Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTTGGTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGATGGGGACTGTT > NC_000913/4477588‑4477774
|
ttttggtttgttttttACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAAT < SRR4302532.857924/78‑1 (MQ=60)
TGTTGGTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAAT < SRR4302532.4967404/94‑1 (MQ=60)
TGTTGGTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAAC < SRR4302532.2219653/94‑1 (MQ=60)
TGTTGGTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAAC < SRR4302532.5163054/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATG < SRR4302532.947807/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATG < SRR4302532.2445078/94‑1 (MQ=60)
TTTGTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGG < SRR4302532.4754617/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGG < SRR4302532.5549589/94‑1 (MQ=60)
TGTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCG < SRR4302532.2346685/94‑1 (MQ=60)
GGTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCG > SRR4302532.2711042/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCG > SRR4302532.2076128/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCG > SRR4302532.1410275/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCG < SRR4302532.1182712/94‑1 (MQ=60)
GTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGT < SRR4302532.4241726/94‑1 (MQ=60)
GTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGA > SRR4302532.804080/1‑94 (MQ=60)
TGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAA > SRR4302532.1884238/1‑94 (MQ=60)
TGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGAACAGTCTCAACGGCGTAA > SRR4302532.1209326/1‑94 (MQ=60)
GTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAG > SRR4302532.2828699/1‑94 (MQ=60)
GTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAG < SRR4302532.529460/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGGCTTAATGACCAGACTCAATGGCGTAAGA > SRR4302532.2514634/1‑94 (MQ=60)
TGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGA > SRR4302532.1119626/1‑94 (MQ=60)
TGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGA < SRR4302532.5113054/94‑1 (MQ=60)
TTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGAT < SRR4302532.5792594/94‑1 (MQ=60)
TTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTT > SRR4302532.4151192/1‑94 (MQ=60)
TTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTT < SRR4302532.3508755/94‑1 (MQ=60)
TTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTA < SRR4302532.5183656/94‑1 (MQ=60)
ACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCGTTAATGACCAGTATAAATGTCGTAAGATTTACTT > SRR4302532.1633504/1‑94 (MQ=60)
ACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTT < SRR4302532.1057068/94‑1 (MQ=60)
CTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTT < SRR4302532.1866347/94‑1 (MQ=60)
TTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGTGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTT < SRR4302532.5725246/94‑1 (MQ=60)
TTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTT > SRR4302532.5466915/1‑94 (MQ=60)
TTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTT > SRR4302532.136340/1‑94 (MQ=60)
GTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAAGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAAT > SRR4302532.4200755/1‑94 (MQ=60)
TTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATT < SRR4302532.1890430/94‑1 (MQ=60)
TTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATT > SRR4302532.5732668/1‑94 (MQ=60)
TTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATT < SRR4302532.1261332/94‑1 (MQ=60)
TTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATT < SRR4302532.1702812/94‑1 (MQ=60)
TTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATT < SRR4302532.1702811/94‑1 (MQ=60)
TTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATT < SRR4302532.1505653/94‑1 (MQ=60)
TACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTG > SRR4302532.5260354/1‑94 (MQ=60)
TACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTG > SRR4302532.3107546/1‑94 (MQ=60)
ACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGC > SRR4302532.6342577/1‑94 (MQ=60)
ACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGC < SRR4302532.110757/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCT < SRR4302532.75783/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCT > SRR4302532.5626821/1‑94 (MQ=60)
TGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTC > SRR4302532.52509/1‑94 (MQ=60)
TTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGACTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTA < SRR4302532.1731238/94‑1 (MQ=60)
TGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTAT > SRR4302532.6140878/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTAT > SRR4302532.5373529/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTAT > SRR4302532.3245449/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTAT > SRR4302532.3245448/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTAT < SRR4302532.3323182/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGA > SRR4302532.2965538/1‑94 (MQ=60)
TTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAA < SRR4302532.5035890/94‑1 (MQ=60)
TTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAA < SRR4302532.1138935/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAA < SRR4302532.3502196/94‑1 (MQ=60)
TGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGG < SRR4302532.3591118/94‑1 (MQ=60)
TGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGG > SRR4302532.2106381/1‑94 (MQ=60)
TGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGG < SRR4302532.4112689/94‑1 (MQ=60)
GCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGG < SRR4302532.1266835/94‑1 (MQ=60)
GCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGG > SRR4302532.2262009/1‑94 (MQ=60)
CTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGT > SRR4302532.1091176/1‑94 (MQ=60)
CTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGT > SRR4302532.1948636/1‑94 (MQ=60)
CTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGT < SRR4302532.6299532/94‑1 (MQ=60)
CTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGT > SRR4302532.688111/1‑94 (MQ=60)
TTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTT < SRR4302532.5746065/94‑1 (MQ=60)
TTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTT < SRR4302532.4046166/94‑1 (MQ=60)
TTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTT < SRR4302532.4530421/94‑1 (MQ=60)
TATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTC < SRR4302532.4164185/94‑1 (MQ=60)
ATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCT > SRR4302532.452956/1‑94 (MQ=60)
ATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCT > SRR4302532.1481865/1‑94 (MQ=60)
ATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGG > SRR4302532.5518945/1‑94 (MQ=60)
ATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGG < SRR4302532.5539472/94‑1 (MQ=60)
ATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGG > SRR4302532.2556201/1‑94 (MQ=60)
ATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGG > SRR4302532.2556200/1‑94 (MQ=60)
TTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGT < SRR4302532.5098413/94‑1 (MQ=60)
TTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTG > SRR4302532.2069404/1‑94 (MQ=60)
TATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGG < SRR4302532.5570843/94‑1 (MQ=60)
ATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGG > SRR4302532.5768026/1‑94 (MQ=60)
GGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTG < SRR4302532.4609290/94‑1 (MQ=60)
GGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTG < SRR4302532.3734893/94‑1 (MQ=60)
GGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTG > SRR4302532.707131/1‑94 (MQ=60)
GCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTATTTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGA > SRR4302532.1109379/1‑94 (MQ=60)
AGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACC > SRR4302532.5753375/1‑94 (MQ=60)
GCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGGCCT > SRR4302532.5969168/1‑94 (MQ=60)
CAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTT > SRR4302532.3492781/1‑94 (MQ=60)
CAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTT < SRR4302532.2533627/94‑1 (MQ=60)
AAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTT < SRR4302532.400521/94‑1 (MQ=60)
AAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTT > SRR4302532.2110378/1‑94 (MQ=60)
AAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTT > SRR4302532.2529277/1‑94 (MQ=60)
AAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTT > SRR4302532.2310541/1‑94 (MQ=60)
GGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCT > SRR4302532.2561869/1‑94 (MQ=60)
GGACTGCCTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCT > SRR4302532.6182667/1‑94 (MQ=60)
GACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTT > SRR4302532.2217732/1‑94 (MQ=60)
ACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTG < SRR4302532.1570661/94‑1 (MQ=60)
ACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTG < SRR4302532.3902720/94‑1 (MQ=60)
CTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGC > SRR4302532.2784719/1‑94 (MQ=60)
CTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGC > SRR4302532.4507691/1‑94 (MQ=60)
CTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGC > SRR4302532.5340942/1‑94 (MQ=60)
CTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGC > SRR4302532.5340944/1‑94 (MQ=60)
GTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGAT > SRR4302532.2947807/1‑94 (MQ=60)
CATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTT > SRR4302532.846381/1‑94 (MQ=60)
CATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTT < SRR4302532.2012454/94‑1 (MQ=60)
CATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTT < SRR4302532.1329286/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTT < SRR4302532.3124114/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTT > SRR4302532.1092977/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTT > SRR4302532.5791983/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGGGACCTTTTTCTTGCCGATTTT > SRR4302532.1092975/1‑94 (MQ=60)
TCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTA < SRR4302532.5953307/94‑1 (MQ=60)
AGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAAT < SRR4302532.5384094/94‑1 (MQ=60)
AGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAAT < SRR4302532.1179323/94‑1 (MQ=60)
GGCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATG < SRR4302532.1274009/94‑1 (MQ=60)
GGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATG > SRR4302532.2847341/1‑94 (MQ=60)
GCCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGG > SRR4302532.4584216/1‑94 (MQ=60)
GCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGG < SRR4302532.5833621/94‑1 (MQ=60)
GCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGG < SRR4302532.1079082/94‑1 (MQ=60)
CCTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGC > SRR4302532.1851067/1‑94 (MQ=60)
CCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATATAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGC < SRR4302532.2752583/94‑1 (MQ=60)
CTTAATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCC < SRR4302532.1251123/94‑1 (MQ=60)
CTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCC > SRR4302532.4576169/1‑94 (MQ=60)
CTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCC < SRR4302532.1759216/94‑1 (MQ=60)
CTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCC < SRR4302532.2919228/94‑1 (MQ=60)
TAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCAT < SRR4302532.2991181/94‑1 (MQ=60)
AATGACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATT < SRR4302532.178869/94‑1 (MQ=60)
AATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATT < SRR4302532.733088/94‑1 (MQ=60)
TGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGG < SRR4302532.720270/94‑1 (MQ=60)
GACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGG > SRR4302532.197313/1‑94 (MQ=60)
ACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGA < SRR4302532.4970534/94‑1 (MQ=60)
ACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGA < SRR4302532.328081/94‑1 (MQ=60)
ACCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGA < SRR4302532.328080/94‑1 (MQ=60)
ACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGA > SRR4302532.5218377/1‑94 (MQ=60)
CCAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGAT < SRR4302532.3114262/94‑1 (MQ=60)
CCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGAT > SRR4302532.3517243/1‑94 (MQ=60)
CAGTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGTGATG < SRR4302532.2931971/94‑1 (MQ=60)
GTCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGATGGG < SRR4302532.5920171/94‑1 (MQ=60)
TCTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGATGGGG < SRR4302532.4070757/94‑1 (MQ=60)
CTCAATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGATGGGGA < SRR4302532.4048132/94‑1 (MQ=60)
TCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGATGGGGAC > SRR4302532.4359709/1‑94 (MQ=60)
AATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGATGGGGACTG < SRR4302532.409311/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGATGGGGACTGT < SRR4302532.3308260/94‑1 (MQ=60)
TGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGATGGGGACTGTT > SRR4302532.3145074/1‑94 (MQ=60)
|
TGTTGGTTGTGTTTTGACTTTGTTACTGTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTCATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTAGTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTGACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGATGGGGACTGTT > NC_000913/4477588‑4477774
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
