Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,825,102 |
T→C |
F230L (TTC→CTC) |
srlE → |
PTS system glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIBC component |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,825,102 | 0 | T | C | 100.0%
| 961.0
/ NA
| 259 | F230L (TTC→CTC) | srlE | PTS system glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIBC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (133/126); total (133/126) |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTA > NC_000913/2825012‑2825191
|
aTTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcctc < 2:5288457/93‑1 (MQ=255)
ttGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCg < 1:2630421/93‑1 (MQ=255)
cccACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGcc > 2:5558723/1‑93 (MQ=255)
ccACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGccc < 1:4938079/93‑1 (MQ=255)
ccGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAg < 2:962300/92‑1 (MQ=255)
aCGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAg > 2:2173925/1‑93 (MQ=255)
aCGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAg > 2:179698/1‑93 (MQ=255)
cGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAgg > 2:2308196/1‑93 (MQ=255)
cGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAgg < 2:6461296/93‑1 (MQ=255)
ggTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgc > 2:2824809/1‑93 (MQ=255)
ggTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgc < 1:603583/93‑1 (MQ=255)
ggTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgc < 1:5072543/93‑1 (MQ=255)
ggTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgc < 1:4511114/93‑1 (MQ=255)
gTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgcg > 1:1389273/1‑93 (MQ=255)
gTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgcg < 2:1526036/93‑1 (MQ=255)
gTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgcg < 1:3875812/93‑1 (MQ=255)
gTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgcg > 1:4307779/1‑93 (MQ=255)
gCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGtt > 2:6063442/1‑93 (MQ=255)
tCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTAt > 2:4992791/1‑93 (MQ=255)
tCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCCGCCCAGGCGCAGTTAt > 1:4593086/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATc < 1:1334439/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcc > 2:5365475/1‑92 (MQ=255)
cTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGca < 2:2349273/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGca > 1:3538984/1‑93 (MQ=255)
ggCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcaca > 2:6153766/1‑93 (MQ=255)
ggCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcaca < 2:193363/93‑1 (MQ=255)
gCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAg > 2:5979477/1‑93 (MQ=255)
aGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGtt < 1:6142014/93‑1 (MQ=255)
cATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATc > 2:3339717/1‑93 (MQ=255)
aTCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCg < 1:707343/93‑1 (MQ=255)
tctaCTGTGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCTCCTTCCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCgg < 1:5975832/90‑1 (MQ=255)
tCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCgg > 1:6366086/1‑93 (MQ=255)
tCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCgg < 1:5903176/93‑1 (MQ=255)
ccACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGc < 2:2916720/93‑1 (MQ=255)
ccACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGc > 2:6254411/1‑93 (MQ=255)
ccACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGc > 1:2294148/1‑93 (MQ=255)
cACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCg > 2:2495916/1‑93 (MQ=255)
cACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCg < 2:4460187/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTGCCCACTGCTTGCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTa < 2:64773/93‑1 (MQ=255)
gggTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTatt < 1:5770400/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgat < 1:5595368/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgat > 2:4003964/1‑93 (MQ=255)
tGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgattg < 1:1449549/93‑1 (MQ=255)
ggTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgatttg > 1:25277/1‑91 (MQ=255)
gTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGc > 1:5257345/1‑93 (MQ=255)
gTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGc > 2:3767450/1‑93 (MQ=255)
tCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCg > 2:3037826/1‑93 (MQ=255)
tCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATAGTCGTATTGATTGGCg > 1:4462152/1‑93 (MQ=255)
gcATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCg < 1:4801728/92‑1 (MQ=255)
cATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGACCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGt > 1:1894601/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGc > 1:2867514/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGc > 1:3018063/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGc > 1:3058676/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGc < 1:3946522/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAg < 2:4252149/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGGTATCGCACAGGTTATCGGCGGATTGATTGGCGTGCAg > 2:6036767/1‑93 (MQ=255)
tGGCGCTTATCTGTTCCTTCCCACTGCTGTCCCCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGa < 2:1187419/93‑1 (MQ=255)
gcgcTCATCTGGTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAtt < 2:1552308/93‑1 (MQ=255)
gcTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTgg > 2:5855465/1‑93 (MQ=255)
gcTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTgg > 1:5447465/1‑93 (MQ=255)
cTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGt < 1:3275123/93‑1 (MQ=255)
cTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGt > 2:1291313/1‑93 (MQ=255)
tCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCg > 1:3401886/1‑93 (MQ=255)
cTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCgg < 1:5420360/93‑1 (MQ=255)
cTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCgg > 1:5138978/1‑93 (MQ=255)
tGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGc > 2:6582925/1‑93 (MQ=255)
tGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGc > 1:2224011/1‑93 (MQ=255)
gTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCa < 1:964554/93‑1 (MQ=255)
gTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCa > 2:2710432/1‑93 (MQ=255)
ttccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCaa > 2:770407/1‑93 (MQ=255)
ttccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCaa > 1:234609/1‑93 (MQ=255)
tccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAat < 2:5715989/93‑1 (MQ=255)
tcttccCGCTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAata < 1:418824/92‑1 (MQ=255)
ccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAata > 1:1819149/1‑93 (MQ=255)
ccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAata < 2:6417897/93‑1 (MQ=255)
ccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGAGTGCAGATTGGTCTCGGCAata > 2:3463523/1‑93 (MQ=255)
cttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAatat > 1:1210525/1‑93 (MQ=255)
ttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATAtt > 2:1469426/1‑93 (MQ=255)
tccCACTGGTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTc > 1:6497968/1‑93 (MQ=255)
cccACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTcc < 2:901192/93‑1 (MQ=255)
cccACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTcc < 1:3657696/93‑1 (MQ=255)
cACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTccgc < 1:2804585/93‑1 (MQ=255)
cACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTacgc > 2:1159510/1‑93 (MQ=255)
aCTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTccgcc > 1:4898746/1‑93 (MQ=255)
aCTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTccgcc < 2:4023288/93‑1 (MQ=255)
tGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCCATATTCccccgc > 1:2519046/1‑93 (MQ=255)
gCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCa < 2:3865731/93‑1 (MQ=255)
gCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCa < 2:1319454/93‑1 (MQ=255)
gCTATCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTTATTTGCGTGCAGATTGCTCTCGGCAATATTCCGCCGCa < 2:3515612/93‑1 (MQ=255)
cTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCAt > 2:2738876/1‑93 (MQ=255)
ttCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCt > 1:1042882/1‑93 (MQ=255)
ttCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGCCTCGGCAGTATTCCGCCGCATCt > 1:6225733/1‑93 (MQ=255)
tCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTg > 2:4893498/1‑93 (MQ=255)
aCCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGc > 1:1265902/1‑93 (MQ=255)
ccTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCt < 1:215065/93‑1 (MQ=255)
ccTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCt < 2:1671663/93‑1 (MQ=255)
ccTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCt > 2:796209/1‑93 (MQ=255)
cTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCtt < 2:6207025/93‑1 (MQ=255)
tttCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCttt > 1:4119992/1‑93 (MQ=255)
ttcctcGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTa > 1:5662621/1‑93 (MQ=255)
|
ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTA > NC_000913/2825012‑2825191
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTACC > NC_000913/2825009‑2825193
|
TGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCC < SRR4302547.4598301/94‑1 (MQ=60)
GGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCT < SRR4302547.3229659/94‑1 (MQ=60)
GGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCT > SRR4302547.2065974/1‑94 (MQ=60)
GATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTC < SRR4302547.3149356/94‑1 (MQ=60)
GATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTC < SRR4302547.1380706/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGG < SRR4302547.2278013/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGG < SRR4302547.2683399/94‑1 (MQ=60)
GCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCC < SRR4302547.4511796/94‑1 (MQ=60)
CCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCC < SRR4302547.3543981/94‑1 (MQ=60)
CCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCA < SRR4302547.5040354/94‑1 (MQ=60)
CACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAG < SRR4302547.4319267/94‑1 (MQ=60)
CACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAG > SRR4302547.1857641/1‑94 (MQ=60)
CACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAG > SRR4302547.3768210/1‑94 (MQ=60)
CGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGC < SRR4302547.2966538/94‑1 (MQ=60)
GGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCG < SRR4302547.5177196/94‑1 (MQ=60)
GGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCG < SRR4302547.614783/94‑1 (MQ=60)
GGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCG > SRR4302547.4396394/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCG > SRR4302547.1417078/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCG < SRR4302547.4604317/94‑1 (MQ=60)
GTCTTGCTCCGCTGGCGAGGCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCGGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGC < SRR4302547.3464201/94‑1 (MQ=60)
GTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGC < SRR4302547.3954675/94‑1 (MQ=60)
TCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCA > SRR4302547.533613/1‑94 (MQ=60)
CCTTGCCCCGCTGGCGGGCCATCCACTTGGTCTGGTCATGCTGGCCCTCCTCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCTCCTTTCCTCGGCCCAGGCGCA < SRR4302547.4906543/94‑1 (MQ=60)
CTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAG < SRR4302547.6562743/94‑1 (MQ=60)
CTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGGCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAG > SRR4302547.4791138/1‑94 (MQ=60)
CGTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAG < SRR4302547.2155873/94‑1 (MQ=60)
TTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGT < SRR4302547.5523216/94‑1 (MQ=60)
TGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTT < SRR4302547.4629275/94‑1 (MQ=60)
TGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTT < SRR4302547.2572941/94‑1 (MQ=60)
TGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTT < SRR4302547.310187/94‑1 (MQ=60)
CTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTAT < SRR4302547.6016225/94‑1 (MQ=60)
CTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCCGCCCAGGCGCAGTTAT > SRR4302547.4688132/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCG < SRR4302547.1361269/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTTGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGC > SRR4302547.4626478/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCA > SRR4302547.3611224/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCAC > SRR4302547.407606/1‑94 (MQ=60)
TGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACA > SRR4302547.3432797/1‑94 (MQ=60)
GGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAG > SRR4302547.5048494/1‑94 (MQ=60)
GGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAG < SRR4302547.4024387/94‑1 (MQ=60)
GAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTT < SRR4302547.1796605/94‑1 (MQ=60)
AGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTA < SRR4302547.6269452/94‑1 (MQ=60)
GCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTAT < SRR4302547.1337193/94‑1 (MQ=60)
CCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATC < SRR4302547.6071375/94‑1 (MQ=60)
CATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCG > SRR4302547.6712745/1‑94 (MQ=60)
CATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCG > SRR4302547.4581866/1‑94 (MQ=60)
CACCCGCTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCCCACAGGTTATCG < SRR4302547.5495318/94‑1 (MQ=60)
ATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGG < SRR4302547.720423/94‑1 (MQ=60)
ATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGG > SRR4302547.6498898/1‑94 (MQ=60)
ATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGG > SRR4302547.3167692/1‑94 (MQ=60)
AGCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGG < SRR4302547.207244/94‑1 (MQ=60)
TCTACTGTGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCTCCTTCCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGC < SRR4302547.6099779/94‑1 (MQ=60)
TCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGC < SRR4302547.1449445/94‑1 (MQ=60)
TCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGC < SRR4302547.6025424/94‑1 (MQ=60)
TCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGC < SRR4302547.2786900/94‑1 (MQ=60)
TCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGC > SRR4302547.2340614/1‑94 (MQ=60)
CACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGT < SRR4302547.5812682/94‑1 (MQ=60)
CACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGT < SRR4302547.1409557/94‑1 (MQ=60)
ACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTA < SRR4302547.6538910/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTAT < SRR4302547.4972403/94‑1 (MQ=60)
TGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATT < SRR4302547.4204056/94‑1 (MQ=60)
TGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATT > SRR4302547.6273988/1‑94 (MQ=60)
TGGGTCTGGTCATCCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATT < SRR4302547.841832/94‑1 (MQ=60)
GGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTG < SRR4302547.5889750/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGAT > SRR4302547.6127888/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATT < SRR4302547.5710797/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTG < SRR4302547.878829/94‑1 (MQ=60)
TGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTTG > SRR4302547.25742/1‑94 (MQ=60)
TGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGG < SRR4302547.1478537/94‑1 (MQ=60)
GGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGC > SRR4302547.5365598/1‑94 (MQ=60)
GGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGC < SRR4302547.1273229/94‑1 (MQ=60)
GTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATAGTCGTATTGATTGGCG > SRR4302547.4554371/1‑94 (MQ=60)
TCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGACCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGT > SRR4302547.1932043/1‑94 (MQ=60)
GCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGT < SRR4302547.4901224/94‑1 (MQ=60)
CATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTG > SRR4302547.2670476/1‑94 (MQ=60)
CATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTG > SRR4302547.2214692/1‑94 (MQ=60)
CATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTG < SRR4302547.5906511/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGC > SRR4302547.2924796/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGC > SRR4302547.3078076/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGC > SRR4302547.3119530/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCA < SRR4302547.4026783/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCA < SRR4302547.5521147/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAG < SRR4302547.2456094/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGTCGTATTGATTGGCGTGCAGA > SRR4302547.3603386/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATT < SRR4302547.5732611/94‑1 (MQ=60)
GCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTG < SRR4302547.5671556/94‑1 (MQ=60)
CGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGG > SRR4302547.5560028/1‑94 (MQ=60)
GCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGT < SRR4302547.905080/94‑1 (MQ=60)
CTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTC < SRR4302547.3340742/94‑1 (MQ=60)
TCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGAGTATTGATTTGAGTGCAGATTGGTCT > SRR4302547.1124318/1‑94 (MQ=60)
ATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG > SRR4302547.3471110/1‑94 (MQ=60)
ATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG > SRR4302547.310412/1‑94 (MQ=60)
ATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG < SRR4302547.2354990/94‑1 (MQ=60)
TCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGG > SRR4302547.5244844/1‑94 (MQ=60)
TCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGG > SRR4302547.2527971/1‑94 (MQ=60)
CTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGC < SRR4302547.5532470/94‑1 (MQ=60)
CTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGC > SRR4302547.5548578/1‑94 (MQ=60)
CTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGC > SRR4302547.2268821/1‑94 (MQ=60)
TGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCA > SRR4302547.4849674/1‑94 (MQ=60)
TGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCA > SRR4302547.5183161/1‑94 (MQ=60)
GTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAA < SRR4302547.983286/94‑1 (MQ=60)
GTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAA > SRR4302547.6069977/1‑94 (MQ=60)
GTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAA > SRR4302547.239017/1‑94 (MQ=60)
GTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAA > SRR4302547.2232790/1‑94 (MQ=60)
GTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAA > SRR4302547.2723717/1‑94 (MQ=60)
TCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCTGCAATA < SRR4302547.4291823/94‑1 (MQ=60)
TCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATA > SRR4302547.6717370/1‑94 (MQ=60)
TCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATA > SRR4302547.1855108/1‑94 (MQ=60)
TCTTCCCGCTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATAT < SRR4302547.426589/94‑1 (MQ=60)
CCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATAT > SRR4302547.619915/1‑94 (MQ=60)
CCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATAT > SRR4302547.5108064/1‑94 (MQ=60)
CCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATAT > SRR4302547.1234954/1‑94 (MQ=60)
CCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATAT > SRR4302547.1458135/1‑94 (MQ=60)
CTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATT > SRR4302547.5578088/1‑94 (MQ=60)
TTCCCACTGGTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTC > SRR4302547.6633214/1‑94 (MQ=60)
TTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCCGCAATATTC > SRR4302547.1308178/1‑94 (MQ=60)
TCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCC < SRR4302547.6310462/94‑1 (MQ=60)
CCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCG < SRR4302547.3732321/94‑1 (MQ=60)
CACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCC > SRR4302547.3672684/1‑94 (MQ=60)
CACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCC < SRR4302547.2860728/94‑1 (MQ=60)
CACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCC > SRR4302547.5000187/1‑94 (MQ=60)
CACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCC < SRR4302547.237331/94‑1 (MQ=60)
ACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCG > SRR4302547.1479545/1‑94 (MQ=60)
ACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCG > SRR4302547.5035184/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCCATATTCCCCCGC > SRR4302547.2569961/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGC < SRR4302547.3837122/94‑1 (MQ=60)
GCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCAT < SRR4302547.4097920/94‑1 (MQ=60)
GCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCAT < SRR4302547.4426271/94‑1 (MQ=60)
CTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATC < SRR4302547.6248679/94‑1 (MQ=60)
CTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATC < SRR4302547.502141/94‑1 (MQ=60)
TTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCT > SRR4302547.1063463/1‑94 (MQ=60)
TTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCT > SRR4302547.5270482/1‑94 (MQ=60)
TTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGCCTCGGCAGTATTCCGCCGCATCT > SRR4302547.6355036/1‑94 (MQ=60)
TTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTG < SRR4302547.3961277/94‑1 (MQ=60)
CACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGC < SRR4302547.641484/94‑1 (MQ=60)
CACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGC > SRR4302547.1291401/1‑94 (MQ=60)
ACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCT < SRR4302547.2940106/94‑1 (MQ=60)
ACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCT > SRR4302547.1261625/1‑94 (MQ=60)
CCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTT < SRR4302547.219122/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTT < SRR4302547.2645862/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTT < SRR4302547.2896322/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTT > SRR4302547.5771894/1‑94 (MQ=60)
CTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTT > SRR4302547.4203721/1‑94 (MQ=60)
TTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTA > SRR4302547.5779517/1‑94 (MQ=60)
TTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTAC > SRR4302547.2427690/1‑94 (MQ=60)
TTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTAC > SRR4302547.4510657/1‑94 (MQ=60)
TCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTACC > SRR4302547.3403266/1‑94 (MQ=60)
TCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTACC > SRR4302547.2453620/1‑94 (MQ=60)
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TGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTACC > NC_000913/2825009‑2825193
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
