AGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTC < SRR4302542.7064208/94‑1 (MQ=60)
AGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTC < SRR4302542.1688066/94‑1 (MQ=60)
AGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTC > SRR4302542.3005025/1‑94 (MQ=60)
AGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTC > SRR4302542.4623884/1‑94 (MQ=60)
AGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTC < SRR4302542.7559389/94‑1 (MQ=60)
AGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTC > SRR4302542.7590246/1‑94 (MQ=60)
GACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCT < SRR4302542.4418548/94‑1 (MQ=60)
CATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTC > SRR4302542.3982615/1‑94 (MQ=60)
CATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTC > SRR4302542.3811919/1‑94 (MQ=60)
ATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCA < SRR4302542.2392458/94‑1 (MQ=60)
ATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCA > SRR4302542.6058558/1‑94 (MQ=60)
ATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCA < SRR4302542.1324794/94‑1 (MQ=60)
AATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAAT > SRR4302542.2116833/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATT < SRR4302542.6291173/94‑1 (MQ=60)
TGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTG < SRR4302542.4310073/94‑1 (MQ=60)
TGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACACAAGATATTCTTCAATTG < SRR4302542.6906110/94‑1 (MQ=60)
CGCTCACCTGACGTTTATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTG > SRR4302542.6140772/1‑94 (MQ=60)
CGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTG < SRR4302542.1981619/94‑1 (MQ=60)
CGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTG < SRR4302542.4688869/94‑1 (MQ=60)
GCTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGA > SRR4302542.746569/1‑94 (MQ=60)
GCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGA > SRR4302542.4091481/1‑94 (MQ=60)
CTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAA > SRR4302542.7338379/1‑94 (MQ=60)
CTCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAA < SRR4302542.1145894/94‑1 (MQ=60)
CTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAA < SRR4302542.2062940/94‑1 (MQ=60)
TCACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAG < SRR4302542.814889/94‑1 (MQ=60)
TCACCTGACGTTAATTCATATTGGTAATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAG < SRR4302542.1296121/94‑1 (MQ=60)
CACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGA > SRR4302542.5340615/1‑94 (MQ=60)
ACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAA > SRR4302542.3044025/1‑94 (MQ=60)
ACCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAA > SRR4302542.5636223/1‑94 (MQ=60)
ACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAA < SRR4302542.1663995/94‑1 (MQ=60)
CCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAAT > SRR4302542.2632071/1‑94 (MQ=60)
CCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAAT < SRR4302542.6562363/94‑1 (MQ=60)
CCTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAAT < SRR4302542.23531/94‑1 (MQ=60)
CCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAAT > SRR4302542.6517038/1‑94 (MQ=60)
CTGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATA > SRR4302542.1737121/1‑94 (MQ=60)
TGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAA > SRR4302542.2304471/1‑94 (MQ=60)
TGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAA < SRR4302542.1013514/94‑1 (MQ=60)
TGACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAA < SRR4302542.578838/94‑1 (MQ=60)
GACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAG > SRR4302542.761248/1‑94 (MQ=60)
GACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAG < SRR4302542.6358333/94‑1 (MQ=60)
GACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAG < SRR4302542.2017921/94‑1 (MQ=60)
GACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAG < SRR4302542.1711487/94‑1 (MQ=60)
ACGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGT > SRR4302542.7326006/1‑94 (MQ=60)
CGTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTC > SRR4302542.2057095/1‑94 (MQ=60)
CGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTC < SRR4302542.527609/94‑1 (MQ=60)
CGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTC < SRR4302542.3515971/94‑1 (MQ=60)
GTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCG > SRR4302542.7454576/1‑94 (MQ=60)
GTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCG < SRR4302542.6454689/94‑1 (MQ=60)
GTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCG < SRR4302542.3097708/94‑1 (MQ=60)
GTTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGCATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCG > SRR4302542.4452332/1‑94 (MQ=60)
GTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCG > SRR4302542.731085/1‑94 (MQ=60)
TTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGG > SRR4302542.2483281/1‑94 (MQ=60)
TTAATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGG < SRR4302542.5299541/94‑1 (MQ=60)
TTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGG < SRR4302542.4523562/94‑1 (MQ=60)
AATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGAT > SRR4302542.6253594/1‑94 (MQ=60)
AATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGAT > SRR4302542.6253595/1‑94 (MQ=60)
AATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGAT > SRR4302542.210851/1‑94 (MQ=60)
ATTCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATA > SRR4302542.4487873/1‑94 (MQ=60)
TCATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAAC < SRR4302542.4945375/94‑1 (MQ=60)
CATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACA > SRR4302542.7116027/1‑94 (MQ=60)
ATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAA > SRR4302542.2562357/1‑94 (MQ=60)
ATATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAA < SRR4302542.4200951/94‑1 (MQ=60)
TATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAG < SRR4302542.5302355/94‑1 (MQ=60)
TATTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAG < SRR4302542.5057371/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCT < SRR4302542.4299964/94‑1 (MQ=60)
TGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTG > SRR4302542.4849231/1‑94 (MQ=60)
TGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTG > SRR4302542.3149903/1‑94 (MQ=60)
TGGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTG < SRR4302542.3039050/94‑1 (MQ=60)
TGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTG > SRR4302542.6542425/1‑94 (MQ=60)
GGTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGT > SRR4302542.930276/1‑94 (MQ=60)
GTGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTA < SRR4302542.6146337/94‑1 (MQ=60)
|
CAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCC‑GGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTA > NC_000913/4110898‑4111084
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
