Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,467,145 |
A→G |
L649L (TTA→TTG) |
mgtA → |
Mg2+ transport ATPase, P‑type 1 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,467,145 | 0 | A | G | 84.6%
| 670.5
/ 109.6
| 293 | L649L (TTA→TTG) | mgtA | Mg2+ transport ATPase, P‑type 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (17/28); new base G (127/121); total (144/149) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.07e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
CGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGATGG > NC_000913/4467054‑4467236
|
gCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTgcgcgc > 1:5320709/1‑93 (MQ=255)
gCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTgcgcgc > 2:3223194/1‑93 (MQ=255)
cATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGCATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCt > 2:1251879/1‑93 (MQ=255)
aTAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTg > 1:3357363/1‑93 (MQ=255)
aTAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTg > 1:208566/1‑93 (MQ=255)
aTAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTg > 2:1351448/1‑93 (MQ=255)
aTAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTg > 1:2901973/1‑93 (MQ=255)
tAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGc < 2:6491366/93‑1 (MQ=255)
aaaGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGGATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCg < 1:1297646/93‑1 (MQ=255)
aaaGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCg < 2:1669927/93‑1 (MQ=255)
aGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGa < 1:1111209/93‑1 (MQ=255)
aGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGa < 2:4273575/93‑1 (MQ=255)
gAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGat > 2:3667934/1‑93 (MQ=255)
aaCGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGata < 1:2740412/93‑1 (MQ=255)
aaCGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGata < 2:1472980/93‑1 (MQ=255)
aCGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGatat > 2:7054794/1‑93 (MQ=255)
aCGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGatat > 2:4454477/1‑93 (MQ=255)
cATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCgg > 1:3961042/1‑93 (MQ=255)
tgtgACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCAt < 1:3574044/93‑1 (MQ=255)
tgtgACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCAt > 1:5567708/1‑93 (MQ=255)
gtgACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCAtt > 1:117919/1‑93 (MQ=255)
gACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTc < 2:7092113/93‑1 (MQ=255)
gACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTc > 2:4438303/1‑93 (MQ=255)
gACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTc > 2:7366644/1‑93 (MQ=255)
aCCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCt < 2:6634664/93‑1 (MQ=255)
ccTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCtg > 1:2690766/1‑93 (MQ=255)
ccTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCtg < 1:4549165/93‑1 (MQ=255)
cTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCtgt > 1:7465950/1‑93 (MQ=255)
cTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCtgt < 2:2632003/93‑1 (MQ=255)
ttACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCtgtg > 1:2321373/1‑93 (MQ=255)
tACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTgg < 1:417047/93‑1 (MQ=255)
aCTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGa < 2:3023268/93‑1 (MQ=255)
aCTGAAGCGCGAAGGGCATGGGGTTGGCTTTTTGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTTGa > 1:4930599/1‑93 (MQ=255)
tGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACg > 2:1159882/1‑93 (MQ=255)
gAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACgg > 1:883077/1‑93 (MQ=255)
aaGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGgc < 2:5019658/93‑1 (MQ=255)
aGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGgcg > 1:6391899/1‑93 (MQ=255)
gcgcGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGgcgc < 1:4086280/93‑1 (MQ=255)
gcgcGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGgcgc < 2:3992198/93‑1 (MQ=255)
gcgAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCgg < 2:5920720/93‑1 (MQ=255)
cgAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGt < 2:3907026/93‑1 (MQ=255)
gAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTa < 2:400952/93‑1 (MQ=255)
aaGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAg > 2:1607282/1‑93 (MQ=255)
aaGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAg > 2:7455011/1‑93 (MQ=255)
gggCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGat < 1:995225/93‑1 (MQ=255)
gggCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGat > 2:5491236/1‑93 (MQ=255)
ggCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGata > 2:3568721/1‑93 (MQ=255)
gCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGatat < 1:5938374/93‑1 (MQ=255)
tgtgGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGc > 2:6806987/1‑93 (MQ=255)
gtgGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGcc < 2:78005/93‑1 (MQ=255)
tgGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGccc < 2:6020154/93‑1 (MQ=255)
gTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGt < 2:2225283/93‑1 (MQ=255)
ggCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGaa > 1:6143278/1‑93 (MQ=255)
ggCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGaa < 1:47829/93‑1 (MQ=255)
ggCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGaa < 1:3107993/93‑1 (MQ=255)
ggCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGaa > 1:7321368/1‑93 (MQ=255)
gCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAg > 2:7241863/1‑93 (MQ=255)
gCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAg < 1:6951891/93‑1 (MQ=255)
gCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAg < 2:3409840/93‑1 (MQ=255)
cTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGc < 1:6345333/93‑1 (MQ=255)
cTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGc < 2:5183368/93‑1 (MQ=255)
cTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGc < 2:2246359/93‑1 (MQ=255)
tttATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCg > 1:7391798/1‑93 (MQ=255)
tttATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCg > 1:3797156/1‑93 (MQ=255)
ttATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCgg > 1:5720630/1‑93 (MQ=255)
tGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTg > 1:4421600/1‑93 (MQ=255)
ggCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGat < 1:2468855/93‑1 (MQ=255)
gCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGata < 1:643517/93‑1 (MQ=255)
gCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGC‑GATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGatat < 1:6077507/93‑1 (MQ=255)
cGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGatat < 1:1901211/93‑1 (MQ=255)
cGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGatat < 2:6878388/93‑1 (MQ=255)
aTGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCGTTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATatca > 2:2462057/1‑93 (MQ=255)
aTGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATatca < 1:237938/93‑1 (MQ=255)
tGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATatcat < 1:1479245/93‑1 (MQ=255)
gTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATcc < 2:4221951/93‑1 (MQ=255)
tATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCct < 1:4985976/93‑1 (MQ=255)
ttAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCctgc < 2:5385691/93‑1 (MQ=255)
ttAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCctgc < 1:1716863/93‑1 (MQ=255)
ttAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCctgc < 2:6144689/93‑1 (MQ=255)
ttAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCctgc > 1:2559015/1‑93 (MQ=255)
ttAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCctgc < 1:4676735/93‑1 (MQ=255)
atgatgCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTgg < 2:2786682/93‑1 (MQ=255)
atgatgCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTgg < 2:1827339/93‑1 (MQ=255)
atgatgCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTgg > 1:5043924/1‑93 (MQ=255)
tgatgCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGa > 1:3239792/1‑93 (MQ=255)
tgatgCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGa > 1:6038806/1‑93 (MQ=255)
gcgcCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGaaaaa < 2:1700149/93‑1 (MQ=255)
gcccgccTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAg > 1:685834/1‑93 (MQ=255)
cccgccTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGc < 1:7104060/93‑1 (MQ=255)
ccgccTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGcc > 1:3615074/1‑93 (MQ=255)
ccgccTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGcc < 1:654930/93‑1 (MQ=255)
cgccTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCt < 2:5870968/93‑1 (MQ=255)
gccTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATcc > 2:3848011/1‑76 (MQ=255)
ccTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGa < 2:3732257/93‑1 (MQ=255)
ccTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGa < 1:1042866/93‑1 (MQ=255)
ccTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGa < 2:6755047/93‑1 (MQ=255)
ccTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGa < 2:5631760/93‑1 (MQ=255)
cTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGAt < 1:1572907/93‑1 (MQ=255)
cTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGAt < 2:5808844/93‑1 (MQ=255)
tACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGATgg < 2:5246865/93‑1 (MQ=255)
|
CGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGATGG > NC_000913/4467054‑4467236
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCCGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGATGGT > NC_000913/4467052‑4467237
|
GCCGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTG < SRR4302542.2256191/94‑1 (MQ=60)
GCCGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTG < SRR4302542.5024888/94‑1 (MQ=60)
CCGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGC > SRR4302542.4946717/1‑94 (MQ=60)
CGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCG < SRR4302542.2207236/94‑1 (MQ=60)
CGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCG > SRR4302542.5725972/1‑94 (MQ=60)
CGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCG > SRR4302542.5677273/1‑94 (MQ=60)
CGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCG < SRR4302542.2764185/94‑1 (MQ=60)
CGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCG > SRR4302542.3629536/1‑94 (MQ=60)
CGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCG > SRR4302542.3629537/1‑94 (MQ=60)
CGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCG > SRR4302542.744878/1‑94 (MQ=60)
CGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACG < SRR4302542.5544091/94‑1 (MQ=60)
GATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGC > SRR4302542.1193825/1‑94 (MQ=60)
ATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCG > SRR4302542.1494885/1‑94 (MQ=60)
TGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGC > SRR4302542.3333205/1‑94 (MQ=60)
TGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGC > SRR4302542.3333204/1‑94 (MQ=60)
TGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGC > SRR4302542.5372396/1‑94 (MQ=60)
TGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGC > SRR4302542.3446823/1‑94 (MQ=60)
GCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCT < SRR4302542.1705615/94‑1 (MQ=60)
GCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCT < SRR4302542.3425059/94‑1 (MQ=60)
CATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTG > SRR4302542.3388931/1‑94 (MQ=60)
CATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTG > SRR4302542.210363/1‑94 (MQ=60)
CATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTG > SRR4302542.954835/1‑94 (MQ=60)
CATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTG > SRR4302542.2929829/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGC < SRR4302542.5051854/94‑1 (MQ=60)
ATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGC > SRR4302542.5839873/1‑94 (MQ=60)
TAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCG < SRR4302542.156241/94‑1 (MQ=60)
AAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGGATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGG < SRR4302542.1308819/94‑1 (MQ=60)
AGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGAT > SRR4302542.3684023/1‑94 (MQ=60)
AGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGAT < SRR4302542.2164861/94‑1 (MQ=60)
AGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGAT < SRR4302542.1120714/94‑1 (MQ=60)
AACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATAT < SRR4302542.3002490/94‑1 (MQ=60)
AACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATAT > SRR4302542.633042/1‑94 (MQ=60)
AACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATAT < SRR4302542.2766835/94‑1 (MQ=60)
AACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATAT < SRR4302542.6767910/94‑1 (MQ=60)
ACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATC > SRR4302542.4599073/1‑94 (MQ=60)
CGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCG < SRR4302542.6072768/94‑1 (MQ=60)
CGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCG < SRR4302542.6098068/94‑1 (MQ=60)
CGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCG > SRR4302542.2629206/1‑94 (MQ=60)
GCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGG > SRR4302542.4000154/1‑94 (MQ=60)
CATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGC < SRR4302542.4752653/94‑1 (MQ=60)
ATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCA > SRR4302542.4120196/1‑94 (MQ=60)
TTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCAT > SRR4302542.5621805/1‑94 (MQ=60)
TTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCAT > SRR4302542.1935849/1‑94 (MQ=60)
TGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATT < SRR4302542.650590/94‑1 (MQ=60)
TGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATT < SRR4302542.3607405/94‑1 (MQ=60)
TGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATT > SRR4302542.118892/1‑94 (MQ=60)
GTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTT > SRR4302542.529002/1‑94 (MQ=60)
GACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCT < SRR4302542.4539414/94‑1 (MQ=60)
GACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCT > SRR4302542.3220983/1‑94 (MQ=60)
ACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTG > SRR4302542.2716713/1‑94 (MQ=60)
ACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTG > SRR4302542.1385777/1‑94 (MQ=60)
ACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTG < SRR4302542.2373495/94‑1 (MQ=60)
CCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGT > SRR4302542.7539096/1‑94 (MQ=60)
CCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGT < SRR4302542.4593691/94‑1 (MQ=60)
CTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTG > SRR4302542.2341273/1‑94 (MQ=60)
TTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGG < SRR4302542.4095894/94‑1 (MQ=60)
TTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGG < SRR4302542.1102608/94‑1 (MQ=60)
TACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGA < SRR4302542.420637/94‑1 (MQ=60)
TACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGA > SRR4302542.6152357/1‑94 (MQ=60)
TACTGAAGCGCGAAGGGCATGGGGTTGGCTTTTTGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTTGA > SRR4302542.4978525/1‑94 (MQ=60)
ACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGAC > SRR4302542.619111/1‑94 (MQ=60)
CTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACG < SRR4302542.1094050/94‑1 (MQ=60)
CTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACG < SRR4302542.12650/94‑1 (MQ=60)
CTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACG > SRR4302542.2541492/1‑94 (MQ=60)
TGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGG > SRR4302542.890710/1‑94 (MQ=60)
TGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGG < SRR4302542.83997/94‑1 (MQ=60)
TGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGG < SRR4302542.5054922/94‑1 (MQ=60)
AAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCG > SRR4302542.6454868/1‑94 (MQ=60)
AAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCG > SRR4302542.6454869/1‑94 (MQ=60)
AGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGC > SRR4302542.4167769/1‑94 (MQ=60)
AGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGC < SRR4302542.947793/94‑1 (MQ=60)
GCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCG < SRR4302542.590739/94‑1 (MQ=60)
GCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCG < SRR4302542.4126549/94‑1 (MQ=60)
GCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGT < SRR4302542.2233979/94‑1 (MQ=60)
GAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAG < SRR4302542.3031632/94‑1 (MQ=60)
AAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGA > SRR4302542.7390828/1‑94 (MQ=60)
AGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGTGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGAT < SRR4302542.6955851/94‑1 (MQ=60)
GGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATA < SRR4302542.6464929/94‑1 (MQ=60)
GGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATA < SRR4302542.1003789/94‑1 (MQ=60)
GGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATA > SRR4302542.2718196/1‑94 (MQ=60)
GGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATA > SRR4302542.4292723/1‑94 (MQ=60)
GGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATAT < SRR4302542.500325/94‑1 (MQ=60)
GGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATAT < SRR4302542.142737/94‑1 (MQ=60)
GCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATT < SRR4302542.5995901/94‑1 (MQ=60)
CATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTG > SRR4302542.4164277/1‑94 (MQ=60)
CATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTG < SRR4302542.4709222/94‑1 (MQ=60)
CATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTG < SRR4302542.6125594/94‑1 (MQ=60)
ATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGC > SRR4302542.3177305/1‑94 (MQ=60)
ATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGC > SRR4302542.7155722/1‑94 (MQ=60)
ATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGC < SRR4302542.4470286/94‑1 (MQ=60)
TGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCC > SRR4302542.6486502/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGT > SRR4302542.1882570/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGT > SRR4302542.1947974/1‑94 (MQ=60)
TTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGA < SRR4302542.7488144/94‑1 (MQ=60)
TGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAA > SRR4302542.7393075/1‑94 (MQ=60)
TGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAA > SRR4302542.6202719/1‑94 (MQ=60)
TGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAA > SRR4302542.1877426/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAG < SRR4302542.48226/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAG < SRR4302542.3137537/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAG < SRR4302542.4723377/94‑1 (MQ=60)
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GCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATACTGCCCGTGAAGC > SRR4302542.2554049/1‑94 (MQ=60)
CTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCG > SRR4302542.6937458/1‑94 (MQ=60)
CTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCG < SRR4302542.6407840/94‑1 (MQ=60)
CTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCG < SRR4302542.2739421/94‑1 (MQ=60)
CTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCG > SRR4302542.2347523/1‑94 (MQ=60)
CTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCG > SRR4302542.7464151/1‑94 (MQ=60)
CTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCG > SRR4302542.3834746/1‑94 (MQ=60)
CTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCG < SRR4302542.7247416/94‑1 (MQ=60)
TTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGG > SRR4302542.5776159/1‑94 (MQ=60)
TTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGG > SRR4302542.2416708/1‑94 (MQ=60)
TTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGC < SRR4302542.854006/94‑1 (MQ=60)
TTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGC < SRR4302542.292356/94‑1 (MQ=60)
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ATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTG > SRR4302542.5505195/1‑94 (MQ=60)
ATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTG > SRR4302542.284160/1‑94 (MQ=60)
ATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTG > SRR4302542.4465029/1‑94 (MQ=60)
GGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATA < SRR4302542.2492818/94‑1 (MQ=60)
GGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATA > SRR4302542.1617840/1‑94 (MQ=60)
GCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATAT < SRR4302542.649051/94‑1 (MQ=60)
GCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGC‑GATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATC < SRR4302542.6136362/94‑1 (MQ=60)
CGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATC < SRR4302542.6503562/94‑1 (MQ=60)
CGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATC < SRR4302542.1917651/94‑1 (MQ=60)
GATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCA > SRR4302542.2491446/1‑94 (MQ=60)
ATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCAT < SRR4302542.6855104/94‑1 (MQ=60)
ATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCAT < SRR4302542.239982/94‑1 (MQ=60)
TGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATC < SRR4302542.1492007/94‑1 (MQ=60)
GGTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCC < SRR4302542.11475/94‑1 (MQ=60)
ttccgatctgagagttCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCT < SRR4302542.3886033/78‑1 (MQ=60)
GTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCT < SRR4302542.4355310/94‑1 (MQ=60)
GTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCT < SRR4302542.484819/94‑1 (MQ=60)
GTATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCT > SRR4302542.5159127/1‑94 (MQ=60)
TATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTG < SRR4302542.5034356/94‑1 (MQ=60)
ATTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGC > SRR4302542.2583820/1‑94 (MQ=60)
TTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCT < SRR4302542.4722434/94‑1 (MQ=60)
TTAATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCT < SRR4302542.1731774/94‑1 (MQ=60)
AATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGG > SRR4302542.5092887/1‑94 (MQ=60)
ATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGA > SRR4302542.3270418/1‑94 (MQ=60)
ATGATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGA > SRR4302542.6097261/1‑94 (MQ=60)
GATGCGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAA > SRR4302542.6314876/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAA > SRR4302542.2590090/1‑94 (MQ=60)
CGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAG > SRR4302542.691758/1‑94 (MQ=60)
CGCCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAG < SRR4302542.6419046/94‑1 (MQ=60)
CCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCC < SRR4302542.7173797/94‑1 (MQ=60)
CCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCC > SRR4302542.3847058/1‑94 (MQ=60)
CCCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCC > SRR4302542.3648762/1‑94 (MQ=60)
CCGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCT < SRR4302542.660583/94‑1 (MQ=60)
CGCCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTG < SRR4302542.1155471/94‑1 (MQ=60)
CCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGAT < SRR4302542.1051819/94‑1 (MQ=60)
CCTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGAT > SRR4302542.7147670/1‑94 (MQ=60)
CTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGATG < SRR4302542.7512137/94‑1 (MQ=60)
CTTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGATG < SRR4302542.1586490/94‑1 (MQ=60)
CTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGATG < SRR4302542.7425225/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGATGG < SRR4302542.3591694/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGATGG < SRR4302542.6503100/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGATGGT < SRR4302542.786174/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGATGGT < SRR4302542.3908212/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGATGGT > SRR4302542.6924221/1‑94 (MQ=60)
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GCCGATGCATAAAGAACGCATTGTGACCTTACTGAAGCGCGAAGGGCATGTGGTTGGCTTTATGGGCGATGGTATTAATGATGCGCCCGCCTTACGCGCTGCGGATATCGGCATTTCTGTGGACGGCGCGGTAGATATTGCCCGTGAAGCGGCTGATATCATCCTGCTGGAAAAAAGCCTGATGGT > NC_000913/4467052‑4467237
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
