Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCCAGGTCAGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCGCACCCA > NC_000913/4014506‑4014691
|
CCCAGGTCAGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGC > SRR4302532.1158149/1‑94 (MQ=60)
CCCAGGTCAGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGC < SRR4302532.1686228/94‑1 (MQ=60)
CCCAGGTCAGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGC < SRR4302532.1377740/94‑1 (MQ=60)
CCCAGGTCAGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAAC > SRR4302532.323201/1‑94 (MQ=60)
CCAGGTCAGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGAGGGGCGGAATGAGCT > SRR4302532.1973956/1‑94 (MQ=60)
CAGGTCAGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGGAATGAACTA > SRR4302532.5753328/1‑94 (MQ=60)
TCAGGAAGGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAA < SRR4302532.3258412/94‑1 (MQ=60)
TCAGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAA < SRR4302532.2935053/94‑1 (MQ=60)
GCAGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAA < SRR4302532.987964/94‑1 (MQ=60)
CAGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAA < SRR4302532.5668532/94‑1 (MQ=60)
AGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAAT > SRR4302532.2807009/1‑94 (MQ=60)
AGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAAT < SRR4302532.3930152/94‑1 (MQ=60)
AGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAAT < SRR4302532.5478167/94‑1 (MQ=60)
AGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAAT < SRR4302532.5019264/94‑1 (MQ=60)
AACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGA < SRR4302532.5224967/94‑1 (MQ=60)
AACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGA > SRR4302532.3451845/1‑94 (MQ=60)
ACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAA < SRR4302532.931956/94‑1 (MQ=60)
CGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAAT > SRR4302532.2494048/1‑94 (MQ=60)
CGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAAT > SRR4302532.1633752/1‑94 (MQ=60)
CGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAAT > SRR4302532.492233/1‑94 (MQ=60)
CGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAAT < SRR4302532.1596200/94‑1 (MQ=60)
GTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATC > SRR4302532.912250/1‑94 (MQ=60)
GTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATC > SRR4302532.1365034/1‑94 (MQ=60)
GTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGGAATGAGCTATGAAATGGAATT > SRR4302532.2093900/1‑94 (MQ=60)
TTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCT < SRR4302532.4837920/94‑1 (MQ=60)
TTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCT < SRR4302532.5712733/94‑1 (MQ=60)
TTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCT < SRR4302532.4255140/94‑1 (MQ=60)
TTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCT < SRR4302532.1332841/94‑1 (MQ=60)
ACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATTAAATGGAATCTGC > SRR4302532.2365963/1‑94 (MQ=60)
CGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCA < SRR4302532.3442730/94‑1 (MQ=60)
CGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCA < SRR4302532.2432298/94‑1 (MQ=60)
CCATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCA < SRR4302532.2192207/94‑1 (MQ=60)
TACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACC > SRR4302532.5423394/1‑94 (MQ=60)
CTTACTCTGGTCGCGTATTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCT < SRR4302532.4347610/94‑1 (MQ=60)
CTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCT < SRR4302532.1828870/94‑1 (MQ=60)
CTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCT > SRR4302532.6198263/1‑94 (MQ=60)
CTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCT < SRR4302532.1326183/94‑1 (MQ=60)
TACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGC > SRR4302532.277821/1‑94 (MQ=60)
TACTCTGGTCGCGTAGCTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATAGGCGTTTATAACTATCAAATGGAATCAGCAACGCTGC > SRR4302532.3637334/1‑94 (MQ=60)
TCTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCT < SRR4302532.1836257/94‑1 (MQ=60)
ACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCT < SRR4302532.1253356/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTGCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCT < SRR4302532.1245664/94‑1 (MQ=60)
CTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTG < SRR4302532.3167074/94‑1 (MQ=60)
CTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTG < SRR4302532.3127527/94‑1 (MQ=60)
CTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTG > SRR4302532.439780/1‑94 (MQ=60)
CTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGAC < SRR4302532.5089960/94‑1 (MQ=60)
TGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACC > SRR4302532.4337747/1‑94 (MQ=60)
GGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCA < SRR4302532.95806/94‑1 (MQ=60)
GTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATTGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGGATGTGCAACCCTGCTGACCAT > SRR4302532.4400525/1‑94 (MQ=60)
CGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGT > SRR4302532.3455826/1‑94 (MQ=60)
CCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTG < SRR4302532.5467269/94‑1 (MQ=60)
CGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGT < SRR4302532.4149524/94‑1 (MQ=60)
GTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTG > SRR4302532.1238116/1‑94 (MQ=60)
GTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTG > SRR4302532.4224875/1‑94 (MQ=60)
TAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGC > SRR4302532.6052218/1‑94 (MQ=60)
AGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCA < SRR4302532.4392328/94‑1 (MQ=60)
AGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCA > SRR4302532.5639339/1‑94 (MQ=60)
AGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCA > SRR4302532.2851230/1‑94 (MQ=60)
GTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAA < SRR4302532.4410101/94‑1 (MQ=60)
TTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAG < SRR4302532.3262551/94‑1 (MQ=60)
TTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAG < SRR4302532.614434/94‑1 (MQ=60)
TTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAG < SRR4302532.4309726/94‑1 (MQ=60)
CGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTC > SRR4302532.985206/1‑94 (MQ=60)
CGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTC > SRR4302532.5433087/1‑94 (MQ=60)
GTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCA < SRR4302532.2202630/94‑1 (MQ=60)
GTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCA > SRR4302532.2398295/1‑94 (MQ=60)
TCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAG < SRR4302532.1554927/94‑1 (MQ=60)
TCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAG < SRR4302532.2247181/94‑1 (MQ=60)
CACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGG < SRR4302532.3838722/94‑1 (MQ=60)
CACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGG < SRR4302532.2893197/94‑1 (MQ=60)
CACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGG > SRR4302532.5870740/1‑94 (MQ=60)
CACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGG < SRR4302532.6163392/94‑1 (MQ=60)
CACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGG > SRR4302532.2434754/1‑94 (MQ=60)
ACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGG > SRR4302532.5464065/1‑94 (MQ=60)
ACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGG > SRR4302532.1164033/1‑94 (MQ=60)
ACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGG < SRR4302532.4972829/94‑1 (MQ=60)
TTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCCAGGCAGGGCC > SRR4302532.3623482/1‑94 (MQ=60)
TTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGGAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGGC > SRR4302532.2349958/1‑94 (MQ=60)
gaggttgttggggggggggggggtcgattGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCG < SRR4302532.3279804/65‑1 (MQ=60)
AAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCG > SRR4302532.1202194/1‑94 (MQ=60)
AGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGT < SRR4302532.534861/94‑1 (MQ=60)
GGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTG > SRR4302532.5001369/1‑94 (MQ=60)
GGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTG < SRR4302532.2630461/94‑1 (MQ=60)
TCTATGGAAGAGTGGCAGGCGGTGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCCAGTCAGGGCCTGCGTGCCG > SRR4302532.6342135/1‑94 (MQ=60)
TCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCG > SRR4302532.6342134/1‑94 (MQ=60)
CTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGG > SRR4302532.5102223/1‑94 (MQ=60)
CTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGG > SRR4302532.5535266/1‑94 (MQ=60)
CTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGGGATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAAGCCTGCTGACCATGTGTGCGAGTCAGGGCCTGCGTGCCGG > SRR4302532.178086/1‑94 (MQ=60)
ATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTT > SRR4302532.3249370/1‑94 (MQ=60)
ATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTA > SRR4302532.4617228/1‑94 (MQ=60)
ATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTA > SRR4302532.4546216/1‑94 (MQ=60)
GGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATG > SRR4302532.4432244/1‑94 (MQ=60)
GGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATG > SRR4302532.178184/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGG > SRR4302532.5726879/1‑94 (MQ=60)
AAGAGTGGCAGGCGCTGGGCGTAATGAGCTATGACATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCGTATGTGCAAGTCAGGGCATGCGTTCCGGTATGCT < SRR4302532.1789275/94‑1 (MQ=60)
AAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGT < SRR4302532.5966290/94‑1 (MQ=60)
AAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGT < SRR4302532.1789274/94‑1 (MQ=60)
AGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTA > SRR4302532.3313212/1‑94 (MQ=60)
AGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTA > SRR4302532.6303995/1‑94 (MQ=60)
AGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGC < SRR4302532.3755335/94‑1 (MQ=60)
AGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGC < SRR4302532.5049665/94‑1 (MQ=60)
AGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGC > SRR4302532.6011145/1‑94 (MQ=60)
AGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGC < SRR4302532.4808110/94‑1 (MQ=60)
AGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGC > SRR4302532.5586407/1‑94 (MQ=60)
AGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGC < SRR4302532.2156214/94‑1 (MQ=60)
AGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGC > SRR4302532.1171006/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGG < SRR4302532.6330555/94‑1 (MQ=60)
GCAGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGACCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGT < SRR4302532.2882735/94‑1 (MQ=60)
GCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGT < SRR4302532.5039691/94‑1 (MQ=60)
AGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGT > SRR4302532.2181983/1‑94 (MQ=60)
AGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGT > SRR4302532.2769401/1‑94 (MQ=60)
AGGCGATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGT > SRR4302532.4630033/1‑94 (MQ=60)
AGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGT < SRR4302532.5991379/94‑1 (MQ=60)
GGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTT > SRR4302532.1653171/1‑94 (MQ=60)
CGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTAT < SRR4302532.4181574/94‑1 (MQ=60)
CGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTAT > SRR4302532.773121/1‑94 (MQ=60)
GATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATC < SRR4302532.4779571/94‑1 (MQ=60)
GATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATC < SRR4302532.4311520/94‑1 (MQ=60)
GATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATC < SRR4302532.3044860/94‑1 (MQ=60)
ATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCG < SRR4302532.3666055/94‑1 (MQ=60)
ATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCG < SRR4302532.6351205/94‑1 (MQ=60)
ATGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCG < SRR4302532.5125760/94‑1 (MQ=60)
ATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCG < SRR4302532.3836425/94‑1 (MQ=60)
ATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCG < SRR4302532.4814122/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGT > SRR4302532.764701/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGT < SRR4302532.5394285/94‑1 (MQ=60)
GGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTA < SRR4302532.915584/94‑1 (MQ=60)
GGCGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTA < SRR4302532.4025490/94‑1 (MQ=60)
CGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAAC > SRR4302532.6037180/1‑94 (MQ=60)
CGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAAC > SRR4302532.4403677/1‑94 (MQ=60)
CGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAAC > SRR4302532.5506534/1‑94 (MQ=60)
CGTAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAAC > SRR4302532.3111204/1‑94 (MQ=60)
GTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACC > SRR4302532.1610993/1‑94 (MQ=60)
GTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACC < SRR4302532.5539998/94‑1 (MQ=60)
TAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCG < SRR4302532.59998/94‑1 (MQ=60)
TAATGAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCG < SRR4302532.5225543/94‑1 (MQ=60)
TAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCG < SRR4302532.6034280/94‑1 (MQ=60)
TAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCG > SRR4302532.5832393/1‑94 (MQ=60)
ATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCGCC > SRR4302532.4819660/1‑94 (MQ=60)
ATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCGCA > SRR4302532.2079159/1‑94 (MQ=60)
ATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCGCA < SRR4302532.394472/94‑1 (MQ=60)
ATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGCGCCTGCGTGCCGGCATGGTAGCGGGGGTTATCGTTAAacaca > SRR4302532.4819659/1‑89 (MQ=60)
TGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCGCAC > SRR4302532.3859096/1‑94 (MQ=60)
TGAACTATGAAATGGAATATGCAACCCTGCTGACCATGTGTGAAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGCAGCGGGTGTTATCGTTAACCGCAC > SRR4302532.544889/1‑94 (MQ=60)
GAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCGCACC > SRR4302532.578954/1‑94 (MQ=60)
GAGCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCGCACC > SRR4302532.91758/1‑94 (MQ=60)
AACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCGCACCC < SRR4302532.3509259/94‑1 (MQ=60)
GCTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCGCACCCA < SRR4302532.3035778/94‑1 (MQ=60)
ACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCGCACCCA > SRR4302532.2363354/1‑94 (MQ=60)
|
CCCAGGTCAGGAACGTTACGATACTTACTCTGGTCGCGTAGTTCGTCACTTTAAAGGTTCTATGGAAGAGTGGCAGGCGATGGGCGTAATGAACTATGAAATGGAATCTGCAACCCTGCTGACCATGTGTGCAAGTCAGGGCCTGCGTGCCGGTATGGTAGCGGGTGTTATCGTTAACCGCACCCA > NC_000913/4014506‑4014691
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
